CC2D2A基因突變體及其應用制造技術

本發(fā)明專利技術公開了CC2D2A基因突變體及其應用，具體涉及分離的編碼CC2D2A突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患遺傳性Joubert綜合征的生物樣品的方法，篩選易患遺傳性Joubert綜合征的生物樣品的系統(tǒng)，用于篩選易患遺傳性Joubert綜合征的生物樣品的試劑盒。其中，該分離的編碼CC2D2A基因突變體的核酸，與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.2999A>T，c.3688C>T的至少一種突變。通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患遺傳性Joubert綜合征。

【技術實現(xiàn)步驟摘要】
【專利摘要】本專利技術公開了CC2D2A基因突變體及其應用，具體涉及分離的編碼CC2D2A突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患遺傳性Joubert綜合征的生物樣品的方法，篩選易患遺傳性Joubert綜合征的生物樣品的系統(tǒng)，用于篩選易患遺傳性Joubert綜合征的生物樣品的試劑盒。其中，該分離的編碼CC2D2A基因突變體的核酸，與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.2999A>T，c.3688C>T的至少一種突變。通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患遺傳性Joubert綜合征。【專利說明】CC2D2A基因突變體及其應用
本專利技術涉及
。具體而言，本專利技術涉及CC2D2A基因突變體及其應用。
技術介紹
Joubert 綜合征(Joubert syndrome, TS, omim num:213300)是.一類與視網(wǎng)膜色素變性相關的遺傳性綜合癥，在1969年由Joubert等首次報道，本病男性多見，男女比例為3:2，發(fā)病比例為1/100000，預后通常較差。5年的存活率僅達50%。 臨床特點主要包括帶有磨牙癥的小腦蚓部發(fā)育不全，并伴隨有神經(jīng)系統(tǒng)癥狀，包括呼吸模式和發(fā)育遲緩的失調(diào)。本病還可伴隨其他發(fā)育異常，如視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良、腎功能異常、小頭畸形、面部畸形、胼胝體發(fā)育不良、多指(趾)畸形等。其臨床診斷標準為必須具備小腦蚓部發(fā)育不全、肌張力低下、發(fā)育延遲3項；異常呼吸以及眼運動異常2項中至少存在I項。 Joubert綜合征與多個基因有關，目前發(fā)現(xiàn)的基因有20個多，這些基因所生成的蛋白是確定的或懷疑在細胞中扮演纖毛的作用。纖毛呈指狀突起，在細胞表面參與化學信號傳導。纖毛在多類細胞的結構和功能上有重要作用，其中包括腦細胞(神經(jīng)元)，腎臟以及肝臟細胞，初級纖毛在浦肯野細胞以及原始粒細胞已經(jīng)被分離出來.而且纖毛也是感官的必要組成部分(如視覺，聽覺，嗅覺)。研究人員認為，纖毛缺陷會引起該疾病的大部分表型，但目前仍不清楚具體是如何導致發(fā)育異常的。 目前有兩個理論來解釋Joubert綜合征患者的小腦蚓部發(fā)育不良。一是由于纖毛缺陷而SHH信號轉(zhuǎn)導異常，從而粒細胞增殖減少導致小腦蚓部發(fā)育不良，二是中后腦邊界以及菱腦節(jié)有細微變化造成小腦蚓部發(fā)育不良。 大約有25%的Joubert綜合征的致病基因是AHIl基因或者CEP290/NPHP6基因。盡管Joubert綜合征在遺傳學研究上進展迅速，但基因缺陷是如何影響大腦功能，發(fā)育以及結構卻仍不清楚。其中CC2D2A基因位于4pl5.33，編碼富含一個卷曲螺旋和C2區(qū)域的蛋白，功能研究發(fā)現(xiàn)該基因可能在鈣離子依賴型信號轉(zhuǎn)導中起重要作用。 因而，目前對Joubert綜合征的研究仍有待深入。
技術實現(xiàn)思路
本專利技術旨在至少在一定程度上解決上述技術問題之一。為此，本專利技術的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易患Joubert綜合征的生物樣品的方法。 本專利技術是基于專利技術人的下列工作完成的:專利技術人通過高通量外顯子組測序聯(lián)合候選基因突變驗證的方法確定了 Joubert綜合征新的致病基因突變位點(CC2D2A基因的c.2999A>T, c.3688C>T 至少之一突變)。 根據(jù)本專利技術的第一方面，本專利技術提出了一種分離的編碼CC2D2A基因突變體的核酸。根據(jù)本專利技術的實施例，所述核酸與SEQ ID NO:1相比，具有選自下列的至少一種突變:c.2999A>T，c.3688C>T。即相對于野生型CC2D2A基因，本專利技術的CC2D2A基因具有錯義突變c.2999A>T,c.3688C>T的至少一種。根據(jù)本專利技術的實施例，專利技術人確定了 CC2D2A基因的新突變體，該突變體與Joubert綜合征的發(fā)病密切相關，從而通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患Joubert綜合征。 根據(jù)本專利技術的第二個方面，本專利技術提出了一種分離的多肽，該多肽與SEQ ID NO:2相比，具有選自下列的至少一種突變:p.GlulOOOVal、p.Argl230X，通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易Joubert綜合征。根據(jù)本專利技術的實施例，該多肽是由上述核酸編碼的。 根據(jù)本專利技術的地三個方面，本專利技術提出了一種篩選易患Joubert綜合征的生物樣品的方法，該方法包括以下步驟:從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO:1相比，具有選自c.2999ΑΧ 或者c.3688C>T的至少一種突變是所述生物樣品易患Joubert綜合征的指示,任選地,所述生物樣品為選自人體血液，任選地，所述核酸樣本為全基因組DNA,任選地,所述Joubert綜合征是常染色體隱性遺傳疾病。通過根據(jù)本專利技術實施例的篩選易感Joubert綜合征的生物樣品的方法，可以有效地篩選易感Joubert綜合征的生物樣品。 根據(jù)本專利技術的第四方面，本專利技術提出了一種篩選易患Joubert綜合征的生物樣品的系統(tǒng)，該系統(tǒng)包括:核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO:1相比，是否具有c.2999A>T，c.3688C>T的至少一種突變，判斷所述生物樣品是否易患Joubert綜合征；任選地，所述Joubert綜合征是常染色體隱性遺傳疾病。利用該系統(tǒng)，能夠有效地實施前述篩選易感Joubert綜合征的生物樣品的方法,從而可以有效地篩選易感Joubert綜合征的生物樣品。 根據(jù)本專利技術的第五方面，本專利技術提出了一種用于篩選易患Joubert綜合征的生物樣品的試劑盒，該試劑盒含有:適于檢測CC2D2A基因突變體的試劑，其中與SEQ ID NO:1相比，所述CC2D2A基因突變體具有選自下列的至少一種突變:c.2999ΑΧ ，c.3688C>T，任選地，所述試劑為核酸探針或引物，任選地，所述核酸探針或引物具有如SEQ ID NO:3-6所示的核苷酸序列，任選地，所述Joubert綜合征是常染色體隱性遺傳疾病。 根據(jù)本專利技術的第六方面，本專利技術還提出了一種構建體。根據(jù)本專利技術的實施例，該構建體包含前面所述的分離的編碼CC2D2A基因突變體的核酸。需要說明的是，“構建體包含前面所述的分離的編碼ATM基因突變體的核酸”表示，本專利技術的構建體包含與SEQ ID NO:1相比具有c.2999ΑΧ 突變的CC2D2A基因突變體的核酸序列，或者包含與SEQ ID N0:1相比具有c.36880T突變的CC2D2A基因突變體的核酸序列，或者同時包含上述兩種CC2D2A基因突變體的核酸序列。由此，利用本專利技術的構建體轉(zhuǎn)化受體細胞獲得的重組細胞，能夠有效地用作Joubert綜合征相關研究的模型。 根據(jù)本專利技術的第七方面，本專利技術還提出了一種重組細胞。根據(jù)本專利技術的實施例，該重組細胞是通過前面所述的構建體轉(zhuǎn)化受體細胞而獲得的。根據(jù)本專利技術的一些本文檔來自技高網(wǎng)...

【技術保護點】
一種分離的編碼CC2D2A基因突變體的核酸，其特征在于，與SEQ?ID?NO：1相比，所述核酸具有選自下列的至少一種突變：c.2999A>T，c.3688C>T。

【技術特征摘要】

【專利技術屬性】
技術研發(fā)人員：江泓，孫占芳，陳召，唐北沙，肖晶晶，咼軍，張建國，
申請(專利權)人：中南大學湘雅醫(yī)院，深圳華大基因科技有限公司，
類型：發(fā)明
國別省市：湖南;43