【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
【國(guó)外來(lái)華專(zhuān)利技術(shù)】本專(zhuān)利技術(shù)涉及一種用于添加一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸到第一L-核酸的3‘端的方法;一種用于擴(kuò)增靶L-核酸的方法;一種包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì);包含氨基酸序列的聚合酶,其中所述氨基酸序列的氨基酸是D-氨基酸;一種野生型聚合酶的聚合酶變體,其中所述野生型聚合酶由根據(jù)SEQ?ID?NO:15的氨基酸序列組成;一種野生型聚合酶的聚合酶變體,其中所述野生型聚合酶由根據(jù)SEQ?ID?NO:1的氨基酸序列組成;包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì)在用于添加一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸的方法中的用途;包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì)在用于擴(kuò)增靶L-核酸的方法中的用途;一種用于鑒別結(jié)合靶分子的L-核酸分子的方法;一種用于分別產(chǎn)生所述蛋白質(zhì)和聚合酶的方法;以及一種用于將第一D-肽或第一D-蛋白質(zhì)與第二D-肽或第二D-蛋白質(zhì)彼此連接的方法。基因技術(shù)的可利用性在廣義上對(duì)醫(yī)學(xué)和診斷領(lǐng)域以及基礎(chǔ)研究在過(guò)去數(shù)十年間所取得的進(jìn)展貢獻(xiàn)良多。基因技術(shù)所提供的合成力超過(guò)了化學(xué)合成的合成力。確切地說(shuō),基因技術(shù)和基因工程允許使用原核細(xì)胞和真核細(xì)胞的酶機(jī)制來(lái)產(chǎn)生事實(shí)上無(wú)限量的L-肽和L-蛋白質(zhì)。確切地說(shuō),酶和聚合酶,或是野生型形式或是這些野生型形式的變體,允許通過(guò)連接D-核酸的構(gòu)筑塊(即,D-核苷酸)到化學(xué)合成可實(shí)現(xiàn)的長(zhǎng)度(至少未獲得合理的產(chǎn)率)來(lái)合成所述D-核酸。由于手性特異性,基因技術(shù)中所使用的酶僅能對(duì)應(yīng)地使用手性與其自身的手性相符的構(gòu)筑塊和底物。對(duì)應(yīng)地具有相反手性的 ...
【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
一種用于添加一個(gè)或多個(gè)L?核苷酸到第一L?核酸的3'端的方法,其中所述方法包括在包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì)存在下使所述一個(gè)或多個(gè)L?核苷酸與所述第一L?核酸反應(yīng)的步驟,其中所述酶活性能夠添加一個(gè)或多個(gè)L?核苷酸到所述第一L?核酸的3'端。
【技術(shù)特征摘要】
【國(guó)外來(lái)華專(zhuān)利技術(shù)】2012.05.16 EP 12003887.21.一種用于添加一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸到第一L-核酸的3'端的方
法,其中所述方法包括在包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì)存在下使所述
一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸與所述第一L-核酸反應(yīng)的步驟,其中所述酶活
性能夠添加一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸到所述第一L-核酸的3'端。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中所述酶活性展現(xiàn)部分由氨
基酸序列組成,其中所述氨基酸序列的氨基酸是D-氨基酸。
3.根據(jù)權(quán)利要求1和2中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述酶活性
展現(xiàn)部分是聚合酶活性展現(xiàn)部分。
4.根據(jù)權(quán)利要求1至3中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述酶活性
是聚合酶活性。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其中所述聚合酶活性是熱穩(wěn)定的
聚合酶活性。
6.根據(jù)權(quán)利要求3至5中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合酶活
性展現(xiàn)部分的氨基酸序列包含至少300個(gè)氨基酸。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部分的
氨基酸序列包含介于300和900個(gè)之間的個(gè)氨基酸,優(yōu)選介于300和
600個(gè)之間的氨基酸,更優(yōu)選介于300和360個(gè)之間的氨基酸,最優(yōu)
選340至360個(gè)氨基酸。
8.根據(jù)權(quán)利要求4至7中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合酶活
性是DNA聚合酶活性。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其中所述DNA聚合酶活性是
DNA依賴(lài)性DNA聚合酶活性。
10.根據(jù)權(quán)利要求1至9中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述酶活性
展現(xiàn)部分是酶。
11.根據(jù)權(quán)利要求3至9中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合酶
活性展現(xiàn)部分是聚合酶。
12.根據(jù)權(quán)利要求1至4和8至11中任一項(xiàng)所述的方法,其中
所述聚合酶活性展現(xiàn)部分選自非洲豬瘟病毒聚合酶X、嗜熱細(xì)菌聚合
酶X核心域、大鼠聚合酶β、真核生物聚合酶β、克列諾片段、克列
諾外切聚合酶、T4?DNA聚合酶、Phi29?DNA聚合酶、測(cè)序酶、T7DNA
聚合酶、SP6聚合酶、DNA聚合酶I、聚合酶λ,及其中每一個(gè)和任
一個(gè)的變體,
其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部分優(yōu)選為非洲豬瘟病毒聚合酶X或
其變體,其由選自以下的氨基酸序列的所選氨基酸序列組成:根據(jù)
SEQ?ID?NO:1的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:2的氨基酸序列、根
據(jù)SEQ?ID?NO:3的氨基酸序列和根據(jù)SEQ?ID?NO:4的氨基酸序列。
13.根據(jù)權(quán)利要求1至11中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合
酶活性展現(xiàn)部分選自聚合酶DPO4、嗜熱高溫球菌DNA聚合酶、火
球菌屬某種DNA聚合酶、激烈火球菌DNA聚合酶、Pfuturbo聚合酶、
硫磺礦硫化葉菌DNA聚合酶、嗜熱古細(xì)菌DNA聚合酶、KOD聚合
酶、Taq聚合酶、Tth聚合酶、Pyrobest聚合酶、Pwo聚合酶、Sac聚
合酶、Bst聚合酶、Poc聚合酶、Pab聚合酶、Mth聚合酶、Pho聚合
酶、ES4聚合酶、EX-Taq聚合酶、LA-Taq聚合酶、Expand聚合酶、
Platinum?Taq聚合酶、Hi-Fi聚合酶、Tbr聚合酶、Tfl聚合酶、Tru聚
合酶、Tac聚合酶、Tne聚合酶、Tma聚合酶、Tih聚合酶、Tfi聚合
酶、AmpliTaq、Stoffel片段、9°Nm?DNA聚合酶、Therminator、
Therminator?II、Phusion?High?Fidelity聚合酶、Paq5000、Pfx-50、
Proofstart、FideliTaq、Elongase及其變體,
其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部分優(yōu)選為Dpo4聚合酶或其變體,其
\t由選自以下的氨基酸序列的所選氨基酸序列組成:根據(jù)SEQ?ID?NO:
15的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:16的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?
NO:17的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:18的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?
ID?NO:19的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:20的氨基酸序列、根據(jù)
SEQ?ID?NO:21的氨基酸序列和根據(jù)SEQ?ID?NO:22的氨基酸序列。
14.根據(jù)權(quán)利要求1至13中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述反應(yīng)
步驟是在允許進(jìn)行所述添加所述至少一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸到所述第
一L-核酸,優(yōu)選允許進(jìn)行所述添加5至20,000個(gè)L-核苷酸、優(yōu)選10
至2,000個(gè)L-核苷酸、更優(yōu)選50至500個(gè)L-核苷酸、最優(yōu)選50至
100個(gè)L-核苷酸的條件下進(jìn)行。
15.根據(jù)權(quán)利要求1至14中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述添加
所述至少一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸到所述第一L-核酸是所述至少一個(gè)或
多個(gè)L-核苷酸共價(jià)結(jié)合到所述第一L-核酸,優(yōu)選通過(guò)在所述第一L-
核酸的3'OH與所述至少一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸之一的5'磷酸之間形成
3'-5'磷酸二酯鍵。
16.根據(jù)權(quán)利要求1至15中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述第一
L-核酸是由DNA、RNA、經(jīng)修飾的DNA、經(jīng)修飾的RNA或其組合
組成的引物。
17.根據(jù)權(quán)利要求1至16中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述第一
L-核酸由L-核苷酸和任選的修飾組成。
18.根據(jù)權(quán)利要求1至17中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述第一
L-核酸由L-核苷酸組成。
19.根據(jù)權(quán)利要求1至18中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述反應(yīng)
還包含第二L-核酸,其中優(yōu)選通過(guò)沃森-克里克堿基配對(duì)使一分子的
所述第一L-核酸與一分子的所述第二L-核酸雜交。
20.根據(jù)權(quán)利要求19所述的方法,其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部
\t分合成與所述第二L-核酸互補(bǔ)的第三L-核酸,其中所述第三L-核酸
包含所述第一L-核酸和添加到所述第一L-核酸的3'端的L-核苷酸。
21.一種用于在L-核苷酸和包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì)存在
下擴(kuò)增靶L-核酸的方法,其中所述酶活性能夠擴(kuò)增所述靶L-核酸。
22.根據(jù)權(quán)利要求21所述的方法,其中所述酶活性展現(xiàn)部分由
氨基酸序列組成,其中所述氨基酸序列的氨基酸是D-氨基酸。
23.根據(jù)權(quán)利要求21和22中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述酶活
性展現(xiàn)部分是聚合酶活性展現(xiàn)部分。
24.根據(jù)權(quán)利要求21至23中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述酶活
性是聚合酶活性。
25.根據(jù)權(quán)利要求24所述的方法,其中所述聚合酶活性是熱穩(wěn)
定的聚合酶活性。
26.根據(jù)權(quán)利要求23至25中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合
酶活性展現(xiàn)部分的氨基酸序列包含至少300個(gè)氨基酸。
27.根據(jù)權(quán)利要求26所述的方法,其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部
分的氨基酸序列包含介于300和900個(gè)之間的氨基酸,優(yōu)選介于300
和600個(gè)之間的氨基酸,更優(yōu)選介于300和360個(gè)之間的氨基酸,最
優(yōu)選介于340和360個(gè)之間的氨基酸。
28.根據(jù)權(quán)利要求24至26中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合
酶活性是DNA聚合酶活性。
29.根據(jù)權(quán)利要求28所述的方法,其中所述DNA聚合酶活性是
DNA依賴(lài)性DNA聚合酶活性。
30.根據(jù)權(quán)利要求21至29中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述酶活
性展現(xiàn)部分是酶。
31.根據(jù)權(quán)利要求23至29中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合
酶活性展現(xiàn)部分是聚合酶。
32.根據(jù)權(quán)利要求21至24和28至31中任一項(xiàng)所述的方法,其
中所述聚合酶活性展現(xiàn)部分選自非洲豬瘟病毒聚合酶X、嗜熱細(xì)菌聚
合酶X核心域、大鼠聚合酶β、真核生物聚合酶β、克列諾片段、克
列諾外切聚合酶、T4?DNA聚合酶、Phi29?DNA聚合酶、測(cè)序酶、T7
DNA聚合酶、SP6聚合酶、DNA聚合酶I、聚合酶λ,及其中每一個(gè)
和任一個(gè)的變體,
其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部分優(yōu)選為非洲豬瘟病毒聚合酶X或
其變體,其由選自以下的氨基酸序列的所選氨基酸序列組成:根據(jù)
SEQ?ID?NO:1的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:2的氨基酸序列、根
據(jù)SEQ?ID?NO:3的氨基酸序列和根據(jù)SEQ?ID?NO:4的氨基酸序列。
33.根據(jù)權(quán)利要求21至31中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合
酶活性展現(xiàn)部分選自聚合酶DPO4、嗜熱高溫球菌DNA聚合酶、火
球菌屬某種DNA聚合酶、激烈火球菌DNA聚合酶、Pfuturbo聚合酶、
硫磺礦硫化葉菌DNA聚合酶、嗜熱古細(xì)菌DNA聚合酶、KOD聚合
酶、Taq聚合酶、Tth聚合酶、Pyrobest聚合酶、Pwo聚合酶、Sac聚
合酶、Bst聚合酶、Poc聚合酶、Pab聚合酶、Mth聚合酶、Pho聚合
酶、ES4聚合酶、EX-Taq聚合酶、LA-Taq聚合酶、Expand聚合酶、
Platinum?Taq聚合酶、Hi-Fi聚合酶、Tbr聚合酶、Tfl聚合酶、Tru聚
合酶、Tac聚合酶、Tne聚合酶、Tma聚合酶、Tih聚合酶、Tfi聚合
酶、AmpliTaq、Stoffel片段、9°Nm?DNA聚合酶、Therminator、
Therminator?II、Phusion?High?Fidelity聚合酶、Paq5000、Pfx-50、
Proofstart、FideliTaq、Elongase及其變體,
其中所述聚合酶活性展現(xiàn)部分優(yōu)選為Dpo4聚合酶或其變體,其
由選自以下的氨基酸序列的所選氨基酸序列組成:根據(jù)SEQ?ID?NO:
15的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:16的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?
\tNO:17的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:18的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?
ID?NO:19的氨基酸序列、根據(jù)SEQ?ID?NO:20的氨基酸序列、根據(jù)
SEQ?ID?NO:21的氨基酸序列和根據(jù)SEQ?ID?NO:22的氨基酸序列。
34.根據(jù)權(quán)利要求21至33中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述反應(yīng)
步驟是在允許擴(kuò)增所述靶L-核酸的條件下進(jìn)行。
35.根據(jù)權(quán)利要求21至34中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述方法
使用至少一種引物,優(yōu)選使用兩種引物,其中所述至少一種引物由
L-核苷酸和任選的修飾組成。
36.根據(jù)權(quán)利要求35所述的方法,其中所述引物由L-核苷酸組
成。
37.根據(jù)權(quán)利要求21至36中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述靶L-
核酸由L-核苷酸組成。
38.根據(jù)權(quán)利要求21至37中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述方法
是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。
39.根據(jù)權(quán)利要求21至38中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述靶L-
核酸由L-DNA組成。
40.根據(jù)權(quán)利要求21至39中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述靶L-
核酸由20至20,000個(gè)L-核苷酸,優(yōu)選30至2,000個(gè)L-核苷酸,更
優(yōu)選40至500個(gè)L-核苷酸,最優(yōu)選50至100個(gè)L-核苷酸組成。
41.一種包含酶活性展現(xiàn)部分的蛋白質(zhì),其中所述酶活性展現(xiàn)部
分由氨基酸序列組成,其中所述氨基酸序列的氨基酸是D-氨基酸,
其中所述酶活性能夠添加一個(gè)或多個(gè)L-核苷酸到所述第一L-核酸的
3'端...
【專(zhuān)利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:A·佩什,R·大衛(wèi),F·雅羅什,M·雅恩茲,S·克魯斯曼,
申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人:諾松制藥股份公司,
類(lèi)型:發(fā)明
國(guó)別省市:德國(guó);DE
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