本發明專利技術涉及多配體聚糖-2(SDC2；NM_002998)基因作為胃息肉和胃癌特異性的甲基化生物標記物的新用途，并且更具體地，涉及多配體聚糖-2基因作為生物標記物的用途，其使得能夠通過測量多配體聚糖-2基因的甲基化水平在早期階段診斷出胃息肉和胃癌。本發明專利技術的效果在于可檢測胃息肉和胃癌特異性標記基因的CpG島的甲基化，從而提供用于診斷胃癌的信息。使用根據本發明專利技術的甲基化檢測方法或本發明專利技術的診斷組合物、試劑盒或核酸芯片使得有可能在早期轉變階段診斷胃癌，從而能夠早期診斷胃癌。另外，與常規方法相比，本發明專利技術的方法使得能夠以準確快速的方式有效地診斷胃癌。
【技術實現步驟摘要】
【國外來華專利技術】
本專利技術涉及多配體聚糖-2(syndecan，SDC2 ;NM_002998)基因作為胃息肉和胃癌 特異性的甲基化生物標記物的新用途，并且更具體地，涉及多配體聚糖-2基因作為生物標 記物的用途，其使得能夠通過測量多配體聚糖-2基因的甲基化水平在早期階段診斷出胃 息肉和胃癌。
技術介紹
即使醫學發展到今天，癌癥患者，特別是實體瘤患者（除了血癌患者以外）的5年 存活率仍小于50%，并且所有癌癥患者中約2/3在晚期被診斷出來，幾乎所有都在癌癥診 斷后的2年內死亡。在癌癥治療中這樣差的結果不僅是治療方法的問題，還是由于這樣的 事實，即不容易在早期診斷癌癥和準確地診斷晚期癌癥，并在癌癥治療后對癌癥患者進行 隨訪。 在目前的臨床實踐中，癌癥的診斷是由后詢問病史、體檢及臨床評估后進行組織 活檢，而如果懷疑是癌癥，隨后進行射線檢測和內窺鏡檢查來確認的。然而，由現有臨床實 踐對癌癥的診斷只有當癌細胞的數目超過十億并且癌的直徑大于Icm時才可能。在這種情 況下，癌細胞已經具有轉移能力，并且其至少一半已經轉移。同時，用于監測從癌直接或間 接產生的物質的腫瘤標記物被用于癌癥篩查，但是它們由于準確性有限而引起混亂，因為 其中高達約半數即使在癌癥存在時也顯示為正常，它們即使在沒有癌癥時也表現為陽性。 此外，主要用于癌癥治療的抗癌劑的問題在于只有當癌體積很小時才顯示出效果。 之所以難以診斷和治療癌癥是因為癌細胞是高度復雜和可變的。癌細胞過度生長 并且連續地侵入周圍組織以及轉移到遠端器官導致死亡。盡管有免疫機制或抗癌治療的攻 擊，但癌細胞仍舊存活，不斷地發展并且選擇性繁殖最適宜存活的細胞群。癌細胞是具有高 度生存能力的生物體，通過大量基因的突變而產生。為了使一個細胞轉變為癌細胞并發展 成臨床上可檢測到的惡性癌癥腫塊，必須發生大量基因的突變。因此，為了從根本上診斷并 治療癌癥，在基因水平的方法是必要的。 最近，已積極嘗試用遺傳分析來診斷癌癥。最簡單的典型方法是通過PCR檢測血 液中ABL :BCR融合基因（白血病的遺傳特征）的存在。該方法具有大于95%的準確率，并 且在使用這個簡易的基因分析來診斷并治療慢性髓細胞性白血病后，這一方法被用于結果 評估和后續研宄。但是，這種方法的缺點在于它只能適用于某些血癌。 此外，已嘗試另一種方法，其中通過RT-PCR和印跡法檢測由癌細胞表達的基因 的存在，從而診斷血細胞中癌細胞的存在。但是，這種方法的缺點在于它只能適用于包 括前列腺癌和黑色素瘤在內的某些癌癥，并且具有較高的假陽性率。此外，難以對該方 法中的檢測和讀數標準化，并且它的效用也很有限（Kopreski, M. S. et al.，Clin. Cancer Res.，5:1961，1999 ;Miyashiro, I. et al.，Clin. Chem.，47:505, 2001) 〇 最近，已積極嘗試使用血清或血漿中的DNA的基因檢測。這是一種檢測從癌細 胞中分離并釋放到血液中并游離DNA的形式存在于血清中的癌癥相關基因的方法。據發 現，血清中的DNA濃度在實際癌癥患者中比正常人中增加5-10倍，并且這種增加的DNA 大多從癌細胞釋放。使用這樣的從癌細胞中分離的DNA來分析癌癥特異性基因的異常， 例如原癌基因和腫瘤抑制基因的突變、缺失和功能喪失，允許診斷癌癥。在這項工作中， 出現了通過檢查血清中突變的K-ras癌基因、p53腫瘤抑制基因和pl6基因中的啟動子 甲基化，以及微衛星的標記和不穩定性來診斷肺癌、頭頸癌、乳腺癌、結腸癌和肝癌的積極 嘗試（Chen, X.Q.et al·，Clin. Cancer Res. ,5:2297, 1999 ;Esteller，M.et al·，Cancer Res.，59:67, 1999 ;Sanchez_Cespedes，M. et al.，Cancer Res.，60:892, 2000 ;Sozzi，G. et al. , Clin. Cancer Res. , 5:2689, 1999) 〇 同時，在血液以外的樣品中，也可以檢測癌細胞的DNA。嘗試一種通過基因或 抗體測試來檢測肺癌患者的痰或支氣管肺泡灌洗術中癌細胞或原癌基因的存在的方 法(Palmisano, ff. A. et al. , Cancer Res.,60:5954, 2000 ；Sueoka, E. et al. , Cancer Res.，59:1404, 1999)。此外，嘗試了檢測結腸和直腸癌患者的糞便中原癌基因的存在 (Ahlquist, D. A. et al.，Gastroenterol.，119:1219-27, 2000)和檢測尿液和前列腺液中啟 動子甲基化異常（Goessl，C.et al·，Cancer Res. ,60:5941，2000)的其他方法。然而，為了 準確地診斷引起大量基因異常的癌癥并顯示每種癌癥的各種突變特性，需要一種以準確且 自動的方式同時分析大量基因的方法。然而，尚未建立這樣的方法。 為了準確診斷癌癥，重要的是不僅檢測突變基因，而且檢測此基因發生突變的機 制。在此之前，進行了側重于編碼序列的突變，即，微變化，如點突變、缺失和插入，或宏觀染 色體異常的研宄。然而，近幾年，表觀遺傳改變被報道為與這些突變一樣重要，并且表觀遺 傳改變的典型例子是啟動子CpG島的甲基化。 在哺乳動物細胞的基因組DNA中，除了 A、C、G和T以外還有第五堿基，即5-甲基 胞嘧啶，其中甲基是結合到胞嘧啶環的第五個碳（5-mC)上。5-mC總是只連接至CG二核苷 酸（5'-mCG-3'）的C，這是經常被標示的CpG。CpG的C通過結合甲基而主要被甲基化。這 一 CpG的甲基化抑制基因組中的重復序列（如Alu或轉座子）被表達。另外，該CpG是在 哺乳動物細胞中表觀遺傳學改變出現次數最多的位點。這一 CpG的5-mC天然脫氨基為T， 并且因此，在哺乳動物基因組中的CpG僅示出了 1%的頻率，這遠低于正常頻率（1/4X1/4 =6. 25% )。 CpG異常地整合的區域被稱為CpG島。CpG島是指長度為0. 2-3kb，并且C+G含量超 過50%且CpG比率超過3. 75%的位點。在人類基因組中大約有45, 000個CpG島，并且發現 它們大多數在調控基因表達的啟動子區中。實際上，在持家基因的啟動子中發現的CpG島 約占人類基因的 50% (Cross, S. et al.，Curr. Opin. Gene Develop.，5:309, 1995)。最近，已 經積極地進行了檢查血液、痰、唾液、糞便或尿液中的腫瘤相關基因的啟動子甲基化，和使 用檢測結果診斷并治療各種癌癥的嘗試（Esteller，M. et al.，Cancer Res.，59:67, 1999 ; Sanchez-Cespedezj M. et al. , Cancer Res. , 60:892, 2000 ；Ahlquist, D. A. et al., Gastroe nterol.，119:1219, 2000)。因此，本專利技術人根據相關的研宄已證明，配體蛋白聚糖2基因可 以特異地用于診斷結腸癌（KR 10-1142131本文檔來自技高網...
【技術保護點】
一種用于診斷胃癌的組合物，包括能夠檢測多配體聚糖2(SDC2)基因的CpG島的甲基化的物質。
【技術特征摘要】
【國外來華專利技術】...
【專利技術屬性】
技術研發人員：安城皖，吳泰禎，
申請(專利權)人：基因特力株式會社，
類型：發明
國別省市：韓國;KR
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