本發明專利技術公開了一種能夠預測低FODMAPs飲食治療腸易激綜合征病人療效的糞便微生物標志物,選自對低FOMDAPs飲食治療應答組中富集的兩種微生物Bacteroides,Dialister或不應答組富集的一種微生物Prevotella中的一種或多種。針對腸道菌群中的微生物標志物的相對豐度進行檢測,通過所得到的相對豐度值與預定的cutoff值進行比較。建立一種預測評分方法來預測腸易激綜合征病人對低FODMAPs飲食對的應答情況,該預測評分方法的AUC為0.951,最佳截斷值為2.5,kappa值為0.761,與實際治療效果相比具有較好的一致性。
【技術實現步驟摘要】
本專利技術設及生物標志物領域,具體的,設及一種腸易激綜合征微生物標志物,及其 在預測低FODMAPs飲食治療腸易激綜合征病人療效中的應用。
技術介紹
腸易激綜合征(IBS)是一類臨床常見的功能性胃腸病,W慢性反復發作的腹痛、腹 部不適伴有排便習慣改變為特征。普通人群中IBS的患病率可達10%-20%(J. American Gastroenterological Association,2012,10(7) :712-721 (e4)),然而,IBS潛在的病理生 理機制至今尚未完全清楚,但胃腸道動力異常、內臟感覺過敏、腦-腸軸功能改變、輕度炎性 反應、精神社會因素等可能起了一定的作用(Camilleri M,Gas1:;roente;rology,200l,120 :652-668)。研究表明腸道菌群素亂也參與了IBS的病理生理過程,IBS患者的糞便菌群 出現豐度和多樣性改變等諸多變化(Magnus S,Gut,2013,62( 1): 159-176)。因此,腸道微生 態干預成為治療包括IBS在內的多種功能性胃腸疾病的新方法(Proc Nu化Soc,2010,69 :187-194.)〇 大約有20-70%的IBS患者具有食物不耐受的情況(Molecular Medicine R邱〇的3,2012,5(6):1382-90.),尤其是一類被稱為。00魁?3(單糖、多糖、寡聚糖和多元醇) 的一類短鏈碳水化合物,可通過滲透作用W及結腸內厭氧菌的發酵產酸產氣而引起IBS患 者的腹痛、腹脹癥狀和腸動力異常(Aliment曲armacol Ther,2010,31 (8): 874-882)。因 此,低FOMDAPs飲食治療被NICE推薦為IBS治療的一線療法。然而,并非所有的IBS病人都能 得到很好的病情改善。缺乏對該治療方案的預測因子是目前亟待解決的問題 (Gastroenterol Hepatol,2015)。 腸道微生物組成可W被飲食所調節(Nutrients ,2013.5(1) :p. 2:34-52.),不同 FODMAPs含量的飲食可W不同程度地改變腸道菌群的豐度和多樣性(Gut ,2015.64(1): P. 93-100.)。同樣,不同的腸道微生物組成對不同食物成分的利用程度也不同(Nu化ients, 2013.5( 1): P. 234-52.)。有研究發現含有大量多糖代謝利用為主的微生物的兒童IBS病人 在低FODMAPs飲食后癥狀緩解更明顯(A1 iment Pharmacol Ther,2015.42(4):P. 418-27.)。 我們推測,基線期腸道菌群組成可能是影響低FOMDAPs飲食治療療效的主要原因,因此,從 腸道微生物中篩選出能夠作為低FODMAPs飲食治療腸易激綜合征的療效的預測因子,對于 相關治療藥物的開發具有十分重要的意義。
技術實現思路
針對上述現有技術,本專利技術的第一個目的是提供一種腸易激綜合征微生物標志 物。 本專利技術的第二個目的是提供上述微生物標志物在作為FODMAPs飲食治療腸易激綜 合征療效的預測因子中的應用。 本專利技術的第Ξ個目的是提供上述微生物標志物在制備治療腸易激綜合征的藥物 和/或在制備功能性食品中的應用。 本專利技術的第四個目的是提供一種非診斷目的的檢測上述微生物標志物的方法。 本專利技術的第五個目的是提供一種利用上述微生物標志物預測腸易激綜合征患者 個體FODMAPs飲食治療療效的系統。 本專利技術的第六個目的是提供一種治療腸易激綜合征的藥物。 為實現上述目的,本專利技術采用下述技術方案: -種腸易激綜合征微生物標志物,選自腸易激綜合征對低FODMAPs飲食治療應答 組富集的兩種微生物8曰(:161'〇1(163、01曰113161'或不應答者組富集的一種微生物Prevotella 中的一種或多種。 優選的,上述腸易激綜合征微生物標志物,同時具有微生物Prevotella和選自微 生物 Bacte;roides、Dialiste;r 中的一種或兩種。 檢測上述微生物標志物的試劑在制備預測FODMAPs飲食治療腸易激綜合征療效的 檢測試劑盒中的應用也是本專利技術的保護范圍。 上述微生物標志物是專利技術人通過對IBS患者(包括對低FODMAPs飲食應答患者和不 應答患者)的糞便樣本中的微生物的豐度的差異比較分析W及驗證,確定上述微生物標志 物可W作為FODMAPs飲食治療腸易激綜合征療效的預測因子。 本專利技術還提供上述微生物標志物在制備治療腸易激綜合征的藥物和/或在制備功 能性食品中的應用。 本專利技術還提供上述微生物標志物的檢測方法,步驟如下: (1)從對象糞便中提取DNA樣本; (2)針對DNA樣本構建測序文庫; (3)對測序文庫進行高通量測序,獲得測序結果; (4)根據測序結果,確定所述對象的腸道菌群是否存在上述的微生物標志物; 所述的步驟(4)中進一步包括:針對腸道菌群中的微生物標志物的相對豐度進行 檢測,通過所得到的相對豐度值與預定的cutoff值進行比較。 本專利技術還提供了一種利用上述微生物標志物預測腸易激綜合征患者個體FODMAPs 飲食治療療效的系統,包括: 核酸樣本分離單元,用于從檢測對象中分離腸道菌群核酸樣本; 測序單元,用于對分離的腸道菌群核酸樣本進行測序,W獲得測序結果; 數據處理單元,用于根據測序結果,對腸道菌群中的上述微生物標志物的相對豐 度進行檢測,將所得到的相對豐度值進行R0C曲線分析,得出上述微生物標志物的cutoff 值; 結果判定單元,用于將數據處理單元得到的上述微生物標志物的cutoff值與設定 診斷值進行比較,若微生物標志物Bacte;roides、Dialiste;r的cutoff值高于設定診斷值,則 分別計為1分,若微生物標志物Prevotella的cutoff值低于設定診斷值,則計為1分;將得分 相加,若高于2.5分,則判定為陽性,即對低F0MDAP飲食治療應答; 所述結果判定單元中,微生物標志物的設定診斷值分別為:Bacteroides的設定診 斷值為20.2%,01曰113*6'的設定診斷值為0.71%,?'6乂〇*611曰的設定診斷值為4.6%。 所述測序單元采用的是高通量測序平臺,優選為化Seq2500陽250測序平臺。 本專利技術還提供一種預測FODMAPs飲食治療腸易激綜合征療效的檢測試劑盒,該試 劑盒中含有對上述微生物標志物進行檢測的試劑。 本專利技術還提供一種治療腸易激綜合征的藥物,所述藥物促使腸易激綜合征微生物 標志物中的Bacteroides和/或Dialister的相對豐度增加; W及促使Prevotella的相對豐度降低。 本專利技術還提供生產或篩選上述藥物的方法,包括篩選促使腸易激綜合征微生物標 志物中的Bacteroides和/或Dialister的相對豐度增加的物質作為所述藥物的步驟; W及包括篩選促使Prevotella的相對豐度降低的物質作為所述藥物的步驟。 術語說明: 除另有規定外,本專利技術中的"富集",是指通過LEfSe分析找到顯著差異的細菌。 "功能性食品",是指具有特定營養保健功能的食品,本專利技術的功能性食品能夠調 節腸道菌群中微生物Bacteroides、Dialiste;r或Pr本文檔來自技高網...
【技術保護點】
一種腸易激綜合征微生物標志物,其特征在于,選自微生物Bacteroides、Dialister或Prevotella中的一種或多種。
【技術特征摘要】
【專利技術屬性】
技術研發人員:李延青,杜佳欣,左秀麗,李理想,李銘,
申請(專利權)人:山東大學齊魯醫院,
類型:發明
國別省市:山東;37
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