本發(fā)明專利技術(shù)提供了一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物,包括Nanog?F?ATGCCTGGTGAACCCGAC和Nanog?R?AGGACTGGATGTTCTGGGT,以及β?actin?F?CACGAAACTACCTTCAACTCC和β?actin?R?CATACTCCTGCTTGCTGATC。檢測(cè)方法包括以下步驟:(1)提取間充質(zhì)干細(xì)胞,并傳代培養(yǎng);(2)提取各代次間充質(zhì)干細(xì)胞的總RNA,進(jìn)行RT?PCR擴(kuò)增;(3)使用所述引物對(duì)擴(kuò)增基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增。該引物特異性好、準(zhǔn)確性高、靈敏度高,檢測(cè)方法簡(jiǎn)單,可檢測(cè)出基因表達(dá)量的微小變化。
【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)屬于生物
,具體涉及一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物及檢測(cè)方法。
技術(shù)介紹
2003年,Chambers等和Mitsui等幾乎同時(shí)報(bào)道了一種在囊胚內(nèi)細(xì)胞群(inner cell mass,ICM)、原始生殖細(xì)胞以及胚胎干細(xì)胞(embryonic stem cells,ESCs)表達(dá)的新轉(zhuǎn)錄因子,命名為Nanog。Nanog基因?qū)儆贏NTP類,NK家族基因,在人定位于12號(hào)染色體12p13~31,其cDNA由2184個(gè)核苷酸租成,包涵1個(gè)開放閱讀框,編碼305個(gè)氨基酸組成的多肽。Nanog基因的發(fā)現(xiàn)是在研究維持ESCs亞全能性和胚胎發(fā)育的相關(guān)基因方面取得的最大進(jìn)展,除了有助于ESCs自我更新和維持其未分化狀態(tài),還能夠促進(jìn)細(xì)胞增殖。去除Nanog基因?qū)?huì)導(dǎo)致ESCs向原始內(nèi)胚層樣細(xì)胞的分化,說明Nanog是組織ESCs分化為原始內(nèi)胚層的關(guān)鍵因子。有研究認(rèn)為Nanog基因也是“逆轉(zhuǎn)因”(reversine)物質(zhì),可以把普通細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)榕咛ゼ?xì)胞,再指導(dǎo)新細(xì)胞生長(zhǎng)出人類需要的各種人體組織,來(lái)代替已失去功能的組織器官,這也是再生醫(yī)學(xué)時(shí)代到來(lái)的原因之一。也有人應(yīng)用Northern Blot和逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)小鼠腎臟中Nanog基因的曾齡變化,發(fā)現(xiàn)腎乳頭區(qū)細(xì)胞表達(dá)較高,并且有年齡依賴性行為。Izadpanah等在研究成年恒河猴間充質(zhì)干細(xì)胞是否具有多項(xiàng)分化潛能時(shí),發(fā)現(xiàn)有Nanog的表達(dá)。同時(shí),研究發(fā)現(xiàn)在睪丸原位癌和睪丸原位癌來(lái)源的睪丸腫瘤中有大量Nanog表達(dá),并具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而在正常睪丸中沒有檢測(cè)到該基因蛋白質(zhì)水平的表達(dá)。這說明Nanog可能是某些腫瘤標(biāo)志之一,并在一定程度上解釋了這些 腫瘤細(xì)胞可以無(wú)休止增殖的原因。因此,通過檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞中Nanog基因的表達(dá)變化對(duì)再生醫(yī)學(xué)的應(yīng)用、細(xì)胞治療和基因治療領(lǐng)域都具有重要意義。本領(lǐng)域迫切需要特異性好、靈敏都高的檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量變化的方法。而在很多基因表達(dá)量研究中,大多采用Northern印跡法或者RT-PCR后進(jìn)行電泳的方法來(lái)檢測(cè)基因的表達(dá)量,但是Northern印跡法檢測(cè)效率不高,靈敏度也低,無(wú)法檢出微小的基因表達(dá)量變化,RT-PCR電泳的方法由于產(chǎn)物量因?yàn)槊阁w系的影響而產(chǎn)生的波動(dòng)在呈指數(shù)增長(zhǎng)的PCR中會(huì)被轉(zhuǎn)化成產(chǎn)物量間很大的差異,所以準(zhǔn)確性不是很好。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
針對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)中存在的上述問題,本專利技術(shù)提供一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物及檢測(cè)方法,可有效解決現(xiàn)有技術(shù)中的檢測(cè)效率不高、靈敏度較低、準(zhǔn)確性不好的問題。為實(shí)現(xiàn)上述目的,本專利技術(shù)解決其技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案是:一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物,包括Nanog基因的上游引物5'-ATGCCTGGTGAACCCGAC-3'和下游引物5'-AGGACTGGATGTTCTGGGT-3',以及β-actin內(nèi)參基因的上游引物5'-CACGAAACTACCTTCAACTCC-3'和下游引物5'-CATACTCCTGCTTGCTGATC-3'。使用上述引物檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的方法,包括以下步驟:(1)提取間充質(zhì)干細(xì)胞,進(jìn)行傳代培養(yǎng);(2)提取各代次間充質(zhì)干細(xì)胞的總RNA,然后進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增;(3)使用上述引物對(duì)擴(kuò)增基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增,確定Nanog 基因表達(dá)量。進(jìn)一步地,RT-PCR反應(yīng)體系為:Total RNA 0.1 ng-5μg、濃度為100μM的Oligo dT引物1μL,補(bǔ)充水至12μL,然后再添加5×Reaction Buffer 4μL、20U/μL的RiboLock RNase inhibitor 1μL、10mM dNTP MIX 2μL和200U/μL的RevertAid M-Mul V RT 1μL。進(jìn)一步地,RT-PCR擴(kuò)增條件為:42℃ 60min,然后70℃ 5min。進(jìn)一步地,實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系為:Fast SYBR Green Master mix 10μL、上游引物1μL、下游引物1μL、cDNA 2μL,然后添加水至20μL。進(jìn)一步地,實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5min,95℃變性15s,60℃退火60s,共39個(gè)循環(huán),最后72℃延伸1min。進(jìn)一步地,間充質(zhì)干細(xì)胞為臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞、脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞或胎盤間充質(zhì)干細(xì)胞。本專利技術(shù)提供的一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物及檢測(cè)方法,具有以下有益效果:(1)本專利技術(shù)提供了用于檢測(cè)Nanog基因表達(dá)量的引物以及管家基因β-actin的引物,引物特異性好,準(zhǔn)確性好,實(shí)現(xiàn)了Nanog基因表達(dá)量的檢測(cè),提高了檢測(cè)的準(zhǔn)確性。(2)本專利技術(shù)還提供了一種間充質(zhì)干細(xì)胞傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的檢測(cè)方法,采用此方法,具有特異性好、靈敏度高、準(zhǔn)確性好等優(yōu)點(diǎn),可以為間充質(zhì)干細(xì)胞的標(biāo)志基因研究、腫瘤標(biāo)志基因的研究及再生醫(yī)學(xué)中間充質(zhì)干細(xì)胞的應(yīng)用提供幫助。附圖說明圖1為脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞P1、P3、P5、P7和P10代中Nanog基因的實(shí)時(shí) 熒光定量PCR擴(kuò)增圖;圖2為胎盤間充質(zhì)干細(xì)胞P7代中Nanog基因的溶解曲線;圖3為胎盤間充質(zhì)干細(xì)胞P1、P3、P5、P7和P10代中Nanog基因的溶解曲線;圖4為臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞、脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞和胎盤間充質(zhì)干細(xì)胞傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的計(jì)算結(jié)果圖。具體實(shí)施方式實(shí)施例1一種間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的檢測(cè)方法,包括以下步驟:(1)提取間充質(zhì)干細(xì)胞UC-MSCs:在生物安全柜中將臍帶用生理鹽水沖洗干凈后,剝離羊膜上皮,去除臍動(dòng)脈和臍靜脈,然后將臍帶膠質(zhì)剪碎后加入30mL Ⅱ型膠原酶,置于37℃,200r/min下持續(xù)消化6h,100目篩網(wǎng)過濾收集細(xì)胞,然后于1200r/min離心10min,棄上清,用D-Hank’s液輕柔沖洗細(xì)胞3次,無(wú)血清培養(yǎng)基(hyclone公司)重懸細(xì)胞,在37℃、體積分?jǐn)?shù)為5%的CO2恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)6-7d后全量換液,棄掉未貼壁細(xì)胞,根據(jù)粘附性差異使UC-MSCs與其他組織細(xì)胞分離,分離后細(xì)胞經(jīng)過表面標(biāo)志物鑒定,從而確定為UC-MSCs,然后使用胰蛋白酶將其消化后,在細(xì)胞瓶?jī)?nèi)接種1×106個(gè)細(xì)胞,添加20mL無(wú)血清培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),每隔3-4d換液1次進(jìn)行傳代培養(yǎng);AD-MSCs:取成人吸脂術(shù)后的脂肪組織,磷酸鹽緩沖液(PBS)反復(fù)浸泡沖洗3次去除血液,加入等體積0.1%I型膠原酶,于37℃水浴震蕩消化1h,低糖DMEM(Gibco)終止消化,2000r/min離心5min,棄上清,再用低糖DMEM 重懸沉淀,200目濾網(wǎng)過濾,向沉淀中再加入3mL低糖DMEM,吹打均勻后移入培養(yǎng)瓶,于37℃、體積分?jǐn)?shù)為5%的CO2恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24h后,首次換液,去除殘余的紅細(xì)胞及未貼壁細(xì)胞,根據(jù)黏附性差異使AD-MSCs與其他組織細(xì)胞分離,分離后細(xì)胞經(jīng)過表面標(biāo)志物鑒定,從而確定為AD-MSCs,然后使用胰蛋白酶將其消化后,在細(xì)胞瓶?jī)?nèi)接種1×106細(xì)胞,添加20mL無(wú)血清培養(yǎng)基培養(yǎng),以后每隔3~4d換液1次進(jìn)行傳代培養(yǎng);PMSCs本文檔來(lái)自技高網(wǎng)...
【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物,其特征在于,包括Nanog基因的上游引物5'?ATGCCTGGTGAACCCGAC?3'和下游引物5'?AGGACTGGATGTTCTGGGT?3',以及β?actin內(nèi)參基因的上游引物5'?CACGAAACTACCTTCAACTCC?3'和下游引物5'?CATACTCCTGCTTGCTGATC?3'。
【技術(shù)特征摘要】
1.一種用于檢測(cè)間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的引物,其特征在于,包括Nanog基因的上游引物5'-ATGCCTGGTGAACCCGAC-3'和下游引物5'-AGGACTGGATGTTCTGGGT-3',以及β-actin內(nèi)參基因的上游引物5'-CACGAAACTACCTTCAACTCC-3'和下游引物5'-CATACTCCTGCTTGCTGATC-3'。2.一種間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的檢測(cè)方法,其特征在于,包括以下步驟:(1)提取間充質(zhì)干細(xì)胞,進(jìn)行傳代培養(yǎng);(2)提取各代次間充質(zhì)干細(xì)胞的總RNA,然后進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增;(3)使用所述引物對(duì)擴(kuò)增基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增,確定Nanog基因表達(dá)量。3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的間充質(zhì)干細(xì)胞體外傳代過程中Nanog基因表達(dá)量的檢測(cè)方法,其特征在于,RT-PCR反應(yīng)體系為:Total RNA 0.1ng-5μg、濃度為100μM的Oligo dT引物1μL,補(bǔ)充水至12μL,然后再添加5×Reaction Buffer 4μL、20U/μL的RiboLock RN...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:劉宇,張蓉,馬明,李曉瑞,林秀芳,
申請(qǐng)(專利權(quán))人:成都中創(chuàng)清科醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司,
類型:發(fā)明
國(guó)別省市:四川;51
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