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    基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門及求反電路制造技術

    技術編號:13674588 閱讀:148 留言:0更新日期:2016-09-07 23:55
    本發明專利技術屬于基于分子電路設計技術領域,具體涉及一種基于DNA鏈自組裝原理的基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門及利用該異或門所構建的求反電路。該異或門采用雙軌邏輯構建而成,包括單鏈DNA輸入、燃料發卡和固定于折紙基質上的DNA發卡;該求反電路屬于一種三位二進制輸入求反電路,由兩個并列的異或門構成。所提供的異或門,錯誤的鏈置換反應發生的概率較低,同時DNA鏈置換反應的效率得以提高。所提供的求反電路中,可實現并行計算,互不干擾;對該求反電路的Visual?DSD的仿真結果表明,該求反電路構建合理,同時該求反電路具有良好的性能,在構建大型復雜分子系統中具有構建速度快、精確度高和拓展性強等優勢。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術屬于基于分子電路設計
    ,具體涉及一種基于DNA鏈自組裝原理的基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門及利用該異或門所構建的求反電路。
    技術介紹
    作為自然計算的一個分支,生物計算中基于生物材料已構建出大量多功能性分子計算設備。基于DNA的自發性配對組裝、可自動進行鏈置換等自然特征,它是一種進行分子計算的理想材料,可為更多DNA分子電路的構建提供巨大潛力。然而,由于全局性DNA鏈置換反應中分子擴散速度慢以及錯誤的分子碰撞問題,越來越多的研究者開始著眼于局域性分子鏈置換在分子電路構建中的應用。局域性DNA分子電路的構建原理為:部分DNA分子被束縛在一種DNA襯底上,并且它們只能與足夠接近的其他DNA分子發生反應,這樣就可有效避免全局性DNA鏈置換反應中分子擴散速度慢以及錯誤的分子碰撞問題。在過去的幾年里,研究者們對局域性DNA分子電路進行了大量設計和構建工作,并取得了一定的成果,例如:2011年, Chandran基于局域性DNA鏈置換反應提出了與門、或門以及與或門等分子邏輯門的詳細設計方法,并在此基礎上構建立了局域性四輸入求平方根電路;2014年,錢璐璐和Winfree基于一種新型鏈置換反應在DNA折紙構建的底板上模擬化學反應網絡,在此基礎上提出了空間邏輯算法電路的構建方法,并以四輸入開平方電路為例進行了詳細闡述。由于DNA分子電路設計的復雜性和其未來應用前景的重要性,基于已有的DNA分子電路設計原理設計新的DNA分子電路仍然具有十分重要的意義。
    技術實現思路
    本專利技術目的在于提供一種基于DNA鏈自組裝原理的基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門及利用該異或門所構建的求反電路,從而豐富現有的DNA分子電路。本專利技術所采取的詳細技術方案如下所述。一種基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門,采用雙軌邏輯構建而成,包括單鏈DNA輸入、燃料發卡和固定于折紙基質上的DNA發卡;所述單鏈DNA輸入有四種:<s a0>、<s b0>、<s c0>、<s d0>;所述DNA燃料發卡有兩種:<y^*>[s*]{x^>、<z^*>[s*]{F^>;所述固定于折紙基質上的DNA發卡有七種:{tether() a0^*本文檔來自技高網...

    【技術保護點】
    一種基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門,其特征在于,該異或門采用雙軌邏輯構建而成,包括單鏈DNA輸入、燃料發卡和固定于折紙基質上的DNA發卡;所述單鏈DNA輸入有四種:<s?a0>、<s?b0>、<s?c0>、<s?d0>;所述DNA燃料發卡有兩種:<y^*>[s*]{x^>、<z^*>[s*]{F^>;所述固定于折紙基質上的DNA發卡有七種:{tether()?a0^*}[s]{y^>、{tether()?x^*}[s]{blank^>、{tether()?b0^*}[s]{y^>、{tether()?x^*}[s]{z^>、{tether()?c0^*}[s]{y^>、{tether()?d0^*}[s]{y^>、{tether()?F^*}[s]{i^>,其中tether()表示發卡被束縛;所述折紙基質,具體為利用DNA短鏈與長鏈的特異性結合自組裝而成的單層DNA;所述單鏈DNA輸入和燃料發卡在空間上均是自由擴散的,而固定在折紙基質上的DNA發卡在空間上則是被束縛的,只能與相鄰的DNA鏈反應。...

    【技術特征摘要】
    1.一種基于局域性DNA發卡鏈置換反應的異或門,其特征在于,該異或門采用雙軌邏輯構建而成,包括單鏈DNA輸入、燃料發卡和固定于折紙基質上的DNA發卡;所述單鏈DNA輸入有四種:<s a0>、<s b0>、&l...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:王延峰劉海燕黃春張勛才孫軍偉王子成姜素霞殷婧崔光照張雯雯
    申請(專利權)人:鄭州輕工業學院
    類型:發明
    國別省市:河南;41

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