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    CSRP2在作為評估成人B-ALL患者預后風險標記物中的應用制造技術

    技術編號:13768707 閱讀:336 留言:0更新日期:2016-09-29 04:10
    本發明專利技術公開了CSRP2在作為評估成人B?ALL患者預后風險標記物中的應用。本發明專利技術所提供的應用具體為用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物在制備用于B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險評估的產品或評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險中的應用。本發明專利技術實驗結果證明,CSRP2低表達可能是成人B?ALL患者OS、EFS和RFS的獨立危險因素,可能在B?ALL的分層診斷和預后評估中發揮重要作用。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術屬于生物醫藥領域,涉及CSRP2在作為評估成人B-ALL患者預后風險標記物中的應用
    技術介紹
    B系急性淋巴細胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)是成人最常見的ALL類型,危險分層和治療方式的進步顯著改善了患者的預后,但成人B-ALL復發率高,總體預后仍較差,長期生存僅為30%-40%。目前的危險度分層根據年齡,初診白細胞計數,染色體核型,中樞神經系統受累以及對初始治療的反應等將患者分為標危和高危[Burke PW,Douer D.Acute lymphoblastic leukemia in adolescents and young adults.Acta Haematol.2014;132:264–73.]。但值得注意的是,標危患者中仍有部分患者復發,提示目前的危險度分層仍有待精準化,因此新的預后相關分子標記物的發現和驗證對于更精確的危險度分層十分必要,且可能提供治療靶點。半胱氨酸和甘氨酸富集蛋白2(cysteine and glycine rich protein 2,CSRP2)是CSRP2基因家族成員之一,參與調節生長發育和細胞分化,可能在腫瘤發生中有一定作用。已有報道CSRP2在乳腺癌中上調,促進乳腺癌侵襲和轉移[Hoffmann C,Mao X,Dieterle M,Moreau F,Al Absi A,Steinmetz A,Oudin A,Berchem G,Janji B,Thomas C.CRP2,a new invadopodia actin bundling factor critically promotes breast cancer cell invasion and metastasis.Oncotarget.2016Mar 22;7(12):13688-705.]。
    技術實現思路
    本專利技術的一個目的是提供一種CSRP2mRNA的新用途。本專利技術所提供的新用途具體為用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物在如下(A)或(B)中的應用:(A)制備用于B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險評估的產品;(B)評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險。本專利技術還提供了一種用于評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險的產品,含有用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物。根據需要,所述產品還可包含數據處理裝置1;所述數據處理裝置1內設模塊1;所述模塊1具有如下(a1)和(a2)所示的功能:(a1)以由若干名未采取任何治療措施的B系急性淋巴細胞白血病患者組成的待測群體的離體骨髓為標本,測定每份標本中所述mRNA的表達量,然后按照所述mRNA的表達量由低到高的順序將所述待測群體進行排列并四等分,將表達量最低的1/4所述待測群體作為CSRP2低表達組,將
    其余3/4所述待測群體作為CSRP2高表達組;(a2)按照如下標準確定來自于所述待測群體的待測者的預后風險:來自于所述CSRP2低表達組中的待測者的預后風險高于或候選高于來自于所述CSRP2高表達組中的待測者。在本專利技術中,所述檢測物可為任何能夠實現對所述mRNA進行定量檢測的試劑和/或儀器。具體可選自如下中任一種:用于檢測所述mRNA的特異性擴增引物和/或探針。對所述mRNA進行定量檢測包括但不限于:設計CSRP2的PCR引物使用逆轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)方法檢測CSRP2的mRNA。在本專利技術中,所述檢測物具體為由序列表中序列1和序列2所示的兩條單鏈DNA組成的引物對,和/或由序列表中序列3所示的單鏈探針;所述單鏈探針的5’端標記有熒光報告基團(如FAM),3’端標記有熒光猝滅基團(如BHQ)。根據需要,所述產品中還可含有用于檢測IKZF1基因是否缺失的物質。其中,這里的IKZF1基因缺失具體有如下幾種情況:IKZF1基因的編碼蛋白缺失第4-7個外顯子、缺失第4-8個外顯子、缺失第2-7個外顯子和缺失第2-8個外顯子。所述的IKZF1基因缺失可為如上情況中的任一種。在本專利技術中,所述用于檢測IKZF1基因是否缺失的物質具體為實施例1表1中所示的“IKZF1Δ4-7,Δ4-8,Δ2-7和Δ2-8缺失引物和TaqMan探針”。進一步,所述IKZF1基因的GenBank登錄號為NC_000007.14的第50303453-50405101位。相應的,所述產品還可包含數據處理裝置2;所述數據處理裝置2內設模塊2;所述模塊2具有如下(b1)和(b2)所示的功能:(b1)以由若干名未采取任何治療措施的B系急性淋巴細胞白血病患者組成的待測群體的離體骨髓為標本,測定每份標本中所述IKZF1基因是否缺失,然后將所述待測群體分為IKZF1基因正常組和IKZF1基因缺失組;之后按照前文所述(a1)再將所述待測群體分為CSRP2低表達組和CSRP2高表達組;(b2)按照如下標準確定來自于所述待測群體的待測者的預后風險:在所述IKZF1基因正常組中,來自于所述CSRP2低表達組中的待測者的預后風險高于或候選高于來自于所述CSRP2高表達組中的待測者;在所述IKZF1基因缺失組中,來自于所述CSRP2低表達組中的待測者的預后風險不高于或候選不高于來自于所述CSRP2高表達組中的待測者。所述“用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物”以及所述數據處理裝置1在制備用于B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險評估的產品或評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險中的應用也屬于本專利技術的保護范圍。所述“用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物”、所述“用于檢測IKZF1基因是否缺失的物質”以及所述數據處理裝置2在制備用于B系急性淋巴細胞白血病
    患者預后風險評估的產品或評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險中的應用也屬于本專利技術的保護范圍。在本專利技術中,所述預后風險為經過實施例1中相應治療后的預后風險。所述預后風險的高低具體可體現為如下指標中的全部或部分:總生存率(OS),無復發生存率(RFS)和無事件生存率(EFS)。若所述總生存率(OS)越低,和/或所述無復發生存率(RFS)越低,和/或所述無事件生存率(EFS)越低,則所述預后風險越高;若所述總生存率(OS)越高,和/或所述無復發生存率(RFS)越高,和/或所述無事件生存率(EFS)越高,則所述預后風險越低。所述產品中還可包含記載有如下內容中的全部或部分的可讀性載體:(1)采集待測者與健康對照者的骨髓標本,并測定其中所述mRNA的表達量,若所述待測者的骨髓標本中所述mRNA的表達量顯著高于健康對照者的骨髓標本中所述mRNA的表達量,則所述待測者為或候選為B系急性淋巴細胞白血病患者;反之,則所述待測者不為或候選不為B系急性淋巴細胞白血病患者。(2)所述CSRP2低表達組的pre-B-ALL比例顯著高于所述CSRP2高表達組。(3)所述CSRP2低表達組的IKZF1缺失陽性率顯著低于所述CSRP2高表達組。(4)MLL重排僅出現在所述CSRP2高表達組,而在所述CSRP2低表達組中未出現。(5)單因素分析,所述CSRP2低表達組的所述總生存率(OS)顯著低于所述CSRP2高表達組,但是所述CSRP2低表達組的所述無復發生存率(RFS本文檔來自技高網
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    【技術保護點】
    用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物在如下(A)或(B)中的應用:(A)制備用于B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險評估的產品;(B)評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險。

    【技術特征摘要】
    1.用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物在如下(A)或(B)中的應用:(A)制備用于B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險評估的產品;(B)評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險。2.用于評估B系急性淋巴細胞白血病患者預后風險的產品,含有用于檢測編碼CSRP2蛋白的mRNA的檢測物。3.根據權利要求2所述的產品,其特征在于:所述產品還包含數據處理裝置1;所述數據處理裝置1內設模塊1;所述模塊1具有如下(a1)和(a2)所示的功能:(a1)以由若干名未采取任何治療措施的B系急性淋巴細胞白血病患者組成的待測群體的離體骨髓為標本,測定每份標本中所述mRNA的表達量,然后按照所述mRNA的表達量由低到高的順序將所述待測群體進行排列并四等分,將表達量最低的1/4所述待測群體作為CSRP2低表達組,將其余3/4所述待測群體作為CSRP2高表達組;(a2)按照如下標準確定來自于所述待測群體的待測者的預后風險:來自于所述CSRP2低表達組中的待測者的預后風險高于或候選高于來自于所述CSRP2高表達組中的待測者。4.根據權利要求1-3中任一所述的應用或產品,其特征在于:所述檢測物選自如下:用于檢測所述mRNA的特異性擴增引物和/或探針。5.根據權利要求4所述的應用或產品,其特征在于:所述檢測物為由序列表中序列1和序列2所示的兩條單鏈DNA組成的引物對,和/或由序列表中序列3所示的單鏈探針。6.根據權利要求5所述的應用或產品,其特征在于:所述單鏈探針的5’端標記有熒光報告基團,3’端標記有熒光猝滅基團。7.根據權利要求2-6中任一所述的產品,其特征在于:所述產品中還含有用于檢測IKZF1基因是否缺失的物質。8.根據權利要求7所述的產品,其特征在于:所述產品還包含數據處理裝置2;所述數據處理裝置2內設模塊...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:阮國瑞劉開彥黃曉軍王樹娟王衛敏盧文藝馮永懷張加敏姚秋妹周嬌
    申請(專利權)人:北京大學人民醫院
    類型:發明
    國別省市:北京;11

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