用于乳膠分解的系統和方法技術方案

一種從乳膠回收珠粒支持體的方法包含：將表面活性劑水溶液供應到離心管中；在所述離心管中的所述表面活性劑溶液上供應疏水性液體，其中所述表面活性劑水溶液的體積與所述疏水性液體的體積的比值不大于0.5；以及在離心時在所述疏水性液體上施加乳膠，所述乳膠包括包含所述珠粒支持體的分散水相，所述乳膠分解且所述分散相的材料優先地分隔到所述表面活性劑溶液。

【技術實現步驟摘要】
【國外來華專利技術】相關申請案的交叉參考本申請要求2013年11月12日提交的美國臨時申請第61/902,897號的權益，所述申請以全文引用的方式并入本文中。本申請要求2014年2月20日提交的美國臨時申請第61/942,167號的權益，所述申請以全文引用的方式并入本文中。
本專利技術大體上涉及用于分解乳膠的系統和方法。
技術介紹
乳膠用于工業范圍，包含食物、生物科學和化學工業。確切地說，化學和生物科學工業利用乳膠來單離大量反應物。舉例來說，化學工業利用乳膠以用于乳液聚合，其中將少量單體溶液單離為分散相且隨后使其聚合。在生物科學中，確切地說在基因科學中，已經使用乳膠來將基因材料單離成分散體積，從而限制分散體積之間的交叉污染。在特定實例中，利用乳膠來單離包含待擴增的珠粒支持體和多核苷酸的體積。舉例來說，單離在較小體積中的多核苷酸與珠粒支持體、引子、各種核苷酸、酶類和其他輔因子一起可經受擴增條件，以促進形成并有擴增的多核苷酸或其補體的核酸珠粒。雖然理解擴增原理，但已證實此過程的工序或自動化是困難的。確切地說，形成乳膠的自動化具有挑戰性。此外，已證實在擴增之后使珠粒支持體從乳膠的回收自動化具有挑戰性。通常，經擴增多核苷酸的產物附著到的大部分珠粒支持體在分離珠粒支持體與乳膠期間失去。因此，結合到多核苷酸的珠粒支持體的得率減少。此類得率損失可不利地影響基因測試方法。
技術實現思路
在一實例中，一種從乳膠回收珠粒支持體的方法包含：將表面活性劑水溶液供應到離心管中；在離心管中的表面活性劑溶液上供應疏水性液體，其中表面活性劑水溶液的體積與疏水性液體的體積的比值不大于0.5；以及在離心時在疏水性液體上施加乳膠，所述乳膠包括包含珠粒支持體的分散水相，乳膠分解且所述分散相的材料優先地分隔到表面活性劑溶液。附圖說明通過參看附圖，可以更好地理解本專利技術，并且使所屬領域的技術人員清楚其眾多特征和優勢。圖1包含說明用于回收經擴增珠粒基質的示范性方法的框流程圖。圖2包含說明用于分解乳膠的示范性方法的框流程圖。圖3包含示范性離心管的圖示。圖4包含示范性離心轉子的圖示。圖5包含示范性離心管的圖示。圖6包含示范性分液器或分配器的圖示。圖7、圖8、圖9、圖10和圖11包含示范性離心裝置的圖示。在不同圖式中使用相同參考符號指示相似或相同的物件。具體實施方式在示范性實施例中，一種從乳膠回收珠粒支持體的方法包含將表面活性劑水溶液施加到離心管中。將疏水性液體施加在離心管中的表面活性劑溶液上方。在一實例中，表面活性劑水溶液的體積與疏水性液體的體積的比不大于1.0，如此不大于0.5。替代地，表面活性劑水溶液的初始體積與離心管的總體積的比不大于0.5，例如不大于0.2或不大于0.1。離心管可位于離心轉子內。在旋轉包含離心管的離心轉子時，可在疏水性液體上方施加乳膠。乳膠包含分散水相，所述分散水相包含珠粒支持體。在乳膠分解時，包含珠粒支持體的分散相的材料可以優先地分隔到表面活性劑溶液中。由此，珠粒支持體響應于離心力而朝向離心管的底部推動到表面活性劑水溶液中。表面活性劑水溶液可包含非離子表面活性劑或可包含陰離子表面活性劑。在一實例中，非離子表面活性劑包含聚乙二醇醚、烷基吡咯啶、烷基咪唑啶酮、烷基嗎啉、烷基咪唑、烷基咪唑啉或其組合。在另一實例中，非離子表面活性劑包含非離子氟表面活性劑。在又一實例中，陰離子表面活性劑包含硫酸鹽或磺酸鹽表面活性劑。在作為基因測試系統的部分經回收時，經回收珠粒支持體可施加到定序分析裝置且可執行定序分析。舉例來說，圖1包含如102處所說明的產生乳膠的示范性方法100的圖示。所述乳膠包含呈分散相的珠粒支持體和靶多核苷酸。舉例來說，反應物和輔因子以及珠粒支持體和靶多核苷酸可單離在較小體積的水溶液中作為分散相。珠粒支持體可以由聚合物形成。示范性聚合物包含丙烯酰胺、醋酸乙烯酯、羥烷基甲基丙烯酸酯、聚乙二醇、其衍生物或其任何組合。在一實例中，珠粒支持體包含其它物質可附著到的功能位點，所述其它物質例如寡核苷酸引子、點擊化學或粘合劑，例如生物素或抗生蛋白鏈菌素。確切地說，可以用具有經寡核苷酸改質的丙烯酸酯的AcryditeTM共聚單體形成珠粒支持體的聚合物。在另一實例中，聚合物珠粒支持體可包含可以與附著到(例如)蛋白或寡核苷酸的額外劑發生反應的胺基或羥基，所述額外劑例如鹵化物、胺、疊氮化合物、三聚氰酸、二異氰酸酯、雙NHS酯或其任何組合。在乳膠中，水相分布在疏水相中。在一實例中，疏水相可包含被氟化的液體、礦物油、硅油或其任何組合。視情況，疏水相可包含表面活性劑，例如非離子表面活性劑，例如下文所描述的非離子表面活性劑。所述乳膠可經受擴增條件，且其結果是可擴增靶多核苷酸且此擴增的產物可附著到珠粒支持體，從而形成模板珠粒支持體，如104處所說明。舉例來說，可使用聚合酶鏈反應(PCR)擴增靶多核苷酸。在另一實例中，可使用重組酶聚合酶擴增(RPA)(例如等溫RPA)來擴增靶多核苷酸。在擴增之后，可分解乳膠且洗滌經模板化的珠粒支持體，如106處所說明。舉例來說，可將乳膠連續地(例如以水流的方式)施加到安置在離心機的旋轉轉子上的離心管。離心管可包含表面活性劑水溶液和(任選地)安置在表面活性劑水溶液上的疏水性液體。在將乳膠施加到疏水性液體時，分散相被推動到疏水性液體與表面活性劑溶液之間的界面。在界面處，乳膠可分解，從而將與分散相相關聯的珠粒支持體推動到表面活性劑溶液中且朝向離心管的底部。在特定實例中，疏水性液體包含被氟化的液體、礦物油、硅油或其任何組合。疏水性液體可進一步包含表面活性劑，例如非離子表面活性劑。下文描述示范性非離子表面活性劑。確切地說，疏水性液體可與乳膠的連續相混溶。舉例來說，疏水性液體可具有與乳膠的連續相的組分相同或相似的組分。確切地說，乳膠在表面活性劑溶液與疏水性液體之間的界面處分解。由此，已經發現相對體積，且確切地說乳膠的分散相在其施加到疏水性液體上時行進的相關聯距離影響珠粒支持體從乳膠的得率。舉例來說，圖2中說明用于分解乳膠的方法200。方法200包含在離心管中提供表面活性劑水溶液，如202處所說明。在特定實例中，水溶液的初始體積在50pF到1mF范圍內，例如50pF到500pF范圍內、50pF到250pF范圍內，或甚至50pF到150μL范圍內。在一實例中，表面活性劑溶液可包含一或多種表面活性劑，所述一或多種表面活性劑的總濃度在0.01重量％到20重量％范圍內。舉例來說，表面活性劑可以0.1重量％到15.0重量％的范圍，例如0.5重量％到10.0重量％的范圍、0.5重量％到5.0重量％的范圍或甚至0.5重量％到3重量％的范圍包含于總量中。在另一實例中，表面活性劑可以5.0％到20.0％的范圍，例如10.0％到20.0％的范圍或12.0％到18.0％的范圍包含于總量中。表面活性劑可以是離子表面活性劑、兩性表面活性劑或非離子表面活性劑。離子表面活性劑可以是陰離子表面活性劑。示范性陰離子表面活性劑包含硫酸鹽表面活性劑、磺酸鹽表面活性劑、磷酸鹽表面活性劑、羧酸鹽表面活性劑或其任何組合。示范性硫酸鹽表面活性劑包含：烷基硫酸鹽，例如月桂基硫酸銨、月桂基硫酸鈉(十二烷基硫酸鈉(SDS))或其組合；烷基醚硫酸酯，例如月桂醇醚硫酸鈉、肉豆蔻醇醚硫酸鈉或其任何組合；或其任何本文檔來自技高網...

【技術保護點】
一種從乳膠回收珠粒支持體的方法，所述方法包括：將表面活性劑水溶液供應到離心管中；在所述離心管中的所述表面活性劑溶液上供應疏水性液體，其中所述表面活性劑水溶液的體積與所述疏水性液體的體積的比值不大于0.5且至少為0.01；以及在離心時在所述疏水性液體上施加乳膠，所述乳膠包括包含所述珠粒支持體的分散水相，所述乳膠分解且所述分散相的材料優先地分隔到所述表面活性劑溶液。

【技術特征摘要】
【國外來華專利技術】2013.11.12 US 61/902897;2014.02.20 US 61/9421671.一種從乳膠回收珠粒支持體的方法，所述方法包括：將表面活性劑水溶液供應到離心管中；在所述離心管中的所述表面活性劑溶液上供應疏水性液體，其中所述表面活性劑水溶液的體積與所述疏水性液體的體積的比值不大于0.5且至少為0.01；以及在離心時在所述疏水性液體上施加乳膠，所述乳膠包括包含所述珠粒支持體的分散水相，所述乳膠分解且所述分散相的材料優先地分隔到所述表面活性劑溶液。2.根據權利要求1所述的方法，其中所述比值不大于0.25。3.根據權利要求2所述的方法，其中所述比值不大于0.1。4.根據權利要求3所述的方法，其中所述比值不大于0.05。5.根據權利要求1到4中任一權利要求所述的方法，其中供應所述疏水性液體包含在離心時供應所述疏水性液體。6.根據權利要求1到5中任一權利要求所述的方法，其進一步包括制備包含所述分散相的所述乳膠，所述分散相包含所述珠粒支持體。7.根據權利要求6所述的方法，其進一步包括擴增靶多核苷酸以在所述珠粒支持體上產生經擴增多核苷酸。8.根據權利要求7所述的方法，其中擴增包含執行聚合酶鏈反應。9.根據權利要求7所述的方法，其中擴增包含執行重組酶聚合酶擴增。10.根據權利要求1到9中任一權利要求所述的方法，其進一步包括洗滌經分離珠粒支持體。11.根據權利要求10所述的方法，其進一步包括將所述經分離珠粒支持體施加到定序分析裝置。12.根據權利要求1到11中任一權利要求所述的方法，其中所述表面活性劑溶液包含總量在0.01％到20.0％范圍內的表面活性劑。13.根據權利要求1到12中任一權利要求所述的方法，其中所述表面活性劑溶液包含非離子表面活性劑。14.根據權利要求13所述的方法，其中所述非離子表面活性劑選自由以下各者組成的群組：聚乙二醇類表面活性劑、烷基吡咯啶表面活性劑、烷基咪唑啶酮表面活性劑、烷基嗎啉表面活性劑、烷基咪唑表面活性劑、烷基咪唑啉表面活性劑和其組合。15.根據權利要求14所述的方法，其中所述非離子表面活性劑包含烷基吡咯啶。16.根據權利要求1到15中任一權利要求所述的方法，其中所述表面...

【專利技術屬性】
技術研發人員：B里德，J鮑爾，
申請(專利權)人：生命科技公司，
類型：發明
國別省市：美國;US