本申請公開了用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑、檢測方法及應用。本申請用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑,包括引物對和探針,探針在引物對擴增靶標區域內,引物對上游引物為Seq?ID?No.1所示序列,下游引物為Seq?ID?No.2所示序列,探針為Seq?ID?No.3所示序列或Seq?ID?No.3所示序列的反向互補序列。本申請的H5N8禽流感病毒檢測試劑,對禽流感亞種H5N8具有很強特異性,能夠準確靈敏的從眾多禽流感病毒中特異性檢出H5N8。基于本申請試劑的H5N8禽流感病毒檢測方法,耗時短,可很快作出判定結果,對于控制流感流行,減少經濟損失,最大限度保護社會人群健康和生命具有很大意義。
【技術實現步驟摘要】
本申請涉及禽流感病毒檢測領域,特別是涉及一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑、檢測方法及應用。
技術介紹
禽流感是禽流行性感冒的簡稱,它是由甲型流感病毒的一種亞型(也稱禽流感病毒)引起的一種急性傳染病,也能感染人類,被國際獸疫局定為甲類傳染病。人感染后的癥狀主要表現為高熱、咳嗽、流涕、肌痛等,多數伴有嚴重的肺炎,嚴重者心、腎等多種臟器衰竭導致死亡,病死率很高,通常人感染禽流感死亡率約為33%。此病可通過消化道、呼吸道、皮膚損傷和眼結膜等多種途徑傳播。流感病毒屬正黏病毒科,由8條單股負鏈RNA構成基因組。流感病毒根據核心蛋白(NP)及基質(M)的抗原性不同,可分為A、B、C三型,其中致病性最強、在世界上流行最廣的是A型流感病毒。A型流感病毒根據表面糖蛋白凝血素(HA)的不同,可以分為15個亞型,H1-H15,根據表面糖蛋白神經氨酸酶(NA)的不同可以分為9個亞型N1-N9,因此理論上共有135種亞型組合。H5N8禽流感病毒是禽流感病毒的一種亞型。流感危害極大,變異極強,宿主范圍極廣,是傳播性極強的傳染病和人獸共患病,是WHO、FDA、OIE等國際組織聯合倡導全球共同防控的重大疫病。流感病毒有抗原漂移和抗原轉變的要求,變異性極大,不斷涌現新的病毒,近年來新型病毒出現的頻率明顯加大。1997年香港首次報道H5N1、H9N2感染人,2004年出現H5N1全球性流行,2013年3月在我國首先出現了H7N9型禽流感,2014年12月20日和2015年1月27新增83起人感染甲型H7N9禽流感病毒。H5N2禽流感在東亞多國──主要在越南、韓國、泰國──嚴重爆發,并造成越南多名病人喪生,中國河北省保定市首次發生H5N2禽流感疫情。2016年前后,廣東肇慶和深圳接連出現H5N6流感病例,深圳2例病例中,一人已經死亡。自2014年8月以來,中國境內廣東、湖南等12個省份家禽共發生新型H5N6高致病性禽流感25起,我國周邊日本、韓國、俄羅斯也均有H5N6發生流行,新出現的H5N6逐步代替H5N1而成為家禽和人群中的優勢流行毒株。2014年開始,H5N8開始在歐洲、亞洲和俄羅斯家禽中大規模流行,由于家禽與人的接觸關系密切,H5N8必然會傳染給人類。基于時效性和準確性上的優勢,實時熒光RT-PCR技術已經在疫病檢測的很多項目上逐步取代了一般RT-PCR方法,成為疫病檢測領域最常用的分子生物學方法。但是到目前為止,我國目前尚沒有比較有效的H5N8禽流感病毒的檢測試劑和方法的報道。
技術實現思路
本申請的目的是提供一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑、檢測方法及應用。本申請采用了以下技術方案:本申請的一方面公開了一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑,該試劑包括引物對和探針,探針在引物對的擴增靶標區域內,引物對的上游引物為SeqIDNo.1所示序列,引物對的下游引物為SeqIDNo.2所示序列,探針為SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互補序列;SeqIDNo.1:5’-CTGCACATAAATACCCAACYCTGTA-3’SeqIDNo.2:5’-TGAGGAATGTTCTTGTTATCCAAATGA-3’SeqIDNo.3:5’-CCACTGTATCCCGACCAATT-3’SeqIDNo.1所示序列中,Y為C或者T堿基。需要說明的是,SeqIDNo.1所示序列中Y為簡并堿基,其可以為C或者T堿基。本申請中,探針為SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互補序列,可以理解,在實時熒光檢測中,探針是特異性的結合到雙鏈的其中一條鏈的,只要PCR擴增的時候,將結合的探針破壞,即可產生熒光信號,因此,可以采用SeqIDNo.3所示序列的探針結合到其中一條鏈上,也可以采用SeqIDNo.3所示序列的反向互補序列作為探針結合到另一條鏈上。優選的,探針的5’端標記有HEX熒光基因,3’端標記有BHQ淬滅基團。本申請的另一面公開了本申請的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑在H5N8禽流感病毒檢測中的應用。本申請的另一面公開了本申請的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑在制備H5N8禽流感病毒檢測試劑盒或設備中的應用。可以理解,本申請的試劑,實際上就針對H5N8禽流感病毒設計的特異性探針和引物,當然可以用于H5N8禽流感病毒的檢測,或者用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑盒或設備。本申請的另一面公開了一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑盒,該試劑盒中含有本申請的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑。本申請的另一面公開了一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑盒,該試劑盒中含有至少一組混合試劑,每組混合試劑由12.5μL2×realtimePCRBuffer、1μL25×enzymemix、終濃度0.4μM/L的引物對和終濃度0.2μM/L的探針組成;引物對的上游引物為SeqIDNo.1所示序列,引物對的下游引物為SeqIDNo.2所示序列,探針為SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互補序列。需要說明的是,本申請的試劑實際上是針對H5N8禽流感病毒逆轉錄實時熒光PCR檢測而設計的,為了方便使用,本申請將反應體系中使用的buffer、酶、引物和探針統一配制成混合試劑,每一組混合試劑就是一個反應體系,直接向其中加入RNA樣品就可以進行檢測,使用簡單方便,不僅避免了配制反應體系的繁瑣步驟,而且避免了配制反應體系過程造成的污染。本申請的再一面還公開了一種H5N8禽流感病毒的逆轉錄實時熒光PCR檢測方法,包括以下步驟:(1)提取待測樣品的基因組RNA;(2)采用權利要求6所述的試劑盒,向所述混合試劑中加入步驟(1)提取的基因組RNA,配制成反應溶液;(3)將步驟(2)配制的反應溶液,在45℃反轉錄30min、95℃熱啟動10min,然后進入40個循環:95℃15s、60℃45s,在循環過程中于60℃時采集熒光。優選的,基因組RNA的提取采用RNA提取試劑盒,或者Trizol核酸抽提法。本申請的有益效果在于:本申請的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑,對禽流感亞種H5N8具有很強的特異性,能夠準確靈敏的從眾多禽流感病毒中特異性的檢測出H5N8,為新型H5N8禽病毒的檢測或監控提供了一種有效的方法和途徑。此外,基于本申請的試劑的H5N8禽流感病毒檢測方法,其耗時短,可以很快作出結果判定,這對于控制流感的流行,減少經濟損失,最大限度的保護全社會人群的健康和生命具有很大的意義。附圖說明圖1是本申請實施例中H5N8禽流感病毒逆轉錄實時熒光PCR檢測的特異性檢測結果;圖2是本申請實施例中H5N8禽流感病毒逆轉錄實時熒光PCR檢測的靈敏度檢測結果。具體實施方式下面通過具體實施例對本申請作進一步詳細說明。以下實施例僅對本申請進行進一步說明,不應理解為對本申請的限制。實施例一、反應體系的建立和優化利用人工合成的H5N8禽流感病毒的病毒質粒作為陽性標準品,其它供試樣本則利用商品化RNA提取試劑盒或Trizol核酸抽提試劑的提取方法提取病毒基因組RNA,分裝后置-20℃保存備用。其它供試樣本包括:H5N8滅活毒株、H5N1、H5N2、H9N2、新城疫病毒、雞傳染性支氣管炎病毒、豬流感經典型H1N1毒株、豬流感本文檔來自技高網...
【技術保護點】
一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑,其特征在于:所述試劑包括引物對和探針,所述探針在引物對的擴增靶標區域內,所述引物對的上游引物為Seq?ID?No.1所示序列,所述引物對的下游引物為Seq?ID?No.2所示序列,所述探針為Seq?ID?No.3所示序列或者Seq?ID?No.3所示序列的反向互補序列;Seq?ID?No.1:5’?CTGCACATAAATACCCAACYCTGTA?3’Seq?ID?No.2:5’?TGAGGAATGTTCTTGTTATCCAAATGA?3’Seq?ID?No.3:5’?CCACTGTATCCCGACCAATT?3’Seq?ID?No.1所示序列中,Y為C或者T堿基。
【技術特征摘要】
1.一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑,其特征在于:所述試劑包括引物對和探針,所述探針在引物對的擴增靶標區域內,所述引物對的上游引物為SeqIDNo.1所示序列,所述引物對的下游引物為SeqIDNo.2所示序列,所述探針為SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互補序列;SeqIDNo.1:5’-CTGCACATAAATACCCAACYCTGTA-3’SeqIDNo.2:5’-TGAGGAATGTTCTTGTTATCCAAATGA-3’SeqIDNo.3:5’-CCACTGTATCCCGACCAATT-3’SeqIDNo.1所示序列中,Y為C或者T堿基。2.根據權利要求1所述的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑,其特征在于:所述探針的5’端標記有HEX熒光基因,3’端標記有BHQ淬滅基團。3.根據權利要求1或2所述的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑在H5N8禽流感病毒檢測中的應用。4.根據權利要求1或2所述的用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑在制備H5N8禽流感病毒檢測試劑盒或設備中的應用。5.一種用于H5N8禽流感病毒檢測的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒中含有權利要求1或2所...
【專利技術屬性】
技術研發人員:秦智鋒,劉建利,唐金明,曾少靈,盧奕良,蔡良語,廖立珊,陳兵,馬嵐,孫潔,盧體康,陶虹,鄭曉聰,林慶燕,陳書琨,詹愛軍,蘭文升,曹琛福,王津津,
申請(專利權)人:深圳市檢驗檢疫科學研究院,深圳出入境檢驗檢疫局動植物檢驗檢疫技術中心,清華大學深圳研究生院,
類型:發明
國別省市:廣東;44
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