本發明專利技術的目的是提供一種MMRN1基因在制備檢測Axenfeld-Rieger綜合征診斷制品中的應用,本發明專利技術提供了MMRN1基因的新的用途,從而提供了一種有效的進行先天性Axenfeld-Rieger綜合征疾病基因診斷、產前基因篩查及遺傳咨詢的途徑,應用效果表明本發明專利技術所提供的基因的SNP位點及檢測引物可以有效的用于臨床患者及胎兒絨毛或羊水進行MMRN1基因突變位點的的快速檢測。
【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于基因診斷制品制備
,具體涉及一種檢測Axenfeld-Rieger綜合征的診斷制品。專利技術背景Axenfeld-Rieger綜合征是指雙眼發育性缺陷,伴有或不伴有全身發育異常的一組發育性疾病,其特點是:雙眼發育缺陷;可伴有全身發育異常;繼發性青光眼;常染色體顯性遺傳,多有家族史,也有散發病例的報道;男女發病相同。目前尚無有效的治療措施,手術預后差。Axenfeld-Rieger綜合征的臨床特點為:①角膜后胚胎環的存在:是本病的典型特征,其表現為Schwalbe線的增厚突出和前移。②虹膜角膜角異常:其主要的特點是粗大的組織條帶自周邊虹膜跨越房角隱窩,與突出的Schwalbe線相連接而房角是開放的,但虹膜根部附著高位,鞏膜嵴往往被掩蓋,虹膜根部附于小梁網后面。③虹膜異常:主要表現為虹膜變薄、失去正常紋理、色素上皮層外翻、瞳孔變形多瞳孔和瞳孔膜閉等。④可伴有全身異常:主要為牙齒和面部發育缺陷;如牙齒缺損小牙、無牙;面中部扁平、上頜骨發育不全此外還可有其他全身異常。⑤繼發性青光眼:50%以上的患者有繼發性青光眼,以兒童期和青年期發病多見,但也有在嬰幼兒期或中年期發病者。⑥雙眼發病:絕大多數是雙眼發病,極個別為單眼發病。⑦無性別差異。⑧本病有家族史。Axenfeld-Rieger綜合征的病因病理尚不清楚,目前世界上研究較少。國內外的遺傳學研究結果表明該病多為常染色體顯性遺傳,也有散發病例的報道。迄今為止,科學家們已經定位了3個Axenfeld-Rieger綜合征疾病基因的位點,并克隆出了2個致病基因(詳見表1)。表1:Axenfeld-Rieger綜合征致病基因定位及克隆情況致病基因染色體定位PITX24q25FOXC16p25.3?13q14但已知基因僅能解釋一小部分的患者的發病,這已經成為Axenfeld-Rieger綜合征的發病機制的研究以及針對病因的診斷和治療研究的瓶頸。這種現狀促使進一步去發現和了解該病新的致病基因,為后續的基因診斷、產前診斷及基因治療提供基礎。
技術實現思路
本專利技術的目的是提供一種檢測Axenfeld-Rieger綜合征的診斷制品,即從多聚蛋白1(MMRN1)上設計分子標記來檢測Axenfeld-Rieger綜合征,從而彌補現有技術的不足。申請人從一個4代呈常染色體顯性遺傳的Axenfeld-Rieger綜合征家系中,對該家系全部成員進行了全基因組連鎖分析,確定該家系的多聚蛋白1(MMRN1)存在遺傳上的致病突變,并在后續工作中驗證了MMRN1與Axenfeld-Rieger綜合征的關系,從而促成了本專利技術。本專利技術首先提供MMRN1基因新的用途,即在制備用于檢測Axenfeld-Rieger綜合征診斷制品中的應用;上述的診斷制品,作為實施例的優選,是檢測Axenfeld-Rieger綜合征的引物或探針。本專利技術還提供一種用于檢測Axenfeld-Rieger綜合征的引物對,所述的引物對的上下游引物序列為SEQ?ID?NO:1-24中,其引物信息如下:本專利技術還提供一種與Axenfeld-Rieger綜合征疾病相關的SNP位點為MMRN1基因編碼區域由起始密碼子起第1952位,其堿基為C或A;其中用于檢測上述SNP位點的引物信息如下:MMRN1-E6-2F:GCTTTTATCAACTGAACAGG?SEQ?ID?NO:13MMRN1-E6-2R:TTCCATATCGGAGGTACATT?SEQ?ID?NO:14。本專利技術還提供另外一種與Axenfeld-Rieger綜合征疾病相關的SNP位點為MMRN1基因編碼區域由起始密碼子起第1157位,其堿基為T或A;其中用于檢測上述SNP位點的引物信息如下:MMRN1-E6-1F:TGTTCTGCAAGTGATATCTC?SEQ?ID?NO:11MMRN1-E6-1R:GTACTCAGTGACATTATTGC?SEQ?ID?NO:12本專利技術還提供一種用于檢測Axenfeld-Rieger綜合征的試劑盒,包含有上述的引物對中的任一種或幾種。本專利技術提供了MMRN1基因的新的用途,從而提供了一種有效的進行Axenfeld-Rieger綜合征疾病基因診斷、產前基因篩查及遺傳咨詢的途徑,應用效果表明本專利技術所提供的基因的SNP位點及檢測引物可以有效的用于臨床患者及胎兒絨毛或羊水進行MMRN1基因突變位點的的快速檢測。附圖說明圖1:實施例1的Axenfeld-Rieger綜合征家系內患者及正常人MMRN1測序圖,其中A:患者;B:家系中正常人。該家系中五名患者MMRN1基因編碼區域由起始密碼子起第1952位發生了雜合突變,其堿基由C為突變為A。圖2:實施例2的Axenfeld-Rieger綜合征患者及其母親MMRN1測序圖,其中A:患者;B:母親。該患者MMRN1基因編碼區域由起始密碼子起第1157位發生了雜合突變,其堿基由T為突變為A。具體實施方式MMRN1基因位于Chr?4:90.8–90.88Mb,可轉錄成大約3687bp的mRNA(NCBI登錄號為NM_007351.2),直接翻譯形成1228個氨基酸組成的蛋白質。下面結合實施例對本專利技術進行詳細的描述。實施例1:從Axenfeld-Rieger綜合征家系中篩選MMRN1基因的突變位點1、提取外周血基因組DNA:在符合國家相關政策規定,并在取樣對象同意的基礎上,抽取第一個Axenfeld-Rieger綜合征家系成員外周靜脈血2-5ml,放入EDTA抗凝管內,-80℃凍存備用;凍存的EDTA抗凝血在室溫融化后,取500μL放于離心管,加入等體積TE(pH8.0),混勻,4℃,10000rpm離心10分鐘,棄上清。加入180μL?TE、20μLSDS(10%)、8μL蛋白酶K(l0mg/ml)混勻,置于37℃水浴過夜。從水浴中取出樣品,瞬時離心沉淀樣本。在反應管中加入等體積的Tris-飽和酚(約300μL),充分混勻,室溫下10000rpm離心10分鐘,吸取上清液(約300μL)至一新離心管中。重復酚抽提一次,吸取上清液至一新離心管中。加入等體積的Tris飽和酚:氯仿混合液(酚、氯仿各150μL),混勻,室溫10000rpm離心10分鐘,轉移上清液至一新離心管。加入等體積的Tris飽和酚:氯仿:異戊醇混合液(酚、氯仿、異戊醇各10本文檔來自技高網...
【技術保護點】
一種MMRN1基因的用途,其特征在于,所述的用途是制備用于檢測Axenfeld?Rieger綜合征診斷制品中的應用。
【技術特征摘要】
1.一種MMRN1基因的用途,其特征在于,所述的用途是制備用于檢測
Axenfeld-Rieger綜合征診斷制品中的應用。
2.如權利要求1所述的應用,其特征在于,所述的診斷制品為PCR檢測
引物或探針。
3.一種用于檢測Axenfeld-Rieger綜合征的引物對,其特征在于,所述的
引物對的信息如下:
4.一種用于檢測Axenfeld-Rieger綜合征的試劑盒,其特征在于,所述的試
劑盒包含有權利要求3所述的引物對中的任一種或幾種。
5.一種與Axenfeld-Rieger綜合征疾病相關的SNP位點,其特征在于,所
述的SNP位點...
【專利技術屬性】
技術研發人員:陳鵬,謝立信,孫大鵬,李素霞,張陽陽,
申請(專利權)人:山東省眼科研究所,
類型:發明
國別省市:山東;37
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