本發明專利技術涉及家畜育種技術領域，尤其涉及一種針對體尺性狀的分子選育方法及其應用。所述分子選育方法包括：同時采用生長形狀、繁殖性狀和體尺性狀評價豬的種用能力；所述體尺性狀包括體長和體高；生長性狀包括日齡、背膘厚，繁殖性狀包括總產仔數。本發明專利技術將體尺類性狀納入現有的種豬基因組選擇分子育種方案中，綜合體尺類性狀和生長、繁殖性狀的遺傳性評估結果，評價豬的種用能力，進而應用于種豬的育種中，得到一種評價豬的種用能力的選育方法，這對未來大體型種豬的選育具有重要意義。來大體型種豬的選育具有重要意義。
【技術實現步驟摘要】
一種針對體尺性狀的分子選育方法及其應用
[0001]本專利技術涉及家畜育種
，尤其涉及一種針對體尺性狀的分子選育方法及其應用。
技術介紹
[0002]目前在現有的種豬遺傳評估體系中，主要僅對校正日齡(達100kg體重日齡)、校正背膘厚(達100kg體重背膘厚)和總產仔數三個性狀進行評估和選擇。其中，對于母系豬品種大白豬和長白豬，同時針對三個性狀進行遺傳評估和選擇；對于父系豬品種杜洛克，僅針對校正日齡和校正背膘厚進行遺傳評估和選擇。然而，當前許多育種場的大白、長白和杜洛克，存在體型偏短、母豬乳頭偏少的體型問題，這些嚴重影響母豬的哺乳性能和商品豬的胴體產肉性能。近年來，基因組選擇分子育種技術已經逐步應用到生豬育種中，目前部分生豬育種企業已經將基因組選擇技術正式應用于主要目標性狀(校正日齡、校正背膘厚和總產仔數等)的分子選育中。基因組選擇提升了遺傳評估的準確性，可以實現種豬的早期選留，縮短了育種的世代間隔，加快了遺傳改良的速度和效率。
[0003]體尺性狀(主要包括體長、體高、胸圍、腹圍、管圍等)是一類重要的表型外貌類性狀，在目前的育種實踐中，體尺性狀常作為重要的輔助性狀對種豬的遺傳潛力和種用性能進行評價，而未直接納入到遺傳評估中。文獻研究表明，體尺性狀具有中等及以上的遺傳力，與生長性狀均具有中等的負遺傳相關，與繁殖性狀具有中等的正遺傳相關。因而對體尺性狀獨立地進行選擇會降低生長性狀的遺傳進展，不能單獨的追求體型高大的種豬。
技術實現思路
[0004]為了解決現有技術存在的問題，本專利技術的目的是提供一種針對體尺性狀的分子選育方法及其應用，通過同時對體尺性狀、生長和繁殖性狀進行遺傳評估，更加科學評估種豬的種用能力，有效提高種豬的綜合性能。
[0005]第一方面，本專利技術提供一種分子選育方法，包括：
[0006]同時采用生長形狀、繁殖性狀和體尺性狀評價豬的種用能力；
[0007]所述體尺性狀包括體長和體高。
[0008]進一步地，所述生長性狀包括日齡和/或背膘厚，所述繁殖性狀包括總產仔數。
[0009]進一步地，同時采用豬的日齡、背膘厚、總產仔數、體長和體高評價豬的種用能力；
[0010]所述豬的日齡、背膘厚、總產仔數、體長和體高的權重比為：30％：10％：30％：20％：10％。
[0011]進一步地，針對豬的日齡、背膘厚、總產仔數、體長和體高進行遺傳評估得到各性狀的基因組育種值，根據各性狀的基因組育種值和權重確定綜合育種指數。
[0012]進一步地，豬的日齡、背膘厚、體長和體高在進行遺傳評估前經過校正；
[0013]其中日齡的校正公式為：
[0014][0015]式中A1值對應公豬、母豬分別為50.775和46.415；和/或，
[0016]背膘厚的校正公式為：
[0017][0018]式中B1值對應公豬、母豬分別為
?
7.7277和
?
9.440；和/或，
[0019]體長的校正公式為：
[0020][0021]式中A2值對應公豬、母豬分別為1.2632和1.2518，B2值對應公豬、母豬分別為0.26133和0.2500；
[0022]體高的校正公式為：
[0023][0024]式中A2值對應公豬、母豬分別為1.1601和1.1964，B2值對應公豬、母豬分別為0.159和0.1953。
[0025]進一步地，針對豬的校正體長和校正體高，所述雙性狀一步法基因組選擇模型為：
[0026]BL/BH＝HYSS+litter+animal+error；
[0027]其中，BL為校正體長；BH為校正體高，HYSS為場年季和性別固定效應，litter為動物個體出生時所在窩的隨機效應；animal為動物個體的加性遺傳效應，error為隨機誤差。
[0028]進一步地，H為整合系譜和基因組信息的親緣關系矩陣，為群體內加性效應方差；litter為窩隨機效應，I為單位矩陣，為群體內窩效應方差；error為隨機誤差，I為單位矩陣，為群體內殘差方差。
[0029]進一步地，所述雙性狀一步法基因組選擇模型為：
[0030][0031]其中，y1和y2為達100kg體重體長和體高，μ1和μ2為兩個性狀總體均值，b1和b2為兩個性狀對應的場、年、季固定效應向量，X1和X2為固定效應對應的系數矩陣，a1和a2為兩個性狀的個體加性基因組育種值向量，Z1和Z2為加性育種值對應的系數矩陣，e1和e2為兩個性狀對應的隨機殘差向量；其中，且
[0032]H為整合系譜和基因組信息的親緣關系矩陣，和分別為體長和體高的加性遺傳方差；在一步法基因組選擇模型的混合模型方程組中，直接應用H矩陣的逆矩陣H
?1，計算方法如下：
[0033][0034]其中，A為基于系譜的所有個體的親緣關系矩陣，A
22
為有基因型個體的基于系譜的親緣關系矩陣，G為有基因型個體的基因組親緣關系矩陣；其中，α,β,w,和τ為H矩陣的調和參數。
[0035]進一步地，所述根據各性狀的育種值和權重確定綜合育種指數為通過如下公式實現：
[0036][0037][0038]其中，EBV
AGE
為達100kg體重日齡的估計基因組育種值，EBV
BF
為達100kg體重背膘厚的估計基因組育種值，EBV
TNB
為總產仔數的估計基因組育種值，EBV
BL
為達100kg體重體長的估計基因組育種值，EBV
BH
為達100kg體重體高的估計基因組育種值，σ
A(AGE)
為達100kg體重日齡的基因組育種值的標準差，σ
A(BF)
達100kg體重背膘厚的基因組育種值標準差，σ
A(TNB)
為總產仔數的基因組育種值標準差，σ
A(BL)
為達100kg體重體長的基因組育種值標準差，σ
A(BH)
達100kg體重體高的基因組育種值標準差，σ(I)是I的標準差。
[0039]進一步地，所述豬為大白豬或長白豬；優選為大白豬。
[0040]本專利技術進一步提供所述分子選育方法在種豬的遺傳評估、選種與選配中的應用。
[0041]本專利技術具備如下有益效果：
[0042]本專利技術將體尺性狀納入遺傳評價體系，得到一種新的分子選育方法，對體尺性狀進行選擇也能促進對繁殖性狀的遺傳改良，最大限度地提高母豬的生產性能。本專利技術提供的分子選育方法可以有效選擇具備較高種用能力的豬種，最大限度地提高母豬的生產性能。
具體實施方式
[0043]以下實施例用于說明本專利技術，但不用來限制本專利技術的范圍。
[0044]實施例1
[0045]本實施例在豬場中對于大白豬進行生長性能測定，同時測定種豬的體尺性狀，并且采集分娩大白母豬的總產仔數、產活仔數等繁殖數據。收集數據后對日齡、背膘本文檔來自技高網...
【技術保護點】
【技術特征摘要】
1.一種針對體尺性狀的分子選育方法，其特征在于，包括：同時采用生長形狀、繁殖性狀和體尺性狀評價豬的種用能力；所述體尺性狀包括體長和體高。2.根據權利要求1所述的分子選育方法，其特征在于，所述生長性狀包括日齡和/或背膘厚，所述繁殖性狀包括總產仔數。3.根據權利要求1或2所述的分子選育方法，其特征在于，同時采用豬的日齡、背膘厚、總產仔數、體長和體高評價豬的種用能力；所述豬的日齡、背膘厚、總產仔數、體長和體高的權重比為：30％：10％：30％：20％：10％。4.根據權利要求3所述的分子選育方法，其特征在于，包括：針對豬的日齡、背膘厚、總產仔數、體長和體高進行遺傳評估得到各性狀的基因組育種值，根據各性狀的基因組育種值和權重確定綜合育種指數。5.根據權利要求4所述的分子育種方法，其特征在于，豬的日齡、背膘厚、體長和體高在進行遺傳評估前經過校正；其中日齡的校正公式為：式中A1值對應公豬、母豬分別為50.775和46.415；和/或，背膘厚的校正公式為：式中B1值對應公豬、母豬分別為
?
7.7277和
?
9.440；和/或，體長的校正公式為：式中A2值對應公豬、母豬分別為1.2632和1.2518，B2值對應公豬、母豬分別為0.26133和0.2500；體高的校正公式為：式中A2值對應公豬、母豬分別為1.1601和1.1964，B2值對應公豬、母豬分別為0.159和0.1953。6.根據權利要求5所述的分子選育方法，其特征在于，針對豬的校正體長和校正體高進行遺傳評估為通過雙性狀一步法基因組選擇模型得到其基因組育種值；和/或，針對豬的校正日齡和校正背膘厚進行遺傳評估為分別通過雙性狀一步法基因組選擇模型得到其基因組育種值，和/或，針對總產仔數采用一步法基因組選擇重復力模型進行遺傳評估得到其基因組育種值。...
【專利技術屬性】
技術研發人員：馮文，楊華威，方鐸，劉劍鋒，周磊，趙祖凱，曾新斌，
申請(專利權)人：深圳市金新農科技股份有限公司，
類型：發明
國別省市：
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