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    一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法及其應(yīng)用技術(shù)

    技術(shù)編號(hào):36930791 閱讀:33 留言:0更新日期:2023-03-22 18:53
    本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)公開(kāi)了一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法及其應(yīng)用,包括,取樣本液,與A組分混合,其中,A組分包括Tris、EDTA和水;加入B組分,其中,B組分由不同粒徑的玻璃珠混合組成;置于漩渦混勻儀震蕩混勻后,在水浴鍋高溫將蛋白質(zhì)變性,得到核酸提取液;將核酸提取液冷卻至室溫后,獲得的細(xì)菌基因組DNA。本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)簡(jiǎn)便快速易操作、提取方法操作步驟少,操作簡(jiǎn)單,整個(gè)過(guò)程僅需要15分鐘就可以完成;提取通量高,樣品需求少:可以一次性提取多個(gè)樣本,樣本可以是培養(yǎng)皿的單菌落菌體或增菌液。皿的單菌落菌體或增菌液。皿的單菌落菌體或增菌液。

    【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
    一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法及其應(yīng)用


    [0001]本專(zhuān)利技術(shù)屬于體外診斷試劑領(lǐng)域,具體涉及到一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法及其應(yīng)用。

    技術(shù)介紹

    [0002]目前,在臨床或科研領(lǐng)域中常規(guī)核酸提取方法包括物理法、化學(xué)法、酶法以及上述方法的組合。物理法包括凍融、超聲、煮沸、研磨等。化學(xué)法為采用十二烷基硫酸鈉(SDS)、十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)、Trixon、螯合樹(shù)脂、吐溫20等裂解后進(jìn)行提取。酶法為采用蛋白酶K、植物蛋白酶、溶菌酶等裂解后進(jìn)行提取。
    [0003]文獻(xiàn)1(CN103820431A)和文獻(xiàn)2(CN104450684A)公開(kāi)了用磁珠法提取病毒或細(xì)菌中核酸的試劑盒及提取方法。該方法主要是通過(guò)裂解液將病毒或細(xì)菌破碎,破碎后通過(guò)磁珠吸附游離的核酸形成磁珠
    ?
    核酸復(fù)合物,并在配合磁場(chǎng)的作用下完成核酸的純化。該方法提取的核酸純度高、完整、可直接用于后續(xù)檢測(cè),但是存在核酸提取時(shí)間較長(zhǎng)、操作步驟復(fù)雜、成本昂貴,并在利用磁場(chǎng)
    ?
    磁珠反復(fù)純化核酸的過(guò)程中造成核酸流失等問(wèn)題。
    [0004]酶解法需要用酶來(lái)消化細(xì)胞壁肽聚糖成分,然后用溶劑抽提,如酚/氯仿。吸附DNA材料主要采用硅質(zhì)材料、陰離子交換樹(shù)脂及磁珠等。該方法試劑耗材價(jià)格昂貴,成本較高。且步驟多、費(fèi)時(shí),操作過(guò)程中易產(chǎn)生蛋白酶殘留,導(dǎo)致PCR反應(yīng)受到抑制,酚、氯仿等有機(jī)溶劑易造成環(huán)境污染,有損實(shí)驗(yàn)操作者的健康。
    [0005]不論是上述文獻(xiàn)中提到的磁珠法、酶解法的核酸提取方法,還是其他常規(guī)核酸提取方法均如凍融、超聲、煮沸、研磨等破除細(xì)菌的細(xì)胞壁,普遍存在步驟繁瑣、操作復(fù)雜、耗時(shí)長(zhǎng),嚴(yán)重減緩了檢測(cè)速度,價(jià)格昂貴、試劑保存條件苛刻,以及核酸提取物不能直接用于后續(xù)核酸擴(kuò)増,需要用特殊儀器等方面的限制。

    技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

    [0006]本部分的目的在于概述本專(zhuān)利技術(shù)的實(shí)施例的一些方面以及簡(jiǎn)要介紹一些較佳實(shí)施例。在本部分以及本申請(qǐng)的說(shuō)明書(shū)摘要和專(zhuān)利技術(shù)名稱(chēng)中可能會(huì)做些簡(jiǎn)化或省略以避免使本部分、說(shuō)明書(shū)摘要和專(zhuān)利技術(shù)名稱(chēng)的目的模糊,而這種簡(jiǎn)化或省略不能用于限制本專(zhuān)利技術(shù)的范圍。
    [0007]鑒于上述和/或現(xiàn)有技術(shù)中存在的問(wèn)題,提出了本專(zhuān)利技術(shù)。
    [0008]因此,本專(zhuān)利技術(shù)的目的是,克服現(xiàn)有技術(shù)中的不足,提供一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法。
    [0009]為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本專(zhuān)利技術(shù)提供了如下技術(shù)方案:一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法,包括,
    [0010]取樣本液,與A組分混合,其中,A組分包括Tris、EDTA和水;
    [0011]加入B組分,其中,B組分由不同粒徑的玻璃珠混合組成;
    [0012]置于漩渦混勻儀震蕩混勻后,在水浴鍋高溫將蛋白質(zhì)變性,得到核酸提取液;
    [0013]將核酸提取液冷卻至室溫后,獲得的細(xì)菌基因組DNA。
    [0014]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述方法的一種優(yōu)選方案,其中:A組分中,Tris的濃度為5~20mM,Tris的pH值為8.0~9.0,EDTA的濃度為1~5mM。
    [0015]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述方法的一種優(yōu)選方案,其中:所述B組分中,玻璃珠粒徑為300~600μm。
    [0016]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述方法的一種優(yōu)選方案,其中:所述震蕩混勻時(shí)間為8~15min。
    [0017]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述方法的一種優(yōu)選方案,其中:蛋白質(zhì)變性溫度為93~97℃。
    [0018]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述方法的一種優(yōu)選方案,其中:A組分為70~90μL,樣本液為10~20μL;
    [0019]B組分使用0.08
    ?
    0.12g;
    [0020]漩渦混勻儀轉(zhuǎn)數(shù)范圍為2000~3000rpm。
    [0021]水浴時(shí)間為5~10min。
    [0022]本專(zhuān)利技術(shù)的再一個(gè)目的是,克服現(xiàn)有技術(shù)中的不足,提供一種快速提取細(xì)菌基因組DNA的試劑盒。
    [0023]為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本專(zhuān)利技術(shù)提供了如下技術(shù)方案:一種快速提取細(xì)菌基因組DNA的試劑盒,包括A組分和B組分,其中,
    [0024]A組分為含有1~5mM的EDTA和5~20mM的Tris水溶液,且pH值為8.0~9.0;
    [0025]所述B組分為粒徑300~600μm的玻璃珠混合物;
    [0026]細(xì)菌基因組DNA用于LAMP擴(kuò)增。
    [0027]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述試劑盒的一種優(yōu)選方案,其中:所述試劑盒B組分使用0.08~0.12g;所述試劑盒在使用時(shí)先將細(xì)菌富集至10
    ?
    20μL。
    [0028]作為本專(zhuān)利技術(shù)所述試劑盒的一種優(yōu)選方案,其中:所述試劑盒在使用時(shí)轉(zhuǎn)數(shù)范圍為2000~3000rpm的漩渦混勻儀混勻8~15min,然后水浴或金屬浴加熱至93~97℃,加熱時(shí)間5~10min。
    [0029]本專(zhuān)利技術(shù)有益效果:
    [0030](1)簡(jiǎn)便快速易操作:提取方法操作步驟少,操作簡(jiǎn)單,整個(gè)過(guò)程僅需要15分鐘就可以完成。
    [0031](2)提取通量高,樣品需求少:可以一次性提取多個(gè)樣本,樣本可以是培養(yǎng)皿的單菌落菌體或增菌液。
    [0032](3)適用菌體范圍廣泛:采用不同粒徑的玻璃珠,可以適用不同直徑大的細(xì)菌,提取效果可靠、高效;成本低、安全可靠:不需要特殊儀器、昂貴試劑,無(wú)有毒有害物質(zhì),安全性高。
    附圖說(shuō)明
    [0033]為了更清楚地說(shuō)明本專(zhuān)利技術(shù)實(shí)施例的技術(shù)方案,下面將對(duì)實(shí)施例描述中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹,顯而易見(jiàn)地,下面描述中的附圖僅僅是本專(zhuān)利技術(shù)的一些實(shí)施例,對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來(lái)講,在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)性的前提下,還可以根據(jù)這些附圖獲得其它的附圖。其中:
    [0034]圖1為本專(zhuān)利技術(shù)實(shí)施例1中用試劑盒得到的測(cè)試結(jié)果圖,(a)是試劑盒I得到的測(cè)試結(jié)果,(b)是試劑盒Ⅱ得到的測(cè)試結(jié)果,(c)是試劑盒Ⅲ得到的測(cè)試結(jié)果。
    [0035]圖2為本專(zhuān)利技術(shù)實(shí)施例2中試劑盒Ⅳ得到的測(cè)試結(jié)果圖。
    [0036]圖3為本專(zhuān)利技術(shù)實(shí)施例4中用試劑盒得到的測(cè)試結(jié)果圖,(d)是試劑盒

    得到的測(cè)試結(jié)果,(e)是試劑盒

    得到的測(cè)試結(jié)果。
    具體實(shí)施方式
    [0037]為使本專(zhuān)利技術(shù)的上述目的、特征和優(yōu)點(diǎn)能夠更加明顯易懂,下面結(jié)合說(shuō)明書(shū)實(shí)施例對(duì)本專(zhuān)利技術(shù)的具體實(shí)施方式做詳細(xì)的說(shuō)明。
    [0038]在下面的描述中闡述了很多具體細(xì)節(jié)以便于充分理解本專(zhuān)利技術(shù),但是本專(zhuān)利技術(shù)還可以采用其他不同于在此描述的其它方式來(lái)實(shí)施,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以在不違背本專(zhuān)利技術(shù)內(nèi)涵的情況下做類(lèi)似推廣,因此本專(zhuān)利技術(shù)不受下面公開(kāi)的具體實(shí)施例的限制。
    [0039]其次,此處所稱(chēng)的“一個(gè)實(shí)施例”或“實(shí)施例”是指可包含于本專(zhuān)利技術(shù)至少一個(gè)實(shí)現(xiàn)方式中的特定特征、結(jié)構(gòu)或特性。在本說(shuō)明書(shū)中不同地方出現(xiàn)的“在一個(gè)實(shí)施例中”并非均指同一個(gè)實(shí)施例,也不是單獨(dú)的或選擇性的與其他實(shí)施例互相排斥的實(shí)施例。
    [0040]下述實(shí)施例中的實(shí)驗(yàn)方法,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)方法。下述實(shí)施例中所用的試驗(yàn)材料,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為自常規(guī)生化試劑商店購(gòu)買(mǎi)得到的試劑。
    [0041]銅綠假單胞桿菌本文檔來(lái)自技高網(wǎng)
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    【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】

    【技術(shù)特征摘要】
    1.一種提取細(xì)菌基因組DNA的方法,其特征在于:包括,取樣本液,與A組分混合,其中,A組分包括Tris、EDTA和水;加入B組分,其中,B組分由不同粒徑的玻璃珠混合組成;置于漩渦混勻儀震蕩混勻后,在水浴鍋高溫將蛋白質(zhì)變性,得到核酸提取液;將核酸提取液冷卻至室溫后,獲得的細(xì)菌基因組DNA。2.如權(quán)利要求1所述提取細(xì)菌基因組DNA的方法,其特征在于:A組分中,Tris的濃度為5~20mM,Tris的pH值為8.0~9.0,EDTA的濃度為1~5mM。3.如權(quán)利要求1或2所述提取細(xì)菌基因組DNA的方法,其特征在于:所述B組分中,玻璃珠粒徑為300~600μm。4.如權(quán)利要求3所述提取細(xì)菌基因組DNA的方法,其特征在于:所述震蕩混勻時(shí)間為8~15min。5.如權(quán)利要求1所述提取細(xì)菌基因組DNA的方法,其特征在于:蛋白質(zhì)變性溫度為93~97℃。6.如權(quán)利要求1所述提取細(xì)菌基因組DNA的方法,其特征在于:A組分為70~90μL,樣本液為1...

    【專(zhuān)利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:彭湖羅杰胡江陳芳鄧麗周澤波周庭波任戰(zhàn)濤張思宇陳漢柒
    申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人:貴州金玖生物技術(shù)有限公司
    類(lèi)型:發(fā)明
    國(guó)別省市:

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