本發(fā)明專利技術(shù)提供了一種用于EBER檢測(cè)的探針組及試劑盒,所述探針組包括選自核苷酸序列如SEQ ID NO:1
【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
一種用于EBER檢測(cè)的探針組及試劑盒
[0001]本專利技術(shù)屬于生物醫(yī)藥領(lǐng)域,尤其是涉及一種用于EBER檢測(cè)的探針組及試劑盒。
技術(shù)介紹
[0002]EB病毒編碼的小RNA包含EBER1和EBER2,EBER1的保守性高,幾乎不存在突變,較易根據(jù)EBER1的序列設(shè)計(jì)探針檢測(cè),而EBER2的保守性較低,易發(fā)生突變,根據(jù)EBER2的序列設(shè)計(jì)探針存在一定的難度,因此目前檢測(cè)該病毒的探針設(shè)計(jì)大多集中在EBER1的檢測(cè)上。同時(shí),探針長(zhǎng)度較短時(shí),敏感性更高,但特異性下降,容易發(fā)生非特異性雜交,對(duì)探針的具體序列設(shè)計(jì)要求較高,而探針長(zhǎng)度較長(zhǎng)時(shí),敏感性下降,特異性上升,不容易發(fā)生非特異雜交,對(duì)探針的設(shè)計(jì)要求較低,因此目前檢測(cè)該病毒的探針設(shè)計(jì)長(zhǎng)度較長(zhǎng),缺點(diǎn)是敏感性較低,對(duì)發(fā)生部分降解的小RNA不能完整結(jié)合,較易被洗脫掉,最終導(dǎo)致顯色較淺或者假陰性的結(jié)果。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
[0003]有鑒于此,本專利技術(shù)旨在提出一種用于EBER檢測(cè)的探針組及試劑盒,針對(duì)EBER1和EBER2同時(shí)設(shè)計(jì)探針,可同時(shí)檢測(cè)兩個(gè)小RNA,探針設(shè)計(jì)的長(zhǎng)度較短,增加探針檢測(cè)的敏感性且同時(shí)保證了特異性。
[0004]為達(dá)到上述目的,本專利技術(shù)的技術(shù)方案是這樣實(shí)現(xiàn)的:
[0005]一種用于EBER檢測(cè)的探針組,包括選自核苷酸序列如SEQ ID NO:1
?
8至少一種所示的EBER1探針及選自核苷酸序列如SEQ ID NO:9
?
15至少一種所示的EBER2探針。
[0006]進(jìn)一步地,所述EBER1探針及EBER2探針的3
’
端用地高辛標(biāo)記。
[0007]進(jìn)一步地,包括選自核苷酸序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8所示的EBER1探針及選自核苷酸序列如SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15所示的EBER2探針。
[0008]進(jìn)一步地,選自核苷酸序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8所示的EBER1探針及選自核苷酸序列如SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15所示的EBER2探針的摩爾比為8:12:5:15:15:5。
[0009]一種用于EBER檢測(cè)的試劑盒,包括如上任一所述的探針組。
[0010]進(jìn)一步地,還包括TE緩沖液、探針雜交緩沖液、胃酶工作液、PBS緩沖液、抗地高辛抗體、DAB工作液、去離子水。
[0011]使用本專利技術(shù)中試劑盒進(jìn)行檢測(cè)的方法及原理如下:
[0012]根據(jù)各核苷酸序列合成為單鏈DNA探針,3
’
端用地高辛標(biāo)記,將探針干粉與TE緩沖液充分溶解,溶解后的探針與探針雜交緩沖液混合稀釋,得到工作液;
[0013]工作液中的探針序列與組織中的EBER序列堿基互補(bǔ),在適當(dāng)?shù)臏囟燃皶r(shí)間下,探針穿過(guò)細(xì)胞核孔進(jìn)入細(xì)胞核,與EBER堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合,探針3
’
標(biāo)記的地高辛與HRP標(biāo)記抗地高辛抗體結(jié)合,最終HRP經(jīng)DAB工作液催化生成棕褐色沉淀物,可在光學(xué)顯微鏡下被觀察到。
[0014]進(jìn)一步地,探針干粉與TE緩沖液的用量比為2OD:1mL。
[0015]進(jìn)一步地,探針雜交緩沖液的制備方法如下:將去離子甲酰胺55mL、硫酸葡萄糖8g、20XSSC 8mL混合后,去離子水定容至100ml。
[0016]進(jìn)一步地,溶解后的探針與探針雜交緩沖液的體積比為6:100。
[0017]進(jìn)一步地,TE緩沖液的pH為8。
[0018]進(jìn)一步地,抗地高辛抗體為HRP標(biāo)記的。
[0019]進(jìn)一步地,工作液在手工檢測(cè)時(shí)每例用量為10ul;全自動(dòng)免疫組化儀(Ultra30/Ultra60)檢測(cè)時(shí)每例用量為150ul。
[0020]相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù),本專利技術(shù)所述的用于EBER檢測(cè)的探針組及試劑盒具有以下優(yōu)勢(shì):
[0021]本專利技術(shù)所述的用于EBER檢測(cè)的探針組及試劑盒使用了分別與EBER1和EBER2特異性結(jié)合的探針,可同時(shí)檢測(cè)兩個(gè)EB病毒編碼的小RNA,探針設(shè)計(jì)的長(zhǎng)度較短,增加探針檢測(cè)的敏感性且同時(shí)保證了特異性。
附圖說(shuō)明
[0022]構(gòu)成本專利技術(shù)的一部分的附圖用來(lái)提供對(duì)本專利技術(shù)的進(jìn)一步理解,本專利技術(shù)的示意性實(shí)施例及其說(shuō)明用于解釋本專利技術(shù),并不構(gòu)成對(duì)本專利技術(shù)的不當(dāng)限定。在附圖中:
[0023]圖1為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以手工方法檢測(cè)淋巴瘤EBER陽(yáng)性樣本100倍放大示意圖;
[0024]圖2為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以手工方法檢測(cè)淋巴瘤EBER陽(yáng)性樣本200倍放大示意圖;
[0025]圖3為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以手工方法檢測(cè)鼻咽癌樣本100倍放大示意圖;
[0026]圖4為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以手工方法檢測(cè)鼻咽癌樣本200倍放大示意圖;
[0027]圖5為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以手工方法檢測(cè)胃癌EBER陽(yáng)性樣本100倍放大示意圖;
[0028]圖6為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以手工方法檢測(cè)胃癌EBER陽(yáng)性樣本200倍放大示意圖;
[0029]圖7為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以全自動(dòng)免疫組化儀檢測(cè)淋巴瘤EBER陽(yáng)性樣本100倍放大示意圖;
[0030]圖8為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以全自動(dòng)免疫組化儀檢測(cè)淋巴瘤EBER陽(yáng)性樣本200倍放大示意圖;
[0031]圖9為本專利技術(shù)實(shí)施例6所述的探針組合以全自動(dòng)免疫組化儀檢測(cè)胃癌EBER陽(yáng)性樣本200倍放大示意圖。
具體實(shí)施方式
[0032]除有定義外,以下實(shí)施例中所用的技術(shù)術(shù)語(yǔ)具有與本專利技術(shù)所屬領(lǐng)域技術(shù)人員普遍理解的相同含義。以下實(shí)施例中所用的試驗(yàn)試劑,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)生化試劑;所述實(shí)驗(yàn)方法,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)方法。
[0033]下面結(jié)合實(shí)施例來(lái)詳細(xì)說(shuō)明本專利技術(shù)。
[0034]本實(shí)施例中使用的各探針設(shè)計(jì)信息信息如表1所示
[0035]表1探針設(shè)計(jì)信息
[0036][0037][0038]探針有效性驗(yàn)證實(shí)施例
[0039]本實(shí)施例中的實(shí)驗(yàn)方法包括以下步驟:
[0040]1、使用1ml PH8.0的TE緩沖液溶解每管2OD探針,作為探針儲(chǔ)存液;探將針儲(chǔ)存液與探針雜交緩沖液以1:100比例稀釋,作為工作液。
[0041]2、實(shí)驗(yàn)方法
[0042]2.1脫蠟
[0043]切片樣本經(jīng)新鮮二甲苯脫蠟(10分鐘
×
3)。脫蠟后的切片在新鮮100%乙醇中放置3分鐘,3缸。經(jīng)空氣干燥5
?
10分鐘即可進(jìn)行酶處理。
[0044]2.2酶處理
[0045]干燥后的切片根據(jù)組織大小,滴加80
?
100ul胃酶工作液,37℃孵育30分鐘。棄去胃
酶工作液后,逐級(jí)酒精脫水(75%、95%和100%),每個(gè)梯度放置2分鐘。空氣干燥后雜交。
[004本文檔來(lái)自技高網(wǎng)...
【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
【技術(shù)特征摘要】
1.一種用于EBER檢測(cè)的探針組,其特征在于:包括選自核苷酸序列如SEQ ID NO:1
?
8至少一種所示的EBER1探針及選自核苷酸序列如SEQ ID NO:9
?
15至少一種所示的EBER2探針。2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于EBER檢測(cè)的探針組,其特征在于:所述EBER1探針及EBER2探針的3
’
端用地高辛標(biāo)記。3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于EBER檢測(cè)的探針組,其特征在于:包括選自核苷酸序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8所示的EBER1探針及選自核苷酸序列如SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15所示的EBER2探針。4.根據(jù)權(quán)利要求3所...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:馬慧寧,呂佳,李舒然,竇凱佳,劉麗華,樊旭利,陳曦,劉勝南,朱玉潔,
申請(qǐng)(專利權(quán))人:北京中杉金橋生物技術(shù)有限公司,
類型:發(fā)明
國(guó)別省市:
還沒(méi)有人留言評(píng)論。發(fā)表了對(duì)其他瀏覽者有用的留言會(huì)獲得科技券。