【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
綠海龜丙肝病毒全基因組序列及其檢測方法
[0001]本專利技術(shù)涉及分子生物工程
，具體涉及一種綠海龜丙肝病毒的全基因組序列及其檢測方法。
技術(shù)介紹
[0002]綠海龜(Chelonia mydas)是海洋旗艦物種、傘護物種，一直以來被人們視為海洋生態(tài)系統(tǒng)的健康指示器。由于長期過度利用，綠海龜已成為瀕危物種，被列為國家一級重點保護野生動物。而近幾年，海南文昌、瓊海等地的養(yǎng)殖點不斷有綠海龜群體死亡現(xiàn)象發(fā)生，存活個體也會陸續(xù)發(fā)病死亡。病龜主要表現(xiàn)為厭食、精神萎靡、反應遲緩，經(jīng)剖檢發(fā)現(xiàn)病死綠海龜肝部出現(xiàn)了明顯病變。目前尚無綠海龜感染丙肝病毒的病例報道，若該病繼續(xù)傳播蔓延，經(jīng)由人類放生等行為傳播至野生綠海龜種群，將給海洋生態(tài)安全帶來極大威脅。
技術(shù)實現(xiàn)思路
[0003]本專利技術(shù)的第一目的在于提供一種綠海龜丙肝病毒的全基因組序列，以解決現(xiàn)目前對于綠海龜致死的丙肝病毒尚不明確的技術(shù)問題，從而達到保護海龜科動物，改善海洋生態(tài)的目的。
[0004]本專利技術(shù)的第二目的在于提供一種綠海龜丙肝病毒的檢測方法，以解決目前難以檢測該病毒的技術(shù)問題，從而起到對該綠海龜丙肝病毒進行提前預防的作用。
[0005]本專利技術(shù)提供了綠海龜丙肝病毒的全基因組序列，病毒全基因組序列全長為9430bp，GC含量為45％，此病毒基因組含有一個長的ORF，核苷酸位置在517
?
9048，該ORF編碼的前體多聚蛋白全長2843aa。綠海龜丙肝病毒全基因組序列、ORF序列及編碼蛋白氨基酸序列如SEQ ID N...
【技術(shù)保護點】
【技術(shù)特征摘要】
1.一種綠海龜丙型肝炎病毒的全基因組序列，其特征在于，該病毒全基因組序列如SEQ ID NO:1所示。2.如權(quán)利要求1所述的綠海龜丙肝病毒全基因組序列，其特征在于，該序列包含一個長的ORF，所述序列如SEQ ID NO:2所示。3.如權(quán)利要求2所述的綠海龜丙肝病毒全基因組序列，其特征在于，所述ORF編碼氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。4.一種用于擴增權(quán)利要求1所述綠海龜丙肝病毒全基因組序列的擴增引物，其特征在于，所述擴增引物序列如下：
5.一種檢測權(quán)利要求1所述綠海龜丙肝病毒的方法，其特征在于，使用權(quán)利要求4所述檢測引物進行PCR檢測。6.如權(quán)利要求5所述檢測方法，其特征在于，包括以下步驟：(1)提取疑似感染病毒的綠海龜病料組織RNA；(2)將步驟(1)終產(chǎn)物RNA進行cDNA第一鏈合成，用所述檢測引物進行普通定性RT
?
PCR擴增；(3)檢測，用1.5％瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物條帶，用2kb DNAm...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：吳山楠，周宏，史衛(wèi)峰，
申請(專利權(quán))人：海口海關(guān)技術(shù)中心，
類型：發(fā)明
國別省市：
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