一種制造技術(shù)

本發(fā)明專利技術(shù)公開了一種

【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
一種DNA甲基化生物標(biāo)志物組合及其在制備多發(fā)肺結(jié)節(jié)診斷或預(yù)后預(yù)測(cè)產(chǎn)品中的應(yīng)用


[0001]本專利技術(shù)屬于惡性腫瘤檢測(cè)領(lǐng)域，更具體地，涉及一種
DNA
甲基化生物標(biāo)志物組合及其在制備多發(fā)肺結(jié)節(jié)診斷或預(yù)后預(yù)測(cè)產(chǎn)品中的應(yīng)用
。

技術(shù)介紹

[0002]肺癌是全世界發(fā)病率和病死率最高的腫瘤，
2020
年中國(guó)因肺癌去世的患者達(dá)到了
118
萬，造成了嚴(yán)重的社會(huì)負(fù)擔(dān)
。
為了實(shí)現(xiàn)對(duì)肺癌患者的早診早治，以低劑量螺旋計(jì)算機(jī)斷層顯像為主要手段的肺癌篩查日益普及
。
在篩查過程中，大量的患者被發(fā)現(xiàn)存在多個(gè)疑似肺癌的肺部結(jié)節(jié)，這種疾病被統(tǒng)稱為“多發(fā)肺結(jié)節(jié)”，這類患者往往性別為女性且無吸煙史
。
目前，這類患者的診斷存在著巨大的爭(zhēng)議
。
[0003]在國(guó)內(nèi)外的肺癌診治指南中，肺癌治療措施的選擇高度依賴于準(zhǔn)確的臨床分期，對(duì)于臨床分期為早期或者可切除局部晚期的患者，優(yōu)先選擇包含手術(shù)在內(nèi)的綜合治療，而對(duì)于不可切除的局部晚期或者晚期患者，則優(yōu)先選擇靶向治療
、
免疫治療
、
放射治療等非手術(shù)治療
。
對(duì)于多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者而言，多個(gè)肺部的病灶既有可能是多個(gè)原發(fā)的肺癌病灶
(
即“多原發(fā)肺癌”)
，也有可能是肺癌在肺內(nèi)轉(zhuǎn)移而形成
(
即“肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌”)
，同一個(gè)患者被診斷為多原發(fā)肺癌或肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌時(shí)的臨床分期存在明顯差異，進(jìn)而會(huì)影響到其治療措施的選擇，最終影響患者的預(yù)后
。
因此，對(duì)多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者進(jìn)行明確診斷是當(dāng)務(wù)之急，然而，由于目前缺乏準(zhǔn)確的鑒別多原發(fā)肺癌和肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌的標(biāo)準(zhǔn)，這類患者無法進(jìn)行準(zhǔn)確的臨床分期，最終導(dǎo)致難以確定治療手段
。
[0004]同時(shí)，
DNA(
脫氧核糖核酸
)
甲基化作為一種生物標(biāo)志物在肺癌的診治中起到了重要的作用，構(gòu)成
DNA
堿基的胞嘧啶可以被甲基轉(zhuǎn)移酶修飾為五
?
甲基胞嘧啶，這一過程常發(fā)生于
CpG
島
(
胞嘧啶
?
鳥嘌呤磷酸二核苷酸島
)
，
CpG
島常可位于基因的啟動(dòng)子或基因的本體上，這些位點(diǎn)的甲基化可以影響基因的轉(zhuǎn)錄，進(jìn)而使得該基因的表達(dá)量上調(diào)或下降
。
在惡性腫瘤中，
DNA
甲基化起到了重要的調(diào)控作用，通過檢測(cè)某個(gè)基因上游區(qū)域或其本體的
DNA
甲基化可以反應(yīng)該基因一段時(shí)間內(nèi)受到調(diào)控的狀態(tài)，進(jìn)而反應(yīng)細(xì)胞的功能
。
目前，通過檢測(cè)患者來源的標(biāo)本
(
如手術(shù)標(biāo)本
、
體液等
)
對(duì)腫瘤進(jìn)行早期篩查或預(yù)測(cè)腫瘤患者的預(yù)后的產(chǎn)品愈發(fā)增多，但尚未有專門針對(duì)多發(fā)肺結(jié)節(jié)的診斷產(chǎn)品
。
[0005]現(xiàn)有技術(shù)中常用病理學(xué)標(biāo)準(zhǔn)或外顯子測(cè)序方法對(duì)多發(fā)肺結(jié)節(jié)進(jìn)行診斷，在病理學(xué)中，對(duì)于多發(fā)肺結(jié)節(jié)的診斷主要依賴于
M
?
M
標(biāo)準(zhǔn)
(M
?
M
為標(biāo)準(zhǔn)制定者
Martini
?
Melamed
姓名首字母縮寫
)
，該標(biāo)準(zhǔn)通過多個(gè)肺部病灶之間的病理類型是否一致
、
是否位于同一個(gè)肺葉
、
是否有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移等特征，將“多發(fā)肺結(jié)節(jié)”診斷為多原發(fā)肺癌或者肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌
。
外顯子測(cè)序方法通過檢測(cè)肺癌標(biāo)本的外顯子突變類型
、
位置
、
驅(qū)動(dòng)基因突變數(shù)量，將不同病灶之間存在共同的驅(qū)動(dòng)基因突變的診斷為肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌，將無共同驅(qū)動(dòng)基因突變的診斷為多原發(fā)肺癌
。
[0006]檢驗(yàn)效能方面，病理學(xué)標(biāo)準(zhǔn)檢驗(yàn)效能差，根據(jù)病理學(xué)標(biāo)準(zhǔn)區(qū)分的多原發(fā)肺癌和肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌的預(yù)后差異不明顯
。
外顯子測(cè)序?qū)Χ嘣l(fā)肺癌和肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌難以區(qū)分
。
腫瘤發(fā)生
過程中往往伴隨基因突變，肺癌標(biāo)本經(jīng)全外顯子測(cè)序后不僅可測(cè)出驅(qū)動(dòng)突變，也可測(cè)出大量的乘客突變，對(duì)于含有相同驅(qū)動(dòng)基因突變但乘客突變不同，或者多個(gè)驅(qū)動(dòng)突變中只有部分相同的多發(fā)肺結(jié)節(jié)，外顯子測(cè)序難以鑒別其為多原發(fā)肺癌或肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌，并且，根據(jù)有無共同驅(qū)動(dòng)基因診斷的多原發(fā)肺癌和肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌預(yù)后差異不明顯
。
費(fèi)用上，無論是全外顯子測(cè)序還是針對(duì)部分驅(qū)動(dòng)突變的外顯子測(cè)序，費(fèi)用均十分昂貴，對(duì)于經(jīng)濟(jì)狀況不佳的患者而言難以負(fù)擔(dān)
。
[0007]因此，亟需一種檢驗(yàn)費(fèi)用低
、
效能高，對(duì)多原發(fā)肺癌和肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌能夠明確區(qū)分，能夠更好地預(yù)測(cè)多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者預(yù)后的檢測(cè)技術(shù)及產(chǎn)品
。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

[0008]本專利技術(shù)的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)中存在的上述缺陷和不足，提供用于檢測(cè)染色體上
17
個(gè)區(qū)域的甲基化水平的制劑在構(gòu)建多發(fā)肺結(jié)節(jié)輔助診斷及預(yù)后預(yù)測(cè)的模型或系統(tǒng)中的應(yīng)用
。
[0009]本專利技術(shù)的第二個(gè)目的在于提供檢測(cè)所述
17
個(gè)區(qū)域的甲基化水平的制劑在制備多發(fā)肺結(jié)節(jié)診斷或預(yù)后預(yù)測(cè)產(chǎn)品中的應(yīng)用
。
[0010]本專利技術(shù)的上述目的是通過以下技術(shù)方案給予實(shí)現(xiàn)的：
[0011]本專利技術(shù)通過提供一種用于檢測(cè)染色體上
17
個(gè)區(qū)域的甲基化水平的制劑在構(gòu)建多發(fā)肺結(jié)節(jié)輔助診斷及預(yù)后預(yù)測(cè)的模型或系統(tǒng)中的應(yīng)用，所述
17
個(gè)區(qū)域?yàn)椋?br/>chr1(118993033
～
118993374)、chr1(118990273
～
118990373)、chr8(98948919
～
98949225)、chr5(141241734
～
141241834)、chr5(141343971
～
141344162)、chr14(36584386
～
36584486)、chr14(36583319
～
36583426)、chr22(50089842
～
50090523)、chr7(27144386
～
27144675)、chr7(27144681
～
27145462)、chr7(27144132
～
27144234)、chr7(27143708
～
27144112)、chr6(26271330
～
26271430)、chr6(26271214
～
26271327)、chr6(26271107
～
26271207)、chr6(10882680
～
10882932)、chr1(47433979
～
47434714)。
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【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】

【技術(shù)特征摘要】
1.
用于檢測(cè)染色體上
17
個(gè)區(qū)域的甲基化水平的制劑在構(gòu)建多發(fā)肺結(jié)節(jié)輔助診斷及預(yù)后預(yù)測(cè)的模型或系統(tǒng)中的應(yīng)用，其特征在于，所述
17
個(gè)區(qū)域?yàn)椋?br/> chr1(118993033
～
118993374)、chr1(118990273
～
118990373)、chr8(98948919
～
98949225)、chr5(141241734
～
141241834)、chr5(141343971
～
141344162)、chr14(36584386
～
36584486)、chr14(36583319
～
36583426)、chr22(50089842
～
50090523)、chr7(27144386
～
27144675)、chr7(27144681
～
27145462)、chr7(27144132
～
27144234)、chr7(27143708
～
27144112)、chr6(26271330
～
26271430)、chr6(26271214
～
26271327)、chr6(26271107
～
26271207)、chr6(10882680
～
10882932)、chr1(47433979
～
47434714)。2.
一種對(duì)多發(fā)肺結(jié)節(jié)進(jìn)行輔助診斷及預(yù)后預(yù)測(cè)的模型，其特征在于，所述模型通過檢測(cè)同一個(gè)多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者不同肺部病灶標(biāo)本中權(quán)利要求1中所述
17
個(gè)區(qū)域的甲基化水平，再根據(jù)該
17
個(gè)區(qū)域的甲基化水平對(duì)多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者進(jìn)行輔助診斷及預(yù)后預(yù)測(cè)：若一個(gè)病灶標(biāo)本中的
17
個(gè)區(qū)域中含有0～1個(gè)區(qū)域完全甲基化，則將該病灶標(biāo)本歸入多原發(fā)肺癌組；若一個(gè)病灶標(biāo)本中的
17
個(gè)區(qū)域中含有2～
17
個(gè)區(qū)域完全甲基化，則將該病灶標(biāo)本歸入肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌組；若該多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者的不同肺部病灶標(biāo)本均歸入多原發(fā)肺癌組，則將多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者診斷為多原發(fā)肺癌；若有一個(gè)或以上病灶標(biāo)本被歸入肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌組，則將多發(fā)肺結(jié)節(jié)患者診斷為肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌；若多發(fā)肺結(jié)節(jié)被歸為多原發(fā)肺癌，則認(rèn)為預(yù)后相對(duì)良好，若多發(fā)肺結(jié)節(jié)被歸為肺內(nèi)轉(zhuǎn)移癌，則認(rèn)為預(yù)后不佳
...

【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：王銘輝，許可，林華月，譚炳華，雷凱，梁佳祿，梁睿豪，何建群，鐘一鳴，
申請(qǐng)(專利權(quán))人：中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院，
類型：發(fā)明
國(guó)別省市：