一種鑒定蕭山雞品種的分子標記組合及其應用制造技術

本發明專利技術公開了一種鑒定蕭山雞品種的分子標記組合及其應用，屬于分子生物學檢測領域

【技術實現步驟摘要】
一種鑒定蕭山雞品種的分子標記組合及其應用


[0001]本專利技術涉及分子生物學檢測領域，特別是涉及一種鑒定蕭山雞品種的分子標記組合及其應用
。

技術介紹

[0002]蕭山雞又名“越雞”，原產地為浙江省蕭山縣，以瓜瀝
、
義蓬
、
坎山
、
靖江
、
城北等鄉鎮所產的雞種最佳，是我國優良的肉蛋兼用型地方雞種，羽毛
、
喙部及腳脛均呈金黃色，具有體型大
、
體態均勻
、
性格溫馴
、
肉質優良
、
屠體率高等特性，早期生長速度快
、
抗病力和適應性強
。
[0003]單核苷酸多態性
(single nucleotide polymorphism
，
SNP)
作為典型的第三代分子標記，是動植物中普遍存在的一種分子標記，存在于整個基因組，隨著測序技術的不斷發展和完善，研究人員可快速
、
準確獲得大量
SNP
位點
。
簡化基因組測序
(reduced
?
representation genome sequencing
，
RRGS)
是利用限制性內切酶對基因組進行酶切，通過對特定基因組區域進行測序來反映整個基因組序列的一種新型測序方法，能大幅降低物種基因組復雜程度和測序成本，快速鑒定高密度
SNP
位點，多用于遺傳變異檢測
、
高密度遺傳圖譜構建
、
重要性狀候選基因定位和群體遺傳進化分析
。
常用于動物基因組研究的簡化基因組測序技術主要有簡化代表文庫測序
(Reduced
?
Representation Libraries sequencing,RRLs)
和限制性酶切位點關聯
DNA
測序
(Restriction
?
site
?
Associated DNA sequencing,RAD
?
seq)。RAD
?
seq
技術是應用最早的簡化基因組測序技術，
RAD
測序文庫構建是對基因組
DNA
片段進行酶切和隨機打斷，選取一端帶有酶切位點，另一端為隨機打斷點的片段進行建庫測序
。
該技術能夠降低基因組的復雜度，操作簡便，同時不受參考基因組的限制，可快速鑒定出高密度的
SNP
，適用于樣本數量少，基因組較小的物種
。
但是目前用于蕭山雞評價的分子標記功能單一，難以評價蕭山雞遺傳多樣性，并且存在對純種鑒定方法不準確的問題，因此，基于簡化基因組測序針對蕭山雞進行單核苷酸多態性分子標記篩選具有重要意義
。

技術實現思路

[0004]本專利技術的目的是提供一種鑒定蕭山雞的分子標記組合及其應用，以解決上述現有技術存在的問題，通過篩選得到特異性
SNP
分子標記，該
SNP
分子標記可以緩解現有技術中由于缺少能夠評價蕭山雞遺傳多樣性的分子標記和現有純種鑒定方法不準確的問題
。
[0005]為實現上述目的，本專利技術提供了如下方案：
[0006]本專利技術提供一種鑒定蕭山雞品種的分子標記組合，所述分子標記組合的核苷酸序列包括如
SEQ ID NO.1
?
10
所示的序列，其中，
SEQ ID NO.1
?
10
所示分子標記組合存在以下
SNP1
?
SNP10
多態性位點：
[0007]所述
SNP1
為
SEQ ID NO.1
所示分子標記的
11bp
處存在
T/C
突變；
[0008]所述
SNP2
為
SEQ ID NO.2
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/G
突變；
[0009]所述
SNP3
為
SEQ ID NO.3
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/A
突變；
[0010]所述
SNP4
為
SEQ ID NO.4
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
T/C
突變；
[0011]所述
SNP5
為
SEQ ID NO.5
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
G/A
突變；
[0012]所述
SNP6
為
SEQ ID NO.6
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
A/G
突變；
[0013]所述
SNP7
為
SEQ ID NO.7
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變；
[0014]所述
SNP8
為
SEQ ID NO.8
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變；
[0015]所述
SNP9
為
SEQ ID NO.9
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變；
[0016]所述
SNP10
為
SEQ ID NO.10
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變
。
[0017]優選的是，所述
SNP1
的基因型為
CC、TT
或
TC
；所述
SNP2
的基因型為
CC、GG
或
GC
；所述
SNP3
的基因型為
CC、AA
或
AC
；所述
SNP4
的基因型為
TT、CC
或
TC
；所述
SNP5
的基因型為
AA、GG
或
GA
；所述
SNP6
的基因型為
AA、GG
或
AG
；所述
SNP7
的基因型為
CC、TT
或
TC
；所述
SNP8
的基因型為
CC、TT
或
TC
；所述
SNP9
的基因本文檔來自技高網...

【技術保護點】

【技術特征摘要】
1.
一種鑒定蕭山雞品種的分子標記組合，其特征在于，所述分子標記組合的核苷酸序列包括如
SEQ ID NO.1
?
10
所示的序列，其中，
SEQ ID NO.1
?
10
所示分子標記組合存在以下
SNP1
?
SNP10
多態性位點：所述
SNP1
為
SEQ ID NO.1
所示分子標記的
11bp
處存在
T/C
突變；所述
SNP2
為
SEQ ID NO.2
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/G
突變；所述
SNP3
為
SEQ ID NO.3
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/A
突變；所述
SNP4
為
SEQ ID NO.4
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
T/C
突變；所述
SNP5
為
SEQ ID NO.5
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
G/A
突變；所述
SNP6
為
SEQ ID NO.6
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
A/G
突變；所述
SNP7
為
SEQ ID NO.7
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變；所述
SNP8
為
SEQ ID NO.8
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變；所述
SNP9
為
SEQ ID NO.9
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變；所述
SNP10
為
SEQ ID NO.10
所示分子標記的
11bp
處堿基存在
C/T
突變
。2.
如權利要求1所述的分子標記組合，其特征在于，所述
SNP1
的基因型為
CC、TT
或
TC
；所述
SNP2
的基因型為
CC、GG
或
GC
；所述
SNP3
的基因型為
CC、AA
或
AC
；所述
SNP4
的基因型為
TT、CC
或
TC
；所述
SNP5
的基因型為
AA、GG
或
GA
；所述
SNP6
的基因型為
AA、GG
或
AG
；所述
SNP7
的基因型為
CC、TT
或
TC
；所述
SNP8
的基因型為<...

【專利技術屬性】
技術研發人員：蔣一秀，韓威，周成浩，李國輝，殷建玫，張會永，薛倩，朱云芬，
申請(專利權)人：江蘇省家禽科學研究所，
類型：發明
國別省市：