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【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)屬于分子生物學(xué)中的基因工程,具體為一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法及其應(yīng)用。
技術(shù)介紹
1、nrf2是一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,它與抗氧化應(yīng)激和細胞甚至整個生物體對環(huán)境的適應(yīng)性有關(guān),其在生命體的許多領(lǐng)域中都具有重要作用,如癌癥,心血管疾病,神經(jīng)退行性疾病和代謝性疾病等。nrf2是一個很重要的參與調(diào)節(jié)的基因,作為被廣泛研究的抗氧化基因之一,其功能與機體對于氧化應(yīng)激反應(yīng)和細胞防御緊密相關(guān),可以調(diào)節(jié)活性氧清除劑和抗炎分子的合成及其轉(zhuǎn)錄和翻譯后的表達。
2、目前許多研究已經(jīng)表明,nrf2在預(yù)防和治療心血管疾病、中風(fēng)和癌癥等方面具有積極的作用,其除了在除氧化應(yīng)激和毒性的物質(zhì),同時在癌細胞生長和分裂方面也發(fā)揮了重要作用。nrf2的活化可以誘導(dǎo)一系列抗癌基因的表達,如細胞周期調(diào)節(jié)基因、dna修復(fù)基因以及凋亡相關(guān)的基因等,降低腫瘤細胞增殖速度和遷移能力,并抵御肝癌、結(jié)直腸癌、肺癌、乳腺癌等多種癌癥。反之,nrf2基因的抑制則可能導(dǎo)致一部分原癌基因的表達,從而引起癌癥細胞的快速增殖和腫瘤惡化。
3、綜上,為了研究nrf2基因在癌癥細胞中的具體作用以及機制,可以對宿主細胞進行nrf2基因表達量的調(diào)整,從而研究這些調(diào)整對于腫瘤細胞的的增殖速度和遷移能力的影響,hepg2細胞屬于肝癌細胞,目前關(guān)于nrf2基因?qū)epg2細胞株影響的報道鮮有。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本專利技術(shù)的目的在于提供一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法及其應(yīng)用,以彌補現(xiàn)有nrf2基因?qū)?span style='display:none'>hepg2細胞株的影響研究的空缺。
2、本專利技術(shù)的目的可以通過以下技術(shù)方案實現(xiàn):
3、一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法,包括以下步驟:
4、步驟s1:nrf2基因的cds序列查找及三靶點設(shè)計,具體步驟如下:
5、在ncbi上查到nrf2基因的cds區(qū)域的序列,如seq?id?no.1所示,在所述nrf2基因的cds區(qū)域上設(shè)計三個感染靶點,如下所示:
6、nrf2-target1:agtttgggaggagctattatc
7、nrf2-target2:ccggcatttcactaaacacaa
8、nrf2-target3:gcaccttatatctcgaagttt;
9、步驟s2:三條shrna分別合成及慢病毒載體構(gòu)建,具體步驟如下:
10、將s1設(shè)計的三靶點,分別添加上載體上的酶切位點和loop環(huán)結(jié)構(gòu),分別合成六個引物:
11、nrf2-shrna1-fp:gatccagtttgggaggagctattatcctcgaggataatagctcctcccaaactttttg;
12、nrf2-shrna1-rp:aattccaaaaagtttgggaggagctattatcctcgaggataatagctcctcccaaact
13、nrf2-shrna2-fp:gatccccggcatttcactaaacacaactcgagttgtgtttagtgaaatgccgtttttg
14、nrf2-shrna2-rp:aattccaaaaacggcatttcactaaacacaactcgagttgtgtttagtgaaatgccgg
15、nrf2-shrna3-fp:gatccgcaccttatatctcgaagtttctcgagaaacttcgagatataaggtgctttttg
16、nrf2-shrna3-rp:aattccaaaaagcaccttatatctcgaagtttctcgagaaacttcgagatataaggtgc;
17、將上述六個合成引物分別兩兩配對進行退火反應(yīng),之后4℃儲存?zhèn)溆茫粚⒊樘岷玫母腥韭《究蛰d使用bamhi和ecori線性化之后膠回收用于后續(xù)的連接反應(yīng),配制好連接反應(yīng)體系后,室溫離心,于pcr儀上25℃恒溫連接15分鐘,連接完成之后,進行感受態(tài)轉(zhuǎn)化,最終挑取單克隆進行擴增,然后進行質(zhì)粒抽提之后測序,得到測序驗證正確的克隆擴大進行質(zhì)粒大抽,最終得到測序驗證正確的大抽慢病毒質(zhì)粒:
18、步驟s3:shrna慢病毒包裝及感染hepg2細胞,具體步驟如下:
19、將上述測序驗證正確的大抽慢病毒質(zhì)粒分別進行慢病毒包裝,之后進行滴度測定,最終得到慢病毒,將得到的慢病毒分別以moi為20感染hepg2細胞株;
20、步驟s4:藥物篩選及干擾穩(wěn)定細胞株的的構(gòu)建,具體步驟如下:
21、在上述慢病毒感染的hepg2細胞株在感染72h時,使用1ug/ml的嘌呤霉素進行藥物篩選,篩選72h后,對存活下來的細胞進行擴大培養(yǎng),分別得到構(gòu)建好的hepg2干擾細胞株;
22、步驟s5:qpcr檢測nrf2基因的干擾效率,具體步驟如下:
23、上述構(gòu)建好的hepg2干擾細胞株和野生型hepg2細胞株使用trizol方法進行rna提取之后,反轉(zhuǎn)錄成cdna之后進行qpcr檢測靶點的干擾效率即可。
24、進一步地,步驟s2中退火溫度為98℃,退火時間為10分鐘。
25、進一步地,本專利技術(shù)還提供了一種nrf2基因干擾hepg2細胞株,應(yīng)用于肝癌細胞的發(fā)病機制及治療方法的研究。
26、本專利技術(shù)的有益效果:
27、本專利技術(shù)提供了一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法及其應(yīng)用,通過nrf2基因靶點干擾靶點設(shè)計,shrna序列合成,載體構(gòu)建及抽提,慢病毒包裝,慢病毒感染hepg2細胞株,藥物篩選穩(wěn)定細胞株構(gòu)建及檢測等步驟制得一種nrf2基因干擾hepg2細胞株,此構(gòu)建好的細胞株中,nrf2基因的表達量相對于未做任何處理的野生型hepg2細胞株表達量明顯下調(diào),可以應(yīng)用于肝癌細胞的發(fā)病機制及治療方法的研究等領(lǐng)域。
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1.一種Nrf2基因干擾hepG2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,包括如下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種Nrf2基因干擾hepG2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,步驟S1中三個感染靶點,如下所示:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種Nrf2基因干擾hepG2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,步驟S2中六個引物,如下所示:
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種Nrf2基因干擾hepG2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,步驟S2中退火溫度為98℃,退火時間為10分鐘。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種Nrf2基因干擾hepG2細胞株的應(yīng)用,其特征在于,所述Nrf2基因干擾hepG2細胞株應(yīng)用于肝癌細胞的發(fā)病機制及治療方法的研究。
【技術(shù)特征摘要】
1.一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,包括如下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,步驟s1中三個感染靶點,如下所示:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種nrf2基因干擾hepg2細胞株的構(gòu)建方法,其特征在于,步驟s2中六個引物,...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:劉登輝,李雨晴,周金山,劉歡,
申請(專利權(quán))人:通用生物安徽股份有限公司,
類型:發(fā)明
國別省市:
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