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【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物工程,涉及一種用于檢測益生菌的引物組合物及應用,具體地說是用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物及應用。
技術介紹
1、動物雙岐桿菌乳亞種i797(以下簡稱i797)是一株安全性強、具有改善小兒腹瀉和消化不良功能的益生菌。隨著益生菌健康作用被消費者所熟知,各國研究機構和相關企業都在致力于益生菌菌種的創新,以深化對現有益生機制的理解并提高益生菌產品的功效。然而,益生菌菌株存在菌株特異性,不合理使用可能引發潛在的食品安全問題,如系統感染、有害代謝產物產生和免疫刺激作用。因此,益生菌菌株的精確鑒定對益生菌食品的品質和功能特性至關重要。
2、目前益生菌的鑒定主要分為培養法和分子生物學法。培養法主要是通過形態學、革蘭氏染色和生化測試進行鑒定,非常耗時且無法對同種的菌株之間進行區分。分子生物學方法主要包括16s?rdna、16s-23s?its基因序列測序方法、脈沖場凝膠電泳法(pulsedfield?gel?electrophoresis,pfge)和隨機擴增多態性dna分析(random?amplifiedpolymorphic?dna,rapd)等。然而,16srdna及16s-23s?its在辨別密切相關的物種和亞種方面存在局限性。脈沖場凝膠電泳法、隨機擴增多態性dna分析等dna指紋分型技術雖然可以用于在菌株水平上鑒定益生菌,但是這些dna指紋分型方法操作復雜,需要專業技能或先進的硬件和軟件,不適用于企業開展快速高效的益生菌株水平特異性鑒別。因此,建立一套高效的、可操作性強的菌株檢測方法迫在眉
3、公開號為cn?112063619?a的中國專利公開了一種快速、高靈敏性檢測和定量酸奶中動物雙歧桿菌bb-12的方法,該方法基于16s?rrna基因構建taqman-mgb探針,通過實時熒光定量pcr技術來檢測酸奶中動物雙歧桿菌bb-12。但該方法只針對16s?rrna基因,特異性差,并不能檢測出同為動物雙歧桿菌乳亞種之間的不同株系。
技術實現思路
1、本專利技術的目的,旨在要提供一種用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物及應用,以解決現有技術中存在的以上不足,達到定性定量地檢測樣品中i797的目的。
2、為了實現上述目的,本專利技術采用的技術方案是:
3、一種用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物,其包括上游引物和下游引物;
4、上游引物的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,下游引物的核苷酸序列如seq?idno.2所示;
5、seq?id?no.1:ggcgccttcgtcaacct;
6、seq?id?no.2:aggttgcgaatctgcgagat。
7、作為一種限定,該引物組合物包括探針,探針的核苷酸序列如seq?id?no.3所示,其中,探針的3′端連接有淬滅基團,5′端連接有熒光基團;
8、seq?id?no.3:atcgatggcctgctaca。
9、作為進一步限定,所述淬滅基團為bhq1,熒光基團為fam。
10、本專利技術還提供了上述用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物的應用,所述引物組合物用于定量檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797。
11、由于采用了上述技術方案,本專利技術與現有技術相比,所取得的技術進步在于:
12、①本專利技術提供的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物及應用,該引物組合物具有良好的特異性,能有效區別i797與其他18株雙歧桿菌菌株(其中包括6株動物雙歧桿菌乳亞種);
13、②本專利技術提供的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物及應用,該引物組合物靈敏度高,對i797菌株dna濃度和菌液濃度的檢出限分為為1.5pg和104cfu/ml;
14、③本專利技術提供的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物及應用,該引物組合物所針對的特異性位點在i797傳代40次過程中表現出較強的穩定性;重復性和重現性檢測結果的相對標準偏差分別小于2%和6%;
15、④本專利技術提供的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物及應用,不僅可以定性檢測出復合益生菌產品中是否含有i797,并且可以定量檢測出i797的菌含量。
16、本專利技術通過與其它22株動物雙歧桿菌乳亞種菌株進行全基因組測序-單核苷酸多態性(whole?genome?sequencing-single?nucleotide?polymorphism,wgs-snp)分析,確定了i797菌株位于k1717_01615基因上的一個特異性位點,根據該位點設計引物及探針,基于qpcr建立了i797菌株的量化分析方法,該引物組合物特異性好、靈敏度高、穩定性強,實現了復合益生菌產品中i797菌株的準確量化分析。
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1.一種用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物,其特征在于,其包括上游引物和下游引物;
2.根據權利要求1所述的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物,其特征在于,該引物組合物包括探針,探針的核苷酸序列:5′-?ATCGATGGCCTGCTACA?-3′;
3.根據權利要求2所述的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物,其特征在于,所述淬滅基團為BHQ1,熒光基團為FAM。
4.根據權利要求2或3所述的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物的應用,其特征在于,所述引物組合物用于定量檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797。
【技術特征摘要】
1.一種用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物,其特征在于,其包括上游引物和下游引物;
2.根據權利要求1所述的用于檢測動物雙歧桿菌乳亞種i797的引物組合物,其特征在于,該引物組合物包括探針,探針的核苷酸序列:5′-?atcgatggcctgctaca?-3′;
<...【專利技術屬性】
技術研發人員:張棟,趙磊,馮麗莉,劉洋,王世杰,張奕南,王新潮,薛玉玲,荀一萍,寧一冰,
申請(專利權)人:君樂寶乳業集團股份有限公司,
類型:發明
國別省市:
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