【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及陸地棉分子育種，涉及一種與陸地棉衣分qtl連鎖的分子標記及應用。
技術介紹
1、陸地棉(gossypium?hirsutum?l.)是最重要的經濟作物之一，是優質天然纖維的主要來源，占全球產量的90％以上。衣分是陸地棉重要的產量構成因子，也是育種上評價皮棉產量提高的指標。通過分子標記輔助育種技術提高陸地棉衣分，可以顯著提高育種效率，降低假陽性率，具有重要的理論價值和應用價值。
2、衣分是由多基因控制的數量性狀，但遺傳力較高。近年來，隨著測序技術的不斷發展，陸地棉參考基因組序列陸續釋放；qtl定位是一種有效的數量性狀研究策略，在陸地棉分子育種中得到了廣泛應用。目前，基于不同類型的作圖群體，利用高密度圖譜進行qtl定位，已經獲得了327個與衣分連鎖的qtl，在26條染色體上均有分布，其中利用陸地棉群體檢測到的qtl有270個。
3、鹽脅迫抑制陸地棉生長發育，并最終導致陸地棉減產。陸地棉是鹽堿地的先鋒作物，可以耐受7.7ds?m-1的鹽度，提供了開發利用鹽堿地的可能性。然而，17.0ds?m-1的鹽濃度可導致陸地棉減產50％。盡管已經鑒定到一些控制陸地棉衣分和耐鹽性的qtl，但是仍存在穩定性差，難以協同改良等問題，無法快速有效進行分子標記輔助選擇(mas)育種。為了促進陸地棉耐鹽及產量的協同改良，揭示陸地棉耐鹽性與產量的遺傳基礎，篩選能夠用于陸地棉分子改良的分子標記非常必要。
技術實現思路
1、針對現有技術中存在的不足，本專利技術目的是提供一種與陸地
2、為解決上述技術問題，本專利技術提供的技術方案是：
3、一種與陸地棉衣分qtl連鎖的分子標記，
4、所述陸地棉衣分qtl為：qlp-chr5-3；
5、所述qlp-chr5-3位于陸地棉第5號染色體上；
6、與所述qlp-chr5-3連鎖的分子標記包括：bin633、bin634、bin635、bin636、bin640、bin641；
7、當基因型為：gx1135時，所述bin633的側翼基因序列如seq?id?no.1所示；當基因型為：gx100-2時，所述bin633的側翼基因序列如seq?id?no.2所示；
8、當基因型為：gx1135時，所述bin634的側翼基因序列如seq?id?no.3所示；當基因型為：gx100-2時，所述bin634的側翼基因序列如seq?id?no.4所示；
9、當基因型為：gx1135時，所述bin635的側翼基因序列如seq?id?no.5所示；當基因型為：gx100-2時，所述bin635的側翼基因序列如seq?id?no.6所示；
10、當基因型為：gx1135時，所述bin636的側翼基因序列如seq?id?no.7所示；當基因型為：gx100-2時，所述bin636的側翼基因序列如seq?id?no.8所示；
11、當基因型為：gx1135時，所述bin640的側翼基因序列如seq?id?no.9所示；當基因型為：gx100-2時，所述bin640的側翼基因序列如seq?id?no.10所示；
12、當基因型為：gx1135時，所述bin641的側翼基因序列如seq?id?no.11所示；當基因型為：gx100-2時，所述bin641的側翼基因序列如seq?id?no.12所示。
13、上述的分子標記在陸地棉衣分標記輔助選擇中的應用。
14、上述的分子標記在陸地棉種質資源衣分的早期預測或篩選中的應用。
15、一種獲得權利要求1所述的與陸地棉衣分qtl連鎖的分子標記的方法，其包括以下步驟，
16、s1.利用欣雜1號(f1)衍生出重組自交系群體；
17、s2.利用gbs簡化基因組測序技術，獲得s1所述重組自交系群體及親本的基因型，檢測出在親本及重組自交系群體中具有多態性的snp及indel分子標記；同時，利用鑒定到的分子標記對親本進行基因分析；對篩選到的snp和indel標記去除重復，對篩選到的ssr標記去除重復及共分離；然后對處理后的snp、indel和ssr標記進行連鎖群排序，最終構建高密度遺傳圖譜；
18、s3.根據重組自交系群體在田間重復實驗的表型性狀，結合已構建好的高密度遺傳圖譜進行陸地棉衣分的qtl定位。
19、s1的具體為：
20、利用gx1135作為母本，gx100-2作為父本配置雜交種欣雜1號，利用單粒傳法進行重組自交系的培育，最終得到重組自交系群體；
21、所述母本gx1135為高衣分，父本gx100-2為低衣分。
22、本專利技術的有益效果是：
23、本專利技術提供的分子標記，能夠與陸地棉5號染色體上的衣分主效qtl緊密連鎖，可以穩定定位衣分主效qtl。存在該分子標記的材料，衣分高；為陸地棉衣分主效qtl定位和衣分相關基因的圖位克隆奠定了良好的基礎，能夠應用于分子標記輔助選育種和分子聚合育種，提高育種效率。
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1.一種與陸地棉衣分QTL連鎖的分子標記，其特征在于，
2.權利要求1所述的分子標記在陸地棉衣分標記輔助選擇中的應用。
3.權利要求1所述的分子標記在陸地棉種質資源衣分的早期預測或篩選中的應用。
【技術特征摘要】
1.一種與陸地棉衣分qtl連鎖的分子標記，其特征在于，
2.權利要求1所述的分子標記在陸地棉衣分標...
【專利技術屬性】
技術研發人員：華金平，郭安慧，李惠靜，崔亞南，李斌，杜肖琪，張靜柔，
申請(專利權)人：中國農業大學，
類型：發明
國別省市：
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