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    一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法技術

    技術編號:41880513 閱讀:17 留言:0更新日期:2024-07-02 00:34
    本發明專利技術公開了一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,屬于微流控細胞分選領域。首先設計用于識別并磁標記細胞膜小RNA的特異性DNA探針,結合微流控芯片分選出具有不同細胞膜RNA表型的細胞亞群。該方法中分選細胞亞群步驟包括:設計識別、磁標記細胞膜小RNA的特異性DNA探針和微流控芯片分選。該分選方法能夠針對細胞膜小RNA的表型,通過DNA探針雜交使細胞膜小RNA帶上磁珠,即不同細胞膜RNA表型的細胞結合有相應數量的磁珠,在相同外部磁場的作用下受到磁場力,結合流速線性變化的微流控芯片,實現不同表型細胞膜小RNA的細胞亞群的分選。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術涉及微流控細胞分選領域,具體涉及一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法。


    技術介紹

    1、small?rna(小rna)作為一種生命活動重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。近年來,研究發現不僅在細胞內,還在細胞膜上發現了相應的小rna,它們在細胞間交流、免疫調解、穩態等方面也具有重要的功能。

    2、使用下一代測序技術的小rna測序(srna-seq)是已知或未知小rna序型分析和發現的重要研究手段。但針對群體細胞的srna-seq只能獲得平均信息,細胞間具有異質性,無法研究不同細胞間細胞膜小rna表型的差異。細胞膜小rna的產生通常受到胞內基因的調控,無法揭示細胞轉錄組在細胞膜小rna形成過程中的作用。因此將具有不同表型細胞膜小rna的細胞分選為不同的亞群在進一步研究小rna的過程中是必要的。

    3、目前,依據目標物的表型進行細胞分選的微流控技術比較成熟,其中最常用的是熒光激活細胞分選技術,該方法通常是對細胞上的目標物進行熒光標記,在細胞流動過程中,不同熒光強度的細胞會受到不同的電場力,從而依據熒光強度的差異分選出目標物表型不同的細胞亞群。但是該技術存在以下問題:1)只能分選熒光強度大的細胞,當目標物的表型較低時,細胞受到的電場力小,無法對該類細胞實現高效分選;當不同細胞間的目標物表型差異較小時,細胞所表現的熒光強度差異較小,難以將其分為不同的亞群。另外,熒光激活細胞分選技術只能分選2-4個細胞亞群。2)在分選時,細胞會受到高電壓和高流速帶來的物理應力和細胞懸浮鞘液帶來的化學應力,對細胞造成不可逆的損傷。3)存在操作步驟繁瑣、靈敏度低、儀器昂貴等缺點。對此,2018年在發表在nature?chemistry上題為《single-cell?mrna?cytometry?via?sequence-specific?nanoparticle?clustering?andtrapping》的文章提出了一種技術,通過所設計的流速梯度變化的微流控芯片,對細胞內mrna進行特異性磁珠標記,在外部磁場的作用下完成細胞高效分選,提供了更易操作、更高效率微流控細胞分選平臺。由于細胞膜小rna與mrna本身在多個方面都存在差異,例如尺寸、定位、序列差異等,使得該方法無法對細胞膜小rna進行特異性磁標記,只能夠用于不同表型mrna細胞亞群的分選,無法用于細胞膜小rna的分選。


    技術實現思路

    1、為了克服上述現有技術的缺點,本專利技術的目的在于提供一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,用以解決現有微流控芯片結合外加磁場技術不適用于細胞膜小rna的分選的問題。

    2、本專利技術具體通過以下技術方案實現:

    3、本專利技術的第一個方面,公開了一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,用探針2識別細胞膜小rna,然后將特異性識別的細胞膜小rna與帶有探針1的鏈霉親和素磁珠雜交,再將完成雜交的細胞流入微流控芯片,實現不同區域對不同細胞表型亞群的分選;

    4、其中,所述探針1的5’端結合有生物素,3’端結合有熒光染料;所述探針2由5’端50個堿基的細胞膜小rna識別區、10個堿基的間隔區和3’端22個堿基用于雜交探針1區組成;所述微流控芯片的微流體通道寬度呈梯度變化。

    5、優選地,探針1的序列如seq?id?no.1所示。

    6、優選地,探針2的序列如seq?id?no.2所示。

    7、優選地,所述熒光染料為cy5或alex488。

    8、優選地,所述微流控芯片捕獲柱的高度為50μm。

    9、優選地,所述微流控芯片通過軟光刻技術制備得到。

    10、優選地,還包括探針3,所述探針3的5’端22個堿基雜交識別探針2,3’端20個堿基雜交探針1。

    11、進一步優選地,探針3的序列如seq?id?no.3所示。

    12、優選地,探針2和探針3的終濃度比為1:1。

    13、進一步優選地,探針2和探針3的終濃度均為1.5μm。

    14、與現有技術相比,本專利技術具有以下有益效果:

    15、本專利技術提供的一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,探針1的5’端結合有生物素,能夠快速且穩定地結合鏈霉親和素,3’端結合有熒光染料,能夠通過熒光強度得知磁珠數量。探針2的5’端的細胞膜小rna識別區域能夠特異性識別細胞膜小rna,10個堿基的間隔區能夠減少空間位阻,3’端用于雜交探針1的區域夠雜交細胞膜表面不同的小rna。微流控芯片的微流體通道寬度呈梯度變化,通過通道寬度的不斷增加,能夠保證分選過程中不同區域有不同的流速,進而使細胞受到不同的作用力,從而滿足捕獲和分選細胞的要求。該方法利用探針2使細胞膜小rna被識別,利用帶磁珠的探針1與被特異性識別的細胞膜小rna雜交,特異性磁標記細胞膜小rna,將其表型轉化為對應的磁場強度,在外加磁場的條件下結合流速線性變化的微流控芯片,實現對不同表型細胞膜小rna細胞亞群的分選,操作簡便,分選效果好,為揭示不同表型細胞膜小rna的產生和相應的調控機制提供了新方法。相較于目前常用的熒光激活分選技術,本方法巧妙運用微流控磁分選技術,通過對細胞膜小rna特異性磁標記,結合流速線性變化的微流控芯片,能夠平衡細胞受到的磁場力和流體作用的力,實現在通道窄流速快的區域捕獲表型高的細胞,在通道寬流速慢的區域捕獲表型低的細胞。通過設計的核酸探針之間的雜交,對細胞膜小rna進行磁珠標記,即在磁場的作用下能夠受到磁場力而被捕獲。該方法能夠分選表型差異較小的細胞亞群,也不會對細胞產生不可逆的損傷。

    16、進一步地,捕獲柱的高度為50μm,能夠滿足對細胞群體的捕獲,足夠容納近百個細胞。

    17、進一步地,探針3的5’端能與探針2雜交,3’端能與磁珠雜交,從而用于雜交識別探針和磁珠修飾探針,適用不同細胞的分選。

    本文檔來自技高網...

    【技術保護點】

    1.一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,用探針2識別細胞膜小RNA,然后將特異性識別的細胞膜小RNA與帶有探針1的鏈霉親和素磁珠雜交,再將完成雜交的細胞流入微流控芯片,實現不同區域對不同細胞表型亞群的分選;

    2.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針1的序列如SEQ?ID?NO.1所示。

    3.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針2的序列如SEQ?ID?NO.2所示。

    4.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,所述熒光染料為Cy5或Alex488。

    5.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,所述微流控芯片捕獲柱的高度為50μm。

    6.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,所述微流控芯片通過軟光刻技術制備得到。

    7.根據權利要求1~6任意一項所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,還包括探針3,所述探針3的5’端22個堿基雜交識別探針2,3’端20個堿基雜交探針1。

    8.根據權利要求7所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針3的序列如SEQ?ID?NO.3所示。

    9.根據權利要求7所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針2和探針3的終濃度比為1:1。

    10.根據權利要求9所述的一種基于細胞膜小RNA表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針2和探針3的終濃度均為1.5μM。

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    【技術特征摘要】

    1.一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,用探針2識別細胞膜小rna,然后將特異性識別的細胞膜小rna與帶有探針1的鏈霉親和素磁珠雜交,再將完成雜交的細胞流入微流控芯片,實現不同區域對不同細胞表型亞群的分選;

    2.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針1的序列如seq?id?no.1所示。

    3.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,探針2的序列如seq?id?no.2所示。

    4.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,所述熒光染料為cy5或alex488。

    5.根據權利要求1所述的一種基于細胞膜小rna表型的微流控細胞分選方法,其特征在于,所述微流控芯片捕獲...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:趙永席羅寧烽陳鋒
    申請(專利權)人:西安交通大學
    類型:發明
    國別省市:

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