【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)總體上涉及核酸化學(xué)和寡核苷酸的化學(xué)合成。更特別地，本專利技術(shù)涉及用于合成寡核苷酸的單體和方法，這些寡核苷酸包含至少一個包含3’-羥基基團的核苷。
技術(shù)介紹
1、經(jīng)修飾的寡核苷酸在分子生物學(xué)研究和治療應(yīng)用中具有重要價值。雖然經(jīng)修飾的寡核苷酸的化學(xué)合成是常規(guī)的，但許多經(jīng)修飾的寡核苷酸的容易性和產(chǎn)率低。例如，常用的保護基團對于為化學(xué)合成的寡核苷酸脫保護所采用的條件是不穩(wěn)定的。這在制備包含至少一個包含3’-羥基基團的核苷的寡核苷酸時尤其成問題。因此，本領(lǐng)域仍然需要用于制備此類寡核苷酸的單體和方法。本披露至少部分地解決了這種需要。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本披露提供了用于制備具有提高的產(chǎn)率和更低雜質(zhì)的寡核苷酸的單體和方法，其中寡核苷酸具有至少一個(例如兩個、三個、四個或更多)具有3’-羥基基團的核苷。通常，該方法包括將核苷或寡核苷酸上的游離羥基基團與具有三異丙基甲硅烷基醚(tips)保護的3’-羥基基團的核苷亞磷酰胺單體偶聯(lián)。偶聯(lián)形成亞磷酸三酯中間體，該中間體可被氧化或硫化以形成磷酸三酯或硫代磷酸酯中間體。
2、可以通過該方法制備具有預(yù)定長度和序列的寡核苷酸。例如，可以使用本文所述的方法和單體制備包含從約6至約50個核苷酸的寡核苷酸。在一些實施例中，該寡核苷酸包含從約10至約30個核苷酸。
3、在另一方面，本披露提供了單體，例如具有三異丙基甲硅烷基醚保護的3’-羥基基團的核苷亞磷酰胺單體。通常，該單體具有式(i)：
4、
5、在式(i)中，
6、在一些具有式(i)的單體中，b是腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶；r1是二甲氧基三苯甲基；r4、r5和r6是異丙基；并且r7是β-氰乙基。
本文檔來自技高網(wǎng)...【技術(shù)保護點】
1.一種具有式(I)結(jié)構(gòu)的核苷單體：
2.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中該羥基保護基團選自由以下組成的組：4,4’-二甲氧基三苯甲基(DMT)、單甲氧基三苯甲基(MMT)、9-芴基甲基碳酸酯(Fmoc)、鄰硝基苯基羰基、對苯基偶氮苯基羰基、苯基羰基、對氯苯基羰基和5′-(α-甲基-2-硝基胡椒基)氧基羰基(MeNPOC)。
3.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中每個R4獨立地是任選地被取代的C1-C6烷基。
4.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中每個R4是異丙基。
5.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中R5和R6獨立地是任選地被取代的C1-C6烷基。
6.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中R5和R6是異丙基。
7.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中R7是任選地被取代的C1-C6烷基。
8.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中R7是甲基或β-氰乙基。
9.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中B是腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶或尿嘧啶；R1是單甲氧基三苯甲基或二甲氧基三苯甲基；R4獨立地是任選地被取代的
10.如權(quán)利要求9所述的核苷單體，其中B是腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶；R1是二甲氧基三苯甲基；R4、R5和R6是異丙基；并且R7是β-氰乙基。
...【技術(shù)特征摘要】
1.一種具有式(i)結(jié)構(gòu)的核苷單體：
2.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中該羥基保護基團選自由以下組成的組：4,4’-二甲氧基三苯甲基(dmt)、單甲氧基三苯甲基(mmt)、9-芴基甲基碳酸酯(fmoc)、鄰硝基苯基羰基、對苯基偶氮苯基羰基、苯基羰基、對氯苯基羰基和5′-(α-甲基-2-硝基胡椒基)氧基羰基(menpoc)。
3.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中每個r4獨立地是任選地被取代的c1-c6烷基。
4.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中每個r4是異丙基。
5.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其中r5和r6獨立地是任選地被取代的c1-c6烷基。
6.如權(quán)利要求1所述的核苷單體，其...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：J·K·奈爾，J·C·薩利納斯，J·F·布里奧尼斯，M·K·施萊格爾，松田茂夫，A·V·凱爾因，張立剛，M·A·邁爾，
申請(專利權(quán))人：阿爾尼拉姆醫(yī)藥品有限公司，
類型：發(fā)明
國別省市：
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