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    一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法及系統(tǒng)技術(shù)方案

    技術(shù)編號(hào):43493972 閱讀:10 留言:0更新日期:2024-11-29 17:02
    本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)涉及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)領(lǐng)域,尤其是涉及一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法及系統(tǒng)。方法包括獲取海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù);基于獲取的點(diǎn)云數(shù)據(jù)構(gòu)建三維網(wǎng)格模型,并利用三維網(wǎng)格模型提取關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征;利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);基于訓(xùn)練好的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè)。本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)通過(guò)結(jié)合高精度三維建模和先進(jìn)的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)技術(shù),能夠捕捉海洋生物的精細(xì)三維結(jié)構(gòu)特征,顯著提高了分類(lèi)的準(zhǔn)確性。

    【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】

    本專(zhuān)利技術(shù)涉及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),尤其是涉及一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法及系統(tǒng)


    技術(shù)介紹

    1、海洋生物分類(lèi)對(duì)于海洋生態(tài)研究、資源管理和生物多樣性保護(hù)具有重要意義。然而,由于海洋生物種類(lèi)繁多、形態(tài)多樣,且部分生物難以獲取完整樣本,傳統(tǒng)的分類(lèi)方法面臨諸多挑戰(zhàn)。目前廣泛應(yīng)用的分類(lèi)技術(shù)包括形態(tài)學(xué)分類(lèi)法、dna條形碼技術(shù)和基于2d圖像的識(shí)別方法等。形態(tài)學(xué)分類(lèi)法雖然直觀(guān),但過(guò)度依賴(lài)專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn),主觀(guān)性強(qiáng),難以應(yīng)對(duì)形態(tài)相似的物種;dna條形碼技術(shù)雖然準(zhǔn)確度高,但成本較高,難以在大規(guī)模分類(lèi)中推廣應(yīng)用;基于2d圖像的識(shí)別方法雖然效率較高,但往往忽略了生物體的三維結(jié)構(gòu)信息,導(dǎo)致分類(lèi)準(zhǔn)確率受限。近年來(lái),三維建模技術(shù)在生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用日益廣泛,為捕捉生物體的立體結(jié)構(gòu)特征提供了新的可能。同時(shí),圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(gnn)在分類(lèi)任務(wù)中展現(xiàn)出了優(yōu)越的性能,特別是在處理具有復(fù)雜關(guān)系結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)時(shí)。然而,現(xiàn)有的海洋生物分類(lèi)方法仍存在諸多不足,主要表現(xiàn)在:未能充分利用海洋生物的三維結(jié)構(gòu)特征,缺乏對(duì)形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)信息的有效整合,以及分類(lèi)模型的泛化能力和可解釋性有待提高。鑒于此,開(kāi)發(fā)一種結(jié)合三維建模和gnn的新型海洋生物分類(lèi)方法具有重要的理論意義和應(yīng)用價(jià)值,有望突破現(xiàn)有技術(shù)的局限,提高海洋生物分類(lèi)的準(zhǔn)確性、效率和可擴(kuò)展性。


    技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

    1、為了解決上述提到的問(wèn)題,本專(zhuān)利技術(shù)提供一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法及系統(tǒng)。

    2、第一方面,本專(zhuān)利技術(shù)提供的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,采用如下的技術(shù)方案:

    3、一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,包括:

    4、獲取海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù);

    5、基于獲取的點(diǎn)云數(shù)據(jù)構(gòu)建三維網(wǎng)格模型,并利用三維網(wǎng)格模型提取關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征;

    6、利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);

    7、基于訓(xùn)練好的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè)。

    8、進(jìn)一步地,所述獲取海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù),包括采用水下3d激光掃描儀從多角度采集海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù),為確保數(shù)據(jù)質(zhì)量,使用迭代最近點(diǎn)icp算法對(duì)多角度點(diǎn)云進(jìn)行配準(zhǔn),每個(gè)采集的點(diǎn)表示為:

    9、

    10、其中,(xi,yi,zi)表示點(diǎn)的三維坐標(biāo),ii表示點(diǎn)的反射強(qiáng)度;

    11、最小化誤差函數(shù)表示為:

    12、

    13、其中,其中r為旋轉(zhuǎn)矩陣,t為平移向量,qi為目標(biāo)點(diǎn)云中的對(duì)應(yīng)點(diǎn)。

    14、進(jìn)一步地,所述基于獲取的點(diǎn)云數(shù)據(jù)構(gòu)建三維網(wǎng)格模型,包括應(yīng)用泊松表面重建算法生成初始網(wǎng)格模型m?=?(v,?f),v為頂點(diǎn)集,f為面片集,泊松表面重建通過(guò)求解偏微分方程得到的零等值面即為重建的表面,并利用拉普拉斯平滑優(yōu)化模型表面。

    15、進(jìn)一步地,所述利用三維網(wǎng)格模型提取關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征,包括通過(guò)計(jì)算模型表面的曲率信息,生成所需形狀索引和形狀描述符,利用形狀索引和形狀描述符與生物學(xué)數(shù)據(jù)融合,構(gòu)建綜合特征向量。

    16、進(jìn)一步地,所述利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),包括利用圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)綜合?圖結(jié)構(gòu),并訓(xùn)練分類(lèi)模型,其中,構(gòu)建相似度矩陣,基于相似度矩陣,使用k近鄰算法確定圖的邊集,利用圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)gcn完成訓(xùn)練,gcn的操作表示為:

    17、

    18、其中,為度矩陣,為鄰接矩陣,為第l層的節(jié)點(diǎn)特征,為可學(xué)習(xí)參數(shù),為relu激活函數(shù)。

    19、進(jìn)一步地,所述利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),還包括為提高模型的表達(dá)能力,引入多頭注意力機(jī)制優(yōu)化圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),具體表示為:

    20、

    21、

    22、其中k表示注意力頭的數(shù)量,ak和wk為可學(xué)習(xí)參數(shù);

    23、損失函數(shù)為:

    24、

    25、其中,為交叉熵?fù)p失,為l2正則化項(xiàng),用于防止模型過(guò)擬合的情況,為對(duì)比損失,用于增強(qiáng)特征的判別性;和為平衡系數(shù),通過(guò)交叉驗(yàn)證確定。

    26、進(jìn)一步地,所述基于訓(xùn)練好的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè),包括通過(guò)訓(xùn)練好的gnn模型進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè):

    27、

    28、評(píng)估預(yù)測(cè)的置信度:

    29、

    30、

    31、當(dāng)c?<?threshold1(threshold1=0.75)或entropy?>?threshold2(hreshold2=0.6)時(shí),觸發(fā)專(zhuān)家審核機(jī)制。

    32、第二方面,一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)系統(tǒng),包括:

    33、數(shù)據(jù)獲取模塊,被配置為,獲取海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù);

    34、三維構(gòu)建模塊,被配置為,基于獲取的點(diǎn)云數(shù)據(jù)構(gòu)建三維網(wǎng)格模型,并利用三維網(wǎng)格模型提取關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征;

    35、模型訓(xùn)練模塊,被配置為,利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);

    36、分類(lèi)預(yù)測(cè)模塊,被配置為,基于訓(xùn)練好的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè)。

    37、第三方面,本專(zhuān)利技術(shù)提供一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),其中存儲(chǔ)有多條指令,所述指令適于由終端設(shè)備的處理器加載并執(zhí)行所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法。

    38、第四方面,本專(zhuān)利技術(shù)提供一種終端設(shè)備,包括處理器和計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),處理器用于實(shí)現(xiàn)各指令;計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)用于存儲(chǔ)多條指令,所述指令適于由處理器加載并執(zhí)行所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法。

    39、綜上所述,本專(zhuān)利技術(shù)具有如下的有益技術(shù)效果:

    40、(1)提高分類(lèi)準(zhǔn)確性:?本專(zhuān)利技術(shù)通過(guò)結(jié)合高精度三維建模和先進(jìn)的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)技術(shù),能夠捕捉海洋生物的精細(xì)三維結(jié)構(gòu)特征,顯著提高了分類(lèi)的準(zhǔn)確性。相比傳統(tǒng)的2d圖像分類(lèi)方法,本專(zhuān)利技術(shù)可以更好地區(qū)分形態(tài)相似但三維結(jié)構(gòu)不同的物種,減少誤分類(lèi)的情況。

    41、(2)增強(qiáng)泛化能力:?采用gnn模型和多頭注意力機(jī)制,使得本專(zhuān)利技術(shù)在面對(duì)未知或罕見(jiàn)物種時(shí)具有更強(qiáng)的泛化能力。這一特性對(duì)于海洋生物多樣性研究和新物種發(fā)現(xiàn)具有重要意義。

    42、(3)提升分類(lèi)效率:?本專(zhuān)利技術(shù)實(shí)現(xiàn)了從數(shù)據(jù)采集到分類(lèi)預(yù)測(cè)的自動(dòng)化流程,大大提高了海洋生物分類(lèi)的效率。特別是在處理大規(guī)模樣本時(shí),相比傳統(tǒng)依賴(lài)專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn)的方法,可以顯著節(jié)省時(shí)間和人力成本。

    43、(4)整合多源信息:?通過(guò)融合三維形態(tài)學(xué)特征、dna序列信息和生態(tài)環(huán)境參數(shù),本專(zhuān)利技術(shù)提供了一個(gè)全面的分類(lèi)依據(jù)。這種多維度的信息整合有助于提高分類(lèi)的可靠性和科學(xué)性。

    本文檔來(lái)自技高網(wǎng)
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    【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】

    1.一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,包括:

    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述獲取海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù),包括采用水下3D激光掃描儀從多角度采集海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù),為確保數(shù)據(jù)質(zhì)量,使用迭代最近點(diǎn)ICP算法對(duì)多角度點(diǎn)云進(jìn)行配準(zhǔn),每個(gè)采集的點(diǎn)表示為:

    3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述基于獲取的點(diǎn)云數(shù)據(jù)構(gòu)建三維網(wǎng)格模型,包括應(yīng)用泊松表面重建算法生成初始網(wǎng)格模型M=?(V,?F),V為頂點(diǎn)集,F(xiàn)為面片集,泊松表面重建通過(guò)求解偏微分方程得到的零等值面即為重建的表面,并利用拉普拉斯平滑優(yōu)化模型表面。

    4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述利用三維網(wǎng)格模型提取關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征,包括通過(guò)計(jì)算模型表面的曲率信息,生成所需形狀索引和形狀描述符,利用形狀索引和形狀描述符與生物學(xué)數(shù)據(jù)融合,構(gòu)建綜合特征向量。

    5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),包括利用圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)綜合?圖結(jié)構(gòu),并訓(xùn)練分類(lèi)模型,其中,構(gòu)建相似度矩陣,基于相似度矩陣,使用k近鄰算法確定圖的邊集,利用圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)GCN完成訓(xùn)練,GCN的操作表示為:

    6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述利用提取的關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征訓(xùn)練圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),還包括為提高模型的表達(dá)能力,引入多頭注意力機(jī)制優(yōu)化圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),具體表示為:

    7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述基于訓(xùn)練好的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè),包括通過(guò)訓(xùn)練好的GNN模型進(jìn)行分類(lèi)預(yù)測(cè):

    8.一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)系統(tǒng),其特征在于,包括:

    9.一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),其中存儲(chǔ)有多條指令,其特征在于,所述指令適于由終端設(shè)備的處理器加載并執(zhí)行如權(quán)利要求1所述的方法。

    10.一種終端設(shè)備,包括處理器和計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),處理器用于實(shí)現(xiàn)各指令;計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)用于存儲(chǔ)多條指令,其特征在于,所述指令適于由處理器加載并執(zhí)行如權(quán)利要求1所述的方法。

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    【技術(shù)特征摘要】

    1.一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,包括:

    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述獲取海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù),包括采用水下3d激光掃描儀從多角度采集海洋生物的點(diǎn)云數(shù)據(jù),為確保數(shù)據(jù)質(zhì)量,使用迭代最近點(diǎn)icp算法對(duì)多角度點(diǎn)云進(jìn)行配準(zhǔn),每個(gè)采集的點(diǎn)表示為:

    3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述基于獲取的點(diǎn)云數(shù)據(jù)構(gòu)建三維網(wǎng)格模型,包括應(yīng)用泊松表面重建算法生成初始網(wǎng)格模型m=?(v,?f),v為頂點(diǎn)集,f為面片集,泊松表面重建通過(guò)求解偏微分方程得到的零等值面即為重建的表面,并利用拉普拉斯平滑優(yōu)化模型表面。

    4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述利用三維網(wǎng)格模型提取關(guān)鍵形態(tài)學(xué)特征,包括通過(guò)計(jì)算模型表面的曲率信息,生成所需形狀索引和形狀描述符,利用形狀索引和形狀描述符與生物學(xué)數(shù)據(jù)融合,構(gòu)建綜合特征向量。

    5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的海洋生物分類(lèi)方法,其特征在于,所述利用提取的關(guān)鍵...

    【專(zhuān)利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:蘇博由麗萍孫婧李淑君趙玉庭何健龍張娟李志林
    申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人:山東省海洋資源與環(huán)境研究院山東省海洋環(huán)境監(jiān)測(cè)中心山東省水產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)中心
    類(lèi)型:發(fā)明
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