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【技術實現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術涉及分子標記,尤其涉及藏綿羊ino80基因作為免疫性狀的遺傳標記及應用。
技術介紹
1、隨著養(yǎng)羊業(yè)的不斷發(fā)展,羊病的種類越來越多,復雜程度不斷加劇,控制也越來越困難。羊病對養(yǎng)羊生產(chǎn)的危害日趨嚴重,同時大量藥物的使用會使動物機體產(chǎn)生耐藥性,給畜產(chǎn)品的安全造成隱患。
2、長遠來看,從抗病力的遺傳基礎研究出發(fā),篩選抗性基因,從分子水平開展抗病育種,從遺傳上提高羊只對病原的抗性,增強免疫力是從根本上解決這一問題的重要途徑。藏綿羊長期生活在青藏高原地區(qū),環(huán)境惡劣,需要更高的抗病力來適應這種環(huán)境。因此,提高藏綿羊抗病力,才能使羊只對高海拔、低氣壓、強紫外線、缺氧和冷季營養(yǎng)脅迫等惡劣的自然環(huán)境具有更強的適應性。
3、免疫指標可以反映動物的抗病力。動物的抗病能力主要取決于其免疫系統(tǒng)的健康狀況和能力。免疫系統(tǒng)的主要功能是識別和消除侵入體內(nèi)的病原體,如細菌、病毒等。當病原體入侵時,免疫系統(tǒng)會迅速做出反應,啟動一系列的免疫反應過程,以對抗和清除病原體。
4、免疫球蛋白g(igg)與動物的抗病力密切相關。iga指的是免疫球蛋白a,在血清中的含量位居第二,僅次于lgg,具有抗感染的作用。igg和iga如果在體內(nèi)含量下降,就容易導致免疫功能低下。igg和iga如果在體內(nèi)含量上升,機體抗病能力就增強。而抗病力的增強可減少藥物的使用,降低生產(chǎn)成本,增加養(yǎng)殖效益。因此,篩選與藏綿羊免疫性狀相關聯(lián)的snp分子標記具有重要意義。而且免疫指標可以作為一個重要的參考,來評估動物的抗病能力和健康狀況。通過監(jiān)測免疫指標的變化,可
5、ino80是一種編碼蛋白質(zhì)的基因,在基因組中被稱為ino80基因。ino80基因編碼的蛋白質(zhì)是ino80復合物的一個重要組成部分。ino80復合物是一種高度保守的atpase驅(qū)動的染色質(zhì)重塑復合物,參與基因表達調(diào)控、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)維護和dna損傷修復等生物學過程。
6、ino80復合物通過atpase活性和其它次單位,參與染色質(zhì)的解旋、滑動和扭曲,從而調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄、dna修復和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的動態(tài)平衡。ino80復合物還與其他蛋白質(zhì)和復合物相互作用,形成復雜的調(diào)控網(wǎng)絡。現(xiàn)有技術中對ino80基因的研究,主要在原發(fā)性免疫缺陷病致病基因的檢測當中(cn201811585465.2),以及dna損傷修復過程中(https://baijiahao.baidu.com/s?id=1799193892331443005&wfr=spider&for=pc)。但目前還沒有建立有關ino80基因作為藏綿羊免疫性狀分子標記的檢測方法,同時該基因作為藏綿羊免疫性狀分子標記輔助選擇也未見應用。
7、因此,如何通過遺傳學和基因工程技術等手段,在藏綿羊育種中從基因?qū)用鎸ふ襥no80基因中的變異位點,通過其與性狀間的關聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)基因與性狀間的關系,進行早期選擇,從而提高選種效率和準確性,具有廣闊的應用價值。
技術實現(xiàn)思路
1、本專利技術的目的在于提供藏綿羊ino80基因作為免疫性狀的遺傳標記及應用。
2、為了實現(xiàn)上述專利技術目的,本專利技術提供以下技術方案:
3、本專利技術提供了一種與藏綿羊免疫性狀相關的ino80基因分子標記,所述分子標記位于國際綿羊基因組oar_v4.0版本第7號染色體上第29519205個堿基處,突變堿基為g或a。
4、優(yōu)選的,突變堿基為g的藏綿羊的基因型為gg或ga;
5、突變堿基為a的藏綿羊的基因型為aa;
6、所述aa基因型的藏綿羊個體的免疫球蛋白iga、igg顯著高于gg和ga基因型個體;
7、所述ga基因型的藏綿羊個體的免疫球蛋白iga、igg顯著高于gg基因型個體。
8、本專利技術還提供了所述的分子標記用于非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇中的應用。
9、本專利技術還提供了所述的分子標記在藏綿羊輔助育種中的應用。
10、本專利技術還提供了擴增所述分子標記的引物對,所述引物對如seq?id?no.2和3所示。
11、本專利技術還提供了所述的引物對在制備非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇產(chǎn)品中的應用。
12、本專利技術還提供了所述的引物對在制備藏綿羊輔助育種的產(chǎn)品中的應用。
13、本專利技術還提供了一種非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇的方法,包括如下步驟:
14、(1)提取藏綿羊基因組dna;
15、(2)以步驟(1)得到的藏綿羊基因組dna為模板,利用所述的引物對進行擴增,得到擴增產(chǎn)物;
16、(3)對所述的擴增產(chǎn)物進行基因型分析,得到不同基因型的藏綿羊;將藏綿羊的基因型與免疫指標關聯(lián);所述免疫指標包括iga和/或igg。
17、優(yōu)選的,步驟(2)所述的擴增的體系為:金牌mix(green)22μl,上、下游引物各1μl,模板dna?1μl;
18、步驟(2)所述的擴增的程序為:98℃2min;98℃10s,58℃10s,72℃10s,共40個循環(huán);72℃延伸2min。
19、本專利技術還提供了一種非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇和/或藏綿羊輔助育種的試劑盒,包括檢測所述的分子標記的試劑或所述的引物對。
20、與現(xiàn)有技術相比,本專利技術具有如下的有益效果:
21、本專利技術所述的snp分子標記位于國際綿羊參考基因組oar_v4.0版本第7號染色體上第29519205個堿基處;變異類型為g/a,命名為g29519205g>a,存在三個基因型,當所述的第7號染色體上第29519205個堿基為g時,基因型為gg或ga;當所述的第7號染色體上第29519205個堿基為a時,基因型為aa;通過不同基因型與免疫球蛋白iga、igg含量的關聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)所述aa基因型的藏綿羊個體的免疫球蛋白iga、igg顯著高于gg和ga基因型個體(p<0.05),ga基因型的藏綿羊個體的免疫球蛋白iga、igg顯著高于gg基因型個體(p<0.05)。
22、本專利技術通過檢測藏綿羊第7號染色體上第29519205個核苷酸位點的堿基,能夠判斷藏綿羊個體的免疫球蛋白iga、igg含量,本專利技術為用于非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇提供了新的snp分子標記資源。
本文檔來自技高網(wǎng)...【技術保護點】
1.一種與藏綿羊免疫性狀相關的INO80基因分子標記,其特征在于,所述分子標記位于國際綿羊基因組Oar_v4.0版本第7號染色體上第29519205個堿基處,突變堿基為G或A。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的分子標記,其特征在于,突變堿基為G的藏綿羊的基因型為GG或GA;
3.權(quán)利要求1或2所述的分子標記用于非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇中的應用。
4.權(quán)利要求1或2所述的分子標記在藏綿羊輔助育種中的應用。
5.擴增權(quán)利要求1或2所述分子標記的引物對,其特征在于,所述引物對如SEQ?ID?NO.2和3所示。
6.權(quán)利要求5所述的引物對在制備非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇產(chǎn)品中的應用。
7.權(quán)利要求5所述的引物對在制備藏綿羊輔助育種的產(chǎn)品中的應用。
8.一種非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇的方法,其特征在于,包括如下步驟:
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,步驟(2)所述的擴增的體系為:金牌Mix(green)22μL,上、下游引物各1μL,模板DNA?1μL;<
...【技術特征摘要】
1.一種與藏綿羊免疫性狀相關的ino80基因分子標記,其特征在于,所述分子標記位于國際綿羊基因組oar_v4.0版本第7號染色體上第29519205個堿基處,突變堿基為g或a。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的分子標記,其特征在于,突變堿基為g的藏綿羊的基因型為gg或ga;
3.權(quán)利要求1或2所述的分子標記用于非診斷目的的藏綿羊免疫性狀標記輔助選擇中的應用。
4.權(quán)利要求1或2所述的分子標記在藏綿羊輔助育種中的應用。
5.擴增權(quán)利要求1或2所述分子標記的引物對,其特征在于,所述引物對如seq?id?no.2和3所示。
6.權(quán)...
【專利技術屬性】
技術研發(fā)人員:袁超,盧曾奎,劉建斌,郭婷婷,安雪姣,
申請(專利權(quán))人:中國農(nóng)業(yè)科學院蘭州畜牧與獸藥研究所,
類型:發(fā)明
國別省市:
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