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    一種快速鑒定嗜鹽四聯(lián)球菌的篩選方法及其應(yīng)用技術(shù)

    技術(shù)編號:43674383 閱讀:15 留言:0更新日期:2024-12-18 20:58
    本申請?zhí)峁┝艘环N快速鑒定嗜鹽四聯(lián)球菌的篩選方法及其應(yīng)用,屬于微生物技術(shù)領(lǐng)域。本申請實現(xiàn)對嗜鹽四聯(lián)球菌的特異性篩選鑒定,無需對菌株進行基因組提取和上機測序,提升了篩選的效率,降低了篩選成本;基于對生物胺生成關(guān)鍵酶的特異性基因擴增進行不產(chǎn)生物胺菌株的篩選,進一步提升了篩選效率,實現(xiàn)了對工業(yè)優(yōu)良性狀嗜鹽四聯(lián)球菌菌株的高效篩選。采用本申請的方法可以同時進行嗜鹽四聯(lián)球菌的鑒定和不產(chǎn)生組胺、酪胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的篩選,并實現(xiàn)了高通量檢測,有效降低了基因提取、測序的人工成本和時間成本,解決了傳統(tǒng)發(fā)酵食品性能和質(zhì)量不穩(wěn)定性的問題。

    【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】

    本申請涉及微生物,尤其是一種快速鑒定嗜鹽四聯(lián)球菌的篩選方法及其應(yīng)用


    技術(shù)介紹

    1、嗜鹽四聯(lián)球菌是一類廣泛存在于醬油,魚露等發(fā)酵產(chǎn)品中具有耐鹽,耐高滲透壓特性的中度耐鹽乳酸菌,其能夠有效提高發(fā)酵產(chǎn)品質(zhì)量并縮短發(fā)酵周期,是一種重要的發(fā)酵菌株。已有研究表明嗜鹽四聯(lián)球菌可以提高發(fā)酵產(chǎn)品中有機酸、醛類、酯類、氨基酸等多種風味物質(zhì)的含量,給醬油,魚露等調(diào)味料提供了柔和豐富的滋味。

    2、然而,嗜鹽四聯(lián)球菌的某些菌株會降解特定的氨基酸,如組氨酸、酪氨酸、精氨酸、絲氨酸、蘇氨酸、苯丙氨酸等,氨基酸降解會導(dǎo)致醬油氨基酸指標的減低,從而對醬油的風味口感帶來不利影響。盡管這些氨基酸的降解途徑尚未完全闡明,但其中一些通過脫羧反應(yīng)變成了脫羧物質(zhì)。醬醪的天然發(fā)酵環(huán)境中含有豐富的乳酸菌組成,既有產(chǎn)生優(yōu)良性狀的菌株也有帶來不良代謝物的菌株,因其菌株代謝的不確定性對醬油等發(fā)酵產(chǎn)品性能的穩(wěn)定性造成了影響。而在醬醪體系中人工干預(yù)強化具有優(yōu)良性狀的菌株為嗜鹽四聯(lián)球菌,能夠抑制不良菌株的生長進而減少不良代謝物的產(chǎn)生。為了獲得具有穩(wěn)定優(yōu)良特性的發(fā)酵產(chǎn)品,防止氨基酸降解等不良代謝物的積累,強化不能代謝氨基酸等的嗜鹽四聯(lián)球菌菌株正在被推廣。

    3、因此,迫切需要篩選具有優(yōu)良性狀的工業(yè)用嗜鹽四聯(lián)球菌菌株。在對篩選所得菌種進行種屬鑒定的方法中最常用的是基因型鑒定,即通過微生物高度保守的核酸序列來進行分離和鑒定,包括細菌的16s?rrna基因序列分析和真菌的18s?rrna基因序列分析以及its區(qū)域序列分析等。基因型鑒定是通過特異性引物對擴增高度保守的核酸序列,并利用多種高通量測序平臺對擴增序列測序后通過生物信息學工具進行序列比對分析等,揭示微生物菌種的親緣關(guān)系。該方法發(fā)展較為成熟,但擴增子測序需要花費一定時間,所得序列的在線比對分析同樣耗時耗力,且只能獲取種屬分類信息。另一方面,隨著測序技術(shù)的發(fā)展,通過微生物的全基因組測序比對,不僅用于分類鑒定還可以更全面的獲取微生物的遺傳信息,如是否攜帶一些特定的基因等。但全基因組測序需要先提取菌株全基因組序列,送檢上機時間長,價格昂貴,且對于其他種屬菌株的額外檢測也增加了不必要的成本。

    4、目前大多數(shù)醬油公司采用自然發(fā)酵模式,整個發(fā)酵體系處于敞開狀態(tài),依靠天然曬露,不添加菌種,依靠自然環(huán)境中的微生物參與發(fā)酵。曲霉菌、酵母菌、乳酸菌等多種微生物的參與促進了更多風味物質(zhì)的形成,使醬油風味更加獨特,但復(fù)雜的微生物體系也導(dǎo)致了發(fā)酵產(chǎn)品質(zhì)量不夠穩(wěn)定。日式醬油工藝雖起源于中式醬油工藝,但對中式傳統(tǒng)的自然發(fā)酵工藝進行了控溫發(fā)酵的改進,采用了大型密閉發(fā)酵罐發(fā)酵、鹽水冷卻成曲、人工強化功能酵母和嗜鹽乳酸菌、定期通氣攪拌等技術(shù),使產(chǎn)品的性能和穩(wěn)定性得到了提高。然而針對具有優(yōu)良特性嗜鹽乳酸菌的分離鑒定和篩選方面,傳統(tǒng)的菌種鑒定方法特異性不強,帶來龐大的測序檢測量,相對耗時耗力,檢測效率較低。

    5、為了解決傳統(tǒng)發(fā)酵食品性能和質(zhì)量不穩(wěn)定性的問題,需要一種高效篩選具有優(yōu)良性狀的嗜鹽四聯(lián)球菌菌株的方法。


    技術(shù)實現(xiàn)思路

    1、本申請的目的在于,克服傳統(tǒng)發(fā)酵食品性能和質(zhì)量不穩(wěn)定性的問題,提供了一種快速鑒定嗜鹽四聯(lián)球菌的篩選方法及其應(yīng)用,本申請的篩選方法簡單、高效且準確性強。

    2、為實現(xiàn)上述目的,本申請采用如下技術(shù)方案:

    3、本申請?zhí)峁┝撕Y選或輔助篩選不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的引物組,所述引物組包括針對嗜鹽四聯(lián)球菌16s?rdna的特異性引物1、針對組氨酸脫羧酶基因的特異性引物2和針對酪胺脫羧酶基因的特異性引物3;

    4、所述特異性引物1的核苷酸序列如seq?no:1~2所示;

    5、所述特異性引物2的核苷酸序列如seq?no:3~4所示;

    6、所述特異性引物3的核苷酸序列如seq?no:5~6所示。

    7、在本申請的技術(shù)方案中,對嗜鹽四聯(lián)球菌核酸序列比對分析發(fā)現(xiàn)其16srdna上有一段高度保守的特異性區(qū)域,通過設(shè)計特異性引物1(分別為p1、p2,核苷酸序列分別如seqno:1~2)進行pcr擴增,能夠快速、準確的篩選出嗜鹽四聯(lián)球菌。

    8、由于氨基酸代謝物組胺和酪胺生成型嗜鹽四聯(lián)球菌通常會攜帶組氨酸脫羧酶基因和酪胺脫羧酶基因,本申請通過設(shè)計針對組氨酸脫羧酶基因的特異性引物2(分別為p3、p4,核苷酸序列分別如seq?no:3~4)和酪胺脫羧酶基因的特異性引物3(分別為p5、p6,核苷酸序列分別如seq?no:5~6)通過pcr擴增,簡單且高效篩選不生產(chǎn)組胺和酪胺等生物胺的優(yōu)良嗜鹽四聯(lián)球菌。

    9、優(yōu)選地,所述生物胺包括組胺或酪胺。

    10、本申請?zhí)峁┝撕Y選或輔助篩選嗜鹽四聯(lián)球菌的試劑或試劑盒,所述試劑或試劑盒包括上述引物組。

    11、采用含有上述引物組的試劑或試劑盒,可以快速、準確的篩選鑒定出嗜鹽四聯(lián)球菌,并且可以高效篩選出不生產(chǎn)組胺和酪胺等生物胺的優(yōu)良嗜鹽四聯(lián)球菌。

    12、優(yōu)選地,所述試劑盒還包括pcr反應(yīng)液。

    13、所述試劑盒還包括高保真taq酶預(yù)混液。

    14、本申請?zhí)峁┝艘环N篩選或輔助篩選不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的方法,所述方法包括以下步驟:

    15、1)提取待測樣品dna;

    16、2)以所述待測樣品dna為模板,用上述引物組進行pcr擴增,鑒定篩選挑取的單克隆菌落,得到不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌。

    17、本申請的篩選方法首先基于嗜鹽四聯(lián)球菌的16s?rdna設(shè)計出特異性引物1,通過pcr擴增可同時實現(xiàn)對嗜鹽四聯(lián)球菌菌株的快速鑒定和對不具有代謝氨基酸性能菌株的快速篩選;并且,進一步設(shè)計針對組氨酸脫羧酶基因的特異性引物2和針對酪胺脫羧酶基因的特異性引物3,通過pcr擴增高效篩選不生產(chǎn)組胺和酪胺等生物胺的優(yōu)良嗜鹽四聯(lián)球菌。

    18、本申請使用pcr擴增的方式實現(xiàn)對嗜鹽四聯(lián)球菌的特異性篩選鑒定,無需對菌株進行基因組提取和上機測序,提升了篩選的效率,降低了篩選成本;基于對生物胺生成關(guān)鍵酶的特異性基因擴增進行不產(chǎn)生物胺菌株的篩選,進一步提升了篩選效率,實現(xiàn)了對工業(yè)優(yōu)良性狀嗜鹽四聯(lián)球菌菌株的高效篩選。

    19、采用本申請的方法可以同時進行嗜鹽四聯(lián)球菌的鑒定和不產(chǎn)生組胺、酪胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的篩選,并實現(xiàn)了高通量檢測,有效降低了基因提取、測序的人工成本和時間成本。

    20、優(yōu)選地,所述步驟1)包括:取醬醪樣品重懸于無菌水中,得到混合菌液,將混合菌液稀釋后,涂布于固體平板上,進行厭氧培養(yǎng),挑取有透明圈的單克隆菌落,分離純化,然后將分離純化后的單克隆菌落重懸于無菌水中,水浴處理,得到待測樣品dna。

    21、更優(yōu)選地,所述固體平板為含0.5%碳酸鈣的mrs加鹽(5%-10%)固體平板。

    22、更優(yōu)選地,所述水浴處理的溫度為95~98℃,水浴處理時間為10~15min。

    23、優(yōu)選地,所述步驟2)中,pcr擴增反應(yīng)程序為:98℃變性30s,60℃退火20s,72℃延伸30s,30個循環(huán)。<本文檔來自技高網(wǎng)...

    【技術(shù)保護點】

    1.篩選或輔助篩選不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的引物組,其特征在于,所述引物組包括針對嗜鹽四聯(lián)球菌16S?rDNA的特異性引物1、針對組氨酸脫羧酶基因的特異性引物2和針對酪胺脫羧酶基因的特異性引物3;

    2.篩選或輔助篩選嗜鹽四聯(lián)球菌的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑或試劑盒包括如權(quán)利要求1所述的引物組。

    3.如權(quán)利要求2所述的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括PCR反應(yīng)液。

    4.一種篩選或輔助篩選不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:

    5.如權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述步驟1)包括:取醬醪樣品重懸于無菌水中,得到混合菌液,將混合菌液稀釋后,涂布于固體平板上,進行厭氧培養(yǎng),挑取有透明圈的單克隆菌落,分離純化,然后將分離純化后的單克隆菌落重懸于無菌水中,水浴處理,得到待測樣品DNA。

    6.如權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述步驟2)中,PCR擴增反應(yīng)程序為:98℃變性30s,60℃退火20s,72℃延伸30s,30個循環(huán)。

    7.如權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述步驟2)中,以所述待測樣品DNA為模板,采用如權(quán)利要求1所述的特異性引物1進行PCR擴增,鑒定篩選挑取的單克隆菌落,得到嗜鹽四聯(lián)球菌,然后再采用如權(quán)利要求1所述的特異性引物2或特異性引物3進行PCR擴增,篩選挑取的單克隆菌落,分別得到不產(chǎn)組胺的嗜鹽四聯(lián)球菌和不產(chǎn)酪胺的嗜鹽四聯(lián)球菌。

    8.如權(quán)利要求4~7任一項所述的方法在發(fā)酵食品中的應(yīng)用。

    9.如權(quán)利要求1所述的引物組或者如權(quán)利要求2或3所述的試劑或試劑盒在篩選或輔助篩選嗜鹽四聯(lián)球菌中的應(yīng)用。

    10.如權(quán)利要求1所述的引物組在制備篩選或者輔助篩選嗜鹽四聯(lián)球菌的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

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    【技術(shù)特征摘要】

    1.篩選或輔助篩選不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的引物組,其特征在于,所述引物組包括針對嗜鹽四聯(lián)球菌16s?rdna的特異性引物1、針對組氨酸脫羧酶基因的特異性引物2和針對酪胺脫羧酶基因的特異性引物3;

    2.篩選或輔助篩選嗜鹽四聯(lián)球菌的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑或試劑盒包括如權(quán)利要求1所述的引物組。

    3.如權(quán)利要求2所述的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括pcr反應(yīng)液。

    4.一種篩選或輔助篩選不生產(chǎn)生物胺的嗜鹽四聯(lián)球菌的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:

    5.如權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述步驟1)包括:取醬醪樣品重懸于無菌水中,得到混合菌液,將混合菌液稀釋后,涂布于固體平板上,進行厭氧培養(yǎng),挑取有透明圈的單克隆菌落,分離純化,然后將分離純化后的單克隆菌落重懸于無菌水中,水浴處理,得到待測樣品dna...

    【專利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:陳晨吳日幫孫艷萍周斌周其洋
    申請(專利權(quán))人:佛山市海天高明調(diào)味食品有限公司
    類型:發(fā)明
    國別省市:

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