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    靶向NPM1c衍生新抗原的TCR及應(yīng)用制造技術(shù)

    技術(shù)編號:43691841 閱讀:31 留言:0更新日期:2024-12-18 21:09
    本發(fā)明專利技術(shù)提供一種靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,以及包含編碼所述TCR的核苷酸序列或其互補序列的核酸分子,以及含有所述核酸分子的載體,以及轉(zhuǎn)導(dǎo)所述核酸分子或所述載體的細胞,以及包含所述TCR、核酸分子、載體或細胞作為活性成分的藥物組合物,以及所述TCR、核酸分子、載體、細胞、藥物組合物在檢測、預(yù)防和/治療NPM1c基因突變衍生新抗原相關(guān)癌癥中的用途。

    【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】

    本專利技術(shù)屬于多肽藥物和多肽疫苗領(lǐng)域,具體涉及靶向npm1c衍生新抗原的特異性tcr及其在腫瘤免疫治療中的應(yīng)用。


    技術(shù)介紹

    1、急性髓細胞白血病(aml)是一類起源于髓樣前體細胞的高度異質(zhì)性和侵襲性惡性疾病,占成人白血病的70%。目前aml臨床治療效果整體較差,5年生存率35%-50%,老年患者更低至5%-10%。基因突變的不斷累積賦予白血病細胞極其復(fù)雜的生存能力,導(dǎo)致其持續(xù)克隆增殖,是aml預(yù)后差的關(guān)鍵。針對基因突變特異性清除白血病細胞克隆,促進免疫平衡,對延長aml患者無病生存期、降低復(fù)發(fā)率具有重要科學(xué)意義。

    2、npm1酪氨酸激酶催化域突變(cytoplasmic?npm1?mutations,npm1c)是aml患者中最常見的基因突變,其導(dǎo)致的功能結(jié)構(gòu)異常被認為是aml發(fā)生發(fā)展的重要因素。研究發(fā)現(xiàn),npm1+/–小鼠表現(xiàn)出基因組不穩(wěn)定并最終發(fā)展為以髓系異常為主的白血病。超過33%的aml患者初診時存在npm1c,復(fù)發(fā)患者體內(nèi)仍可監(jiān)測到持續(xù)性npm1c,與初診時npm1c序列高度重疊。提示靶向清除npm1c對延長aml患者生存期的重要性。然而,目前尚缺乏靶向npm1c的治療方式。

    3、npm1c一般發(fā)生于12號外顯子,共有50余種亞型,其中最常見的是a型,即在956-969核苷酸中插入tctg堿基導(dǎo)致開放閱讀框移,使得野生型npm1的7個氨基酸序列(wqwrksl)突變?yōu)閚pm1c上11個不同的氨基酸序列(claveevslrk)。我們前期在aml患者外周血及骨髓浸潤淋巴細胞中檢測到npm1c特異性t細胞,提示靶向npm1c的特異性t細胞在抗白血病免疫中發(fā)揮重要作用。然而,此類細胞在aml患者體內(nèi)比例極低(約0.02%),在白血病細胞不斷克隆增殖的狀態(tài)下難以完全清除惡變細胞。通過人工提升npm1c特異性t細胞的比例,增強t細胞抗白血病能力,誘使白血病細胞裂解進而釋放更多免疫原性蛋白,解除免疫抑制狀態(tài),擴大靶向免疫反應(yīng)的廣度和深度,從而形成良性的免疫循環(huán),將有可能恢復(fù)患者免疫平衡狀態(tài),實現(xiàn)長期帶瘤生存甚至治愈aml的目的。

    4、t細胞免疫反應(yīng)的啟動依賴于tcr對抗原的識別。將抗原特異性tcr人工轉(zhuǎn)導(dǎo)至t細胞構(gòu)建的tcr-t細胞,靶向殺傷腫瘤細胞,改變機體免疫抑制狀態(tài),誘導(dǎo)特異性免疫反應(yīng)。其中,靶標(biāo)的選擇是關(guān)鍵。新抗原由體細胞基因突變衍生,特異性表達于癌細胞,不引起中樞免疫耐受,具有免疫原性強、安全性好的優(yōu)勢,是免疫細胞治療的理想靶標(biāo)。我們前期研究發(fā)現(xiàn),npm1c衍生的新抗原與人白細胞抗原h(huán)la-a*02:01結(jié)合,被其遞呈至白血病細胞表面形成phla復(fù)合物,并誘導(dǎo)特異性t細胞免疫反應(yīng),提示npm1c衍生新抗原是基于t細胞的免疫治療的重要靶標(biāo)。

    5、基于npm1c是aml免疫治療良好靶標(biāo)及tcr對新抗原的識別啟動特異性免疫反應(yīng)的事實,過繼性回輸靶向npm1c的tcr-t細胞是提升npm1c特異性t細胞數(shù)量的直接途徑。然而,天然tcr結(jié)構(gòu)的人工轉(zhuǎn)導(dǎo),存在表達率低、錯配率高等限制。因此需要開發(fā)親和力增強的tcr突變體。


    技術(shù)實現(xiàn)思路

    1、本專利技術(shù)目的在于針對現(xiàn)有技術(shù)的不足,本專利技術(shù)提供了靶向npm1c衍生新抗原的特異性tcr及其在腫瘤免疫治療中的應(yīng)用。

    2、根據(jù)本專利技術(shù)目的的第一方面,提供一種靶向npm1c衍生新抗原的特異性tcr,

    3、所述npm1c衍生的新抗原(多肽序列:aiqdlcmav),與hla-a*02:01分子結(jié)合并被遞呈至目標(biāo)靶細胞表面形成aiqdlcmav-hla-a*02:01復(fù)合物。

    4、所述aiqdlcmav-hla-a*02:01復(fù)合物,被t細胞表面特異性tcr識別,誘導(dǎo)并啟動特異性免疫反應(yīng)。

    5、所述tcr具有結(jié)合aiqdlcmav-hla-a*02:01復(fù)合物的特性,所述tcr包含tcrα鏈可變區(qū)和tcrβ鏈可變區(qū);

    6、所述tcrα鏈可變區(qū)的cdr3氨基酸序列為cataggyqgaqklvf(seq?id?no:7)。

    7、和/或所述tcrβ鏈可變區(qū)的氨基酸序列為casslmgqgtyeqyf(seq?id?no:10)。

    8、優(yōu)選的,所述tcrα鏈可變區(qū)的3個互補決定區(qū)氨基酸序列為:

    9、αcdr1:seq?id?no:5;

    10、αcdr2:seq?id?no:6;

    11、αcdr3:seq?id?no:7。

    12、優(yōu)選的,所述tcrβ鏈可變區(qū)的3個互補決定區(qū)氨基酸序列為:

    13、βcdr1:seq?id?no:8;

    14、βcdr2:seq?id?no:9;

    15、βcdr3:seq?id?no:10。

    16、優(yōu)選的,以上所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,所述tcrα鏈可變區(qū)的氨基酸序列為與seq?id?no:1具有至少90%序列相同性的氨基酸序列;和/或所述tcrβ鏈可變區(qū)為與seq?id?no:2具有至少90%序列相同性的氨基酸序列。

    17、優(yōu)選的,所述tcr包含α鏈氨基酸序列seq?id?no:17。

    18、優(yōu)選的,所述tcr包含β鏈氨基酸序列seq?id?no:18。

    19、優(yōu)選的,所述tcr為αβ異源二聚體。

    20、優(yōu)選的,所述tcr的α鏈與β鏈之間含有人工鏈間二硫鍵。

    21、優(yōu)選的,所述tcr的氨基酸序列如seq?id?no:21所示。

    22、本專利技術(shù)的第二方面。提供了一種核酸分子,所述核酸分子包含編碼本專利技術(shù)第一方面所述的tcr分子的核酸序列或其互補序列。

    23、優(yōu)選的,所述核酸分子包含編碼tcrα鏈可變區(qū)的核苷酸序列seq?id?no:3。

    24、優(yōu)選的,所述核酸分子包含編碼tcrβ鏈可變區(qū)的核苷酸序列seq?id?no:4。

    25、優(yōu)選的,所述核酸分子包含編碼tcrα鏈的核苷酸序列seq?id?no:19。

    26、優(yōu)選的,所述核酸分子包含編碼tcrβ鏈的核苷酸序列seq?id?no:20。

    27、優(yōu)選的,所述核酸分子包含核苷酸序列seq?id?no:22。

    28、本專利技術(shù)的第三方面,提供了一種載體,所述的載體含有本專利技術(shù)第二方面所述的核酸分子。

    29、優(yōu)選的,所述的載體為病毒載體。

    30、更優(yōu)選的,所述的病毒載體為慢病毒載體或逆轉(zhuǎn)錄病毒載體。

    31、本專利技術(shù)的第四方面,提供了一種分離的宿主細胞,所述的宿主細胞中含有本專利技術(shù)第三方面所述的載體或基因組中整合由外源的本專利技術(shù)第三方面所述的核酸分子。

    32、本專利技術(shù)的第五方面,提供了一種細胞,所述細胞表達本專利技術(shù)第一方面所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr或其抗原結(jié)合片段,或攜帶本專利技術(shù)第二方面所述的多核苷酸,或含有本專利技術(shù)第三方面所述的載體。

    33、優(yōu)選的,所述細胞為t細胞、外周血單個核細胞(pbmc)或干細胞本文檔來自技高網(wǎng)...

    【技術(shù)保護點】

    1.一種靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于,包括TCR能夠識別AIQDLCMAV-HLA-A*02:01復(fù)合物,所述TCR包含TCRα鏈可變區(qū)和/或TCRβ鏈可變區(qū):

    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:所述TCRα鏈可變區(qū)還包括αCDR1和/或αCDR2互補決定區(qū),其氨基酸序列為:

    3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:所述TCRβ鏈可變區(qū)還包括_x0016_βCDR1和/或βCDR2互補決定區(qū),其氨基酸序列為:

    4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:所述TCRα鏈可變區(qū)的氨基酸序列為與SEQ?ID?NO:1具有至少90%序列相同性的氨基酸序列;和/或所述TCRβ鏈可變區(qū)為與SEQ?ID?NO:2具有至少90%序列相同性的氨基酸序列。

    5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:所述所述TCR包含α鏈氨基酸序列SEQ?ID?NO:17。

    6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:所述TCR包含β鏈氨基酸序列SEQ?ID?NO:18。

    7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:TCR為αβ異源二聚體,α鏈與β鏈之間含有人工鏈間二硫鍵。

    8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR,其特征在于:所述TCR的氨基酸序列如SEQ?ID?NO:21所示。

    9.一種核酸分子,其特征在于:所述核酸分子包含編碼權(quán)利要求1~8所述的TCR分子的核酸序列或其互補序列。

    10.根據(jù)權(quán)利要求9所述核酸分子,其特征在于:包含編碼TCRα鏈可變區(qū)的核苷酸序列SEQ?ID?NO:3。

    11.根據(jù)權(quán)利要求9所述核酸分子,其特征在于:所述核酸分子包含編碼TCRα鏈的核苷酸序列SEQ?ID?NO:19。

    12.根據(jù)權(quán)利要求9所述核酸分子,其特征在于:所述核酸分子包含編碼TCRβ鏈可變區(qū)的核苷酸序列SEQ?ID?NO:4。

    13.根據(jù)權(quán)利要求9所述核酸分子,其特征在于:所述核酸分子包含編碼TCRβ鏈的核苷酸序列SEQ?ID?NO:20。

    14.根據(jù)權(quán)利要求9所述核酸分子,其特征在于:所述核酸分子包含核苷酸序列SEQ?IDNO:22。

    15.一種載體,其特征在于:所述的載體含有權(quán)利要求9~14任一項所述的核酸分子。

    16.根據(jù)權(quán)利要求15所述的載體,其特征在于:所述載體為病毒載體。

    17.一種分離的宿主細胞,其特征在于:所述的宿主細胞中含有權(quán)利要求15和16所述的載體或基因組中整合由外源的權(quán)利要求9~14任一項所述的核酸分子。

    18.一種細胞,其特征在于:所述細胞表達權(quán)利要求1~8所述的靶向NPM1c衍生新抗原的TCR或其抗原結(jié)合片段,或攜帶權(quán)利要求9~14所述的多核苷酸,或含有權(quán)利要求15和16所述的載體。

    19.根據(jù)權(quán)利要求18所述的細胞,其特征在于:所述細胞為T細胞、外周血單個核細胞(PBMC)或干細胞。

    20.一種用于治療腫瘤的藥物,所述藥物包含權(quán)利要求1~8所述的靶向NPM1c突變衍生新抗原的TCR或其抗原結(jié)合片段,或權(quán)利要求9~14的多核苷酸,或權(quán)利要求9~14的載體,或權(quán)利要求17所述的細胞,或權(quán)利要求18和19的細胞。

    21.權(quán)利要求1~8中任一所述的TCR、或權(quán)利要求9~14的多核苷酸,或權(quán)利要求9~14的載體,或權(quán)利要求17所述的細胞,或權(quán)利要求18和19的細胞的用途,用于治療白血病的藥物中的應(yīng)用。

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    【技術(shù)特征摘要】

    1.一種靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于,包括tcr能夠識別aiqdlcmav-hla-a*02:01復(fù)合物,所述tcr包含tcrα鏈可變區(qū)和/或tcrβ鏈可變區(qū):

    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:所述tcrα鏈可變區(qū)還包括αcdr1和/或αcdr2互補決定區(qū),其氨基酸序列為:

    3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:所述tcrβ鏈可變區(qū)還包括_x0016_βcdr1和/或βcdr2互補決定區(qū),其氨基酸序列為:

    4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:所述tcrα鏈可變區(qū)的氨基酸序列為與seq?id?no:1具有至少90%序列相同性的氨基酸序列;和/或所述tcrβ鏈可變區(qū)為與seq?id?no:2具有至少90%序列相同性的氨基酸序列。

    5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:所述所述tcr包含α鏈氨基酸序列seq?id?no:17。

    6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:所述tcr包含β鏈氨基酸序列seq?id?no:18。

    7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:tcr為αβ異源二聚體,α鏈與β鏈之間含有人工鏈間二硫鍵。

    8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向npm1c衍生新抗原的tcr,其特征在于:所述tcr的氨基酸序列如seq?id?no:21所示。

    9.一種核酸分子,其特征在于:所述核酸分子包含編碼權(quán)利要求1~8所述的tcr分子的核酸序列或其互補序列。

    10.根據(jù)權(quán)利要求9所述核酸分子,其特征在于:包含編碼tcrα鏈可變區(qū)的核苷酸序列seq?id?no:3。...

    【專利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:周煒均王侃侃喻瑾怡
    申請(專利權(quán))人:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院
    類型:發(fā)明
    國別省市:

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