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【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物醫藥技術和診斷領域,具體涉及一種生物標志物組合及其在預測食管癌風險中的應用。
技術介紹
1、食管癌在惡性腫瘤死亡原因中排第四位。全球每年食管癌發病為57.2萬人,死亡50.8萬人。
2、臨床上可通過b超、ct檢查、活組織病理檢查等早期發現病變,通過定期的自我檢查也有助于早期發現病變。然而這些手段都存在假陽性率過高,發現時間較晚等缺點。
3、目前,現有技術公開了一種利用44種血清代謝物作為標志物診斷食管癌的方法(專利公布號:cn112151121a),其診斷的靈敏度、特異度和準確度約為94%。考慮到利用代謝物作為診斷標志在實際操作以及診斷的靈敏度和特異性方面的局限,急需一種更為便捷、更高靈敏度和準確率的診斷方法來實現早期癌癥篩查。
4、蛋白質組學在揭示腫瘤發生的復雜分子事件,如腫瘤發生、侵襲、轉移和對治療耐受上起了重大作用。蛋白質組學腫瘤診斷具有靈敏度高、特異性強、背景機理明確的優點,近年來被越來越多地運用于腫瘤檢測。而且,這些腫瘤標志物的研究往往是基于一定量的實驗數據,所涉及的癌癥種類和樣本量都相對有限。近年來,隨著蛋白質組不斷發展,體液蛋白質組大數據不斷增加。因此,通過收集體液蛋白質組數據,利用大數據分析方法,找到一種適用范圍廣、準確率高的腫瘤風險模型,有助于實現早期診斷,對患者進行早診早治療具有重要的臨床意義。
技術實現思路
1、針對現有技術中缺少一種適用范圍廣、預測準確率、診斷靈敏度和特異性高的預測食管癌風險的技術方案的缺
2、本專利技術通過篩選體液蛋白質組,獲得了一組能夠預測食管癌風險的生物標志物,篩選方法包括如下步驟:
3、(1)收集健康人和食管癌患者的體液樣本;
4、(2)健康人和食管癌患者體液樣本蛋白質制備;
5、(3)檢測健康人和食管癌患者體液樣品中的蛋白質分子表達水平;
6、(4)找到腫瘤患者體液特異性高表達的蛋白質組分子,并構建分類器進行區分。
7、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種生物標志物組合在制備預測和/或診斷食管癌的試劑盒中的應用;
8、其中,所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp10、myl6b、myof、naxd、ncald、pcbp3、plbd2、rcn1、reck、ruvbl1、saa1、sf3a3、smc2和spg21組成。
9、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種用于檢測生物標志物組合的試劑,所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp10、myl6b、myof、naxd、ncald、pcbp3、plbd2、rcn1、reck、ruvbl1、saa1、sf3a3、smc2和spg21組成。
10、如本專利技術所述的試劑,所述試劑用于檢測所述生物標志物組合的表達水平;所述表達水平為蛋白表達水平和/或mrna轉錄水平。
11、如本專利技術所述的試劑,所述試劑為與所述生物標志物特異性結合,或者與編碼所述生物標志物的核酸特異性雜交的生物分子試劑。
12、如本專利技術所述的試劑,所述生物分子試劑選自引物、探針和抗體。
13、如本專利技術所述的試劑,所述試劑為用于基因組、轉錄組和/或蛋白質組測序的試劑。
14、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種用于檢測生物標志物組合的試劑在制備預測和/或診斷食管癌的試劑盒中的應用;
15、其中,所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp10、myl6b、myof、naxd、ncald、pcbp3、plbd2、rcn1、reck、ruvbl1、saa1、sf3a3、smc2和spg21組成。
16、如本專利技術所述的應用,所述試劑如本專利技術所述。
17、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種生物標志物組合,所述組合所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp10、myl6b、myof、naxd、ncald、pcbp3、plbd2、rcn1、reck、ruvbl1、saa1、sf3a3、smc2和spg21組成。
18、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種試劑盒,所述試劑盒包含如本專利技術所述的試劑和如本專利技術所述的生物標志物組合。
19、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種非診斷目的的檢測食管癌的方法,所述方法包括檢測待測樣本中的生物標志物組合的表達水平;
20、其中,所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp10、myl6b、myof、naxd、ncald、pcbp3、plbd2、rcn1、reck、ruvbl1、saa1、sf3a3、smc2和spg21組成;
21、所述表達水平為蛋白表達水平和/或mrna轉錄水平。
22、本專利技術中,所述“非診斷目的”是指出于科學研究、病理數據統計的目的,適用場景包括驗證動物模型是否成功構建、體外藥效實驗、腫瘤的流行病學統計等。
23、為解決上述技術問題,本專利技術提供的一個技術方案為:一種食管癌風險的預測系統,所述預測系統包括:檢測模塊和分析判斷模塊;
24、所述檢測模塊檢測待測樣本中的生物標志物組合的表達水平,并將表達水平數據傳輸至所述分析判斷模塊;
25、所述分析判斷模塊通過firmian本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.一種用于檢測生物標志物組合的試劑,其特征在于,所述生物標志物組合由ACTB、ACTG1、ALDH9A1、ARMC8、B3GAT3、CRP、DLG1、DSC3、DUSP3、EIF2B1、EIF5A2、EIF5AL1、GLO1、GP1BB、GSTO1、H1-10、H3-4、H3C1、H3C15、HSPA6、MMP10、MYL6B、MYOF、NAXD、NCALD、PCBP3、PLBD2、RCN1、RECK、RUVBL1、SAA1、SF3A3、SMC2和SPG21組成;
2.一種生物標志物組合,其特征在于,所述組合所述生物標志物組合由ACTB、ACTG1、ALDH9A1、ARMC8、B3GAT3、CRP、DLG1、DSC3、DUSP3、EIF2B1、EIF5A2、EIF5AL1、GLO1、GP1BB、GSTO1、H1-10、H3-4、H3C1、H3C15、HSPA6、MMP10、MYL6B、MYOF、NAXD、NCALD、PCBP3、PLBD2、RCN1、RECK、RUVBL1、SAA1、SF3A3、SMC2和SPG21組成。
3.一種試劑盒,其特征在于,所述
4.如權利要求1所述的試劑、如權利要求2所述的生物標志物組合或如權利要求3所述的試劑盒在制備預測和/或診斷食管癌的產品中的應用。
5.一種食管癌風險的預測系統,其特征在于,所述預測系統包括:
6.一種計算機可讀存儲介質,其存儲有計算機程序,其特征在于,所述計算機程序被處理器執行時,可實現如權利要求5所述的預測系統的功能。
7.一種電子設備,其包括存儲器和處理器,所述存儲器存儲有計算機程序,其特征在于,所述處理器用于執行所述計算機程序以實現如權利要求5所述的預測系統的功能。
...【技術特征摘要】
1.一種用于檢測生物標志物組合的試劑,其特征在于,所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp10、myl6b、myof、naxd、ncald、pcbp3、plbd2、rcn1、reck、ruvbl1、saa1、sf3a3、smc2和spg21組成;
2.一種生物標志物組合,其特征在于,所述組合所述生物標志物組合由actb、actg1、aldh9a1、armc8、b3gat3、crp、dlg1、dsc3、dusp3、eif2b1、eif5a2、eif5al1、glo1、gp1bb、gsto1、h1-10、h3-4、h3c1、h3c15、hspa6、mmp1...
【專利技術屬性】
技術研發人員:李明珠,
申請(專利權)人:上海愛譜蒂康生物科技有限公司,
類型:發明
國別省市:
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