【技術實現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術涉及生物化學領域，具體涉及一種修飾的核苷酸單體及其在sirna分子中的用途。
技術介紹
1、近年來，在sirna成藥方面取得了相當程度的進展。sirna作為藥物活性成分已為公眾所知，rna干擾其對應的sirna作用機制是以一種核酸內(nèi)切酶復合物為特征介導的rna干擾方式。從基因水平上，通過sirna幾乎可以治療所有的疾病，包括腫瘤、傳染病、遺傳性疾病等，因而sirna已成為最熱門的生物醫(yī)藥研究領域。理論上，sirna療法可以靶向任何致病基因組中的靶基因，有著強力和持久的作用療效，可以顯著降低給藥頻率，提高患者用藥的依從性，從而達到更好的治療效果。
2、研究表明，rnai脫靶效應的一個主要因素是與靶點mrna結合的sirna序列中的部分片段可能起到像微rna(mirna)一樣的功能，它們可以與其它mrna的3’-端非轉(zhuǎn)錄區(qū)(3’-utr)相結合，抑制mrna的翻譯和穩(wěn)定性。而mirna主要通過種子區(qū)域(5'-末端的位置2-8位)與靶mrna之間的堿基配對識別靶基因的。研究也表明由sirna引起的脫靶效應主要源自sirna的反義鏈種子區(qū)域與一個或多個mrna的堿基互補性。因此，反義鏈種子區(qū)域的序列可能影響多種基因的表達，成為rnai藥物副作用的主要因素。
3、為了有效解決反義鏈種子區(qū)的脫靶效應，alnylam通過對位于種子區(qū)的核苷酸單體進行修飾，找到了一類新型核苷單體(甘油核酸，glycerol?nucleic?acid，簡稱gna)，引入到sirna反義鏈種子區(qū)后，能夠減低rnai的脫靶效應，提高藥
4、本專利技術通過藥物化學手段，合成經(jīng)修飾后的核苷酸單體，并通過磷酸二酯鍵鏈接方式引入到sirna反義鏈種子區(qū)的特定位置，這種對sirna序列的修飾，能夠?qū)irna靶基因的沉默效應不受影響的同時，顯著減低了sirna的脫靶效應，擴大了sirna藥物分子的安全窗口。因此，本專利技術對sirna藥物的開發(fā)和臨床應用具有十分重要的價值。
技術實現(xiàn)思路
1、為解決上述問題，本專利技術旨在提供一種新型修飾核苷酸，能夠提高rnai藥物分子對靶基因沉默的選擇性，降低脫靶效應。
2、一方面，本專利技術提供了一種具有式i所示結構的核苷酸單體化合物，或其氘代化合物、或其氟代化合物、或其可用的鹽：
3、
4、其中：
5、bx為非常規(guī)堿基；
6、r為羥基保護基團；優(yōu)選地，r選自4,4’-雙甲氧基三苯甲基，4-甲氧基三苯甲基；
7、sug為核糖環(huán)或核糖替代環(huán)；
8、n為0～3；m為0～3；
9、z為磷酸酯部分、硫代磷酸酯部分或亞磷酰胺部分。
10、進一步地，
11、sug選自如下結構：
12、
13、其中，aa端與bx端相連，bb端與or端相連，cc端與z端相連；
14、x選自o或s；
15、y選自氫、鹵素、疊氮基、c1-c6烷基、c1-c6烷氧基、-o-(c1-c6亞烷基)-o-(c1-c6烷基)、-o-(c1-c6亞烷基)-c(o)nry1ry2；
16、ry1、ry2分別獨立選自氫、c1-c6烷基、環(huán)烷基。
17、在本專利技術的一些實施方案中，式i所示的化合物如式ii或式iii所示：
18、
19、其中，
20、bx為非常規(guī)堿基；
21、x選自o或s；
22、n為0～3；m為0～3；
23、r為羥基保護基團；優(yōu)選地，r選自4,4’-雙甲氧基三苯甲基，4-甲氧基三苯甲基；
24、y選自氫、鹵素、疊氮基、c1-c6烷基、c1-c6烷氧基、-o-(c1-c6亞烷基)-o-(c1-c6烷基)、-o-(c1-c6亞烷基)-c(o)nry1ry2；
25、ry1、ry2分別獨立選自氫、c1-c6烷基、環(huán)烷基。
26、z為磷酸酯部分、硫代磷酸酯部分或亞磷酰胺部分。
27、在本專利技術的一些實施方案中，式i所示的化合物如式iv所示：
28、
29、bx為非常規(guī)堿基；
30、r為羥基保護基團；優(yōu)選地，r選自4,4’-雙甲氧基三苯甲基，4-甲氧基三苯甲基；
31、n為0～3；m為0～3；
32、z為磷酸酯部分、硫代磷酸酯部分或亞磷酰胺部分。
33、在本專利技術的一些實施方案中，所述的非常規(guī)堿基為除常規(guī)核苷堿基之外的非常規(guī)嘌呤、嘧啶或含氮雜環(huán)堿基；
34、優(yōu)選地，
35、非常規(guī)堿基選自a環(huán)、b環(huán)或a環(huán)b環(huán)相互稠合、橋合而成的環(huán)；
36、a環(huán)、b環(huán)分別獨立選自五元、六元或七元雜環(huán)；
37、a環(huán)b環(huán)相互稠合、橋合而成的環(huán)如式v所示：
38、
39、其中,
40、a環(huán)、b環(huán)分別獨立為五元、六元或七元環(huán)雜環(huán)；
41、所述雜環(huán)含有0～3個o、s或n原子；
42、a環(huán)、b環(huán)或a環(huán)b環(huán)相互稠合、橋合而成的環(huán)任選被c1-c6烷基或環(huán)烷基、苯基、c1-c3烷基取代的苯基或者鹵代苯基取代。
43、在本專利技術的一些實施方案中，所述非常規(guī)堿基的具體結構如下：
44、ssdd；其中，r、r0選自氫、c1-c6烷基、c3-c6環(huán)烷基。
45、在本專利技術的一些實施方案中，所述非常規(guī)堿基的具體結構如下：
46、
47、在本專利技術的一些實施方案中，所述非常規(guī)堿基的具體結構如下：
48、
49、
50、在本專利技術的一些實施方案中，
51、r選自氫或dmt；
52、m為0；n為0或1；
53、y為甲氧基；
54、z為在本專利技術的一些具體實施方案中，所述化合物具體為：
55、
56、
57、本專利技術還提供了任一上述的核苷酸單體化合物在制備寡核苷酸中作為中間體的用途；優(yōu)選地，所述寡核苷酸為sirna。
58、在本專利技術的一些實施方案中，提供所述的核苷酸單體化合物作為中間體在制備sirna反義鏈種子區(qū)中作為中間體的用途。
59、另一方面，本專利技術還提供了一種sirna，其包含正義鏈和反義鏈；所述正義鏈和反義鏈各自包含15至45個修飾或未修飾的核苷酸，正義鏈和反義鏈部分互補形成雙鏈區(qū)；其中，所述反義鏈的種子區(qū)中至少含有一個具有式via或式vib所示的結構的核苷酸，并在位點與sirna其余部分共價連接：
60、
61、其中：
62、x分別獨立選自o或s；
63、y選自氫、鹵素、疊氮基、c1-c6烷基、c1-c6烷氧基、-o-(c1-c6亞烷基)-o-(c1-c6烷基)、-o-(c1-c6本文檔來自技高網(wǎng)...
【技術保護點】
1.一種具有式I所示結構的核苷酸單體化合物，或其氘代化合物、或其氟代化合物、或其可用的鹽：
2.根據(jù)如權利要求1所述的化合物，其特征在于：
3.根據(jù)權利要求1或2所述的化合物，其特征在于：式I所示的化合物如式II或式III所示：
4.根據(jù)權利要求1或2所述的化合物，其特征在于：式I所示的化合物如式IV所示：
5.根據(jù)權利要求1-4任一所述的化合物，其特征在于，
6.根據(jù)權利要求5所述的化合物，其特征在于：
7.根據(jù)權利要求5所述的化合物，其特征在于,所述非常規(guī)堿基的具體結構如下：
8.根據(jù)權利要求1-7任一所述的化合物，其特征在于：
9.根據(jù)權利要求1-8任一所述的化合物，其特征在于，所述化合物具體為：
10.權利要求1～9任一所述的核苷酸單體化合物在制備寡核苷酸中作為中間體的用途；優(yōu)選地，所述寡核苷酸為siRNA。
11.根據(jù)權利要求10所述的用途，其特征在于：權利要求1～8任一所述的核苷酸單體化合物作為中間體在制備siRNA反義鏈種子區(qū)中作為中間體的用途。<...
【技術特征摘要】
1.一種具有式i所示結構的核苷酸單體化合物，或其氘代化合物、或其氟代化合物、或其可用的鹽：
2.根據(jù)如權利要求1所述的化合物，其特征在于：
3.根據(jù)權利要求1或2所述的化合物，其特征在于：式i所示的化合物如式ii或式iii所示：
4.根據(jù)權利要求1或2所述的化合物，其特征在于：式i所示的化合物如式iv所示：
5.根據(jù)權利要求1-4任一所述的化合物，其特征在于，
6.根據(jù)權利要求5所述的化合物，其特征在于：
7.根據(jù)權利要求5所述的化合物，其特征在于,所述非常規(guī)堿基的具體結構如下：
8.根據(jù)權利要求1-7任一所述的化合物，其特征在于：
9.根據(jù)權利要求1-8任一所述的化合物，其特征在于，所述化合物具體為：
10.權利要求1～9任一所述的核苷酸單體化合物在制備寡核苷酸中作為中間體的用途；優(yōu)選地，所述寡核苷酸為sirna。
11.根據(jù)權利要求10所述的用途，其特征在于：權利要求1～8任一所述的核苷酸單體化合物作為中間體在制備sirna反義鏈種子區(qū)中作為中間體的用途。
12.一種sirna，其包含正義鏈和反義鏈；所述正義鏈和反義鏈各自包含15至45個修飾或未修飾的核苷酸，正義鏈和反義鏈部分互補形成雙鏈區(qū)；其中，所述反義鏈的種子區(qū)中至少含有一個具有式via或式vib所示的結構的核苷酸，并在位點與sirna其余部分共價連接：
【專利技術屬性】
技術研發(fā)人員：劉兆貴，萬金橋，
申請(專利權)人：成都先衍生物技術有限公司，
類型：發(fā)明
國別省市：
還沒有人留言評論。發(fā)表了對其他瀏覽者有用的留言會獲得科技券。