【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及小麥育種，具體涉及一種高通量小麥抗穗發芽分子標記及其在育種中的應用。
技術介紹
1、小麥是我國三大糧食作物之一，為保障國家糧食安全做出了重要貢獻，保證小麥高產穩產時確保國家糧食安全的關鍵。穗發芽(pre-harvest?sprouting,phs)會導致小麥產量降低和品質劣化，在全球各小麥主產區均有發生，每年導致約10億美金的損失，對小麥生產造成嚴重威脅。穗發芽對作物的危害主要體現在三個方面：一是穗發芽后籽粒中的儲藏物不斷被水解、消耗，導致容重和千粒重下降，嚴重影響作物產量；二是穗發芽導致種子發芽勢減弱，苗小苗弱，甚至造成出苗率嚴重下降，給農戶和種子經營者造成重大經濟損失；三是穗發芽降低了種子內營養物質的含量，導致面團的延展性、彈性和保水能力降低，淀粉的糊化、凝膠化和回生特性改變，從而顯著影響米線、面條、蛋糕、面包的品質。
2、挖掘抗穗發芽基因/位點，開發可以快速、高通量檢測抗穗發芽基因/位點的功能標記，篩選具有優異抗穗發芽基因/位點的優異種質，培育抗穗發芽的小麥品種并推廣種植，是緩解小麥穗發芽危害的有效手段。目前，已報道的47項(約40個群體)抗穗發芽qtl作圖研究中，共檢測到分布于小麥21條染色體上的250多個與穗發芽抗性或種子休眠特性相關的qtl。隨著測序技術和分子標記的發展，全基因組關聯分析成為發掘抗穗發芽qtl的新手段，在已報道的gwas研究中，共檢測到約1100個與小麥穗發芽抗性及相關性狀關聯的snp標記(marker-trait?association?snp,mtas)，分析這些mtas
技術實現思路
1、本專利技術旨在提供一種高通量小麥抗穗發芽分子標記kasp5d3041及其在育種中的應用。
2、本專利技術保護一種高通量小麥抗穗發芽分子標記kasp5d3041，對應抗穗發芽主效位點qphs-5ds的物理位置在小麥5d染色體短臂7018543bp處，該分子標記為t或c。
3、本專利技術還保護擴增上述分子標記的引物對，該標記為kasp高通量snp標記，包括2條正向引物，1條反向引物；引物序列如下：
4、kasp5d3041fam：
5、5'ggtccttccctttccactcttg?3'，其核苷酸序列如seq?id?no.1所示：ggtccttccctttccactct?tg；
6、kasp5d3041hex：
7、5'ggtccttccctttccactcttc?3'，其核苷酸序列如seq?id?no.2所示：ggtccttccctttccactct?tc；
8、kasp5d3041r：
9、5'gggcagactacagcacaaga?3'，其核苷酸序列如seq?id?no.3所示：ggtccttccctttccactct?tc。
10、本專利技術還保護含有上述引物對用于鑒定與小麥抗穗發芽性狀相關的kasp分子標記的檢測試劑盒。
11、本專利技術還保護上述引物對或上述檢測試劑盒在分子標記輔助小麥抗穗發芽選擇育種中的應用，具體操作為：
12、以待測小麥樣品的dna作為模板，分別用seq?id?no.1、seq?id?no.2、seq?id?no.3所示的引物對模板進行pcr擴增；
13、利用omega?fluo?star對擴增好的pcr產物進行基因分型，收集snp在小麥中的分布結果，判定標準為點的顏色和聚集在橫軸或縱軸的位置：信號為橘黃色，聚集在橫軸附近且與抗穗發芽對照親本聚集在一起，判定為抗穗發芽基因型；信號為藍色，與縱軸和感穗發芽對照親本聚集在一起，判定為感穗發芽基因型。
14、利用本專利技術提供的分子標記kasp5d3041對小麥的穗發芽抗性具有顯著影響，根據結果結合穗發芽表型進行標記輔助選擇，篩選含有抗穗發芽位點的優異種質用于小麥抗穗發芽育種，提高育種效率，加快小麥抗穗發芽育種進程。
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1.一種高通量小麥抗穗發芽分子標記KASP5D3041，其特征在于，該分子標記對應抗穗發芽主效位點QPhs-5DS的物理位置在小麥5D染色體短臂7018543bp處，該分子標記為T或C。
2.擴增權利要求1所述分子標記的引物對，其特征在于，該標記為KASP高通量SNP標記，包括2條正向引物，1條反向引物；引物序列如下：
3.含有權利要求2所述的引物對用于鑒定與小麥抗穗發芽性狀相關的KASP分子標記的檢測試劑盒。
4.權利要求2所述的引物對或權利要求3所述的檢測試劑盒在分子標記輔助小麥抗穗發芽選擇育種中的應用。
5.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，具體操作為：
【技術特征摘要】
1.一種高通量小麥抗穗發芽分子標記kasp5d3041，其特征在于，該分子標記對應抗穗發芽主效位點qphs-5ds的物理位置在小麥5d染色體短臂7018543bp處，該分子標記為t或c。
2.擴增權利要求1所述分子標記的引物對，其特征在于，該標記為kasp高通量snp標記，包括2條正向引物，1條反...
【專利技術屬性】
技術研發人員：王丹峰，劉樹兵，劉靜嫻，燕強，代文慧，熊海鋒，穆蒙迪，王靜雯，
申請(專利權)人：周口師范學院，
類型：發明
國別省市：
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