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    一種與雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記與應(yīng)用制造技術(shù)

    技術(shù)編號:44049133 閱讀:9 留言:0更新日期:2025-01-15 01:29
    本發(fā)明專利技術(shù)公開了一種與雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記與應(yīng)用,該方法利用產(chǎn)蛋時間數(shù)據(jù),并對產(chǎn)蛋時間性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),發(fā)現(xiàn)在雞參考基因組Gallus_gallus.GRCg6a版本9號染色體上的第5817488bp處有一個C>A的核苷酸單堿基突變,定位到PIK3CB基因內(nèi)部,該突變顯著影響雞的產(chǎn)蛋時間。同時,公開了該分子標(biāo)記的獲得及應(yīng)用。本發(fā)明專利技術(shù)還提供了一種影響雞產(chǎn)蛋時間的分子標(biāo)記基因分型檢測方法,利用該方法可建立高效準(zhǔn)確的分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),將其應(yīng)用于雞產(chǎn)蛋穩(wěn)定性的遺傳改良中,從而提高雞的產(chǎn)蛋性能及其耐逆性。

    【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】

    本專利技術(shù)涉及分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù)及動物遺傳育種,特別涉及一種與雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)的snp分子標(biāo)記與應(yīng)用。


    技術(shù)介紹

    1、雞蛋的生產(chǎn)成本低,富含多種營養(yǎng)物質(zhì),作為人類最常見的廉價蛋白質(zhì)來源之一。然而在蛋雞生產(chǎn)中,產(chǎn)蛋率的異常波動與產(chǎn)蛋高峰持續(xù)時間不長的現(xiàn)象是當(dāng)前突出的問題。因此如果針對雞的產(chǎn)蛋穩(wěn)定性進(jìn)行選育,提高蛋雞的耐逆性,將大幅提高雞的產(chǎn)蛋性能。

    2、研究表明,雞的產(chǎn)蛋時間與該枚蛋卵黃的排卵時間間隔比較穩(wěn)定,一般為23-25小時。而雞的排卵時間受到上一枚蛋的產(chǎn)出、光照、激素水平、生理狀態(tài)等的影響。其中激素水平主要是指促黃體生成素作為排卵的信號,其高濃度水平一般出現(xiàn)在排卵前4-8小時且需處于黑暗環(huán)境下,因此正常生理狀態(tài)下的雞排卵時間與產(chǎn)蛋時間均是在上午。有研究表明,產(chǎn)蛋時間與產(chǎn)蛋穩(wěn)定性數(shù)、產(chǎn)蛋數(shù)均顯著相關(guān),即一只雞的平均產(chǎn)蛋時間越早,其越接近于每天穩(wěn)定產(chǎn)一個蛋的狀態(tài),且其后期產(chǎn)蛋數(shù)就越多。同時,產(chǎn)蛋時間可以在產(chǎn)蛋高峰期進(jìn)行測量,可作為后期產(chǎn)蛋性能的早選關(guān)聯(lián)性狀之一,加快育種進(jìn)展的速度。此外,產(chǎn)蛋時間的早晚不僅與產(chǎn)蛋性能密切相關(guān),而且較早較且統(tǒng)一的產(chǎn)蛋時間也更方便養(yǎng)殖人員管理,增加養(yǎng)殖場效益。因此,提前產(chǎn)蛋時間可作為目前的蛋雞育種工作的重點(diǎn)之一。


    技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

    1、鑒于以上研究背景,通過對多個產(chǎn)蛋母的產(chǎn)蛋高峰期內(nèi)一段時間每一枚雞蛋產(chǎn)出時間的統(tǒng)計,可獲得單一個體的產(chǎn)蛋時間表型數(shù)據(jù)。再利用高通量測序與gwas(全基因組關(guān)聯(lián)分析genome-wide?association?study),可以快速、高效、準(zhǔn)確的選擇與雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)的snp。從而填補(bǔ)國際上對產(chǎn)蛋時間性狀gwas研究的空白,對我國雞育種事業(yè)有著重要的意義。本專利技術(shù)的首要目的在于提供一個用于選擇雞產(chǎn)蛋時間性狀的snp分子標(biāo)記。本專利技術(shù)基于高產(chǎn)蛋雞專門化母本品系,運(yùn)用全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法尋找與雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)的snp分子標(biāo)記,以作為對雞產(chǎn)蛋時間性狀進(jìn)行標(biāo)記輔助選擇的snp分子標(biāo)記。

    2、本專利技術(shù)的第二個目的在于提供上述雞產(chǎn)蛋時間性狀的snp分子標(biāo)記在雞遺傳育種中應(yīng)用。

    3、為尋找上述目的中的snp,本專利技術(shù)采用的技術(shù)方案是:與雞產(chǎn)蛋時間相關(guān)的snp分子標(biāo)記,所述snp分子標(biāo)記選自chr9_5817488,snp分子標(biāo)記chr9_5817488含有雞參考基因組gallus_gallus.grcg6a版本9號染色體上第5817488bp處多態(tài)性為c/a的氨基酸序列。

    4、所述snp分子標(biāo)記chr9_5817488所含多態(tài)性位點(diǎn)的基因型為cc基因型,表明具有提前的產(chǎn)蛋平均時間。

    5、本專利技術(shù)還提供一種引物組,用于擴(kuò)增所述與雞產(chǎn)蛋時間相關(guān)的snp分子標(biāo)記,所述引物組包括如seq?id?no.2所示的上游引物和如seq?id?no.3所示的下游引物。

    6、上游引物primer-f:tgatctgcaaggtcttttcca(seq?id?no.01),

    7、下游引物primer-r:tcttgatgtggttggggttc(seq?id?no.02)。

    8、一種試劑盒,包括所述引物組。

    9、本專利技術(shù)還提供了一種對雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)分子標(biāo)記的檢測在雞遺傳育種中的應(yīng)用,用于鑒別不同的產(chǎn)蛋時間的雞只。

    10、本專利技術(shù)還提供了一種選擇產(chǎn)蛋時間早的雞品系的方法,包括以下步驟:

    11、(1)獲得待測雞個體的全基因組dna,并將其作為模板,采用如權(quán)利要求3所述的引物組或權(quán)利要求4所述的試劑盒進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得包含chr9:5817488位點(diǎn)的dna片段;

    12、(2)鑒定所述dna片段在chr9:5817488位點(diǎn)的基因型,當(dāng)經(jīng)過sanger測序后,保留所述待測雞個體的snp分子標(biāo)記chr9_5817488所含多態(tài)性位點(diǎn)的基因型為cc的個體,以提高該位點(diǎn)的等位基因c的頻率,從而使后代雞的平均產(chǎn)蛋時間提前,進(jìn)而提高其產(chǎn)蛋性能及其穩(wěn)定性。淘汰所述待測雞個體的snp分子標(biāo)記chr9_5817488所含多態(tài)性位點(diǎn)的基因型為ca、aa的個體。

    13、本文專利技術(shù)相對于現(xiàn)有技術(shù)具有以下優(yōu)點(diǎn)和效果:本專利技術(shù)國際首次研究并確定影響雞產(chǎn)蛋時間性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,驗證其對產(chǎn)蛋時間的影響效應(yīng),最終建立分子輔助育種技術(shù),將其應(yīng)用于雞產(chǎn)蛋性能及其穩(wěn)定性的遺傳改良中。

    本文檔來自技高網(wǎng)...

    【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】

    1.一種與雞產(chǎn)蛋時間相關(guān)的SNP分子標(biāo)記,其特征在于:所述SNP分子標(biāo)記選自chr9_5817488,SNP分子標(biāo)記chr9_5817488含有雞參考基因組Gallus_gallus.GRCg6a版本9號染色體上第5817488bp處多態(tài)性為C/A的氨基酸序列。

    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的SNP分子標(biāo)記,其特征在于,所述SNP分子標(biāo)記chr9_5817488所含多態(tài)性位點(diǎn)的基因型為CC基因型,表明具有提前的產(chǎn)蛋平均時間。

    3.一種引物組,用于擴(kuò)增權(quán)利要求1或2所述與雞產(chǎn)蛋時間相關(guān)的SNP分子標(biāo)記,其特征在于,所述引物組包括如SEQ?ID?NO.01所示的上游引物和如SEQ?ID?NO.02所示的下游引物。

    4.一種試劑盒,其特征在于,包括權(quán)利要求3所述引物組。

    5.一種如權(quán)利要求1-2所述的SNP分子標(biāo)記、如權(quán)利要求3所述的引物組或權(quán)利要求4所述的試劑盒在雞育種中的應(yīng)用:鑒別不同產(chǎn)蛋時間的雞只。

    6.一種選擇產(chǎn)蛋時間早的雞品系的方法,其特征在于,包括以下步驟:

    7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,在步驟(1)中,所述PCR擴(kuò)增的反應(yīng)體系為:40ul反應(yīng)體系,包括DNA模板4.0ul,雙蒸水12ul,Master?Mix20ul,上游引物2ul,下游引物2ul;

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    【技術(shù)特征摘要】

    1.一種與雞產(chǎn)蛋時間相關(guān)的snp分子標(biāo)記,其特征在于:所述snp分子標(biāo)記選自chr9_5817488,snp分子標(biāo)記chr9_5817488含有雞參考基因組gallus_gallus.grcg6a版本9號染色體上第5817488bp處多態(tài)性為c/a的氨基酸序列。

    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的snp分子標(biāo)記,其特征在于,所述snp分子標(biāo)記chr9_5817488所含多態(tài)性位點(diǎn)的基因型為cc基因型,表明具有提前的產(chǎn)蛋平均時間。

    3.一種引物組,用于擴(kuò)增權(quán)利要求1或2所述與雞產(chǎn)蛋時間相關(guān)的snp分子標(biāo)記,其特征在于,所述引物組包括如seq?id?no.01...

    【專利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:李競一盛哲雅郭屹凡陳宇琦陳艷王兵輝郭煥杰
    申請(專利權(quán))人:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
    類型:發(fā)明
    國別省市:

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