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【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物,具體涉及一種膿毒癥凝血相關的預后標志基因及其在制備膿毒癥預后預測診斷產品中的應用。
技術介紹
1、膿毒癥是一種危及生命的疾病,是由宿主系統性炎癥反應引起的多器官功能障礙綜合征,常伴有高發病率和高死亡風險。其機制涉及病原微生物、全身炎癥反應、能量代謝異常、免疫抑制、多靶器官等多個方面。盡管我們在抗感染治療、液體復蘇、多器官支持等醫療技術方面取得了顯著的進步,但這并不能改變膿毒癥患者的惡性進展和患者大概率死亡的事實。
2、膿毒癥誘導的凝血病(sic)獨特的特征是凝血激活伴纖溶過度抑制,被公認為是膿毒癥嚴重程度和病死率的獨立指標。膿毒癥患者最初更容易通過外源性激活途徑、抗凝途徑抑制和細胞因子誘導的凝血擴增表現出促血栓狀態。隨著過量凝血因子的累積消耗和彌散性血管內凝血(dic)的建立,在后期反而會出現反常的出血特征??鼓蚩寡A防性治療似乎有益于膿毒癥患者,例如血栓調節蛋白(tm)是一種內皮抗凝輔助因子,可阻止促炎細胞因子的活性,并已被推薦作為膿毒癥和sic患者的保護性治療。基于最近發布的surviving?sepsis?campaign指南,低分子肝素藥物抗血栓預防治療強烈推薦給膿毒癥或感染性休克患者。此外,在最新的日本surviving?sepsis?campaign指南中,也推薦使用抗凝藥物治療膿毒癥相關的dic。多項臨床試驗和大型觀察性研究報道,血栓形成是covid-19住院患者常見且致命的并發癥。因此,專家共識和治療指南也強烈推薦使用抗血栓預防治療預防。然而,并不是所有的患者都能從抗凝藥物中獲
3、認識到我們正在研究和治療一種綜合征,而不是一種獨特的特定疾病,這是研究和改善臨床問題的一部分,精準醫學在膿毒癥領域是迫切期待的,換句話說,在基因組學水平上的準確診斷和治療對未來的臨床實踐是必要的。但目前尚無一組可對膿毒癥預后及治療反應性進行預測的凝血相關基因。因此,需要開發一組膿毒癥預后標志凝血相關的膿毒癥預后風險預測系統,用于評估預后和指導治療,滿足當前臨床需求。
技術實現思路
1、本專利技術目的是提供一組膿毒癥凝血相關預后標志基因及其在制備膿毒癥預后預測診斷產品中的應用,可用以評估膿毒癥預后并指導選擇治療方案。
2、為實現上述目的,本專利技術采用如下技術方案:
3、本專利技術第一方面,提供了一組膿毒癥凝血相關預后標志基因,所述膿毒癥凝血相關預后標志基因由wfdc1、fgfbp2、cx3cr1、gimap4、elane和defa4組成。
4、本專利技術的第二方面,提供了一種膿毒癥凝血相關預后標志基因的表達水平測定產品,包括檢測所述6種膿毒癥凝血相關預后標志基因在膿毒癥外周血中的mrna表達水平的產品。
5、進一步地,所述產品包括:檢測所述膿毒癥凝血相關預后標志基因的探針和引物。該探針能夠通過分子雜交與目標基因序列結合產生雜交信號,該引物能夠通過基于pcr的技術對目標基因進行擴增。
6、本專利技術中的檢測樣本為膿毒癥患者的外周血,由外周血液樣本分離出白細胞中的mrna或dna,測定6種膿毒癥凝血相關預后標志基因的表達水平,然后通過計算預后評分來預測病人的臨床結果。上述6種基因為wfdc1、fgfbp2、cx3cr1、gimap4、elane和defa4。
7、本專利技術的第三方面,提供了一組所述的膿毒癥凝血相關預后標志基因、所述的膿毒癥凝血相關標志基因的表達水平測定產品在建立預測膿毒癥預后風險的模型/預測膿毒癥凝血狀態的模型、建立預測膿毒癥預后風險預測系統/膿毒癥凝血狀態預測系統或制備膿毒癥預后預測診斷產品/膿毒癥凝血狀態預測診斷產品中的應用。
8、本專利技術的第四方面,提供了一種膿毒癥預后風險預測模型/膿毒癥凝血狀態預測模型,所述預測模型的計算公式如下:
9、
10、所述基因i為所述膿毒癥凝血相關預后標志基因:wfdc1、fgfbp2、cx3cr1、gimap4、elane和defa4。評分越高患者的死亡風險越大,評分越高患者高凝狀態的風險也越大。
11、所述基因i的表達水平為所述膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna表達水平。
12、所述基因i的系數為將所述膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna表達水平進行cox多因素回歸分析后獲得。
13、由于不同的樣本,不同的檢測手段所獲得的各基因的mrna表達水平不同,因此所測得的基因i的系數會有所不同。
14、進一步地,所述膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna表達水平的測定方法包括pcr、基因芯片、二代高通量測序等中的任意一種或至少兩種的組合。
15、本專利技術的第五方面,提供了一種所述的預測模型在制備預測膿毒癥預后風險產品/預測膿毒癥凝血風險產品中的應用,所述預測模型的輸入變量為所述的膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna水平,通過計算即可獲得膿毒癥預后風險/膿毒癥凝血風險的預測分值。
16、本專利技術的第六方面,提供了一種膿毒癥預后風險預測系統/膿毒癥凝血風險預測系統,所述系統包括:處理器和存儲器;所述存儲器耦接到所述處理器,所述存儲器存儲指令,當所述指令由所述處理器執行時使用以下步驟:將膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna表達水平輸入所述預測模型中,獲得膿毒癥預后風險/膿毒癥凝血風險預測分值。
17、本專利技術的第七方面,提供了一種計算機可讀存儲介質,其上存儲有計算機程序,所述計算機程序被處理器執行時使用以下步驟:將膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna的表達水平輸入如所述預測模型中,經過計算獲得膿毒癥預后風險/膿毒癥凝血風險預測分值。
18、本專利技術的第八方面,提供了一種膿毒癥預后預測診斷產品/膿毒癥凝血狀態預測診斷產品,包括:
19、膿毒癥凝血相關預后標志基因的mrna水平測定產品;
20、和所述的膿毒癥預后風險預測系統/膿毒癥凝血風險預測系統或所述的計算機可讀存儲介質。
21、本專利技術至少具有如下優點和有益效果:本專利技術選取迄今為止全面且無偏見的膿毒癥全基因組數據,采用了一種多步驟生物信息學策略,開發了一組膿毒癥凝血相關預后標志基因。時間依賴性roc曲線及多變量cox回歸分析顯示本專利技術開發的6-基因預后評分系統對總生存率(os)的判別能力明顯優于其他臨床因素(如年齡、性別),且在3周的曲線下面積不劣于其在1或2周的面積,說明本預后評分系統對膿毒癥預后有獨立且較持久的判別力。本專利技術的6-基因預后評分系統在多個獨立的臨床病例中進行驗證,結果顯示該評分系統能夠準確預測膿毒癥患者的預后情況,與實際臨床病例的預后結果高度一致,相比傳統的預后評估方法,本專利技術的基因評分系統操作簡便,檢測過程快捷,大大縮短了預后評估的時間,提升了臨床本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.一種膿毒癥凝血相關預后標志基因,其特征在于:所述膿毒癥凝血相關預后標志基因由WFDC1、FGFBP2、CX3CR1、GIMAP4、ELANE和DEFA4?6個基因組成。
2.一種膿毒癥凝血相關預后標志基因的表達水平測定產品,其特征在于:包括檢測權利要求1中所述6種基因mRNA表達水平的產品。
3.根據權利要求2所述的膿毒癥凝血相關預后標志基因的表達水平測定產品,其特征在于:所述產品包括:檢測權利要求1中所述6種基因的探針和引物。
4.一種權利要求1所述的標志基因或權利要求2-3所述的測定產品的應用,其特征在于,所述應用包括下述中的至少一種:
5.一種膿毒癥預后風險預測模型/膿毒癥凝血狀態預測模型,其特征在于,所述預測模型的計算公式如下:
6.根據權利要求5所述的預測模型,其特征在于,所述基因的mRNA表達水平的測定方法包括PCR、基因芯片、二代高通量測序中的任意一種或至少兩種的組合。
7.一種權利要求5或6所述的預測模型在制備預測膿毒癥風險產品/預測膿毒癥凝血風險產品中的應用。
8.一種膿毒癥
9.一種計算機可讀存儲介質,其上存儲有計算機程序,其特征在于,所述計算機程序被處理器執行時使用以下步驟:
10.一種膿毒癥預后預測診斷產品/膿毒癥凝血狀態預測診斷產品,其特征在于,包括:
...【技術特征摘要】
1.一種膿毒癥凝血相關預后標志基因,其特征在于:所述膿毒癥凝血相關預后標志基因由wfdc1、fgfbp2、cx3cr1、gimap4、elane和defa4?6個基因組成。
2.一種膿毒癥凝血相關預后標志基因的表達水平測定產品,其特征在于:包括檢測權利要求1中所述6種基因mrna表達水平的產品。
3.根據權利要求2所述的膿毒癥凝血相關預后標志基因的表達水平測定產品,其特征在于:所述產品包括:檢測權利要求1中所述6種基因的探針和引物。
4.一種權利要求1所述的標志基因或權利要求2-3所述的測定產品的應用,其特征在于,所述應用包括下述中的至少一種:
5.一種膿毒癥預后風險預測模型/膿毒癥...
【專利技術屬性】
技術研發人員:彭志勇,孫中毅,曲嘉琛,胡暢,
申請(專利權)人:武漢大學中南醫院,
類型:發明
國別省市:
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