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【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及生物數據管理,具體為一種生物數據管理及系統發育分析流程化方法。
技術介紹
1、物數據管理是指對生物實驗過程中產生的各類數據(如樣本信息、實驗記錄、實驗結果等)進行系統性收集、存儲、組織、分析和共享的過程。其目標是確保數據的完整性、一致性和可追溯性,以支持科學研究的透明性和可重復性,并促進團隊合作和知識共享。通過有效的數據管理,研究人員能夠更快速地獲取重要信息,優化實驗設計,并作出基于數據的科學決策。
2、在對生物培養過程中,期間需要對培養皿中添加一些抗生素、化學誘導劑與緩沖劑等試劑,可以極大地改善細胞培養的效果,促進實驗的成功和研究成果的獲得,然而在操作過程中,需要人工進行添加,操作較為麻煩,針對上述問題,專利技術人提出一種生物數據管理及系統發育分析流程化方法用于解決上述問題。
技術實現思路
1、為了解決在培養過程中人工添加試劑過于麻煩的問題;本專利技術的目的在于提供一種生物數據管理及系統發育分析流程化方法。
2、為解決上述技術問題,本專利技術采用如下技術方案:一種生物數據管理,包括以下步驟:
3、步驟一、數據采集與錄入;
4、步驟二、數據存儲與組織;
5、步驟三、數據檢測與查詢;
6、步驟四、數據分析與可視化;
7、步驟五、報告生成與分享。
8、優選地,步驟一中的數據采集與錄入:建立一個用戶友好的界面,允許實驗人員通過表單錄入樣本信息(樣本id、來源、生物種類、實驗日期等
9、步驟二中的數據存儲與組織:使用關系型數據庫(如mysql或postgresql)來存儲數據,設計結構化的數據表格,如樣本表、測序數據表和實驗記錄表。確保數據的完整性和一致性;
10、步驟三中的數據檢測與查詢:實現強大的查詢功能,允許用戶根據不同參數(如樣本id、日期范圍、實驗類型等)快速檢索記錄。提供多條件篩選和排序功能,方便數據分析;
11、步驟四中的數據分析與可視化:集成數據分析模塊,支持基礎統計分析(如平均值、標準差),并生成可視化圖表(如餅圖、柱狀圖、折線圖),幫助科研人員直觀理解實驗結果集成數據分析模塊,支持基礎統計分析(如平均值、標準差),并生成可視化圖表(如餅圖、柱狀圖、折線圖),幫助科研人員直觀理解實驗結果;
12、步驟五中帶的報告生成與分享:自動化報告生成工具,匯總實驗數據和分析結果,生成標準化的實驗報告(如pdf格式),便于分享和存檔,支持與其他研究人員或團隊的在線協作與反饋。
13、一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于,包括以下步驟:
14、s1、樣本準備與培養:樣本選擇、培養條件與記錄培養信息;
15、s2、數據采集:生長數據記錄與核酸提取;
16、s3、數據管理:構建數據庫與數據清洗;
17、s4、系統發育分析:序列比對與構建系統發育樹;
18、s5、結果展示與報告生成:數據可視化與報告撰寫。
19、優選地,s1中的樣本選擇:根據研究目標選擇合適的生物材料(細菌、真菌等);
20、s1中的培養條件設置:在培養箱中設定溫度、濕度等;
21、s1中的記錄培養信息:使用電子實驗室筆記本記錄接種時間和培養條件;
22、s2中的生長數據記錄:定期采集od值、細胞計數等;
23、s2中的核酸提取:按計劃提取樣本dna/rna,記錄樣本相關元數據;
24、s3中的構建數據庫:管理樣本信息、生長數據和序列數據;
25、s3中的數據清洗:確保數據一致性,與缺失值處理;
26、s4中的序列比對:使用clustal?omega等軟件進行比對;
27、s4中的構建系統發育樹:使用mega或raxml等工具,進行支持度統計;
28、s5中的數據可視化:用figtree或itol生成系統發育樹圖;
29、s5中的報告撰寫:整合結果與圖表,撰寫標準化實驗報告,分享結果并邀請反饋。
30、一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,包括培養箱,其特征在于:所述培養箱包括箱體與監測組件,所述監測組件安裝在箱體內,所述箱體內安裝有監測機構,所述箱體年內安裝有培養機構,所述箱體內壁頂端安裝有添加機構。
31、優選地,所述監測機構包括外接環形滑道,所述外接環形滑道內滑動設有內齒環,所述內齒環底端安裝有安裝板,所述監測組件安裝在安裝板底端,所述箱體頂端轉動插設有轉動桿,所述轉動桿外側安裝有齒輪,所述齒輪與內齒環相互嚙合,所述箱體頂端安裝有一號電機,所述一號電機輸出軸端部貫穿插設在箱體內并與轉動桿固定連接,所述箱體內壁固定設有放置板,所述放置板底端轉動設有呈對稱分布的螺紋桿,所述螺紋桿外側螺紋套設有螺紋滑塊,所述放置板內開設有呈對稱分布的滑動槽,兩個所述螺紋滑塊活動插設在兩個滑動槽內,所述螺紋滑塊頂端安裝有放置盒,所述放置盒內活動插設有蓋板,所述蓋板兩端均固定設有兩個固定桿,所述放置盒頂端兩側開設有方形槽,位于蓋板兩側的兩個所述固定桿分別活動插在兩個方形槽內,所述放置板頂端兩側均固定設有呈對稱分布的立桿,所述蓋板頂端固定設有呈對稱分布的導向桿,所述箱體兩側安裝均安裝有二號電機,所述二號電機輸出軸端部貫穿插設在箱體內并與螺紋桿固定連接,所述添加機構包括電缸,所述電缸安裝在箱體頂端,所述電缸貫穿插設在箱體內并固定設有固定板,所述固定板內安裝有若干個噴頭。
32、與現有技術相比,本專利技術的有益效果在于:
33、1、本專利技術中通過設置監測機構可以對兩個培養皿進行輪流監測,并進行數據收集,接著通過培養機構與添加機構,可以自動對培養皿內添加藥劑,可以極大地改善細胞培養的效果,促進實驗的成功和研究成果的獲得,避免人工操作較為麻煩;
34、2、本專利技術中通過設置螺紋桿、螺紋滑塊、放置盒與蓋板等結構相互配合,可以帶動放置盒移動,同時可以打開蓋板,方便噴頭向培養皿內添加藥劑,避免人工操作較為麻煩的問題;
35、3、本專利技術中通過設置內齒環、外接環形滑道與檢測組件等結構相互配合,可以對兩個放置盒內的培養皿進行數據檢測并進行及時記錄。
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1.一種生物數據管理,其特征在于,包括以下步驟:
2.如權利要求1所述的一種生物數據管理,其特征在于:
3.如權利要求1-2任意一項所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于,包括以下步驟:
4.如權利要求1所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于:
5.如權利要求3所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,包括培養箱,其特征在于:所述培養箱包括箱體(1)與監測組件(204),所述監測組件(204)安裝在箱體(1)內,所述箱體(1)內安裝有監測機構(2),所述箱體(1)年內安裝有培養機構(3),所述箱體(1)內壁頂端安裝有添加機構(4)。
6.如權利要求5所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于:所述監測機構(2)包括外接環形滑道(201),所述外接環形滑道(201)內滑動設有內齒環(202),所述內齒環(202)底端安裝有安裝板(203),所述監測組件(204)安裝在安裝板(203)底端,所述箱體(1)頂端轉動插設有轉動桿(205),所述轉動桿(
7.如權利要求5所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于:所述箱體(1)內壁固定設有放置板(301),所述放置板(301)底端轉動設有呈對稱分布的螺紋桿(302),所述螺紋桿(302)外側螺紋套設有螺紋滑塊(303),所述放置板(301)內開設有呈對稱分布的滑動槽(304),兩個所述螺紋滑塊(303)活動插設在兩個滑動槽(304)內,所述螺紋滑塊(303)頂端安裝有放置盒(305),所述放置盒(305)內活動插設有蓋板(306),所述蓋板(306)兩端均固定設有兩個固定桿(311),所述放置盒(305)頂端兩側開設有方形槽(310),位于蓋板(306)兩側的兩個所述固定桿(311)分別活動插在兩個方形槽(310)內,所述放置板(301)頂端兩側均固定設有呈對稱分布的立桿(312),所述蓋板(306)頂端固定設有呈對稱分布的導向桿(313),所述箱體(1)兩側安裝均安裝有二號電機(307),所述二號電機(307)輸出軸端部貫穿插設在箱體(1)內并與螺紋桿(302)固定連接。
8.如權利要求5所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于:所述添加機構(4)包括電缸(401),所述電缸(401)安裝在箱體(1)頂端,所述電缸(401)貫穿插設在箱體(1)內并固定設有固定板(402),所述固定板(402)內安裝有若干個噴頭(403)。
...【技術特征摘要】
1.一種生物數據管理,其特征在于,包括以下步驟:
2.如權利要求1所述的一種生物數據管理,其特征在于:
3.如權利要求1-2任意一項所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于,包括以下步驟:
4.如權利要求1所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于:
5.如權利要求3所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,包括培養箱,其特征在于:所述培養箱包括箱體(1)與監測組件(204),所述監測組件(204)安裝在箱體(1)內,所述箱體(1)內安裝有監測機構(2),所述箱體(1)年內安裝有培養機構(3),所述箱體(1)內壁頂端安裝有添加機構(4)。
6.如權利要求5所述的一種生物數據管理所用的系統發育分析流程化方法,其特征在于:所述監測機構(2)包括外接環形滑道(201),所述外接環形滑道(201)內滑動設有內齒環(202),所述內齒環(202)底端安裝有安裝板(203),所述監測組件(204)安裝在安裝板(203)底端,所述箱體(1)頂端轉動插設有轉動桿(205),所述轉動桿(205)外側安裝有齒輪(206),所述齒輪(206)與內齒環(202)相互嚙合,所述箱體(1)頂端安裝有一號電機(207),所述一號電機(207)輸出軸端部貫穿插設在箱體(1)內并與轉動桿(205)固定連接。
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