【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于snp，具體涉及一種與綿羊角長度性狀相關的snp分子標記及其應用。
技術介紹
1、西藏羊又稱藏羊、藏系羊，是中國古老的綿羊品種之一，由于分布面廣及不同的地理氣候特點，分列出一些獨具特點的類型，青海省分出高原型(草地型)藏羊、山谷型藏羊和歐拉型藏羊三種類型，其中90％以上屬于高原型。高原型藏羊的公羊角粗大，長而扁平，呈螺旋形或捻曲狀，尖端向外，向左右伸展，母羊角扁平，比公羊角稍小，多呈捻曲狀，有的呈小柱角，有部分公羊、母羊無角。在現代集約化飼養條件下，大角易對家畜造成角斗傷殘，從而影響家畜的胴體、毛皮質量，且容易發生感染，并且角的營養物質需要較多，所以培育無角綿羊品種對畜牧業發展具有很大的意義。
2、早期研究認為位于常染色體ho基因座上的3個等位基因調控綿羊有角與無角表型，即為hop、ho+和hoh1，其中ho+為有角等位基因，hoh1為性連鎖角等位基因，hop為無角等位基因(dolling?chs.breeding?merinos.rigby,adelaide,australia,1970)。在常規育種中，為了培育無角品種，經常使用測交方法剔除顯性無角雜合基因型個體，但通過測交來判定基因型的方法周期長，甚至要幾個世代才能完成，并且費財費力。分子標記輔助選擇將為這一特殊種質資源的發掘和利用提供新的思路和方法。運用現代分子生物學技術，發掘和收集無角藏羊品種種質資源，開展本品種分子選育，是保證選育進展的重要途徑，也是長遠培育無角藏羊新品種(系)的首要步驟。
3、目前有關報道發現在rxfp2基因(u
4、有研究表明羊角的長度、角基周長和角體積可以適度遺傳，這意味著角長度在一定程度上會影響角的整體大小或有無，但現未見rxfp2基因第10號染色體(nc_056063.1)的第30947874位點與角長度相關的報道。
技術實現思路
1、本專利技術的目的在于提供一種新的rxfp2基因的snp，以及將其用于選育綿羊角長度性狀，從而得到無角綿羊。
2、本專利技術提供了檢測與綿羊角長性狀相關的snp分子遺傳標記的試劑在選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系中的用途，
3、選育或輔助選育角長短/長的綿羊；
4、與綿羊角長性狀相關的snp分子遺傳標記位于綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位，多態性為c或t。
5、進一步地，第30947874位在綿羊角長度性狀的優勢等位基因為c等位基因；優勢基因型為cc基因型；cc基因型的綿羊的角長短。
6、本專利技術還提供了一種選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系的方法，包括如下步驟：
7、提取待檢綿羊樣本的基因組總dna，檢測綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位點的脫氧核苷酸，測出第30947874位點的脫氧核苷酸為t或c，確定綿羊的基因型是tt型、tc或cc型；
8、cc基因型綿羊的角長短于tc基因型綿羊和tt基因型綿羊，tc基因型綿羊的角長短于tt基因型綿羊。
9、進一步地，所述步驟還包括：
10、取cc型綿羊個體進行下一步的育種，即可；
11、所述綿羊為藏羊，優選地，所述綿羊為高原藏羊。
12、本專利技術最后提供了一種用于檢測與綿羊角長性狀相關的snp分子遺傳標記的試劑盒，它包括檢測綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位點的脫氧核苷酸的試劑。
13、進一步地，所述的試劑為測序試劑、pcr檢測試劑、限制性片段長度多態性方法用試劑或者單鏈構象多態性分析用試劑。
14、進一步地，所述試劑為競爭性等位基因特異性pcr檢測試劑，優選包括seq?idno.1～2所示擴增引物和seq?id?no.3所示延伸引物。
15、本專利技術還提供了一種前述試劑盒在選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系中的用途。
16、本專利技術最后提供了一種使用前述試劑盒選育綿羊角長度性狀的方法，包括如下步驟：
17、1)提取待檢綿羊樣本的基因組總dna；
18、2)使用前述試劑盒對步驟1)所得總dna進行pcr擴增，并對擴增片段進行延伸；
19、3)取步驟2)經延伸的pcr產物進行測序，根據綿羊參考基因組第10號染色體上第30947874位點的脫氧核苷酸確定綿羊的基因型是tt型、tc或cc型；
20、cc基因型綿羊的角長短于tc基因型綿羊和tt基因型綿羊，tc基因型綿羊的角長短于tt基因型綿羊。
21、進一步地，所述步驟還包括：
22、選取綿羊參考基因組第10號染色體上第30947874位點為cc型的個體進行下一步的育種；
23、所述綿羊為藏羊，優選地，所述綿羊為高原藏羊。
24、本專利技術所述“選育綿羊角長度性狀“是指在育種過程中，通過選擇和培育特定的角長度性狀特征，以獲得無角綿羊品種。
25、本專利技術所述“無角綿羊“包括完全無角或僅有殘角的綿羊。
26、本專利技術所述“殘角”是指在頭骨上無角的正常位置上長出發育不全的角，它沒有附著在頭骨上，呈骨突狀。
27、本專利技術所述“角長度”是指羊角基部至角尖端沿角背面縱棱的弧線長。
28、本專利技術首次發現rxfp2基因中位于綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位點的多態性與綿羊(特別是藏羊)角長度具有非常強的相關性，該位點可以作為綿羊角長度性狀的分子遺傳標記，通過檢測該snp位點篩選綿羊的角長度性狀短的優良綿羊，進行無角綿羊的選育或輔助選育，從而有效組建無角藏羊群體，構建綿羊優異角長選育體系，為綿羊無角品種改良提供珍貴的遺傳資源，有利于提高品種優質的無角綿羊品種培育進程，同時也有利于提高無角綿羊選種的準確性。
29、本專利技術的關鍵在于發現rxfp2基因中位于綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位點多態性與綿羊(特別是藏羊本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.檢測與綿羊角長性狀相關的SNP分子遺傳標記的試劑在選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系中的用途，其特征在于：
2.根據權利要求1所述的用途，其特征在于：第30947874位在綿羊角長度性狀的優勢等位基因為C等位基因；優勢基因型為CC基因型；CC基因型的綿羊的角長短。
3.一種選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系的方法，其特征在于：包括如下步驟：
4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于：所述步驟還包括：
5.一種用于檢測與綿羊角長性狀相關的SNP分子遺傳標記的試劑盒，其特征在于：它包括檢測綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位點的脫氧核苷酸的試劑。
6.根據權利要求5所述的試劑盒，其特征在于：所述的試劑為測序試劑、PCR檢測試劑、限制性片段長度多態性方法用試劑或者單鏈構象多態性分析用試劑。
7.根據權利要求6所述的試劑盒，其特征在于：所述試劑為競爭性等位基因特異性PCR檢測試劑，優選包括SEQ?ID?NO.1～2所示擴增引物和SEQ?ID?NO.3所示延伸引物。
...【技術特征摘要】
1.檢測與綿羊角長性狀相關的snp分子遺傳標記的試劑在選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系中的用途，其特征在于：
2.根據權利要求1所述的用途，其特征在于：第30947874位在綿羊角長度性狀的優勢等位基因為c等位基因；優勢基因型為cc基因型；cc基因型的綿羊的角長短。
3.一種選育或輔助選育與綿羊角長性狀相關的綿羊品種或品系的方法，其特征在于：包括如下步驟：
4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于：所述步驟還包括：
5.一種用于檢測與綿羊角長性狀相關的snp分子遺傳標記的試劑盒，其特征在于：它包括檢測綿羊參考基因組第10號染色體的第30947874位點的脫氧核苷酸的試...
【專利技術屬性】
技術研發人員：田得紅，趙凱，張子安，張沛，王源，趙進財，韓步鷹，李雪，陳存霞，田菲，劉思嘉，
申請(專利權)人：中國科學院西北高原生物研究所，
類型：發明
國別省市：
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