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    一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法技術

    技術編號:44094133 閱讀:14 留言:0更新日期:2025-01-21 12:28
    本發明專利技術涉及一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,屬于蛋白質提取方法技術領域。為解決現有方法只能提取核蛋白,無法直接提取DNA結合蛋白的問題,本發明專利技術提供了一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,將植物材料用液氮研磨成粉末并加入到溶液1中充分震蕩,過濾收集濾液,離心收集沉淀;用NaCl溶液重懸沉淀后震蕩并超聲;向體系中加入超純水將NaCl濃度稀釋到0.14mol/L,離心收集沉淀,得到DNA?蛋白復合物,從DNA?蛋白復合物中提取純化蛋白,得到植物DNA結合蛋白。本發明專利技術能夠直接提取植物DNA結合蛋白,且組蛋白含量高,細胞質蛋白和葉綠體的污染明顯減少,DNA結合蛋白的得率較經典方法提高了2~3倍。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術屬于蛋白質提取方法,尤其涉及一種高效的植物dna結合蛋白提取方法。


    技術介紹

    1、dna結合蛋白包括組蛋白修飾因子、染色質重塑因子和非組蛋白等。dna結合蛋白在調節基因表達、表觀遺傳學調控、維護染色質結構和保持基因組完整性方面起關鍵作用,也為dna包裝提供支架,并構成表觀遺傳調控與基因組保持的基礎。例如,組蛋白修飾因子在組蛋白的翻譯后修飾(ptm)中發揮重要作用,對表觀遺傳修飾至關重要。近期研究表明,gcn5等組蛋白乙酰轉移酶參與調控植物的應激反應基因,從而增強植物對環境脅迫的適應性。染色質重塑復合體,例如swi/snf復合體,利用atp水解重新定位或重組核小體,從而提高dna轉錄的可及性。在擬南芥中,swi/snf復合體參與開花時間的調節和對環境刺激的反應。非組蛋白dna結合蛋白,如轉錄因子和結構蛋白,在染色質動力學中也發揮重要作用。例如,myb轉錄因子家族已被證明能與染色質相互作用,并在紫外線下調節類黃酮生物合成相關基因的表達。在植物中,這些蛋白質參與多種生物過程,包括發育、應激反應和表觀遺傳調控。dna結合蛋白在植物的各種發育過程中至關重要。例如,polycomb組(pcg)蛋白參與抑制特定發育基因的表達。最近的研究顯示,pcg復合體通過表觀遺傳沉默調節基因表達模式,從而影響擬南芥莖和根的發育。除了發育作用外,dna結合蛋白還介導植物對生物和非生物脅迫的反應。組蛋白變體h2a.z與促使干旱條件下應激反應基因的表達相關,表明其在植物抗逆性中起到關鍵作用。

    2、鑒定dna結合蛋白的完整清單將有助于深化對基因調控及其他與染色質相關過程的理解。dna結合蛋白的研究推動了多種技術的發展,如染色質免疫沉淀(chip),為研究人員提供了研究dna結合蛋白在基因組結合模式的能力。這為理解植物基因表達的調控網絡提供了新思路。例如,chip-seq分析揭示了水稻種子發育過程中某些組蛋白修飾與基因表達譜之間的關系。此外,整合多組學方法,包括基因組學、轉錄組學和表觀基因組學,已開始闡明植物中染色質動力學與基因調控之間的復雜相互作用。

    3、因此,分離dna結合蛋白在生命科學研究中非常重要,然而目前分離dna結合蛋白的方法并不理想。經典的方法都是先分離細胞核,再提取dna結合蛋白。然而,經典方法不僅提取過程復雜,還有很高的背景,尤其是細胞質蛋白的含量很高,一般獲得的蛋白中核蛋白僅占25%左右,此外,在液氮研磨過程中,大量的細胞核會被研磨破碎,導致細胞核的產量降低,從而降低了核蛋白的得率。而最重要的問題是經典的方法是提取核蛋白,并非直接提取dna結合蛋白,而核蛋白中有大量的非dna結合蛋白,給后續分析帶來影響,因此亟需建立能夠直接提取dna結合蛋白的方法。


    技術實現思路

    1、為解決現有方法只能提取核蛋白,無法直接提取dna結合蛋白的問題,本專利技術提供了一種高效的植物dna結合蛋白提取方法。

    2、本專利技術的技術方案:

    3、一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,包括如下步驟:

    4、步驟一、將植物材料用液氮研磨成粉末;

    5、步驟二、將步驟一所得植物粉末加入到溶液1中旋渦震蕩處理,將充分震蕩后的混合體系過濾收集濾液,將所得濾液離心收集沉淀;

    6、步驟三、將步驟二所得沉淀用nacl溶液重新懸浮后旋渦震蕩并進行超聲處理;

    7、步驟四、向步驟三超聲處理后的體系中加入超純水,將nacl濃度稀釋到0.14mol/l,離心收集沉淀,得到dna-蛋白復合物;

    8、步驟五、從步驟四得到的dna-蛋白復合物中提取純化蛋白,即得到植物dna結合蛋白。

    9、進一步的,步驟一還包括將植物材料浸泡到甲醛溶液中進行dna與蛋白質交聯的步驟,然后將所得dna蛋白交聯材料用液氮研磨成粉末。

    10、進一步的,步驟二所述溶液1為含有0.4m?sucrose、1.5mm?mgcl2和1mm?dtt的ph為8.0的10mm?tris-hcl緩沖溶液。

    11、進一步的,步驟二中所述植物粉末與溶液1的質量體積比為1g:10ml,所述旋渦震蕩時間為10~20min。

    12、進一步的,步驟二所述過濾采用2層300目的尼龍布過濾或2-4層miracloth濾布過濾。

    13、進一步的,步驟二所述離心的具體條件為4℃,1000~1200rpm離心10~20min。

    14、進一步的,步驟三所述nacl溶液的濃度為1mol/l。

    15、進一步的,步驟三所述超聲處理在冰浴條件下進行,超聲輸出功率為100~200w,工作時間3s,間隔時間12s,操作總時長20~30min。

    16、進一步的,步驟四所述離心的具體條件為4℃,10000~25000rpm離心5~30min。

    17、進一步的,步驟五需要獲得有活性的植物dna結合蛋白時,用微球菌核酸酶處理所述dna-蛋白復合物并提取純化植物dna結合蛋白;不需要獲得有活性的植物dna結合蛋白時,采用常規提取蛋白的方法從所述dna-蛋白復合物中提取純化植物dna結合蛋白。

    18、進一步的,用微球菌核酸酶處理所述dna-蛋白復合物時,微球菌核酸酶的用量為2μl,微球菌核酸酶的活性為2000gel?units/μl。

    19、本專利技術的有益效果:

    20、本專利技術提供了一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,利用dna結合蛋白在不同濃度nacl溶液中溶解度不同分離dna結合蛋白和其他污染物,能夠直接提取dna結合蛋白。本專利技術所得dna結合蛋白純度較經典方法顯著提高,組蛋白含量高,細胞質蛋白和葉綠體的污染明顯減少,dna結合蛋白的得率較經典方法提高了2~3倍。

    21、本專利技術提供的dna結合蛋白提取方法無需分離細胞核,因此減少了操作步驟,使得提取dna結合蛋白實驗更簡單省時而且高效。本專利技術提取到的dna結合蛋白能夠在蛋白酶k作用下解交聯釋放出dna,便于后續實驗的操作。

    22、本專利技術能夠用于正常的dna結合蛋白提取,也適用于dna和蛋白交聯材料的提取,可用于研究蛋白和dna互作,還能夠用于分離直接或間接與染色質結合的蛋白質,而無需其他核蛋白,從而為轉錄調控、表觀遺傳學和染色質結構的研究提供了更多的便利。

    本文檔來自技高網...

    【技術保護點】

    1.一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,包括如下步驟:

    2.根據權利要求1所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟一還包括將植物材料浸泡到甲醛溶液中進行DNA與蛋白質交聯的步驟,然后將所得DNA蛋白交聯材料用液氮研磨成粉末。

    3.根據權利要求1或2所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二所述溶液1為含有0.4M?sucrose、1.5mM?MgCl2和1mM?DTT的pH為8.0的10mM?Tris-HCl緩沖溶液。

    4.根據權利要求3所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二中所述植物粉末與溶液1的質量體積比為1g:10mL,所述旋渦震蕩時間為10~20min。

    5.根據權利要求4所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二所述過濾采用2層300目的尼龍布過濾或2-4層Miracloth濾布過濾。

    6.根據權利要求5所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二所述離心的具體條件為4℃,1000~1200rpm離心10~20min。

    7.根據權利要求6所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟三所述NaCl溶液的濃度為1mol/L。

    8.根據權利要求7所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟三所述超聲處理在冰浴條件下進行,超聲輸出功率為100~200W,工作時間3s,間隔時間12s,操作總時長20~30min。

    9.根據權利要求8所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟四所述離心的具體條件為4℃,10000~25000rpm離心5~30min。

    10.根據權利要求9所述一種高效的植物DNA結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟五需要獲得有活性的植物DNA結合蛋白時,用微球菌核酸酶處理所述DNA-蛋白復合物并提取純化植物DNA結合蛋白;不需要獲得有活性的植物DNA結合蛋白時,采用常規提取蛋白的方法從所述DNA-蛋白復合物中提取純化植物DNA結合蛋白。

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    【技術特征摘要】

    1.一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,其特征在于,包括如下步驟:

    2.根據權利要求1所述一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟一還包括將植物材料浸泡到甲醛溶液中進行dna與蛋白質交聯的步驟,然后將所得dna蛋白交聯材料用液氮研磨成粉末。

    3.根據權利要求1或2所述一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二所述溶液1為含有0.4m?sucrose、1.5mm?mgcl2和1mm?dtt的ph為8.0的10mm?tris-hcl緩沖溶液。

    4.根據權利要求3所述一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二中所述植物粉末與溶液1的質量體積比為1g:10ml,所述旋渦震蕩時間為10~20min。

    5.根據權利要求4所述一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,其特征在于,步驟二所述過濾采用2層300目的尼龍布過濾或2-4層miracloth濾布過濾。

    6.根據權利要求5所述一種高效的植物dna結合蛋白提取方法,...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:王玉成,王鵬宇,
    申請(專利權)人:東北林業大學,
    類型:發明
    國別省市:

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