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【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及snp分子標記,尤其涉及一種與綿羊多羔性狀相關的snp分子標記及其檢測引物組、試劑盒和應用。
技術介紹
1、繁殖性能是影響羊養殖經濟效益的關鍵因素,特別是產羔數由微效多基因這一核心指標控制,遺傳力較低(0.08-0.18),并且母羊的產羔性狀受環境和飼養條件影響較大,常規育種方法的改良進展相對緩慢。隨著分子標記技術的發展,利用與產羔性狀緊密相關的分子遺傳標記進行精準選擇,可以減少育種過程中的盲目性,提高選育效率,加快育種速度。
2、要推動羊產業的發展,需加強良種選育與推廣,發展適度規模養殖,促進農牧循環。引進國外優良品種,結合我國地方品種,采用先進育種技術培育新羊種是核心任務,可以更好的推動羊產業向健康、安全、高品質發展。
3、杜泊綿羊生長快、肉質優、抗逆性強;湖羊繁殖力高、耐高溫高濕。通過杜泊羊與湖羊的雜交,獲得杜湖雜種綿羊,既兼具兩者的優點,又提升了生長速度和肉質。研究杜湖雜種綿羊的產羔數分子標記,對綿羊多胎資源的開發利用及生產實踐具有重要意義,有助于充分發揮其繁殖潛力,從而為羊產業的可持續發展奠定堅實基礎。
4、隨著分子生物學和基因組學技術的迅速發展,高通量測序、基因組選擇、分子標記以及遺傳修飾技術日益成熟。全基因組重測序通過高精度測序,能夠檢測單核苷酸多態性(snp)、插入缺失(indels)等遺傳變異,結合生物信息學分析,揭示與產羔性狀相關的關鍵基因,為研究動物遺傳特性提供了新的視角。sequenom?massarray技術以其高通量和高準確性,廣泛應用于已知候選基因位
5、將全基因組重測序與sequenom?massarray技術相結合,不僅能夠全面解析杜湖雜種綿羊產羔性狀的遺傳基礎,還可加速育種進程,提升繁殖效率和經濟效益。這種精準育種方法為綿羊多胎資源的開發利用提供了新的機遇,有望推動羊產業向高效益、高質量方向發展。
6、三磷酸腺苷結合盒轉運體a1(atpbinding?cassette?subfamilyamember1,abca1)是由abca1基因編碼的一類膜整合蛋白,屬于三磷酸腺苷結合盒轉運體(abc)超家族成員之一。目前已發現7個abc亞家族共48個成員。abca亞家族共有12個成員,其中abca1主要負責膽固醇和磷脂從細胞內向胞外的轉運,參與高密度脂蛋白(hdl)生成。
7、有研究表明,純合雌性abca1缺陷小鼠在繁殖方面表現出顯著障礙,具體表現為懷孕次數減少、產仔數少,表明abca1基因與繁殖性能存在一定關聯。這可能與該基因在脂質代謝中的重要作用有關,abca1缺陷可能導致脂質代謝失衡,進而影響生殖器官的功能和胚胎發育,最終導致繁殖能力下降(robert?j.aiello?et?al.,2003)。盡管abca1基因多態性在小鼠等模式動物中已有較多研究,但在家畜中的研究尚未開展,這為探索家畜繁殖性能的分子基礎提供了新的方向。
技術實現思路
1、本專利技術的目的在于提供一種利用sequenom?snp技術檢測綿羊abca1基因單核苷酸多態性的方法及其應用,為綿羊的分子輔助標記選擇育種提供基礎數據,加快中國綿羊種質資源的改良工作。
2、為了實現上述專利技術目的,本專利技術提供以下技術方案:
3、一種與綿羊多羔性狀相關的snp分子標記在綿羊多羔性檢測或綿羊育種中的應用,所述snp分子標記位于綿羊基因組ars-ui_ramb_v2.0第2號染色體abca1基因組序列第18197516bp位點,堿基多態性為t>c。
4、優選的,所述位點的tt基因型母羊的產羔數顯著高于tc、cc基因型。
5、本專利技術還提供了一種檢測所述應用中的snp分子標記的引物組,所述引物組含上下游引物和延伸引物,所述上下游引物序列如seq?id?no.1~2所示,所述延伸引物序列如seq?id?no.3所示。
6、本專利技術還提供了一種所述的引物組的用于檢測綿羊多羔性狀的試劑盒。
7、本專利技術還提供了所述的引物組或所述的試劑盒在綿羊多羔性檢測或綿羊育種中的應用。
8、本專利技術還提供了一種所述的引物組或所述的試劑盒選育繁殖能力強的綿羊的方法,包括如下步驟:
9、(1)提取待測綿羊的基因dna;
10、(2)以待測綿羊的基因組dna為模版,利用所述引物組中上下游引物進行pcr擴增;
11、(3)sap酶對pcr擴增產物進行消化,獲得酶消化物;
12、(4)以酶消化產物為模版,利用所述延伸引物進行延伸反應;
13、(5)分析延伸產物,對綿羊第2號染色體abca1基因組序列第18197516bp位點基因進行分型;
14、(6)選育所述第18197516bp位點基因型為tt的綿羊。
15、優選的,所述綿羊為杜湖雜種綿羊。
16、優選的,所述繁殖能力為胎產羊羔數量。
17、本專利技術提供了一種snp分子標記,此snp分子標記與綿羊的多羔性狀顯著相關。該分子標記可以單獨使用或與現有標記結合,對綿羊多羔性狀進行高精度的預測,從而提供穩定且準確的結果。這為提升綿羊繁殖性能及育種效率提供了重要支持,加速了綿羊種質改良進程,推動中國綿羊產業的現代化發展。
本文檔來自技高網...【技術保護點】
1.一種與綿羊多羔性狀相關的SNP分子標記在綿羊多羔性檢測或綿羊育種中的應用,其特征在于,所述SNP分子標記位于綿羊基因組ARS-UI_Ramb_v2.0第2號染色體ABCA1基因組序列第18197516bp位點,堿基多態性為T>C。
2.根據權利要求1所述的應用,其特征在于,所述位點的TT基因型母羊的產羔數顯著高于TC、CC基因型。
3.一種檢測權利要求1~2任一項所述應用中的SNP分子標記的引物組,其特征在于,所述引物組含上下游引物和延伸引物,所述上下游引物序列如SEQ?ID?NO.1~2所示,所述延伸引物序列如SEQ?ID?NO.3所示。
4.一種包括權利要求3所述的引物組的用于檢測綿羊多羔性狀的試劑盒。
5.權利要求3所述的引物組或權利要求4所述的試劑盒在綿羊多羔性檢測或綿羊育種中的應用。
6.一種利用權利要求3所述的引物組或權利要求4所述的試劑盒選育繁殖能力強的綿羊的方法,其特征在于,包括如下步驟:
7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,所述綿羊為杜湖雜種綿羊。
8.根據權利要
...【技術特征摘要】
1.一種與綿羊多羔性狀相關的snp分子標記在綿羊多羔性檢測或綿羊育種中的應用,其特征在于,所述snp分子標記位于綿羊基因組ars-ui_ramb_v2.0第2號染色體abca1基因組序列第18197516bp位點,堿基多態性為t>c。
2.根據權利要求1所述的應用,其特征在于,所述位點的tt基因型母羊的產羔數顯著高于tc、cc基因型。
3.一種檢測權利要求1~2任一項所述應用中的snp分子標記的引物組,其特征在于,所述引物組含上下游引物和延伸引物,所述上下游引物序列如seq?id?no.1~...
【專利技術屬性】
技術研發人員:喬利英,張思穎,龐志旭,王萬年,張莉,劉文忠,
申請(專利權)人:山西農業大學,
類型:發明
國別省市:
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