【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物，具體涉及腹膜后脂肪肉瘤預后生物標志物及其應用。
技術介紹
1、腹膜后脂肪肉瘤（retroperitoneal?liposarcoma,?rpls）是一種罕見的腫瘤，發病率約為每10萬人年1例，占所有軟組織肉瘤的15-20%。目前，完全手術切除是唯一有潛在治愈可能的方法。然而，約40%的原發性腹膜后脂肪肉瘤起源于腹膜后脂肪組織，由于解剖結構的復雜性，很難實現陰性切緣切除，導致腹膜后脂肪肉瘤術后復發率高。根據分化程度，大多數腹膜后脂肪肉瘤可分為高分化脂肪肉瘤（wdls）和去分化脂肪肉瘤（ddls）。wdls和ddls的5年復發率為40-60%，而wdls的總體生存率為80%，顯著高于ddls（44-53%）。因此，手術后殘留腹膜后脂肪肉瘤細胞的不同生物學特性決定了患者的預后，個性化的手術切除策略可以顯著提高腹膜后脂肪肉瘤患者的總體生存率和生活質量。
2、目前，雖然有少數分子如cdk4、mdm2、aurk4和ccndbp1等被報道可作為rpls診斷和預后標記物，但這些標記物代表性差且缺乏驗證。因此，探索發現新的生物標志物來準確地預測和評估腹膜后脂肪肉瘤的預后，從而及時調整治療方案，是個體化精準治療的重要方面。
技術實現思路
1、為了彌補現有技術的不足，本專利技術的目的在于提供一種新型的腹膜后脂肪肉瘤預后生物標志物及其應用。
2、為了實現上述目的，本專利技術采用如下技術方案：
3、本專利技術的第一方面提供了檢測生物標志物表達量的試劑在
4、進一步，所述生物標志物包括ecm2、klf6或lmnb2。
5、術語“生物標志物”是指以可用于預測個體的癌癥狀態的不同濃度存在于個體中的生物分子。生物標志物可包括，但不限于，核酸、蛋白質及其變體和片段。生物標志物可以是包含編碼該生物標志物的全部或部分核酸序列或這類序列的互補體的dna。可用于本專利技術的生物標志物核酸被認為包括包含任何目的核酸序列的全部或部分序列的dna和rna。在本專利技術的具體實施方式中，所述的生物標志物包括ecm2、klf6或lmnb2。
6、本專利技術中，生物標志物例如ecm2、klf6或lmnb2包括基因及其編碼的蛋白及其同源物，突變，和同等型。該術語涵蓋全長，未加工的生物標志物，以及源自細胞中加工的任何形式的生物標志物。該術語涵蓋生物標志物的天然發生變體(例如剪接變體或等位變體)。
7、本文所述的生物標志物可用于診斷測試中以評估受試者的腹膜后脂肪肉瘤狀態。腹膜后脂肪肉瘤狀態包括腹膜后脂肪肉瘤存在或不存在。腹膜后脂肪肉瘤狀態還可以包括監測腹膜后脂肪肉瘤的病程，例如，監測疾病進展。基于受試者的腹膜后脂肪肉瘤狀態，可以指示另外的程序，包括例如另外的診斷測試或治療程序。
8、進一步，所述ecm2、klf6在預后差的腹膜后脂肪肉瘤患者中低表達；所述lmnb2在預后差的腹膜后脂肪肉瘤患者中高表達。
9、在一些實施例中，所述預后的指標包括客觀緩解率(objectiveresponserate，orr)、總生存期(overallsurvivalrate，overallsurvival，os)、無進展生存期(progression-freesurvival，pfs)、疾病進展時間(timetoprogress，ttp)、無病生存期(disease-freesurvival，dfs)、治療失敗時間(timetotreatmentfailure，ttf)、應答率(rr)、完全應答(cr)、部分應答(pr)。在本專利技術的具體實施方式中，所述的預后指標包括總生存期和/或無病生存期。
10、術語“表達”一般指基因所編碼的信息轉換成細胞中存在的和運行的結構的過程。因此，依照本專利技術，基因的“表達”可以指轉錄成多核苷酸、翻譯成蛋白質、或甚至蛋白質的翻譯后修飾。轉錄得到的多核苷酸的、翻譯得到的蛋白質的、或翻譯后修飾得到的蛋白質的片段也應視為表達的，無論它們是源自通過可變剪接生成的轉錄物或經過降解的轉錄物，或者是源自蛋白質的翻譯后加工(例如通過蛋白水解)。
11、生物標志物的“升高”或“較高”的量或水平指所述量等于或大于健康對照群體中生物標志物表達水平，生物標志物相對于對照表達水平過表達至少1.1倍，例如至少1.1倍、1?.2倍、1?.3倍、1?.4倍、1?.5倍、1?.6倍、1?.7倍、1?.8倍、1?.9倍、2.0倍、2.1倍、2.2倍、2.3倍、2.4倍、2.5倍、2.6倍、2.7倍、2.8倍、2.9倍、3.0倍、3.1倍、3.2倍、3.3倍、3.4倍或3.5倍或更多。
12、生物標志物的“降低”或“較低”的量或水平指所述量小于健康對照群體中生物標志物的中值量，生物標志物相對于對照表達水平低表達至少1.1倍，例如至少1.1倍、1.2倍、1?.3倍、1?.4倍、1?.5倍、1?.6倍、1?.7倍、1?.8倍、1?.9倍、2.0倍、2.1倍、2.2倍、2.3倍、2.4倍、2.5倍、2.6倍、2.7倍、2.8倍、2.9倍、3.0倍、3.1倍、3.2倍、3.3倍、3.4倍或3.5倍或更多。
13、在一些實施方案中，為了界定生物標志物分子的高低表達，將隊列中所有患者依據各標志物測序表達值進行排序，以各標志分子中位表達值定義其高低表達。在本專利技術的具體實施方案中，所述klf6中位表達值為1.2；lmnb2中位表達值為1.8；ecm2中位表達值為1.1。
14、進一步，所述試劑包括檢測生物標志物mrna表達量和/或生物標志物蛋白表達量的試劑。
15、進一步，所述檢測生物標志物mrna表達量的試劑包括以下方法中使用到的試劑：基于pcr的檢測方法、southern雜交、northern雜交、點雜交、熒光原位雜交、dna微陣列、aso法、高通量測序平臺。
16、進一步，所述檢測生物標志物mrna表達量的試劑包括特異性引物和/或探針。
17、進一步，所述檢測生物標志物蛋白表達量的試劑包括以下方法中使用的試劑：酶聯免疫吸附測定、放射性免疫測定、夾心測定、蛋白質印跡、流式細胞術、熒光輔助的細胞分選、酶底物顯色測定和抗原-抗體聚集、質譜法、免疫組化染色、免疫沉淀分析法、補體結合分析法、流式細胞熒光分邊技術和蛋白質芯片。
18、在一些實施例中，所述基于pcr的定量檢測方法包括將mrna逆轉錄為cdna的步驟和/或測量cdna的含量的步驟。優選地，所述測量cdna的含量的方法包括但不限于pcr、nasba、rpa、sda、lamp、had、near、mda、rca、lcr、ram。
19、術語“引物”是指寡核苷酸，它與靶核酸中的序列(“引物結合位點”)雜交并且能夠用作在適用于合成的條件下沿著核酸的互補鏈啟動該合成的點。
20、術語“探針”指能與另一分子的特定序列或亞序列或其它部分結合的分子。除非另有指出，術語“探針”通常指能通過互補堿基配對與另一多本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.檢測生物標志物表達量的試劑在制備預測腹膜后脂肪肉瘤患者預后的產品中的應用，其特征在于，所述生物標志物包括ECM2、KLF6或LMNB2。
2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述ECM2、KLF6在預后差的腹膜后脂肪肉瘤患者中低表達；所述LMNB2在預后差的腹膜后脂肪肉瘤患者中高表達。
3.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述試劑包括檢測生物標志物mRNA表達量和/或生物標志物蛋白表達量的試劑。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述檢測生物標志物mRNA表達量的試劑包括以下方法中使用到的試劑：基于PCR的檢測方法、Southern雜交、Northern雜交、點雜交、熒光原位雜交、DNA微陣列、ASO法、高通量測序平臺；
5.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述產品包括試劑盒、芯片、試紙、高通量測序平臺；
6.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，所述試劑盒包括下組的一種或多種物質：容器、使用說明書、陽性對照物、陰性對照物、緩沖劑、助劑或溶劑。
7.生物標志物或其促進劑在制備預防
8.LMNB2的抑制劑在制備預防和/或治療腹膜后脂肪肉瘤患者的產品中的應用，所述抑制劑可以敲除LMNB2基因或降低LMNB2的表達量；
9.一種診斷對象是否患有腹膜后脂肪肉瘤或預測對象是否存在患腹膜后脂肪肉瘤風險或預測腹膜后脂肪肉瘤患者預后的系統或裝置，其特征在于，所述的系統或裝置包括：
10.一種計算機可讀存儲介質，其特征在于，其上存儲有計算機程序，所述計算機程序被處理器執行時實現權利要求9所述的系統或裝置。
...【技術特征摘要】
1.檢測生物標志物表達量的試劑在制備預測腹膜后脂肪肉瘤患者預后的產品中的應用，其特征在于，所述生物標志物包括ecm2、klf6或lmnb2。
2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述ecm2、klf6在預后差的腹膜后脂肪肉瘤患者中低表達；所述lmnb2在預后差的腹膜后脂肪肉瘤患者中高表達。
3.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述試劑包括檢測生物標志物mrna表達量和/或生物標志物蛋白表達量的試劑。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述檢測生物標志物mrna表達量的試劑包括以下方法中使用到的試劑：基于pcr的檢測方法、southern雜交、northern雜交、點雜交、熒光原位雜交、dna微陣列、aso法、高通量測序平臺；
5.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述產品包括試劑盒、芯片、...
【專利技術屬性】
技術研發人員：肖萌萌，閔力，李向冀，卜凡欽，馬世祥，羅成華，
申請(專利權)人：北京大學人民醫院，
類型：發明
國別省市：
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