【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)屬于snp，具體涉及一種與綿羊角長(zhǎng)度性狀相關(guān)的snp分子遺傳標(biāo)記及其應(yīng)用。
技術(shù)介紹
1、培育無(wú)角綿羊品種對(duì)畜牧業(yè)發(fā)展具有很大的意義。
2、早期研究認(rèn)為位于常染色體ho基因座上的3個(gè)等位基因調(diào)控綿羊有角與無(wú)角表型，即為hop、ho+和hoh1，其中ho+為有角等位基因，hoh1為性連鎖角等位基因，hop為無(wú)角等位基因(dolling?chs.breeding?merinos.rigby,adelaide,australia,1970)。在常規(guī)育種中，為了培育無(wú)角品種，經(jīng)常使用測(cè)交方法剔除顯性無(wú)角雜合基因型個(gè)體，但通過(guò)測(cè)交來(lái)判定基因型的方法周期長(zhǎng)，甚至要幾個(gè)世代才能完成，并且費(fèi)財(cái)費(fèi)力。分子標(biāo)記輔助選擇將為這一特殊種質(zhì)資源的發(fā)掘和利用提供新的思路和方法。運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)，發(fā)掘和收集無(wú)角藏羊品種種質(zhì)資源，開(kāi)展本品種分子選育，是保證選育進(jìn)展的重要途徑，也是長(zhǎng)遠(yuǎn)培育無(wú)角藏羊新品種(系)的首要步驟。
3、目前有關(guān)報(bào)道發(fā)現(xiàn)在rxfp2基因(uniprot登記號(hào)為q91zz5)的3'-utr區(qū)有一個(gè)1833bp的基因組插入片段與無(wú)角表型有關(guān)(wiedemar?n,?c.a?1.8-kbinsertion?in?the?3'-utr?of?rxfp2?is?associated?with?polledness?in?sheep.animgenet,2015,46(4):457-461)，而此區(qū)域的插入片段只在部分綿羊品種的角表型中出現(xiàn)分離(lühken?g,krebs?s,rothammer?s,küppe
4、有研究表明羊角的長(zhǎng)度、角基周長(zhǎng)和角體積可以適度遺傳，這意味著角長(zhǎng)度在一定程度上會(huì)影響角的整體大小或有無(wú)，但現(xiàn)未見(jiàn)rxfp2基因第10號(hào)染色體(nc_056063.1)的第30991957位點(diǎn)與角長(zhǎng)度相關(guān)的報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本專利技術(shù)的目的在于提供一種新的rxfp2基因的snp，以及將其用于選育綿羊角長(zhǎng)度性狀，從而得到無(wú)角綿羊。
2、本專利技術(shù)提供了檢測(cè)與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的snp分子遺傳標(biāo)記的試劑在選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系中的用途，選育或輔助選育角長(zhǎng)短/長(zhǎng)的綿羊；
3、與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的snp分子遺傳標(biāo)記位于綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位，多態(tài)性為c或t。
4、進(jìn)一步地，第30991957位在綿羊角長(zhǎng)度性狀的優(yōu)勢(shì)等位基因?yàn)閠等位基因；優(yōu)勢(shì)基因型為tt基因型；tt基因型的綿羊的角長(zhǎng)短。
5、本專利技術(shù)還提供了一種選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系的方法，包括如下步驟：
6、提取待檢綿羊樣本的基因組總dna，檢測(cè)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)的脫氧核苷酸，測(cè)出第30991957位點(diǎn)的脫氧核苷酸為t或c，確定綿羊的基因型是tt型、ct或cc型；
7、tt基因型綿羊的角長(zhǎng)短于ct基因型綿羊和cc基因型綿羊，ct基因型綿羊的角長(zhǎng)短于cc基因型綿羊。
8、進(jìn)一步地，所述步驟還包括：
9、取tt型綿羊個(gè)體進(jìn)行下一步的育種，即可；
10、所述綿羊?yàn)椴匮颍瑑?yōu)選地，所述綿羊?yàn)楦咴匮颉?/p>
11、本專利技術(shù)還提供了一種用于檢測(cè)與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的snp分子遺傳標(biāo)記的試劑盒，它包括檢測(cè)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)的脫氧核苷酸的試劑；
12、進(jìn)一步地，所述的試劑為測(cè)序試劑、pcr檢測(cè)試劑、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性方法用試劑或者單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析用試劑。
13、更進(jìn)一步地，所述試劑為競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性pcr檢測(cè)試劑，優(yōu)選包括seq?idno.1～2所示擴(kuò)增引物和seq?id?no.3所示延伸引物。
14、本專利技術(shù)還提供了一種前述試劑盒在選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系中的用途。
15、本專利技術(shù)最后提供了一種使用前述試劑盒選育綿羊角長(zhǎng)度性狀的方法，包括如下步驟：
16、1)提取待檢綿羊樣本的基因組總dna；
17、2)使用前述試劑盒對(duì)步驟1)所得總dna進(jìn)行pcr擴(kuò)增，并對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行延伸；
18、3)取步驟2)經(jīng)延伸的pcr產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序，根據(jù)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體上第30991957位點(diǎn)的脫氧核苷酸確定綿羊的基因型是tt型、ct或cc型；
19、tt基因型綿羊的角長(zhǎng)短于ct基因型綿羊和cc基因型綿羊，ct基因型綿羊的角長(zhǎng)短于cc基因型綿羊。
20、進(jìn)一步地，所述步驟還包括：
21、選取綿羊參考基因組第10號(hào)染色體上第30991957位點(diǎn)為tt型的個(gè)體進(jìn)行下一步的育種；
22、所述綿羊?yàn)椴匮颍瑑?yōu)選地，所述綿羊?yàn)楦咴匮颉?/p>
23、本專利技術(shù)所述“選育綿羊角長(zhǎng)度性狀“是指在育種過(guò)程中，通過(guò)選擇和培育特定的角長(zhǎng)度性狀特征，以獲得無(wú)角綿羊品種。
24、本專利技術(shù)所述“無(wú)角綿羊“包括完全無(wú)角或僅有殘角的綿羊。
25、本專利技術(shù)所述“殘角”是指在頭骨上無(wú)角的正常位置上長(zhǎng)出發(fā)育不全的角，它沒(méi)有附著在頭骨上，呈骨突狀。
26、本專利技術(shù)所述“角長(zhǎng)度”是指羊角基部至角尖端沿角背面縱棱的弧線長(zhǎng)。
27、本專利技術(shù)首次發(fā)現(xiàn)rxfp2基因中位于綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)的多態(tài)性與綿羊(特別是藏羊)角長(zhǎng)度具有非常強(qiáng)的相關(guān)性，該位點(diǎn)可以作為綿羊角長(zhǎng)度性狀的分子遺傳標(biāo)記，通過(guò)檢測(cè)該snp位點(diǎn)篩選綿羊的角長(zhǎng)度性狀短的優(yōu)良綿羊，進(jìn)行無(wú)角綿羊的選育或輔助選育，從而有效組建無(wú)角藏羊群體，構(gòu)建綿羊優(yōu)異角長(zhǎng)選育體系，為綿羊無(wú)角品種改良提供珍貴的遺傳資源，有利于提高品種優(yōu)質(zhì)的無(wú)角綿羊品種培育進(jìn)程，同時(shí)也有利于提高無(wú)角綿羊選種的準(zhǔn)確性。
28、本專利技術(shù)的關(guān)鍵在于發(fā)現(xiàn)rxfp2基因中位于綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)多態(tài)性與綿羊(特別是藏羊)角長(zhǎng)度具有極強(qiáng)的相關(guān)性，可以通過(guò)檢測(cè)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)來(lái)篩選確定角長(zhǎng)度性狀，進(jìn)而用于無(wú)角綿羊的選育或輔助選育。任何能夠檢測(cè)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)的方法和試劑均可以用于角長(zhǎng)度性狀短的綿羊的篩選確定，轉(zhuǎn)化前景十分廣闊。
29、顯然，根據(jù)本專利技術(shù)的上述內(nèi)容，按照本領(lǐng)域的普通技術(shù)知識(shí)和慣用手段，在不脫離本專利技術(shù)上述基本技術(shù)思想前提下，還可以做出其它多種形式的修改、替換或變更。
30、以下通過(guò)實(shí)施例形式的具體實(shí)本文檔來(lái)自技高網(wǎng)...
【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
1.檢測(cè)與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的SNP分子遺傳標(biāo)記的試劑在選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系中的用途，其特征在于：
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用途，其特征在于：第30991957位在綿羊角長(zhǎng)度性狀的優(yōu)勢(shì)等位基因?yàn)門等位基因；優(yōu)勢(shì)基因型為TT基因型；TT基因型的綿羊的角長(zhǎng)短。
3.一種選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系的方法，其特征在于：包括如下步驟：
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于：所述步驟還包括：
5.一種用于檢測(cè)與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的SNP分子遺傳標(biāo)記的試劑盒，其特征在于：它包括檢測(cè)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)的脫氧核苷酸的試劑。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒，其特征在于：所述的試劑為測(cè)序試劑、PCR檢測(cè)試劑、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性方法用試劑或者單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析用試劑。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒，其特征在于：所述試劑為競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR檢測(cè)試劑，優(yōu)選包括SEQ?ID?NO.1～2所示擴(kuò)增引物和SEQ?ID?NO.3所示延伸引物。
...【技術(shù)特征摘要】
1.檢測(cè)與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的snp分子遺傳標(biāo)記的試劑在選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系中的用途，其特征在于：
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用途，其特征在于：第30991957位在綿羊角長(zhǎng)度性狀的優(yōu)勢(shì)等位基因?yàn)閠等位基因；優(yōu)勢(shì)基因型為tt基因型；tt基因型的綿羊的角長(zhǎng)短。
3.一種選育或輔助選育與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的綿羊品種或品系的方法，其特征在于：包括如下步驟：
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于：所述步驟還包括：
5.一種用于檢測(cè)與綿羊角長(zhǎng)性狀相關(guān)的snp分子遺傳標(biāo)記的試劑盒，其特征在于：它包括檢測(cè)綿羊參考基因組第10號(hào)染色體的第30991957位點(diǎn)的脫氧核苷酸的試...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：田得紅，趙凱，裴全幫，張子安，薛航，王守艷，韓步鷹，李雪，田菲，劉思嘉，
申請(qǐng)(專利權(quán))人：中國(guó)科學(xué)院西北高原生物研究所，
類型：發(fā)明
國(guó)別省市：
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