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【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物,具體涉及一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr引物、試劑盒及其應用。
技術介紹
1、人體腸道微生物群中含有由真菌、細菌、病毒和原生動物組成的微生物群落,其中微生物-微生物和微生物-宿主的相互作用對人類健康至關重要。這些相互作用的不平衡,反映在組成和功能的變化上,與疾病的發生發展息息相關。結直腸癌(colorectal?cancer,crc)是常見癌癥,研究發現,從異常的隱窩到腫瘤,各種遺傳和環境因素都有助于crc的發展。在crc中,最密切相關的致病菌是具核梭桿菌,它可以在crc組織中檢測到,其豐度從正常組織到腺瘤組織再到結直腸癌逐漸增加,富集在腫瘤中的具核梭桿菌參與crc進展的各個階段,因此,通過檢測具核梭桿菌,可以作為輔助診斷結直腸癌的手段之一。
2、在過去的幾十年里,隨著微生物組技術和生物信息學的進步,人們開發了各種檢測細菌的方法,其中,通過分子生物學的手段應用最為廣泛,如基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(matrix-assisted?laser?desorption/ionization?time-of-flight?massspectrometry,maldi-to?f?ms)技術、qpcr法,血清學elisa,斑點雜交,原位雜交等鑒定等。而目前臨床上對于具核梭桿菌的檢測(如菌血癥、結直腸癌組織,口腔拭子等)主要基于培養基培養,形態檢測,生化反應鑒定,需要3-7天的時間,并且需要厭氧環境,嚴重限制了其應用。
3、針對上述技術問題,本專利技術提供了一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr
技術實現思路
1、本專利技術的目的在于提供一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr引物,所述的引物序列中正向引物的序列如seq?id?no.1所示,反向引物的序列如seq?id?no.2所示。
2、本專利技術的第二目的是提供所述的pcr引物在檢測具核梭狀桿菌中的應用,所述的檢測為非疾病診斷目的的檢測。
3、本專利技術的第三目的是提供所述的pcr引物在制備用于檢測具核梭狀桿菌的試劑盒中的應用。
4、本專利技術的第四目的是提供一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr試劑盒,所述的試劑盒包括所述的pcr引物。
5、本專利技術的第五目的是提供所述的pcr試劑盒在檢測具核梭狀桿菌中的應用,所述的檢測為非疾病診斷目的的檢測。
6、本專利技術的第六目的是提供一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr方法,提取待檢微生物dna,取dna溶液作為反應模板,以所述的引物組合物進行pcr反應。
7、優選的,所述的方法中的反應體系為:2×sybr?green?qpcr?master?5μl,模板1μl,上游引物0.3μl,下游引物0.3μl,水3.4μl。
8、優選的,所述的方法中的pcr反應程序為:預變性95℃,30s;變性/退火/延伸40循環,95℃,10s,95℃,30s;熔解曲線,95℃,15s,60℃,60s,95℃,15s。
9、本專利技術的有益效果是:
10、(1)本專利技術提供一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr引物,所述的引物能夠對具核梭狀桿菌進行特異性擴增,提高了檢測效率,降低了檢測成本;
11、(2)本專利技術提供了一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr方法,使用的pcr引物及反應體系,能在復雜群落背景下特異性檢測具核梭桿菌。
12、(3)所述的方法具有成本低,速度快,準確度高的優點,能夠避免傳統的基于分離培養微生物,再進行測序或質譜鑒定等實驗的速度慢,花費高,周期長等缺點,可以廣泛用于具核梭桿菌的快速檢測中。
本文檔來自技高網...【技術保護點】
1.一種特異性檢測具核梭狀桿菌的PCR引物,其特征在于,所述的引物序列中正向引物的序列如SEQ?ID?NO.1所示,反向引物的序列如SEQ?ID?NO.2所示。
2.如權利要求1所述的PCR引物在檢測具核梭狀桿菌中的應用,所述的檢測為非疾病診斷目的的檢測。
3.如權利要求1所述的PCR引物在制備用于檢測具核梭狀桿菌的試劑盒中的應用。
4.一種特異性檢測具核梭狀桿菌的PCR試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒包括權利要求1所述的PCR引物。
5.如權利要求4所述的PCR試劑盒在檢測具核梭狀桿菌中的應用,所述的檢測為非疾病診斷目的的檢測。
6.一種特異性檢測具核梭狀桿菌的PCR方法,其特征在于,提取待檢微生物DNA,取DN?A溶液作為反應模板,以權利要求1所述的引物組合物進行PCR反應。
7.如權利要求6所述的PCR方法,其特征在于,所述的方法中的反應體系為:2×SYBR?Green?qPCR?Master?5μL,模板1μL,上游引物0.3μL,下游引物0.3μL,水3.4μL。
8.如權利要求6所述的
...【技術特征摘要】
1.一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr引物,其特征在于,所述的引物序列中正向引物的序列如seq?id?no.1所示,反向引物的序列如seq?id?no.2所示。
2.如權利要求1所述的pcr引物在檢測具核梭狀桿菌中的應用,所述的檢測為非疾病診斷目的的檢測。
3.如權利要求1所述的pcr引物在制備用于檢測具核梭狀桿菌的試劑盒中的應用。
4.一種特異性檢測具核梭狀桿菌的pcr試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒包括權利要求1所述的pcr引物。
5.如權利要求4所述的pcr試劑盒在檢測具核梭狀桿菌中的應用,所述的檢測為非疾病診斷目的的檢測。
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