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    一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用制造技術(shù)

    技術(shù)編號:44196708 閱讀:9 留言:0更新日期:2025-02-06 18:34
    本發(fā)明專利技術(shù)公開了一種α?吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,所述α?吡喃酮類化合物可提高鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移效率,且α?吡喃酮類化合物具有如式I所示的結(jié)構(gòu),式I中R1為CH<subgt;3</subgt;或H,R<subgt;2</subgt;為CH<subgt;3</subgt;或H,R<subgt;3</subgt;為CH<subgt;3</subgt;。該類化合物可有效解決鏈霉菌難以通過接合轉(zhuǎn)移進(jìn)行遺傳改造的瓶頸問題,能夠提高鏈霉菌的接合轉(zhuǎn)移效率,促進(jìn)新型抗生素開發(fā)及提高已有抗生素的活性和產(chǎn)量,降低制藥成本,從而提高藥物可及性。

    【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】

    本專利技術(shù)涉及微生物,特別涉及一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用


    技術(shù)介紹

    1、α-吡喃酮(α-pyrone),又稱為查爾酮(chalcone),是由細(xì)菌、真菌及植物等產(chǎn)生的一類不飽和六元環(huán)內(nèi)酯結(jié)構(gòu)化合物,這一家族的化合物結(jié)構(gòu)多樣,具有抑制孢子萌發(fā)、抗細(xì)菌、抗真菌、抗腫瘤、抗凝血劑、hiv蛋白酶抑制劑等多種生物活性,具有巨大的應(yīng)用潛力。germicidin?a~d是由鏈霉菌產(chǎn)生的四種最典型α-吡喃酮類化合物。

    2、鏈霉菌是一類高g+c含量的革蘭氏陽性菌,是抗生素的主要來源。自然界分離的野生型鏈霉菌存在抗生素產(chǎn)量低、化合物結(jié)構(gòu)多樣性不夠、活性不高以及代謝產(chǎn)物基因簇沉默等問題,難以滿足人類對抗生素的需求,因此,需要通過遺傳操作手段(主要為接合轉(zhuǎn)移)對鏈霉菌進(jìn)行遺傳改造。

    3、接合轉(zhuǎn)移是質(zhì)粒dna或者其他整合性元件(integrative?and?conjugativeelement,ice)通過直接接觸由供體菌向受體菌水平轉(zhuǎn)移的過程。不同細(xì)菌之間的接合轉(zhuǎn)移有不同方式,但幾乎所有革蘭氏陽性菌和陰性菌均是通過ⅳ型分泌系統(tǒng)形成接合孔介導(dǎo)質(zhì)粒dna從供體菌向受體菌轉(zhuǎn)移。然而以鏈霉菌為代表的放線菌不依賴ⅳ型分泌系統(tǒng),它主要是通過一個質(zhì)粒編碼的蛋白trab形成接合孔介導(dǎo)質(zhì)粒dna的轉(zhuǎn)移。

    4、然而,由于鏈霉菌廣泛存在的限制修飾系統(tǒng),很多鏈霉菌都難以作為受體菌通過接合轉(zhuǎn)移進(jìn)行遺傳改造,極大地限制了鏈霉菌資源的開發(fā)與利用,導(dǎo)致新型抗生素的開發(fā)也受到極大的限制。

    5、同時,現(xiàn)有促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移效率的方法主要是通過優(yōu)化接合轉(zhuǎn)移的條件,如供體菌和受體菌的培養(yǎng)狀態(tài)、熱激、預(yù)萌發(fā)時間、供受體菌的比例、金屬離子濃度和接合轉(zhuǎn)移所用的培養(yǎng)基等(choi?s?u,lee?c?k,hwang?y?i,et?al.intergeneric?conjugaltransfer?of?plasmid?dna?from?escherichia?coli?to?kitasatospora?setae,abafilomycin?b1?producer[j].arch?microbiol,2004,181(4):294-298.),這些優(yōu)化后的條件適用于某一種鏈霉菌的接合轉(zhuǎn)移,但鏈霉菌是一種高度分化的種屬,且具有限制性修飾系統(tǒng),使這些條件對于其他的鏈霉菌不一定適用,對于一些難以進(jìn)行接合轉(zhuǎn)移的鏈霉菌,盡管嘗試了優(yōu)化接合轉(zhuǎn)移的條件,但是仍然不能長出接合子,沒有一套通用的接合轉(zhuǎn)移條件能夠解決大多數(shù)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移的問題,從而導(dǎo)致了鏈霉菌遺傳操作仍然存在較大的困難性。故而,如何提高鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移效率和普適性成為了亟待解決的技術(shù)問題。


    技術(shù)實現(xiàn)思路

    1、本專利技術(shù)要解決的技術(shù)問題是:克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一類能夠促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移的化合物germicidin?a~d,該類化合物大大提高了鏈霉菌的接合轉(zhuǎn)移率,可有效突破鏈霉菌難以通過接合轉(zhuǎn)移進(jìn)行遺傳改造的瓶頸,為通過遺傳改造鏈霉菌獲得活性更好、產(chǎn)量更高的菌株提供一種新的有效途徑。

    2、本專利技術(shù)解決其技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案是:一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,所述α-吡喃酮類化合物可提高鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移效率,且α-吡喃酮類化合物具有如式i所示的結(jié)構(gòu):

    3、

    4、式i中r1為ch3或h,r2為ch3或h,r3為ch3。

    5、進(jìn)一步,所述α-吡喃酮類化合物為germicidin?a、germicidin?b、germicidin?c、germicidin?d,所述germicidin?a對應(yīng)式i中的r1和r2均為ch3,且c7為s構(gòu)型,其結(jié)構(gòu)式如式ii所示;所述germicidin?b對應(yīng)式i中的r1為ch3、r2為h,其結(jié)構(gòu)式如式iii所示;所述germicidin?c對應(yīng)式i中的r1為h、r2為ch3,且c7為s構(gòu)型,其結(jié)構(gòu)式如式iv所示;所述germicidin?d對應(yīng)式i中的r1和r2均為h,其結(jié)構(gòu)式如式v所示;

    6、

    7、

    8、進(jìn)一步,在鏈霉菌的接合轉(zhuǎn)移步驟中,以鏈霉菌為受體菌,采用含α-吡喃酮類化合物的接合轉(zhuǎn)移平板進(jìn)行鏈霉菌與供體菌的接合轉(zhuǎn)移。

    9、進(jìn)一步,所述接合轉(zhuǎn)移具體包括以下步驟:

    10、1)受體菌的活化及孢子懸液的制備;

    11、2)供體菌的活化及菌懸液的制備;

    12、3)接合轉(zhuǎn)移平板的制備:向isp4培養(yǎng)基中加入mgcl2和α-吡喃酮類化合物,使mg2+和α-吡喃酮類化合物的終濃度分別為30mm和2~10nm,混勻后倒平板;;

    13、4)接合轉(zhuǎn)移:先將受體菌的孢子懸液和供體菌的菌懸液混合均勻,得到混合菌懸液;然后將混合菌懸液涂布于接合轉(zhuǎn)移平板上,吹干后于培養(yǎng)箱內(nèi)倒置培養(yǎng);再將培養(yǎng)好的平板取出,用apr抗生素和tmp抗生素進(jìn)行均勻覆蓋,吹干后于培養(yǎng)箱內(nèi)倒置培養(yǎng)。

    14、優(yōu)選地,所述α-吡喃酮類化合物的終濃度為2~5nm。

    15、最優(yōu)選地,所述α-吡喃酮類化合物的終濃度為2nm。

    16、進(jìn)一步,所述步驟4)中受體菌的孢子懸液與供體菌的菌懸液的體積比為100:1;所述混合菌懸液涂布于接合轉(zhuǎn)移平板時,其與接合轉(zhuǎn)移平板內(nèi)培養(yǎng)基的體積比為1:40,且涂布并吹干后進(jìn)行倒置培養(yǎng)的溫度為28℃,時間為16-20h。

    17、進(jìn)一步,所述步驟4)中apr抗生素和tmp抗生素的終濃度分別為50μg/ml和100μg/ml,且apr抗生素和tmp抗生素進(jìn)行均勻覆蓋并吹干后進(jìn)行倒置培養(yǎng)的溫度為28℃,培養(yǎng)時間為3-5天。

    18、進(jìn)一步,所述α-吡喃酮類化合物是從天藍(lán)色鏈霉菌a3(2)的發(fā)酵培養(yǎng)物中分離制備得到的。

    19、進(jìn)一步,所述從天藍(lán)色鏈霉菌a3(2)的發(fā)酵培養(yǎng)物中分離制備α-吡喃酮類化合物的方法包括以下步驟:

    20、a)制備種子液;

    21、b)發(fā)酵培養(yǎng),得到發(fā)酵培養(yǎng)物;

    22、c)制備粗提物:將發(fā)酵培養(yǎng)物的發(fā)酵液和菌絲體分離開,發(fā)酵液經(jīng)乙酸乙酯萃取蒸餾濃縮后得到浸膏a,菌絲體用丙酮浸提,并經(jīng)超聲處理,收集浸提液經(jīng)蒸餾濃縮后得到浸膏b,將浸膏a與b合并為浸膏c,得到粗提物;

    23、d)分離:浸膏c用甲醇溶解后,經(jīng)硅膠柱層析,以體積比從80:1~0:100的二氯甲烷-甲醇作為流動相梯度洗脫,收集二氯甲烷/甲醇體積比為50:1梯度洗脫下來的含有化合物germicidin?a-d的餾分fr.2;再將餾分fr.2經(jīng)硅膠柱層析,用二氯甲烷/乙酸乙酯作為洗脫劑,從體積比80:1~0:100進(jìn)行梯度洗脫,收集二氯甲烷/乙酸乙酯體積比為60:1梯度洗脫下來的含有化合物germicidin?a-d的餾分fr.2-2和fr.2-3;餾分fr.2-2和fr.2-3再經(jīng)半制備型hplc制備分離,離心濃縮儀冷凍抽干,得到化合物germicidin?a、b、c和d。

    24、進(jìn)一步,所述步驟d)中hplc的條件為:色譜柱本文檔來自技高網(wǎng)...

    【技術(shù)保護(hù)點】

    1.一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述α-吡喃酮類化合物可提高鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移效率,且α-吡喃酮類化合物具有如式I所示的結(jié)構(gòu):

    2.如權(quán)利要求1所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述α-吡喃酮類化合物為germicidin?A、germicidin?B、germicidin?C、germicidinD,所述germicidin?A對應(yīng)式I中的R1和R2均為CH3,且C7為S構(gòu)型;所述germicidin?B對應(yīng)式I中的R1為CH3、R2為H;所述germicidin?C對應(yīng)式I中的R1為H、R2為CH3,且C7為S構(gòu)型;所述germicidin?D對應(yīng)式I中的R1和R2均為H。

    3.如權(quán)利要求1所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,在鏈霉菌的接合轉(zhuǎn)移步驟中,以鏈霉菌為受體菌,采用含α-吡喃酮類化合物的接合轉(zhuǎn)移平板進(jìn)行鏈霉菌與供體菌的接合轉(zhuǎn)移。

    4.如權(quán)利要求3所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述接合轉(zhuǎn)移具體包括以下步驟:

    5.如權(quán)利要求4所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述步驟4)中受體菌的孢子懸液與供體菌的菌懸液的體積比為100:1;所述混合菌懸液涂布于接合轉(zhuǎn)移平板時,其與接合轉(zhuǎn)移平板內(nèi)培養(yǎng)基的體積比為1:40,且涂布并吹干后進(jìn)行倒置培養(yǎng)的溫度為28℃,時間為16-20h。

    6.如權(quán)利要求4所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述步驟4)中Apr抗生素和TMP抗生素的終濃度分別為50μg/mL和100μg/mL,且Apr抗生素和TMP抗生素進(jìn)行均勻覆蓋并吹干后進(jìn)行倒置培養(yǎng)的溫度為28℃,培養(yǎng)時間為3-5天。

    7.如權(quán)利要求2所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述α-吡喃酮類化合物是從天藍(lán)色鏈霉菌A3(2)的發(fā)酵培養(yǎng)物中分離制備得到的。

    8.如權(quán)利要求7所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述從天藍(lán)色鏈霉菌A3(2)的發(fā)酵培養(yǎng)物中分離制備α-吡喃酮類化合物的方法包括以下步驟:

    9.如權(quán)利要求8所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述步驟d)中HPLC的條件為:色譜柱為Agilent?Ultimate?XB-C18柱;流動相包括A相和B相,流動相A相:10%(v/v)的乙腈+0.08%(v/v)的甲酸,溶劑為水;流動B相:90%(v/v)的乙腈,溶劑為水;梯度洗脫程序如下:

    10.如權(quán)利要求2所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述germicidin?A、germicidin?B、germicidin?C、germicidin?D中的任意一種作為促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移的活性成分用于制備促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移的試劑。

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    【技術(shù)特征摘要】

    1.一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述α-吡喃酮類化合物可提高鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移效率,且α-吡喃酮類化合物具有如式i所示的結(jié)構(gòu):

    2.如權(quán)利要求1所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述α-吡喃酮類化合物為germicidin?a、germicidin?b、germicidin?c、germicidind,所述germicidin?a對應(yīng)式i中的r1和r2均為ch3,且c7為s構(gòu)型;所述germicidin?b對應(yīng)式i中的r1為ch3、r2為h;所述germicidin?c對應(yīng)式i中的r1為h、r2為ch3,且c7為s構(gòu)型;所述germicidin?d對應(yīng)式i中的r1和r2均為h。

    3.如權(quán)利要求1所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,在鏈霉菌的接合轉(zhuǎn)移步驟中,以鏈霉菌為受體菌,采用含α-吡喃酮類化合物的接合轉(zhuǎn)移平板進(jìn)行鏈霉菌與供體菌的接合轉(zhuǎn)移。

    4.如權(quán)利要求3所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述接合轉(zhuǎn)移具體包括以下步驟:

    5.如權(quán)利要求4所述一種α-吡喃酮類化合物在促進(jìn)鏈霉菌接合轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用,其特征在于,所述步驟4)中受體菌的孢子懸液與供體菌的菌懸液的體積比為100:1;所述混合菌懸液涂布于接合轉(zhuǎn)移平板時,其與接合轉(zhuǎn)移平板內(nèi)培養(yǎng)基的體積比為1:40,且涂布并吹干后進(jìn)行倒置培養(yǎng)的溫度為28℃,時間...

    【專利技術(shù)屬性】
    技術(shù)研發(fā)人員:余子全丁軒屈文華田晨曦李佩芝
    申請(專利權(quán))人:湖南師范大學(xué)
    類型:發(fā)明
    國別省市:

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