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【技術實現步驟摘要】
本申請涉及計算機視覺,具體而言,涉及一種囊胚的三維擬合重建方法、裝置、電子設備和存儲介質。
技術介紹
1、隨著胚胎學的發展,胚胎學家更期待能夠從更高的維度對胚胎進行觀察并希冀能夠獲得一個完整、形態特征信息豐富且具備空間特征的模型進行對胚胎的評估和研究。
2、現階段,主要采用熒光染色和共聚焦顯微成像的方式獲取序列熒光切片數據進行胚胎三維模型的重建,然而,這樣的方式需要對胚胎進行染色以及高能量的光譜進行照射,會對胚胎造成不可逆的損害。
技術實現思路
1、有鑒于此,本申請實施例提供了一種囊胚的三維擬合重建方法、裝置、電子設備和存儲介質,以解決在重建胚胎三維模型時對胚胎造成不可逆的損害的問題。
2、第一方面,本申請實施例提供了一種囊胚的三維擬合重建方法,包括:
3、獲取囊胚的多個焦平面圖像;
4、基于所述多個焦平面圖像,識別所述囊胚中滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜;
5、根據所述滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,分別構建滋養層細胞網格模型和內細胞團網格模型;
6、根據所述多個焦平面圖像,構建所述囊胚的深度圖;
7、對所述多個焦平面圖像進行圖像融合,得到紋理圖像;
8、根據所述紋理圖像和所述深度圖進行平面映射,生成所述囊胚的內部三維點云模型;
9、根據所述滋養層細胞網格模型、所述內細胞團網格模型以及所述內部三維點云模型,構建所述囊胚的三維幾何模型;
10、將所述紋理圖像映
11、在一可選的實施方式中,所述根據所述多個焦平面圖像,構建所述囊胚的深度圖,包括:
12、獲取所述多個焦平面圖像中各像素點的清晰度;
13、從所述多個焦平面圖像對應的多個焦平面中,確定所述各像素點的清晰度最大的目標焦平面,得到所述目標焦平面的深度信息;
14、根據所述目標焦平面的深度信息,構建所述深度圖。
15、在一可選的實施方式中,所述獲取囊胚的多個焦平面圖像,包括:
16、獲取所述囊胚的多個第一焦平面圖像;
17、對所述多個第一焦平面圖像進行插幀處理,得到所述囊胚的多個第二焦平面圖像,所述多個焦平面圖像包括:所述多個第一焦平面圖像和所述多個第二焦平面圖像。
18、在一可選的實施方式中,所述根據所述滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,分別構建滋養層細胞網格模型和內細胞團網格模型之前,所述方法還包括:
19、對所述多個焦平面圖像進行分割,得到所述多個焦平面圖像中的所述囊胚;
20、若所述多個焦平面圖像中存在目標焦平面圖像,則將所述目標焦平面圖像中的所述囊胚移動至預設視野中央,并進行邊界填充重新生成所述目標焦平面圖像,所述目標焦平面圖像中的所述囊胚不在所述預設視野中央。
21、在一可選的實施方式中,所述基于所述多個焦平面圖像,識別所述囊胚中滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,包括:
22、根據所述多個焦平面圖像對應的預設標記圖形,分別在所述多個焦平面圖像上標記滋養層細胞區域;
23、對所述滋養層細胞區域進行識別,得到所述滋養層細胞的掩膜;
24、對位于所述滋養層細胞區域內部的內細胞團區域進行識別,得到所述內細胞團的掩膜。
25、在一可選的實施方式中,所述方法還包括:
26、確定所述多個焦平面圖像對應的多個焦平面中的預設焦平面為所述滋養層細胞的最佳焦平面;
27、根據所述多個焦平面圖像中所述內細胞團的掩膜的面積,從所述多個焦平面中確定所述內細胞團的最佳焦平面;
28、根據所述滋養層細胞的最佳焦平面,確定所述滋養層細胞網格模型的三維位置,以及根據所述內細胞團的最佳焦平面,確定所述內細胞團網格模型的三維位置;
29、所述根據所述滋養層細胞網格模型、所述內細胞團網格模型以及所述內部三維點云模型,構建所述囊胚的三維幾何模型,包括:
30、根據所述滋養層細胞網格模型的三維位置,對所述滋養層細胞網格模型和所述內部三維點云模型進行位置匹配,以及根據所述內細胞團網格模型的三維位置,對所述內細胞團網格模型和所述內部三維點云模型進行位置匹配,得到所述三維幾何模型。
31、在一可選的實施方式中,所述根據所述多個焦平面圖像中所述內細胞團的掩膜的面積,從所述多個焦平面中確定所述內細胞團的最佳焦平面,包括:
32、根據所述多個焦平面圖像中所述內細胞團的掩膜的面積,從所述多個焦平面圖像中確定所述內細胞團的掩膜的面積最大的目標焦平面圖像;
33、將所述目標焦平面圖像中的所述內細胞團的掩膜作為分割掩膜,對所述多個焦平面圖像進行分割,得到多個分割焦平面圖像;
34、根據所述多個分割焦平面圖像的清晰度,從所述多個焦平面中確定所述內細胞團的最佳焦平面。
35、第二方面,本申請實施例還提供了一種囊胚的三維擬合重建裝置,包括:
36、獲取模塊,用于獲取囊胚的多個焦平面圖像;
37、識別模塊,用于基于所述多個焦平面圖像,識別所述囊胚中滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜;
38、構建模塊,用于根據所述滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,分別構建滋養層細胞網格模型和內細胞團網格模型;
39、所述構建模塊,還用于根據所述多個焦平面圖像,構建所述囊胚的深度圖;
40、融合模塊,用于對所述多個焦平面圖像進行圖像融合,得到紋理圖像;
41、映射模塊,用于根據所述紋理圖像和所述深度圖進行平面映射,生成所述囊胚的內部三維點云模型;
42、所述構建模塊,還用于根據所述滋養層細胞網格模型、所述內細胞團網格模型以及所述內部三維點云模型,構建所述囊胚的三維幾何模型;
43、所述映射模塊,還用于將所述紋理圖像映射到所述三維幾何模型的表面上,生成所述囊胚的三維模型。
44、在一可選的實施方式中,所述構建模塊,具體用于:
45、獲取所述多個焦平面圖像中各像素點的清晰度;
46、從所述多個焦平面圖像對應的多個焦平面中,確定所述各像素點的清晰度最大的目標焦平面,得到所述目標焦平面的深度信息;
47、根據所述目標焦平面的深度信息,構建所述深度圖。
48、在一可選的實施方式中,所述獲取模塊,具體用于:
49、獲取所述囊胚的多個第一焦平面圖像;
50、對所述多個第一焦平面圖像進行插幀處理,得到所述囊胚的多個第二焦平面圖像,所述多個焦平面圖像包括:所述多個第一焦平面圖像和所述多個第二焦平面圖像。
51、在一可選的實施方式中,所述裝置還包括:
52、分割模塊,用于對所述多個焦平面圖像進行分割,得到所述多個焦平面圖像中的所述囊胚;
53、移動模塊,用于若所述多個焦平面圖像本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.一種囊胚的三維擬合重建方法,其特征在于,包括:
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據所述多個焦平面圖像,構建所述囊胚的深度圖,包括:
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述獲取囊胚的多個焦平面圖像,包括:
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據所述滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,分別構建滋養層細胞網格模型和內細胞團網格模型之前,所述方法還包括:
5.根據權利要求1-4任一項所述的方法,其特征在于,所述基于所述多個焦平面圖像,識別所述囊胚中滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,包括:
6.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,所述根據所述多個焦平面圖像中所述內細胞團的掩膜的面積,從所述多個焦平面中確定所述內細胞團的最佳焦平面,包括:
8.一種囊胚的三維擬合重建裝置,其特征在于,包括:
9.一種電子設備,其特征在于,包括:處理器、存儲器和總線,所述存儲器存儲有所述處理器可執行的機器可讀指令,當電
10.一種計算機可讀存儲介質,其特征在于,所述計算機可讀存儲介質上存儲有計算機程序,所述計算機程序被處理器運行時執行權利要求1至7任一項所述的方法。
...【技術特征摘要】
1.一種囊胚的三維擬合重建方法,其特征在于,包括:
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據所述多個焦平面圖像,構建所述囊胚的深度圖,包括:
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述獲取囊胚的多個焦平面圖像,包括:
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據所述滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,分別構建滋養層細胞網格模型和內細胞團網格模型之前,所述方法還包括:
5.根據權利要求1-4任一項所述的方法,其特征在于,所述基于所述多個焦平面圖像,識別所述囊胚中滋養層細胞的掩膜和內細胞團的掩膜,包括:
6.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法還包括...
【專利技術屬性】
技術研發人員:王雪峰,史振志,周文靜,王陸權,
申請(專利權)人:廣州市華粵行醫療科技有限公司,
類型:發明
國別省市:
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