【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)屬于生物分子，具體涉及與谷子穗型相關(guān)的snp位點(diǎn)、分子標(biāo)記及其應(yīng)用。
技術(shù)介紹
1、谷子(setariaitalica)，古稱稷或粟，是一年生草本作物,原產(chǎn)于中國(guó)，是中國(guó)重要的糧食作物之一，在旱作農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展中具有不可替代的作用。谷子耐旱節(jié)水性強(qiáng),被認(rèn)為是應(yīng)對(duì)未來干旱環(huán)境和氣候變暖的戰(zhàn)略儲(chǔ)備作物。谷子的穗型對(duì)產(chǎn)量有顯著影響。谷子的穗型與產(chǎn)量之間的關(guān)系主要體現(xiàn)在穗部穎花量、粒重、結(jié)實(shí)率等方面，這些因素直接影響到谷子的最終產(chǎn)量。一般來說，具有較高粒數(shù)和粒重的穗型類型，如圓錐花序類型的品種，通常具有較高的產(chǎn)量。這是因?yàn)檫@種穗型類型的品種能夠提供更多的籽粒，從而增加產(chǎn)量。此外，穗型的大小還影響著養(yǎng)分的需求量、抗逆性以及栽培管理的難易程度，這些都是影響產(chǎn)量的重要因素。谷子的穗型不僅關(guān)系到其產(chǎn)量，還與病蟲害的發(fā)生有一定的關(guān)聯(lián)。谷子的穗型對(duì)其產(chǎn)量有著直接的影響，通過選擇合適的穗型類型以及采取有效的栽培管理措施，可以顯著提高谷子的產(chǎn)量和抗病蟲害能力。谷子作為二倍體自花授粉作物，基因組較小，操作方便，繁殖周期短，遺傳相對(duì)簡(jiǎn)單，現(xiàn)已具備了較高質(zhì)量的參考基因組序列，且谷子ssr遺傳連鎖圖譜的發(fā)表，為谷子的遺傳分析奠定了良好基礎(chǔ)。雖然谷子全基因組序列已經(jīng)完成測(cè)序,但是有關(guān)谷子穗型的基因關(guān)聯(lián)研究鮮見報(bào)道；故有必要開發(fā)、利用、鑒定谷子穗型性狀的分子標(biāo)記以培育出更為優(yōu)良的品種。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、基于以上背景，本專利技術(shù)提供了與谷子穗型相關(guān)的snp位點(diǎn)、分子標(biāo)記及其應(yīng)用。
2、本專利技術(shù)
3、與谷子穗型相關(guān)的snp位點(diǎn)，所述snp位點(diǎn)包括第一snp位點(diǎn)、第二snp位點(diǎn)，所述第一snp位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31676683位，其等位變異為a/c；所述第二snp位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31693050位，其等位變異為a/t。
4、基于同一專利技術(shù)構(gòu)思，本專利技術(shù)還提供了檢測(cè)谷子基因組中snp的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在如下任一中的應(yīng)用，所述應(yīng)用包括：
5、1)在對(duì)谷子的穗型進(jìn)行預(yù)測(cè)中的應(yīng)用；
6、2)在對(duì)谷子的穗型性狀鑒定或是輔助鑒定中的應(yīng)用；
7、3)在谷子穗型的改良相關(guān)育種或輔助育種中的應(yīng)用。
8、所述snp位點(diǎn)包括第一snp位點(diǎn)、第二snp位點(diǎn)，所述第一snp位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31676683位，其等位變異為a/c；所述第二snp位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31693050位，其等位變異為a/t。
9、基于同一專利技術(shù)構(gòu)思，本專利技術(shù)還提供了與谷子穗型相關(guān)的分子標(biāo)記，所述分子標(biāo)記包括第一分子標(biāo)記、第二分子標(biāo)記，所述第一分子標(biāo)記包括谷子的第8染色體第31676683位點(diǎn)在內(nèi)，所述第二分子標(biāo)記包括谷子的第8染色體第31693050位在內(nèi)；
10、其中第一分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.1所示，具體見下：
11、tgagggctggcctccaattttacaatatgtactat[a/c]tactccctctgtcctaaattactattcgttttgac，其第36位堿基為a/c等位變異；
12、所述第二分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.2所示，具體見下：
13、agcagagctttactgatagataaagatcaaaaccc[a/t]agggttaggataatttcatatttagcatattcgga，其第36位堿基為a/t等位變異。
14、基于同一專利技術(shù)構(gòu)思，本專利技術(shù)還提供了與谷子穗型相關(guān)的分子標(biāo)記在如下任一中的應(yīng)用，所述應(yīng)用包括：
15、1)在對(duì)谷子的穗型進(jìn)行預(yù)測(cè)中的應(yīng)用；
16、2)在對(duì)谷子的穗型性狀鑒定或是輔助鑒定中的應(yīng)用；
17、3)在谷子穗型的改良相關(guān)育種或輔助育種中的應(yīng)用。
18、基于同一專利技術(shù)構(gòu)思，本專利技術(shù)還提供了一種預(yù)測(cè)谷子穗型的方法，采用特異性的用于檢測(cè)所述的snp位點(diǎn)的探針或芯片，對(duì)預(yù)測(cè)對(duì)象的谷子基因組dna進(jìn)行檢測(cè)，獲得所述的snp位點(diǎn)的等位變異位點(diǎn)的堿基情況，根據(jù)堿基情況預(yù)測(cè)谷子的穗型；
19、或是以谷子的單葉片或種子的dna為模板，采用分子標(biāo)記對(duì)應(yīng)的引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增，對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序及其鑒定，根據(jù)鑒定結(jié)果預(yù)測(cè)谷子的穗型。
20、相比現(xiàn)有技術(shù)，本專利技術(shù)的有益效果為：
21、本專利技術(shù)提供了與谷子谷子穗型性狀顯著相關(guān)的snp位點(diǎn)，并就此開發(fā)出與谷子穗型相關(guān)的分子標(biāo)記，以此將基因組dna序列與谷子穗型性狀聯(lián)系起來，有利于谷子分子標(biāo)記輔助育種體系的建立，可為更為精細(xì)定位、谷子選育提供方向及其依據(jù)。
本文檔來自技高網(wǎng)...【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
1.與谷子穗型相關(guān)的SNP位點(diǎn)，其特征在于，所述SNP位點(diǎn)包括第一SNP位點(diǎn)、第二SNP位點(diǎn)，所述第一SNP位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31676683位，其等位變異為A/C；所述第二SNP位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31693050位，其等位變異為A/T。
2.檢測(cè)谷子基因組中SNP的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在如下任一中的應(yīng)用，其特征在于，所述應(yīng)用包括：
3.與谷子穗型相關(guān)的分子標(biāo)記，其特征在于，所述分子標(biāo)記包括第一分子標(biāo)記、第二分子標(biāo)記，所述第一分子標(biāo)記包括谷子的第8染色體第31676683位點(diǎn)在內(nèi)，所述第二分子標(biāo)記包括谷子的第8染色體第31693050位在內(nèi)；
4.權(quán)利要求3所述的與谷子穗型相關(guān)的分子標(biāo)記在如下任一中的應(yīng)用，其特征在于，所述應(yīng)用包括：
5.一種預(yù)測(cè)谷子穗型的方法，其特征在于，采用特異性的用于檢測(cè)權(quán)利要求1所述的SNP位點(diǎn)的探針或芯片，對(duì)預(yù)測(cè)對(duì)象的谷子基因組DNA進(jìn)行檢測(cè)，獲得權(quán)利要求1中所述的SNP位點(diǎn)的等位變異位點(diǎn)的堿基情況，根據(jù)堿基情況預(yù)測(cè)谷子的穗型；
【技術(shù)特征摘要】
1.與谷子穗型相關(guān)的snp位點(diǎn)，其特征在于，所述snp位點(diǎn)包括第一snp位點(diǎn)、第二snp位點(diǎn)，所述第一snp位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31676683位，其等位變異為a/c；所述第二snp位點(diǎn)位于谷子的第8染色體第31693050位，其等位變異為a/t。
2.檢測(cè)谷子基因組中snp的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在如下任一中的應(yīng)用，其特征在于，所述應(yīng)用包括：
3.與谷子穗型相關(guān)的分子標(biāo)記，其特征在于，所述分子標(biāo)記包括第一分子標(biāo)記、第二分子標(biāo)記，所述...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：王鈺文，劉穎慧，趙治海，范曉慶，王曉明，范光宇，
申請(qǐng)(專利權(quán))人：張家口市農(nóng)業(yè)科學(xué)院河北省高寒作物研究所，
類型：發(fā)明
國(guó)別省市：
還沒有人留言評(píng)論。發(fā)表了對(duì)其他瀏覽者有用的留言會(huì)獲得科技券。