【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
本專利技術(shù)屬于生物醫(yī)藥技術(shù)和診斷領(lǐng)域，具體涉及一種生物標(biāo)志物組合及其在預(yù)測膀胱癌風(fēng)險中的應(yīng)用。
技術(shù)介紹
1、膀胱癌是指發(fā)生在膀胱黏膜上的惡性腫瘤。是泌尿系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤，也是全身十大常見腫瘤之一。占我國泌尿生殖系腫瘤發(fā)病率的第一位，而在西方其發(fā)病率僅次于前列腺癌，居第2位。2012年全國腫瘤登記地區(qū)膀胱癌的發(fā)病率為6.61/10萬，列惡性腫瘤發(fā)病率的第9位。
2、因此，精準(zhǔn)靈敏的早期篩查手段是十分有必要的。傳統(tǒng)癌癥腫瘤篩查手段包括影像學(xué)檢查，病理學(xué)檢查，放射及免疫學(xué)檢查等。體檢中各項血液檢查指標(biāo)，x光，ct等都是常用的篩查膀胱癌的方法。然而這些手段都存在假陽性率過高，發(fā)現(xiàn)時間較晚等缺點(diǎn)。
3、因此，急需一種高靈敏度高準(zhǔn)確率的診斷方法來實(shí)現(xiàn)早期癌癥篩查。
4、蛋白質(zhì)組學(xué)在揭示腫瘤發(fā)生的復(fù)雜分子事件，如腫瘤發(fā)生、侵襲、轉(zhuǎn)移和對治療耐受上起了重大作用。蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤診斷具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、背景機(jī)理明確的優(yōu)點(diǎn)，近年來被越來越多地運(yùn)用于腫瘤檢測。而且，這些腫瘤標(biāo)志物的研究往往是基于一定量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，所涉及的癌癥種類和樣本量都相對有限。近年來，隨著蛋白質(zhì)組不斷發(fā)展，體液蛋白質(zhì)組大數(shù)據(jù)不斷增加。因此，通過收集體液蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)，利用大數(shù)據(jù)分析方法，找到一種適用范圍廣、準(zhǔn)確率高的腫瘤風(fēng)險模型，有助于實(shí)現(xiàn)早期診斷，對患者進(jìn)行早診早治療具有重要的臨床意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本專利技術(shù)所要解決的技術(shù)問題是現(xiàn)有技術(shù)缺少能夠早期準(zhǔn)確預(yù)測膀胱癌風(fēng)險的生物標(biāo)志物，提
2、本專利技術(shù)通過以下技術(shù)方案解決上述技術(shù)問題。
3、本專利技術(shù)的第一方面提供一種生物標(biāo)志物組合在制備預(yù)測和/或診斷膀胱癌的試劑盒中的應(yīng)用；
4、其中，所述生物標(biāo)志物組合由agpat5、arhgef10l、atl3、atp6ap2、b3gat3、bag2、bhmt2、blvrb、c12orf10、c1orf50、ca1、cast、cat、cd74、cdc37、celf1、clic1、cops5、crp、ctsl、ddt、dennd10、dennd10p1、dnase2、dusp3、eif5a2、eif5al1、eml4、fkbp1a、g6pd、get4、gmppa、h1-1、h3-4、h3c1、h3c15、hba1、hbb、hbe1、hcls1、hnrnpa0、hspa6、kcnn4、klhl13、klhl9、lgals4、lss、man2b1、mecp2、mrpl17、msl1、mtpn、ncald、pcbp3、pdlim3、plaa、plekhm1、postn、prdx2、ptpre、pus1、pxdn、rbm47、rdh10、s100a4、scgb1a1、sftpb、smarca5、sqstm1、stk24、tbl3、tex15、tmprss13、txn、ufc1和xpnpep1組成。
5、本專利技術(shù)的第二方面提供一種用于檢測生物標(biāo)志物組合的試劑，所述生物標(biāo)志物組合由agpat5、arhgef10l、atl3、atp6ap2、b3gat3、bag2、bhmt2、blvrb、c12orf10、c1orf50、ca1、cast、cat、cd74、cdc37、celf1、clic1、cops5、crp、ctsl、ddt、dennd10、dennd10p1、dnase2、dusp3、eif5a2、eif5al1、eml4、fkbp1a、g6pd、get4、gmppa、h1-1、h3-4、h3c1、h3c15、hba1、hbb、hbe1、hcls1、hnrnpa0、hspa6、kcnn4、klhl13、klhl9、lgals4、lss、man2b1、mecp2、mrpl17、msl1、mtpn、ncald、pcbp3、pdlim3、plaa、plekhm1、postn、prdx2、ptpre、pus1、pxdn、rbm47、rdh10、s100a4、scgb1a1、sftpb、smarca5、sqstm1、stk24、tbl3、tex15、tmprss13、txn、ufc1和xpnpep1組成。
6、本專利技術(shù)一些實(shí)施方案中，所述試劑用于檢測所述生物標(biāo)志物組合的表達(dá)水平；所述表達(dá)水平為蛋白表達(dá)水平和/或mrna轉(zhuǎn)錄水平。
7、本專利技術(shù)一些較佳實(shí)施方案中，所述試劑為與所述生物標(biāo)志物特異性結(jié)合，或者與編碼所述生物標(biāo)志物的核酸特異性雜交的生物分子試劑。
8、本專利技術(shù)一些實(shí)施方案中，所述生物分子試劑選自引物、探針和抗體。
9、本專利技術(shù)一些實(shí)施方案中，所述試劑為用于基因組、轉(zhuǎn)錄組和/或蛋白質(zhì)組測序的試劑。
10、本專利技術(shù)的第三方面提供一種用于檢測生物標(biāo)志物組合的試劑在制備預(yù)測和/或診斷膀胱癌的試劑盒中的應(yīng)用；
11、其中，所述生物標(biāo)志物組合由agpat5、arhgef10l、atl3、atp6ap2、b3gat3、bag2、bhmt2、blvrb、c12orf10、c1orf50、ca1、cast、cat、cd74、cdc37、celf1、clic1、cops5、crp、ctsl、ddt、dennd10、dennd10p1、dnase2、dusp3、eif5a2、eif5al1、eml4、fkbp1a、g6pd、get4、gmppa、h1-1、h3-4、h3c1、h3c15、hba1、hbb、hbe1、hcls1、hnrnpa0、hspa6、kcnn4、klhl13、klhl9、lgals4、lss、man2b1、mecp2、mrpl17、msl1、mtpn、ncald、pcbp3、pdlim3、plaa、plekhm1、postn、prdx2、ptpre、pus1、pxdn、rbm47、rdh10、s100a4、scgb1a1、sftpb、smarca5、sqstm1、stk24、tbl3、tex15、tmprss13、txn、ufc1和xpnpep1組成。
12、本專利技術(shù)一些實(shí)施方案中，所述試劑如第二方面所述。
13、本專利技術(shù)的第四方面提供一種生物標(biāo)志物組合，所述組合所述生物標(biāo)志物組合由agpat5、arhgef10l、atl3、atp6ap2、b3gat3、bag2、bhmt2、blvrb、c12orf10、c1orf50、ca1、cast、cat、cd74、cdc37、celf1、clic1、cops5、crp、ctsl、ddt、dennd10、dennd10p1、dnase2、dusp3、eif5a2、eif5al1、eml4、fkbp1a、g6pd、get4、gmppa、h1-1、h3-4、h3c1、h3c15、hba1、hbb、hbe1、hcls1、hnrnpa0、hspa6、kcnn4、klhl1本文檔來自技高網(wǎng)...
【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
1.一種用于檢測生物標(biāo)志物組合的試劑，其特征在于，所述生物標(biāo)志物組合由AGPAT5、ARHGEF10L、ATL3、ATP6AP2、B3GAT3、BAG2、BHMT2、BLVRB、C12orf10、C1orf50、CA1、CAST、CAT、CD74、CDC37、CELF1、CLIC1、COPS5、CRP、CTSL、DDT、DENND10、DENND10P1、DNASE2、DUSP3、EIF5A2、EIF5AL1、EML4、FKBP1A、G6PD、GET4、GMPPA、H1-1、H3-4、H3C1、H3C15、HBA1、HBB、HBE1、HCLS1、HNRNPA0、HSPA6、KCNN4、KLHL13、KLHL9、LGALS4、LSS、MAN2B1、MECP2、MRPL17、MSL1、MTPN、NCALD、PCBP3、PDLIM3、PLAA、PLEKHM1、POSTN、PRDX2、PTPRE、PUS1、PXDN、RBM47、RDH10、S100A4、SCGB1A1、SFTPB、SMARCA5、SQSTM1、STK24、TBL3、TEX15、TMPRSS13、TXN、UFC1和XPNP
2.一種生物標(biāo)志物組合，其特征在于，所述組合所述生物標(biāo)志物組合由AGPAT5、ARHGEF10L、ATL3、ATP6AP2、B3GAT3、BAG2、BHMT2、BLVRB、C12orf10、C1orf50、CA1、CAST、CAT、CD74、CDC37、CELF1、CLIC1、COPS5、CRP、CTSL、DDT、DENND10、DENND10P1、DNASE2、DUSP3、EIF5A2、EIF5AL1、EML4、FKBP1A、G6PD、GET4、GMPPA、H1-1、H3-4、H3C1、H3C15、HBA1、HBB、HBE1、HCLS1、HNRNPA0、HSPA6、KCNN4、KLHL13、KLHL9、LGALS4、LSS、MAN2B1、MECP2、MRPL17、MSL1、MTPN、NCALD、PCBP3、PDLIM3、PLAA、PLEKHM1、POSTN、PRDX2、PTPRE、PUS1、PXDN、RBM47、RDH10、S100A4、SCGB1A1、SFTPB、SMARCA5、SQSTM1、STK24、TBL3、TEX15、TMPRSS13、TXN、UFC1和XPNPEP1組成。
3.一種試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包含如權(quán)利要求1所述的試劑和如權(quán)利要求2所述的生物標(biāo)志物組合。
4.如權(quán)利要求1所述的試劑、如權(quán)利要求2所述的生物標(biāo)志物組合或如權(quán)利要求3所述的試劑盒在制備預(yù)測和/或診斷膀胱癌的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
5.一種膀胱癌風(fēng)險的預(yù)測系統(tǒng)，其特征在于，所述預(yù)測系統(tǒng)包括檢測模塊和分析判斷模塊；所述檢測模塊檢測待測樣本中的生物標(biāo)志物組合的表達(dá)水平，并將表達(dá)水平數(shù)據(jù)傳輸至所述分析判斷模塊；所述分析判斷模塊通過Firmiana軟件處理所述表達(dá)水平數(shù)據(jù)，預(yù)設(shè)為基于廣義線性回歸模型的機(jī)器學(xué)習(xí)算法，構(gòu)建預(yù)測模型，分別預(yù)測樣本患膀胱癌的概率和不患膀胱癌的概率，判斷所述表達(dá)水平數(shù)據(jù)是否符合預(yù)設(shè)的判斷條件，以預(yù)測樣本患膀胱癌的風(fēng)險，并輸出預(yù)測結(jié)果；所述判斷條件為患膀胱癌的概率大于或等于不患膀胱癌的概率；
6.一種計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其存儲有計算機(jī)程序，其特征在于，所述計算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時，可實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求5所述的預(yù)測系統(tǒng)的功能。
7.一種電子設(shè)備，其包括存儲器和處理器，所述存儲器存儲有計算機(jī)程序，其特征在于，所述處理器用于執(zhí)行所述計算機(jī)程序以實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求5所述的預(yù)測系統(tǒng)的功能。
...【技術(shù)特征摘要】
1.一種用于檢測生物標(biāo)志物組合的試劑，其特征在于，所述生物標(biāo)志物組合由agpat5、arhgef10l、atl3、atp6ap2、b3gat3、bag2、bhmt2、blvrb、c12orf10、c1orf50、ca1、cast、cat、cd74、cdc37、celf1、clic1、cops5、crp、ctsl、ddt、dennd10、dennd10p1、dnase2、dusp3、eif5a2、eif5al1、eml4、fkbp1a、g6pd、get4、gmppa、h1-1、h3-4、h3c1、h3c15、hba1、hbb、hbe1、hcls1、hnrnpa0、hspa6、kcnn4、klhl13、klhl9、lgals4、lss、man2b1、mecp2、mrpl17、msl1、mtpn、ncald、pcbp3、pdlim3、plaa、plekhm1、postn、prdx2、ptpre、pus1、pxdn、rbm47、rdh10、s100a4、scgb1a1、sftpb、smarca5、sqstm1、stk24、tbl3、tex15、tmprss13、txn、ufc1和xpnpep1組成；
2.一種生物標(biāo)志物組合，其特征在于，所述組合所述生物標(biāo)志物組合由agpat5、arhgef10l、atl3、atp6ap2、b3gat3、bag2、bhmt2、blvrb、c12orf10、c1orf50、ca1、cast、cat、cd74、cdc37、celf1、clic1、cops5、crp、ctsl、ddt、dennd10、dennd10p1、dnase2、dusp3、eif5a2、eif5al1、eml4、fkbp1a、g6pd、get4、gmppa、h1-1、h3-4、h3c1、h3c15、hba1、hbb...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：李明珠，
申請(專利權(quán))人：上海愛譜蒂康生物科技有限公司，
類型：發(fā)明
國別省市：
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