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【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及分子育種,具體地,涉及一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀中日均產奶量和/或校正奶量的方法。
技術介紹
1、中國荷斯坦奶牛,又稱中國黑白花奶牛,是在19世紀末期由當時引進中國的荷斯坦奶牛與中國黃牛雜交而培育出來的一個品種,經過持續改良逐漸形成,這也是我國廣泛應用的奶牛品種。
2、目前已發現有acadsb、prl、angptl5、masp2、c3、lbp、pde10a、serpine2、cxcr2等多個主效基因對乳品質性狀具有相關性。
3、轉錄因子激活增強子結合蛋白4(transcription?factor?activating?enhancer-binding?protein4,tfap4)作為一種轉錄調控因子,是堿性螺旋-環-螺旋轉錄因子家族成員,其不僅與正常發育有關,而且似乎還與細胞瘤形成有關;沉默內源性tfap4,能在體外模型中抑制子宮內膜癌細胞的惡性增殖,其機制可能與破壞了tfap4/pokemon轉錄復合物對cdkn1a的轉錄抑制,從而阻抑了腫瘤細胞的周期運行;tfap4蛋白在非小細胞肺癌組織中呈高表達,下調a549細胞中tfap4基因表達可抑制細胞增殖、遷移和侵襲能力;c-myc通過誘導tfap4,限制增殖的b淋巴細胞自我更新,意外抑制了淋巴細胞癌的發生;tfap4轉錄激活bbox1-as1在胃癌組織和細胞系中高表達,進而促進胃癌細胞mkn45的增殖和遷移;tfap2b在人表皮黑色素細胞中特異性高表達,其表達與黑色素細胞標記分子dct的表達呈顯著正相關,在白癜風患者表皮黑色素細胞中
4、可見tfap4參與控制著多種細胞的增殖分化相關。目前業內對tfap4的研究對象主要集中于人體,在農業領域的相關調查與研究比較少甚至空白。
技術實現思路
1、本專利技術的目的是為了克服現有技術的上述不足,提供一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀中日均產奶量和/或校正奶量的方法。
2、本專利技術的第一個目的是提供一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的方法。
3、本專利技術的第二個目的是提供一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的試劑盒。
4、本專利技術的第三個目的是提供檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型的試劑在評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀中的應用。
5、本專利技術的第四個目的是提供檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型的試劑在制備評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的試劑盒中的應用。
6、本專利技術的第五個目的是提供所述的方法或所述的試劑盒在中國荷斯坦奶牛乳品質性狀試劑盒中的應用。
7、為了實現上述目的,本專利技術是通過以下方案予以實現的:
8、本專利技術要求保護一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的方法,檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型,所述snps位點為i6-653?g>c,即rs382915208位點,位于nc_037352.1:3444953,即ars-ucd?2.0版牛基因組的第25染色體的第3444953位,存在gg、cg和cc三種基因型。
9、優選地,gg基因型個體的日均產奶量顯著高于cc基因型個體;gg基因型個體的校正奶量顯著高于cc基因型個體。
10、優選地,使用核苷酸序列如seq?id?no:1~2引物進行pcr擴增檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型.
11、本專利技術還要求保護一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的試劑盒,含有檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型的試劑,所述snps位點為i6-653?g>c,即rs382915208位點,位于nc_037352.1:3444953,即ars-ucd?2.0版牛基因組的第25染色體的第3444953位,存在gg、cg和cc三種基因型。
12、優選地,gg基因型個體的日均產奶量顯著高于cc基因型個體;gg基因型個體的校正奶量顯著高于cc基因型個體。
13、優選地,所述試劑為核苷酸序列如seq?id?no:1~2引物。
14、上游引物序列為:5'-ggctgtcctttgttcctgg-3'(seq?id?no:1),
15、下游引物序列為:5'-cactcattcaccctcgtctc-3'(seq?id?no:2)。
16、本專利技術還要求保護以下應用:
17、檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型的試劑在評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀中的應用。
18、檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型的試劑在制備評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的試劑盒中的應用。
19、所述的方法或所述的試劑盒在中國荷斯坦奶牛乳品質性狀試劑盒中的應用。
20、優選地,所述乳品質性狀為日均產奶量或校正奶量。
21、與現有技術相比,本專利技術具有以下有益效果:
22、本專利技術發現了位于tfap4基因片段的內含子中的snps位點i6-653?g>c,即rs382915208位點,位于nc_037352.1:3444953,即ars-ucd?2.0版牛基因組的第25染色體的第3444953位,存在gg、cg和cc三種基因型。其gg基因型的奶量和校正奶量均顯著高于cc型。利用該snps位點i6-653?g>c建立了評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的方法和試劑盒,其可以應用于中國荷斯坦奶牛的分子育種。
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1.一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的方法,其特征在于,檢測SNPs位點為I6-653G>C的基因型,所述SNPs位點為I6-653?G>C,即rs382915208位點,位于NC_037352.1:3444953,即ARS-UCD?2.0版牛基因組的第25染色體的第3444953位,存在GG、CG和CC三種基因型。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,GG基因型個體的日均產奶量顯著高于CC基因型個體;GG基因型個體的校正奶量顯著高于CC基因型個體。
3.根據權利要求1或2所述的方法,其特征在于,使用核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1~2引物進行PCR擴增檢測SNPs位點為I6-653?G>C的基因型。
4.一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的試劑盒,其特征在于,含有檢測SNPs位點為I6-653?G>C的基因型的試劑,所述SNPs位點為I6-653?G>C,即rs382915208位點,位于NC_037352.1:3444953,即ARS-UCD?2.0版牛基因組的第25染色體的第3444953位,存在GG、CG和CC三種基因型。
...【技術特征摘要】
1.一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的方法,其特征在于,檢測snps位點為i6-653g>c的基因型,所述snps位點為i6-653?g>c,即rs382915208位點,位于nc_037352.1:3444953,即ars-ucd?2.0版牛基因組的第25染色體的第3444953位,存在gg、cg和cc三種基因型。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,gg基因型個體的日均產奶量顯著高于cc基因型個體;gg基因型個體的校正奶量顯著高于cc基因型個體。
3.根據權利要求1或2所述的方法,其特征在于,使用核苷酸序列如seq?id?no:1~2引物進行pcr擴增檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型。
4.一種評估中國荷斯坦奶牛乳品質性狀的試劑盒,其特征在于,含有檢測snps位點為i6-653?g>c的基因型的試劑,所述snps位點為i6-653?g>c,即rs382915208位點,位于...
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