【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于豬的品種鑒定領域，涉及墩頭豬的種質資源，特別指一種鑒定墩頭豬的特異分子身份證及其應用。
技術介紹
0、技術背景
1、對海南當地地方品種的保護和開發有助于海南省養豬業的可持續發展和家畜資源多樣性的豐富。特別是對地方豬種的特異遺傳結構和表征的研究，將有助于根據品種遺傳情況制定專門的品種保護計劃，促進對地方品種的具體保護，保存每個品種的獨特變異、基因和特征對于維持生物多樣性和適應未來環境變化至關重要。因此，利用生物信息技術鑒定海南地方豬種墩頭豬獨特的遺傳特征是準確保護地方豬種資源的重要部分。
2、墩頭豬，中心產區為東方市八所鎮的墩頭、新街、港北、北黎、剪半園、昌義、益興等沿海村莊(漁村)等地。由于墩頭豬的中心產區位于海邊和新街鹽場旁，同時有北黎河從旁邊流過，青飼料和動物性蛋白飼料(小魚、小蝦)極為豐富，特別是野生青飼料海草和海藻類較多，且含鹽量高。小乳豬的豬肉奶腥味淡，皮薄肉嫩，味香，是制作烤乳豬和白切乳豬的上乘原料。隨著生物信息技術的逐漸完善，全基因組測序分析已廣泛應用于解析畜禽基因組信息。在地方品種豬選擇過程中，其基因組中留下了大量的選擇印記，形成了獨特的品種特征，使得在肉品質、抗病性和繁殖性能方面具有一定的優勢，因此，保護地方豬品種可以極大地豐富海南省的遺傳資源，保護地方豬的多樣性，保留地方豬品種的優良基因。
3、為了進一步準確鑒定墩頭豬，本專利技術利用選擇性清除的方法挖掘墩頭豬的特異位點并結合kasp分型技術開發和驗證墩頭豬的特異分子身份證，可以闡明地方豬種的遺傳背景，為海南墩
技術實現思路
1、為實現上述目的，本專利技術提出一種鑒定墩頭豬的特異分子身份證及其應用。
2、本專利技術的技術方案是這樣實現的：
3、第一方面，本專利技術保護一種鑒定墩頭豬的特異分子身份證，所述特異分子身份證為墩頭豬特有的純合snp位點合集，
4、所述snp位點的合集包括：
5、snp1位點：chr1:124873505，snp2位點：chr1:129629182，
6、snp3位點：chr1:129717791，snp4位點：chr7:57455527，
7、snp5位點：chr7:57455569，snp6位點：chr7:57459036，
8、snp7位點：chr7:57459855，snp8位點：chr7:57460468；
9、所述snp1位點的基因型為a/a、snp2位點的基因型為c/c、snp3位點的基因型為c/c、snp4位點的基因型為a/a、snp5位點的基因型為g/g、snp6位點的基因型為g/g、snp7位點的基因型為g/g、snp8位點的基因型為g/g。
10、進一步地，其具體信息如表1所示。
11、表1墩頭豬品種的特異性位點
12、 序號 染色體 位置 突變類型 1 chr1 124873505 g/a 2 chr1 129629182 c/a 3 chr1 129717791 c/a 4 chr7 57455527 a/g 5 chr7 57455569 a/g 6 chr7 57459036 a/g 7 chr7 57459855 a/g 8 chr7 57460468 c/g
13、第二方面，本專利技術保護鑒定墩頭豬品種的特異性位點的kasp分型引物，所述位點及其對應引物如下：
14、snp1位點：chr1:124873505
15、上游引物f1：actgcatcaaacactatttctctgac，如seq?id?no：1所示；
16、上游引物f2：cactgcatcaaacactatttctctgat，如seq?id?no：2所示；
17、下游引物r：acgcacagcatttatgaagtatcccattt，如seq?id?no：3所示；
18、snp2位點：chr1:129629182
19、上游引物f1：gtgccatcctatgcaaacccaga，如seq?id?no：4所示；
20、上游引物f2：gccatcctatgcaaacccagc，如seq?id?no：5所示；
21、下游引物r：gcaacygtgtcccgtgggagaa，如seq?id?no：6所示；
22、snp3位點：chr1:129717791
23、上游引物f1：tctcccacgggacaccg，如seq?id?no：7所示；
24、上游引物f2：ccttctcccacgggacacca，如seq?id?no：8所示；
25、下游引物r：ctacctctggttattgttaggaattgcaa，如seq?id?no：9所示；
26、snp4位點：chr7:57455527
27、上游引物f1：aaggaaattcttgcaggctgagc，如seq?id?no：10所示；
28、上游引物f2：caaggaaattcttgcaggctgagt，如seq?id?no：11所示；
29、下游引物r：ggcat本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.一種鑒定墩頭豬的特異分子身份證，其特征在于，所述特異分子身份證為墩頭豬特有的純合SNP位點合集，所述SNP位點的合集包括：
2.?鑒定墩頭豬品種的SNP位點的KASP分型引物，所述位點及其對應引物如下：
3.含有權利要求2所述引物的試劑。
4.含有權利要求2所述引物或權利要求3所述的試劑的試劑盒。
5.權利要求1所述的分子身份證、權利要求2所述的引物、權利要求3所述的試劑或權利要求4所述的試劑盒在鑒定墩頭豬品種中的應用。
6.權利要求1所述的分子身份證、權利要求2所述的引物、權利要求3所述的試劑或權利要求4所述的試劑盒在檢測待測樣本中是否有墩頭豬品種中的應用。
7.權利要求1所述的分子身份證、權利要求2所述的引物、權利要求3所述的試劑或權利要求4所述的試劑盒在制備鑒定墩頭豬品種的產品中應用。
8.權利要求1所述的分子身份證、權利要求2所述的引物、權利要求3所述的試劑或權利要求4所述的試劑盒在制備檢測待測樣本中是否有墩頭豬品種的產品中的應用。
9.根據權利要求7或8所述的應用，其特征
10.一種鑒定墩頭豬品種的方法，其特征在于，所述方法包括如下步驟：
...【技術特征摘要】
1.一種鑒定墩頭豬的特異分子身份證，其特征在于，所述特異分子身份證為墩頭豬特有的純合snp位點合集，所述snp位點的合集包括：
2.?鑒定墩頭豬品種的snp位點的kasp分型引物，所述位點及其對應引物如下：
3.含有權利要求2所述引物的試劑。
4.含有權利要求2所述引物或權利要求3所述的試劑的試劑盒。
5.權利要求1所述的分子身份證、權利要求2所述的引物、權利要求3所述的試劑或權利要求4所述的試劑盒在鑒定墩頭豬品種中的應用。
6.權利要求1所述的分子身份證、權利要求2所述的引物、權利要求3...
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