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    一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒及其使用方法技術

    技術編號:44346767 閱讀:3 留言:0更新日期:2025-02-25 09:33
    本發明專利技術屬于分子生物技術領域,具體涉及一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT?PCR檢測試劑盒及其使用方法,具體的,所述檢測試劑盒包括RT?PCR引物探針、緩沖溶液和Taq酶,所述引物探針包括分別針對煙曲霉、黑曲霉、黃曲霉、土曲霉、構巢曲霉、耳念珠菌、白色念珠菌的正反向擴增引物和檢測探針;序列分別如SEQ?ID?NO.1~SEQ?ID?NO.17所示。本發明專利技術試劑盒可以同時對上述5種曲霉菌和2種念珠菌進行檢測和鑒別,準確識別出病原體,具有優異的靈敏度和檢測準確性,對進一步的治療和感染預防具有指導作用。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術屬于分子生物,具體涉及一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒及其使用方法。


    技術介紹

    1、呼吸道真菌感染是指真菌侵入人體呼吸道系統,包括鼻腔、咽部、氣管、支氣管和肺部,引起的感染性疾病。這種感染可以是局部的,也可以是全身性的,嚴重時可能導致器官功能障礙甚至死亡。呼吸道真菌感染在全球范圍內是一種重要的公共衛生問題,其流行性情況、每年感染人數和死亡人數具有顯著的地區差異和時間變化。

    2、上呼吸道曲霉菌和念珠菌污染和定植十分常見,而真菌定植是發展成為侵入性感染的重要危險因素,在宿主存在易患因素時會導致深部真菌感染。國內資料顯示,綜合醫院住院患者侵襲性真菌病(invasive?fungal?disease,ifi)的發病率為4.12%,感染部位以下呼吸道最多;檢出的真菌種類以念珠菌屬為主,其中白色念珠菌占67.29%,霉菌占6.20%;院內侵襲性念珠菌感染發生率為0.025%~0.074%,病死率高達37.7%。白色念珠菌占院內侵襲性念珠菌感染的首位(57.1%)。近年來,侵襲性曲霉感染發生率也逐漸上升,占所有ifi的5.9%~12.0%,最常見煙曲霉、黃曲霉及黑曲霉。

    3、呼吸道真菌感染的檢測對于早期診斷和治療具有重要意義。不同的檢測方法在診斷呼吸道真菌感染中具有不同的特點。目前的檢測方法主要分為以下幾類:真菌培養法、熒光染色法、熒光pcr法、血清學檢測、免疫學檢測方法等。熒光pcr方法以其高靈敏度和特異性、操作簡便、可快速獲取結果等優點越來越受到廣泛的應用。

    4、對于真菌檢測熒光pcr檢測方法技術需要提升的技術難點主要為:一方面提升檢測的特異性,需要設計高度特異性的引物和探針,而真菌種類繁多,基因序列的多樣性要求引物和探針必須非常精確地針對目標真菌,以避免與其他微生物發生交叉反應,尤其是對于真菌的分型檢測需要尋找不同種真菌各自高度保守區域;另一方面提升檢測的靈敏度,眾所周知,真菌的結構比較復雜,具有堅硬的細胞壁,核酸提取的難度比較大,因此一般提取的核酸濃度相對較低,因此可以提升檢測試劑的靈敏度來提升檢出率,避免漏檢的風險。因此,本領域中存在對可以更高效地實現真菌多指標同檢的引物及探針的需要。


    技術實現思路

    1、針對
    技術介紹
    中提到的現有熒光pcr檢測真菌技術中存在靈敏度不足、特異性較差,從而導致無法同時進行多項真菌檢測的問題,對引物和探針進行特異性設計,提高了檢測的靈敏度和特異性。

    2、本專利技術的具體技術方案:

    3、一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒,所述檢測試劑盒包括試劑i和試劑ii,所述試劑i和試劑ii均包括緩沖溶液、taq酶和用于檢測的引物、探針,所述試劑i用于檢測土曲霉、黑曲霉、煙曲霉和黃曲霉,所述試劑ii用于檢測構巢曲霉、白色念珠菌和耳念珠菌。

    4、進一步,所述試劑i中引物包括土曲霉、黑曲霉、煙曲霉和黃曲霉的正向擴增引物:5’-gtccgrtcctcgagcgta+tg-3’,如seq?id?no.1所示;反向擴增引物:5’-atccctacctgatccgag+gtca-3’,如seq?id?no.2所示;

    5、所述試劑i探針中包括土曲霉檢測探針:5’-cttcgtcttccgctccg-3’、5’-ctttgtcttccgctctg-3’,如seq?id?no.10、seq?id?no.11所示;

    6、黑曲霉檢測探針:5’-acatgctctgtaggattg-3’,如seq?id?no.12所示;

    7、黃曲霉檢測探針:5’-cgcttgccgaacgcaaatcaatc-3’,如seq?id?no.13所示;

    8、煙曲霉檢測探針:5’-ccagccgacacccaactatttttctaaggt-3’,如seq?id?no.14所示。

    9、進一步,所述土曲霉檢測探針序列5’端標記有fam熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團mgb;

    10、所述黑曲霉的檢測探針序列5’端標記有vic熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團mgb;

    11、所述黃曲霉的檢測探針序列5’端標記有cy5熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團bhq2;

    12、所述煙曲霉的檢測探針序列5’端標記有rox熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團bhq2。

    13、進一步,所述試劑ii中引物包括構巢曲霉的正向擴增引物:5’-ggcttgtgtgttgggtc+gt-3’,如seq?id?no.3所示;反向擴增引物:5’-gccctaatgagcgggtga+c-3’,如seq?id?no.4所示;

    14、白色念珠菌的正向擴增引物:5’-gcttgaaagacggtagtggtaa+gg-3’,如seq?idno.5所示;反向擴增引物:5’-ccgccgcaagcaatg+ttt-3’,如seq?id?no.6所示;

    15、耳念珠菌的正向擴增引物:

    16、5’-cgatacgtagtatgacttgcaga+cg-3’、

    17、5’-gatacgtcgtacgacttgcaga+c-3’,如seq?id?no.7、seq?id?no.8所示;反向擴增引物:5’-accgcgaagattggtgagaagac+at-3’,如seq?id?no.9所示;

    18、所述試劑ii探針中包括構巢曲霉檢測探針:5’-accggacacggtgcc-3’,如seq?idno.15所示;

    19、白色念珠菌檢測探針:5’-ctaagccattgtcaaagc-3’,如seq?id?no.16所示;

    20、耳念珠菌檢測探針:5’-cacattgcgccttggggtattccc-3’,如seq?id?no.17所示。

    21、進一步,所述構巢曲霉的檢測探針序列5’端標記有fam熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團mgb;

    22、所述白色念珠菌的檢測探針序列5’端標記有vic熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團mgb;

    23、所述耳念珠菌的檢測探針序列5’端標記有rox熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團bhq2。

    24、進一步,所述引物序列中堿基“a+”、“c+”和“g+”為鎖核酸修飾的堿基。

    25、進一步,所述試劑i中,土曲霉、黑曲霉、黃曲霉、煙曲霉引物終濃度為444nm,各指標探針終濃度均為111nm。所述試劑ii中,構巢曲霉、白色念珠菌、耳念珠菌各引物終濃度為444nm,各指標探針終濃度均為222nm。

    26、本專利技術還提供一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒的使用方法,包括如下步驟:

    27、步驟一:提取樣本核酸

    28、步驟二:將試劑i和試劑ii混勻后直接分裝至試管中,再將提取的樣本模版、陰性對照、陽性質控品分別加入至不同的pcr反應管中,設置反應條件反應;

    29、步驟三本文檔來自技高網...

    【技術保護點】

    1.一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述檢測試劑盒包括試劑Ⅰ和試劑Ⅱ,所述試劑Ⅰ和試劑Ⅱ均包括緩沖溶液、taq酶和用于檢測的引物、探針,所述試劑Ⅰ用于檢測土曲霉、黑曲霉、煙曲霉和黃曲霉,所述試劑Ⅱ用于檢測構巢曲霉、白色念珠菌和耳念珠菌。

    2.根據權利要求1所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑Ⅰ中引物包括土曲霉、黑曲霉、煙曲霉和黃曲霉的正向擴增引物:5’-GTCCGRTCCTCGAGCGTA+TG-3’,如SEQ?ID?No.1所示;反向擴增引物:5’-ATCCCTACCTGATCCGAG+GTCA-3’,如SEQ?ID?No.2所示;

    3.根據權利要求2所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述土曲霉檢測探針序列5’端標記有FAM熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團MGB;

    4.根據權利要求3所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑Ⅱ中引物包括構巢曲霉的正向擴增引物:5’-?GGCTTGTGTGTTGGGTC+GT-3’,如SEQ?ID?No.3所示;反向擴增引物:5’-?GCCCTAATGAGCGGGTGA+C-3’,如SEQ?ID?No.4所示;

    5.根據權利要求4所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述構巢曲霉的檢測探針序列5’端標記有FAM熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團MGB;

    6.根據權利要求5所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述引物序列中堿基“A+”、“C+”和“G+”為鎖核酸修飾的堿基。

    7.根據權利要求5所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑Ⅰ中,土曲霉、黑曲霉、黃曲霉、煙曲霉引物終濃度為444nM,各指標探針終濃度均為111nM;所述試劑Ⅱ中構巢曲霉、白色念珠菌、耳念珠菌各引物終濃度為444nM,各指標探針終濃度為222?nM。

    8.權利要求1-7中任意一項中所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒的使用方法,其特征在于,包括如下步驟:

    9.根據權利要求8中所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的RT-PCR檢測試劑盒的使用方法,其特征在于:所述步驟二中反應條件為預變性階段95℃,2min;擴增階段95℃,5s、56℃,30s,循環40次。

    ...

    【技術特征摘要】

    1.一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒,其特征在于:所述檢測試劑盒包括試劑ⅰ和試劑ⅱ,所述試劑ⅰ和試劑ⅱ均包括緩沖溶液、taq酶和用于檢測的引物、探針,所述試劑ⅰ用于檢測土曲霉、黑曲霉、煙曲霉和黃曲霉,所述試劑ⅱ用于檢測構巢曲霉、白色念珠菌和耳念珠菌。

    2.根據權利要求1所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑ⅰ中引物包括土曲霉、黑曲霉、煙曲霉和黃曲霉的正向擴增引物:5’-gtccgrtcctcgagcgta+tg-3’,如seq?id?no.1所示;反向擴增引物:5’-atccctacctgatccgag+gtca-3’,如seq?id?no.2所示;

    3.根據權利要求2所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒,其特征在于:所述土曲霉檢測探針序列5’端標記有fam熒光基團,3’端標記有熒光淬滅基團mgb;

    4.根據權利要求3所述的一種用于多種曲霉菌和念珠菌的rt-pcr檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑ⅱ中引物包括構巢曲霉的正向擴增引物:5’-?ggcttgtgtgttgggtc+gt-3’,如seq?id?no.3所示;反向擴增引物:5’-?gcccta...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:丁小靜張倩,楊揚,戴舒雅,
    申請(專利權)人:江蘇和創生物科技有限公司
    類型:發明
    國別省市:

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