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    一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法技術

    技術編號:44401823 閱讀:6 留言:0更新日期:2025-02-25 10:16
    本發明專利技術公開了一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,屬于及生物信息及基因檢測技術領域。本發明專利技術利用生物信息學方法,比對和分析彝藥發酵液不同發酵階段樣本之間的真菌種類、豐度和分布情況,從而了解彝藥發酵液在發酵過程中微生物菌群的變化規律,通過對微生物菌群的變化進行監測和分析,對可以更好地控制發酵過程以提高彝藥發酵液的品質和效果有重要意義。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術涉及生物信息及基因檢測,更具體的說是涉及一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法。


    技術介紹

    1、中國少數民族醫藥是傳統醫藥的重要組成部分,其中彝藥具有悠久的歷史和豐富的理論。經過長期的實踐驗證,其療效確切可靠,為我國醫療衛生事業的發展做出了積極貢獻。彝藥發酵液是一種在低溫、無金屬環境下制備的發酵液,其獨特之處在于,通過將多種天然植物與微生物結合起來進行共同發酵,以獲得豐富多樣化的營養成分,具備一定的保健作用及疾病防治的作用。

    2、但目前有關彝藥發酵液的發酵過程中微生物多樣性相關研究甚少,因此,提供一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,對更好地控制發酵過程,提高彝藥發酵液的品質和效果具有重要意義。


    技術實現思路

    1、針對上述問題,本專利技術提供了一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法

    2、為了實現上述目的,本專利技術采用如下技術方案:

    3、一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,包括以下步驟:

    4、(1)取樣:根據發酵周期,從不同發酵時間的彝藥發酵液中分別選取7個時期的樣本,分別封裝于無菌瓶后置于冰盒,-80℃保存;

    5、(2)基因組dna提?。悍謩e從步驟(1)中的各樣品中提取微生物的基因組dna;

    6、(3)pcr擴增:采用引物組對步驟(2)提取的各樣品中微生物基因組dna進行擴增,通過1%瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增目標條帶大小,純化pcr產物;

    <p>7、(4)miseq文庫構建和測序;

    8、(5)數據處理:對非重復的非單序列進行otu聚類,在聚類過程中去除嵌合體,得到otu的代表序列;

    9、(6)數據分析:對步驟(5)得到的otu代表序列進行分類學分析。

    10、具體的,所述的彝藥發酵液為由5~100份刺梨、5~100份蜂蜜、1~30份余甘子、1~30份核桃和1~30份檸檬經過粉碎或切片后,加入0.1~5%酵母混合均勻,需氧發酵后取上清液制備得到。

    11、優選的,步驟(1)所述的7個時期為:按月進行取樣,開始發酵的第1個月、第2個月、第3個月、第4個月、第6個月、第8個月、第10個月。

    12、具體的,步驟(3)所述的引物組為通用引物its1和its2。

    13、優選的,步驟(6)所述otu聚類的相似性閾值設定為97%。

    14、優選的,步驟(6)所述分類學分析具體為:通過alpha多樣性指數評估微生物群落的豐度和多樣性;通過beta多樣性分析比較不同樣品之間群落組成的差異性。

    15、優選的,步驟(6)所述alpha多樣性指數包括稀釋曲線、chao1指數和shannon指數。

    16、經由上述的技術方案可知,與現有技術相比,本專利技術公開提供了一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,利用生物信息學方法,比對和分析不同樣本之間的真菌種類、豐度和分布情況,從而了解彝藥發酵液在發酵過程中微生物菌群的變化規律,通過對微生物菌群的變化進行監測和分析,對可以更好地控制發酵過程以提高彝藥發酵液的品質和效果有重要意義。

    本文檔來自技高網
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    【技術保護點】

    1.一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:

    2.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,所述的彝藥發酵液為:由5~100份刺梨、5~100份蜂蜜、1~30份余甘子、1~30份核桃和1~30份檸檬經過粉碎或切片后,加入0.1~5%酵母混合均勻,需氧發酵后取上清液制備得到。

    3.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,步驟(1)所述的7個時期為:按月進行取樣,開始發酵的第1個月、第2個月、第3個月、第4個月、第6個月、第8個月、第10個月。

    4.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,步驟(3)所述的引物組為通用引物ITS1和ITS2。

    5.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,步驟(5)所述OTU聚類的相似性閾值設定為97%。

    6.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,步驟(6)所述分類學分析具體為:通過Alpha多樣性指數評估微生物群落的豐度和多樣性;通過Beta多樣性分析比較不同樣品之間群落組成的差異性。

    7.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,步驟(6)所述Alpha多樣性指數包括稀釋曲線、Chao1指數和Shannon指數。

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    【技術特征摘要】

    1.一種彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:

    2.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,所述的彝藥發酵液為:由5~100份刺梨、5~100份蜂蜜、1~30份余甘子、1~30份核桃和1~30份檸檬經過粉碎或切片后,加入0.1~5%酵母混合均勻,需氧發酵后取上清液制備得到。

    3.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落多樣性的檢測方法,其特征在于,步驟(1)所述的7個時期為:按月進行取樣,開始發酵的第1個月、第2個月、第3個月、第4個月、第6個月、第8個月、第10個月。

    4.根據權利要求1所述的彝藥發酵液的發酵過程中真菌群落...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:梁寒峭,范勇田婧,盧亞楠,劉滿嬌,朱子冬王萌萌,李守黔,周譽,李光陸
    申請(專利權)人:北京城市學院,
    類型:發明
    國別省市:

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