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    一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法技術

    技術編號:44420819 閱讀:4 留言:0更新日期:2025-02-28 18:36
    本發明專利技術公開了一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法。本發明專利技術搜集了636份外來玉米種質資源,與兩個測驗種京2416和鄭58雜交形成兩套測交種,并進行兩年兩點的鑒定。利用R軟件中的RR?BLUP程序,將636份外來玉米種質資源測交種的所有數據,選取4/5的種質作為訓練集,1/5的玉米種質作為驗證集,利用RR?BLUP技術,建立外來玉米種質配合力的基因組預測(GP)模型,并對驗證集種質的配合力進行預測,計算模型的預測結果。試驗結果表明,該GP模型對所有農藝性狀的預測效果為0.36~0.56。其中穗粗的預測效果最好為0.56,產量的預測效果為0.49,穗粒數最低為0.36。

    【技術實現步驟摘要】

    本專利技術涉及作物遺傳育種領域,具體涉及一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法


    技術介紹

    1、種質資源是玉米育種的基礎。2010年以前,育種工作以國內玉米種質為主,如塘四平頭群、旅大紅骨群、pa和pb群。隨著國外種子公司的玉米品種進入中國市場,大量優異的玉米種質資源也被國內育種所應用。這些種質具有抗倒伏、早熟、脫水快、宜機收等優點。這些資源拓寬了國內玉米種質基礎,并形成了一種新型的雜種優勢群,與國內的塘四平頭和pa群具有較強的雜種優勢。這些外來種質如何去用,需要建立外來種質配合力的快速預測技術。

    2、meuwissen等提出全基因組預測(genomic?prediction,gp)育種策略,利用遍布全基因組的全部分子標記數據或單倍型數據與參考群體中每個樣本的表型數據來建立預測模型,估計每個標記的遺傳效應,而在其他相關的育種群體中利用每個標記的遺傳效應預測個體的育種值(meuwissen?et?al.2001)。在雜交育種中,可以利用已鑒定雜交種的數據建立gp模型,預測未鑒定雜交種的表現。主要做法是在同一個雜種優勢群內,利用部分親本自交系的基因分型結果及其雜交組合的田間表現做出配合力的基因組預測(gp)模型,然后利用模型預測其他自交系的配合力。這樣減少了測配和組合鑒定的成本。


    技術實現思路

    1、為解決以上技術上的不足,本專利技術提供了一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法。本專利技術提供了全基因組預測技術建立外來玉米自交系配合力的基因組預測模型,并進行了驗證。</p>

    2、本專利技術是通過以下技術方案實現的:

    3、本專利技術提供了一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,包括以下步驟:

    4、st1.提取玉米外來種質資的dna進行40k芯片的基因型分析;

    5、st2.玉米外來種質資和測試種進行雜交,雜交種的其相關性狀的數據進行方差分析;

    6、st3.根據測交種的表型值和自交系snp基因型數據,利用線性無偏估計法,估算每個標記的效應值,所用模型如下:

    7、y=xβ+vb+hg+si+σ2ε

    8、y是雜交種的表型結果;β是試驗位點的固定效應值;b位點內的區組數;g是雜交種的基因型值;i是基因型與環境的互作值;ε是試驗位點的隨機效應值;σ2ε每個位點的誤差估計;x,v,h和s分別是β,b,g,和i的關聯矩陣。

    9、本專利技術提供的玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,適用于預測產量、株高、穗長、穗粗、穗粒數或百粒重。

    10、優選的,所述預測方法適用于預測穗粗或株高。

    11、更有效的,所述預測方法適用于預測穗粗。

    12、本專利技術提供的玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,可用于玉米外來種質資源配合力的測試。

    13、本專利技術提供的玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,可用于玉米外來種質資源育種。

    14、本專利技術的有益效果是:本專利技術提供了一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,所述方法不用大田進行雜交測試,減少了測配和組合鑒定的成本。

    本文檔來自技高網...

    【技術保護點】

    1.一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,包括以下步驟:

    2.根據權利要求1所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法適用于預測產量、株高、穗長、穗粗、穗粒數或百粒重。

    3.根據權利要求2所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法適用于預測穗粗或株高。

    4.根據權利要求3所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法適用于預測穗粗。

    5.根據權利要求1-4所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法用于玉米外來種質資源配合力的測試。

    6.根據權利要求1-4所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法用于玉米外來種質資源育種。

    【技術特征摘要】

    1.一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,包括以下步驟:

    2.根據權利要求1所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法適用于預測產量、株高、穗長、穗粗、穗粒數或百粒重。

    3.根據權利要求2所述一種玉米外來種質資源配合力的基因組預測方法,其特征在于:所述預測方法適用于預測穗粗或株高。

    4.根據權利要...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:孫琦曾廷儒孟昭東魯守平李文才趙勐李文蘭
    申請(專利權)人:山東省農業科學院
    類型:發明
    國別省市:

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