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【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物,更具體地,本專利技術涉及一種與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記及其應用。
技術介紹
1、花青素(anthocyanidin)又稱花色素,是自然界一類廣泛存在于植物中的水溶性天然色素,是水果、蔬菜、花卉中的主要呈色物質。在植物細胞液泡不同的ph值條件下,花青素使花瓣呈現五彩繽紛的顏色?;ㄇ嗨刂饕念愋陀?種,即天竺葵色素、矢車菊色素、飛燕草色素、芍藥色素、牽牛花色素和錦葵色素。自然狀態的花青素都以糖苷形式存在,稱為花色苷,很少有游離的花青素存在?;ㄇ嗨刂饕糜谑称分矫妫部捎糜谌玖?、醫藥、化妝品等方面。
2、茄子(solanum?melongena?l.,2n=24),別名落蘇、又名昆侖瓜等,是茄科茄屬一年生草本至亞灌木植物,因其良好的口感,豐富的營養物質,且是可以連年供應的大眾蔬菜,是我國、東南亞及非洲等許多國家重要的蔬菜作物之一。茄子營養物質含量豐富,果實中含有蛋白質、脂肪、碳水化合物、胡蘿卜素、葉綠素、花青素、各種維生素及生物堿等成分。茄子果實具有食用方式多樣,口感好等特點,且價格經濟實惠,深受廣大消費者喜愛。
3、中國作為茄子的第二起源地及次生演化中心,具有豐富的茄子種子資源。茄子的農藝性狀多種多樣,其中茄子果實顏色是茄子最直觀的農藝性狀之一。目前已有的茄子品種中,果實顏色有紫黑色、紫紅色、淺紫色、綠色和白色等,豐富的果實顏色和種類給消費者提供了更多的選擇性。茄子果色的顏色主要由花青素和葉綠素的含量決定。在茄子中,花青素含量決定果皮紫色的深淺;葉綠素賦予果皮綠色,當果皮
4、目前關于調控茄子果實中花青素的基因及轉錄因子已有很多人研究,然而大多都是通過轉錄組、代謝組、gwas(全基因組關聯分析)分析等生物信息學手段,難以轉化為有效的分子標記并且應用?,F有研究中與茄子果實紫色性狀緊密連鎖的kasp分子標記較少,且利用開發的kasp分子標記,在自然群體驗證時其準確度也不夠高。
5、因此,開發與茄子果皮中花青素性狀緊密連鎖的、可高效且準確鑒定茄子果皮中是否含有花青素的kasp分子標記非常有意義。
技術實現思路
1、基于此,本專利技術的目的在于提供一種與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記及其應用,利用該kasp分子標記,可以高效鑒定茄子果皮中是否含有花青素,且在自然群體驗證時基因型與表型對應準確率高。
2、實現上述專利技術目的的技術方案包括如下。
3、本專利技術中的第一方面,提供了一種與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記,所述kasp分子標記位于茄子基因組10號染色體的76516913位,在76516913位堿基發生c→g的點突變。
4、本專利技術的第二方面,提供了擴增上述與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記的kasp引物,所述kasp引物包括序列如seq?id?no:1所示的上游引物fp1、序列如seq?id?no:2所示的上游引物fp2、以及序列如seq?id?no:3所示的下游引物r。
5、本專利技術的第三方面,提供了上述kasp分子標記或kasp引物在茄子果皮顏色的早期鑒定、果皮中含有花青素的茄子品種輔助育種或制備檢測茄子果皮顏色的試劑盒中的應用。
6、本專利技術的第四方面,提供了一種檢測茄子果皮顏色的試劑盒,包括上述擴增上述與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記的kasp引物。
7、本專利技術的第五方面,提供了一種鑒定茄子果皮顏色的方法,包括以下步驟:以待鑒定茄子的dna作為模板,以上述kasp引物為擴增引物,進行pcr擴增后,分析基因分型數據。
8、本專利技術具有以下有益效果:
9、本專利技術基于精細定位開發了鑒定茄子果皮中是否有花青素的kasp分子標記21qp381,并以來自全國各地的264份茄子品種為材料,驗證kasp分子標記21qp381的適用性,結果發現基因型與表型對應準確率高達97.35%,表明本專利技術開發的分子標記具有更好的適用性,且kasp分子標記21qp381在f2、f3、f4和自然群體中的基因分型非常清楚。利用本專利技術的kasp分子標記21qp381可在茄子幼苗期實現高通量快速鑒定茄子果實的顏色,篩選出紫茄和非紫色茄子,為茄子分子標記輔助選擇育種提供技術支持,在生產上具有重要的應用價值。
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1.一種與茄子果皮中花青素相關的KASP分子標記,其特征在于,所述KASP分子標記位于茄子基因組10號染色體的76516913位,在76516913位堿基發生C→G的點突變。
2.一種擴增上述與茄子果皮中花青素相關的KASP分子標記的KASP引物,其特征在于,所述KASP引物包括序列如SEQ?ID?NO:1所示的上游引物FP1、序列如SEQ?ID?NO:2所示的上游引物FP2、以及序列如SEQ?ID?NO:3所示的下游引物R。
3.權利要求1所述的KASP分子標記或權利要求2所述的KASP引物在茄子果皮顏色的早期鑒定中的應用。
4.權利要求1所述的KASP分子標記或權利要求2所述的KASP引物在果皮中含有花青素的茄子品種輔助育種中的應用。
5.權利要求1所述的KASP分子標記或權利要求2所述的KASP引物在制備檢測茄子果皮顏色的試劑盒中的應用。
6.一種檢測茄子果皮顏色的試劑盒,其特征在于,包括權利要求2所述的擴增上述與茄子果皮中花青素相關的KASP分子標記的KASP引物。
7.一種鑒定茄子果皮顏色的方法,其
8.根據權利要求7所述的鑒定茄子果皮顏色的方法,其特征在于,所述PCR擴增的反應體系包括:KASP?MIX?2.5±0.1μL、8~12μM上游引物Fp10.075±0.005μL、8~12μM上游引物Fp20.075±0.005μL、8~12μM下游引物R?0.2±0.05μL、模板DNA?2±0.2μL、ddH2O加至5μL。
9.根據權利要求7所述的鑒定茄子果皮顏色的方法,其特征在于,所述PCR擴增的反應程序為:
10.根據權利要求7~9任一項所述的鑒定茄子果皮顏色的方法,其特征在于,所述分析基因分型數據包括以下步驟:基因型為G/G時,果皮顏色為綠色;基因型為C/C時,果皮顏色為紫黑色;基因型為C/G時,果皮顏色為紫黑色。
...【技術特征摘要】
1.一種與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記,其特征在于,所述kasp分子標記位于茄子基因組10號染色體的76516913位,在76516913位堿基發生c→g的點突變。
2.一種擴增上述與茄子果皮中花青素相關的kasp分子標記的kasp引物,其特征在于,所述kasp引物包括序列如seq?id?no:1所示的上游引物fp1、序列如seq?id?no:2所示的上游引物fp2、以及序列如seq?id?no:3所示的下游引物r。
3.權利要求1所述的kasp分子標記或權利要求2所述的kasp引物在茄子果皮顏色的早期鑒定中的應用。
4.權利要求1所述的kasp分子標記或權利要求2所述的kasp引物在果皮中含有花青素的茄子品種輔助育種中的應用。
5.權利要求1所述的kasp分子標記或權利要求2所述的kasp引物在制備檢測茄子果皮顏色的試劑盒中的應用。
6.一種檢測茄子果皮顏色的試劑盒,其特征在于,包括權利要求2所述的擴增上述與茄子果皮...
【專利技術屬性】
技術研發人員:邱正坤,夏志磊,曹必好,顏爽爽,楊夢,
申請(專利權)人:華南農業大學,
類型:發明
國別省市:
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