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    具有經修飾的主鏈化學的剪接轉換器反義寡核苷酸制造技術

    技術編號:44450148 閱讀:4 留言:0更新日期:2025-02-28 18:55
    本文公開了具有一個或多個間隔物或不具有間隔物的寡核苷酸。在各種實施方案中,具有間隔物的STMN2、KCNQ2、UNC13A或SMN2寡核苷酸減少具有隱蔽外顯子的STMN2轉錄物或減少錯誤剪接的KCNQ2、UNC13A或SMN2轉錄物并增加全長STMN2、KCNQ2、UNC13A、SMN轉錄物,從而賦予針對神經學疾病諸如肌萎縮側索硬化癥(ALS)、額顳葉癡呆(FTD)、阿爾茨海默氏病(AD)或脊髓性肌萎縮癥(SMA)的治療功效。

    【技術實現步驟摘要】
    【國外來華專利技術】


    技術介紹

    1、反義寡核苷酸是基于核酸的化合物,其可以用于抑制與疾病相關的某些基因的表達。盡管反義寡核苷酸通常經設計以與靶基因雜交,但常規反義寡核苷酸通常展示出差的功效。因此,存在對開發展示出改進的性能和功效的經修飾的反義寡核苷酸用于預防、改善和治療疾病(其實例包括神經學疾病)的需要。

    2、因此,存在對鑒定能夠預防、改善和治療神經學疾病的化合物和/或組合物的迫切需要,該神經學疾病諸如:肌萎縮側索硬化癥(als)、額顳葉癡呆(ftd)、als伴ftd、阿爾茨海默氏病(ad)、帕金森氏病(pd)、亨廷頓氏病、進行性核上性麻痹(psp)、腦外傷(braintrauma)、脊髓損傷、皮質基底節變性(cbd)、神經損傷(例如臂叢神經損傷)、神經病(例如化療誘導的神經病)、tdp43蛋白病(例如,慢性創傷性腦病、佩里綜合征、與阿爾茨海默氏病相關聯的路易體癡呆、伴或不伴癡呆的帕金森氏病以及邊緣為主年齡相關性tdp-43腦病(limbic-predominant?age-related?tdp-43encephalopathy(late))、大腦年齡相關性tdp-43伴硬化癥(carts)、面部發病感覺和運動神經元病(facial?onset?sensory?andmotor?neuronopathy)、關島帕金森-癡呆復合征(guam?parkinson-dementia?complex)、多系統蛋白病、cte、脊髓性肌萎縮癥(sma)和突觸疾病如自閉癥。


    技術實現思路

    1、本文公開了包含剪接轉換寡核苷酸的化合物,并且其中剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。本文額外公開了剪接轉換寡核苷酸,其中剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。

    2、本文額外公開了化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,剪接轉換寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵是非天然鍵聯。

    3、本文額外公開了化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,剪接轉換寡核苷酸包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    4、在各種實施方案中,剪接轉換寡核苷酸包含與來自seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    5、在各種實施方案中,剪接轉換寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    6、本文額外公開了化合物,其包含經修飾的剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    7、在各種實施方案中,寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?idno:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或者與其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列。

    8、本文額外公開了包含剪接轉換寡核苷酸的化合物,其中剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。

    9、在各種實施方案中,剪接轉換寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    10、在各種實施方案中,剪接轉換寡核苷酸包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中寡核苷酸包含間隔物。

    11、在各種實施方案中,寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。在各種實施方案中,經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    12、本文額外公開了化合物,其包含經修飾的寡核苷酸,經修飾的寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中寡核苷酸包含間隔物。

    13、在各種實施方案中,經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或者與其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列。

    14、本文額外公開了剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵是非天然鍵聯。

    15、本文額外公開了剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    16、在各種實施方案中,寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。在各種實施方案中,經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    17、本文額外公開了剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    18、在各種實施方案中,寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?idno:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。...

    【技術保護點】

    1.化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。

    2.權利要求1所述的化合物,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    3.權利要求1所述的化合物,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自受TDP-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    4.權利要求1或2所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與來自STMN2、KCNQ2、UNC13A或SMN2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    5.權利要求1-2或4所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與SEQ?ID?NO:1339或SEQ?ID?NO:1341、SEQ?ID?NO:3032-3043、SEQ?ID?NO:9587-9595或SEQ?ID?NO:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    >6.化合物,其包含經修飾的寡核苷酸,所述經修飾的寡核苷酸包含與來自STMN2、KCNQ2、UNC13A或SMN2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    7.權利要求6所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與SEQ?ID?NO:1339或SEQID?NO:1341、SEQ?ID?NO:3032-3043、SEQ?ID?NO:9587-9595或SEQ?ID?NO:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列。

    8.剪接轉換寡核苷酸,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。

    9.權利要求8所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    10.權利要求8所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自受TDP-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互-補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    11.權利要求8或9所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自STMN2、KCNQ2、UNC13A或SMN2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    12.權利要求8-9或11所述的寡核苷酸,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與SEQ?ID?NO:1339或SEQ?ID?NO:1341、SEQ?ID?NO:3032-3043、SEQ?ID?NO:9587-9595或SEQ?ID?NO:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    13.剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自STMN2、KCNQ2、UNC13A或SMN2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    14.權利要求13所述的寡核苷酸,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與SEQ?ID?NO:1339或SEQ?ID?NO:1341、SEQ?ID?NO:3032-3043、SEQ?ID?NO:9587-9595或SEQ?ID?NO:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    15.寡核苷酸,其包含與SEQ?ID?NO:1339或SEQ?ID?NO:1341、SEQ?ID?NO:3032-3043、SEQ?ID?NO:9587-9595或SEQ?ID?NO:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或與其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    16.化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵是非天然鍵聯。

    17.化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自受TDP-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個...

    【技術特征摘要】
    【國外來華專利技術】

    1.化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。

    2.權利要求1所述的化合物,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    3.權利要求1所述的化合物,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    4.權利要求1或2所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    5.權利要求1-2或4所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    6.化合物,其包含經修飾的寡核苷酸,所述經修飾的寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    7.權利要求6所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seqid?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列。

    8.剪接轉換寡核苷酸,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含間隔物。

    9.權利要求8所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    10.權利要求8所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互-補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    11.權利要求8或9所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    12.權利要求8-9或11所述的寡核苷酸,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    13.剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    14.權利要求13所述的寡核苷酸,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    15.寡核苷酸,其包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或與其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯,并且進一步其中所述寡核苷酸包含間隔物。

    16.化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵是非天然鍵聯。

    17.化合物,其包含剪接轉換寡核苷酸,所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    18.權利要求16所述的化合物,其中所述剪接轉換寡核苷酸包含與來自seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    19.權利要求16或18所述的化合物,其中所述經修飾的剪接轉換寡核苷酸包含與seqid?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?idno:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    20.化合物,其包含經修飾的剪接轉換寡核苷酸,所述經修飾的剪接轉換寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    21.權利要求20所述的化合物,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707、其具有90%同一性的序列中任一個的等長部分或其15至50個連續核堿基部分至少85%互補的序列。

    22.剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自其錯誤剪接導致神經學疾病的轉錄物或其剪接能夠被調節以治療神經學疾病的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵是非天然鍵聯。

    23.剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自受tdp-43調控的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    24.權利要求23所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列。

    25.權利要求22或24所述的寡核苷酸或,其中所述經修飾的寡核苷酸包含與seq?idno:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    26.剪接轉換寡核苷酸,其包含與來自stmn2、kcnq2、unc13a或smn2中任一個的轉錄物的序列的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    27.權利要求26所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與seq?id?no:1339或seq?idno:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列。

    28.剪接轉換寡核苷酸,其包含與seq?id?no:1339或seq?id?no:1341、seq?id?no:3032-3043、seq?id?no:9587-9595或seq?id?no:9698-9707中任一個的等長部分至少85%互補的序列,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯是非天然鍵聯。

    29.權利要求28所述的寡核苷酸,其進一步包含間隔物。

    30.權利要求1-29所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多11個連接核苷的區段。

    31.權利要求1-29所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多10、9或8個連接核苷的區段。

    32.權利要求1-29所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多7個連接核苷的區段。

    33.權利要求1-29所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多6、5、4、3或2個連接核苷的區段。

    34.權利要求1-33所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的每個區段包含至多7個連接核苷。

    35.權利要求30-34中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與seqid?no:1-466、seq?id?no:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seqid?no:10655-10669、seq?id?no:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seq?id?no:3398-3899和seq?id?no:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seq?id?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seqid?no:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享至少85%同一性的序列。

    36.權利要求30-35中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與seqid?no:1-466、seq?id?no:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seqid?no:10655-10669、seq?id?no:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seq?id?no:3398-3899和seq?id?no:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seq?id?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seqid?no:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享至少90%同一性的序列。

    37.權利要求30-36中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與seqid?no:1-466、seq?ino:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seq?idno:10655-10669、seq?id?no:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seq?id?no:3398-3899和seq?id?no:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seq?id?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seq?idno:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享至少95%同一性的序列。

    38.權利要求30-36中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含與seqid?no:1-466、seq?id?no:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seqid?no:10655-10669、seq?id?no:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seq?id?no:3398-3899和seq?id?no:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seq?id?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seqid?no:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享100%同一性的序列。

    39.權利要求1-38中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多11個連接核苷或至多7個連接核苷的區段,并且其中所述寡核苷酸包含與seq?id?no:1-466、seq?id?no:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seq?id?no:10655-10669、seq?id?no:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seqid?no:3398-3899和seq?id?no:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seq?id?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seq?id?no:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享至少85%同一性的序列。

    40.權利要求39所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多6、5、4、3或2個連接核苷的片段,其中所述寡核苷酸包含與seq?id?no:1-466、seq?id?no:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seq?id?no:10655-10669、seq?id?no:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seq?id?no:3398-3899和seq?idno:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seqid?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seq?id?no:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享至少85%同一性的序列。

    41.權利要求39或40所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含具有至多6、5、4、3或2個連接核苷的片段,其中所述寡核苷酸包含與seq?id?no:1-466、seq?id?no:893-1338、seq?id?no:1342-1366、seq?id?no:1392-1664或seq?id?no:10655-10669、seq?idno:1676-1851、seq?id?no:2028-2529、seq?id?no:3046-3221、seq?id?no:3398-3899和seqid?no:4402-4530、seq?id?no:4531-5794、seq?id?no:7059-8322、seq?id?no:9596-9603、seq?id?no:9710-10141、seq?id?no:10574-10651、seq?id?no:10670-10779、seq?id?no:10783-10808和seq?id?no:10814-10820中任一個的等長部分共享至少90%同一性的序列。

    42.權利要求1-41中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的長度為至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少為23、至少24、或至少25個寡核苷酸單位。

    43.權利要求42所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的長度為至少19個寡核苷酸單位。

    44.權利要求1-43中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物是包含不能夠與核苷酸堿基連接的非糖取代基的核苷置換基團。

    45.權利要求44所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物位于所述寡核苷酸的位置10和15之間。

    46.權利要求44所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物位于所述寡核苷酸的位置7和11之間。

    47.權利要求44-46所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸進一步包含第二間隔物,其中所述第二間隔物位于所述寡核苷酸的位置14和22之間。

    48.權利要求47所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物和所述第二間隔物在寡核苷酸中由至少5個核堿基、至少6個核堿基或至少7個核堿基分隔。

    49.權利要求47或48所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物位于所述寡核苷酸的位置7和9之間,并且其中所述第二間隔物位于所述寡核苷酸的位置15和18之間。

    50.權利要求47-49中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物位于所述寡核苷酸的位置8處,并且其中所述第二間隔物位于所述寡核苷酸的位置16處。

    51.權利要求47-50中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸進一步包含第三間隔物,其中所述第三間隔物位于所述寡核苷酸的位置21和24之間。

    52.權利要求44所述的化合物或寡核苷酸,其中所述間隔物位于所述寡核苷酸的位置2和5之間。

    53.權利要求52所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸進一步包含第二間隔物,其中所述第二間隔物位于所述寡核苷酸的位置8和12之間。

    54.權利要求53所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸進一步包含第三間隔物,其中所述第三間隔物位于所述寡核苷酸的位置18和22之間。

    55.權利要求44所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸進一步包含第二間隔物和第三間隔物,其中所述三個間隔物位于所述寡核苷酸中使得所述寡核苷酸的每個區段具有至多7個連接核苷的位置處。

    56.權利要求55所述的化合物或寡核苷酸,其中所述三個間隔物中至少兩個與鳥嘌呤核堿基相鄰。

    57.權利要求56所述的化合物或寡核苷酸,其中所述三個間隔物中的至少兩個中的每個緊接鳥嘌呤核堿基之前。

    58.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物中的每個是包含非糖取代基的核苷置換基團,其中所述非糖取代基不含有酮、醛、縮酮、半縮酮、縮醛、半縮醛、縮醛胺或半縮醛胺部分并且不能夠與核苷酸堿基形成共價鍵。

    59.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物中的每個獨立地由式(x)表示,其中:

    60.權利要求59所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物中的每個獨立地由式(xa)表示,其中:

    61.權利要求59或60所述的化合物或核苷酸,其中環a是任選取代的4-8元單環環烷基或4-8元單環雜環基,所述4-8元單環環烷基選自環丁基、環戊基、環己基、環庚基和環辛基;所述4-8元單環雜環基選自氧雜環丁烷基、四氫呋喃基、四氫吡喃基、1,4-二氧雜環己基、吡咯烷基、哌啶基、哌嗪基、嗎啉基和氮雜環庚基。

    62.權利要求61所述的化合物或核苷酸,其中環a是四氫呋喃基。

    63.權利要求61所述的化合物或核苷酸,其中環a是四氫吡喃基。

    64.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式i表示,其中:

    65.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式i’表示,其中:

    66.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(ia)表示,其中:

    67.權利要求4457中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(ia’)表示,其中:

    68.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式ii表示,其中:

    69.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式ii’表示,其中:

    70.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iia)表示,其中:

    71.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iia’)表示,其中:

    72.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iii)表示,其中:

    73.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iii’)表示,其中:

    74.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iiib)表示,其中:

    75.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iiib’)表示,其中:

    76.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式iii表示,其中:

    77.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式iii表示,其中:

    78.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iiia)表示,其中:

    79.權利要求44-57中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述第一、第二或第三間隔物的每個獨立地由式(iiia’)表示,其中:

    80.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸進一步包含鎖核酸(lna)。

    81.權利要求80所述的化合物或寡核苷酸,其中所述鎖核酸(lna)位于所述寡核苷酸的位置4、7、9、12、15或20之一處。

    82.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中包含所述間隔物的所述寡核苷酸具有至少10%的gc含量。

    83.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中包含所述間隔物的所述寡核苷酸具有至少20%的gc含量。

    84.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中包含所述間隔物的所述寡核苷酸具有至少25%的gc含量。

    85.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中包含所述間隔物的所述寡核苷酸具有至少30%的gc含量。

    86.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中包含所述間隔物的所述寡核苷酸具有至少40%的gc含量。

    87.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中包含所述間隔物的所述寡核苷酸具有至少50%的gc含量。

    88.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的長度在12至40個寡核苷酸單位之間。

    89.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的至少一個(即,一個或多個)核苷鍵聯獨立地選自下組:磷酸二酯鍵聯、硫代磷酸酯鍵聯、烷基磷酸酯鍵聯、二硫代磷酸酯鍵聯、磷酸三酯鍵聯、烷基膦酸酯鍵聯、3-甲氧基丙基膦酸酯鍵聯、甲基膦酸酯鍵聯、氨基烷基磷酸三酯鍵聯、亞烷基膦酸酯鍵聯、亞膦酸酯鍵聯、磷酸酰胺酯鍵聯、硫代磷酸酰胺酯鍵聯、硫代磷酸二酰胺鍵聯、磷酸二酰胺鍵聯、氨基烷基磷酸酰胺酯鍵聯、硫代磷酸酰胺酯鍵聯、硫代烷基膦酸酯鍵聯、硫代烷基磷酸三酯鍵聯、硫代磷酸酯鍵聯、硒代磷酸酯鍵聯和硼代磷酸酯鍵聯。

    90.權利要求1-89中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中連接所述寡核苷酸的位置3或位置4處的堿基的一個或多個核苷鍵聯是磷酸二酯鍵聯。

    91.權利要求90所述的化合物或寡核苷酸,其中連接所述寡核苷酸的位置3或位置4處的堿基的僅一個核苷鍵聯是磷酸二酯鍵聯。

    92.權利要求1-89中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中連接所述寡核苷酸的位置3和位置4兩者處的堿基的核苷鍵聯是磷酸二酯鍵聯。

    93.權利要求1-89中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中緊接間隔物之前的一個或多個堿基通過磷酸二酯鍵連接。

    94.權利要求93所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中僅緊接所述間隔物之前的堿基通過磷酸二酯鍵與所述間隔物連接。

    95.權利要求94所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中緊接所述間隔物之前的堿基進一步通過磷酸二酯鍵與進一步在前的堿基連接。

    96.權利要求94所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含第二間隔物,其中緊接所述第二間隔物之前的堿基通過磷酸二酯鍵與進一步在前的堿基連接。

    97.權利要求1-89中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中緊接間隔物之后的一個或多個堿基通過磷酸二酯鍵連接。

    98.權利要求97所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中僅緊接所述間隔物之后的堿基通過磷酸二酯鍵與所述間隔物連接。

    99.權利要求93所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中緊接所述間隔物之前的兩個堿基通過磷酸二酯鍵連接。

    100.權利要求1-89中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸中緊接間隔物之前的一個或多個堿基通過磷酸二酯鍵連接,并且其中緊接所述間隔物之后的一個或多個堿基寡核苷酸中通過磷酸二酯鍵連接。

    101.權利要求100所述的化合物或寡核苷酸,其中緊接所述間隔物之前的一個堿基和緊接所述間隔物之后的一個堿基通過磷酸二酯鍵連接。

    102.權利要求100或101所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含第二間隔物,并且其中所述寡核苷酸中緊接所述第二間隔物之前的一個或多個堿基通過磷酸二酯鍵連接,并且其中所述寡核苷酸中緊接所述第二間隔物之后的一個或多個堿基通過磷酸二酯鍵連接。

    103.權利要求102所述的化合物或寡核苷酸,其中緊接所述第二間隔物之前的一個堿基和緊接所述第二間隔物之后的一個堿基通過磷酸二酯鍵連接。

    104.權利要求189中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含通過磷酸二酯鍵連接的一系列堿基,所述一系列堿基包含至少兩個堿基。

    105.權利要求1-89中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含通過磷酸二酯鍵連接的一系列堿基,所述一系列堿基包含至少五個堿基。

    106.權利要求104或105的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含兩個或更多個間隔物,并且其中所述一系列堿基位于所述至少兩個間隔物之間。

    107.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的一個或多個核苷間鍵聯是經修飾的核苷間鍵聯。

    108.權利要求107所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的經修飾的核苷間鍵聯是硫代磷酸酯鍵聯。

    109.權利要求107或108所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的所有核苷間鍵聯都是硫代磷酸酯鍵聯。

    110.權利要求108所述的化合物或寡核苷酸,其中所述硫代磷酸酯鍵聯呈rp構型或sp構型之一。

    111.前述權利要求中任一項所述的化合物或寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含至少一個經修飾的糖部分。

    112.根據權利要求111所述的化合物或寡核苷酸,其中所述經修飾的糖部分是以下之一:2’-ome修飾的糖部分、雙環糖部分、2’-o-(2-甲氧基乙基)(2’-moe)、2’-脫氧-2’-氟核苷,2’-氟-β-d-阿糖核苷、鎖核酸(lna)、受約束乙基2’-4’-橋接核酸(cet)、s-cet、tcdna、己糖醇核酸(hna)和三環類似物(例如,tcdna)。

    ...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:S·辛克雷D·布朗D·埃爾鮑姆M·E·卡梅爾加恩
    申請(專利權)人:奎里斯公司
    類型:發明
    國別省市:

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