【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及生物，特別是涉及一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的生物標志物及其應用。
技術介紹
1、棉花是集纖維、油分、蛋白質為一體的經濟作物，棉籽作為棉花的副產物，具有極大的應用前景，不僅可以作為油料資源，還是潛在的植物蛋白資源。棉仁中所包含的蛋白質與大豆蛋白質含量相當，在質量、營養價值上也遠超谷類蛋白，棉籽蛋白不僅可以作為食用蛋白質，同時也是一種經濟實惠的飼用植物蛋白，高蛋白的棉籽在一定程度上可以替代大豆蛋白從而滿足我國畜牧行業在發展過程中出現的飼料短缺情況，促進我國畜牧行業的發展。目前有關陸地棉蛋白質含量的研究較為滯后，高蛋白優異品種較少，并不能很好地滿足市場的需求，如何更好地利用豐富的陸地棉種質資源，培育高蛋白陸地棉品種成為亟待解決的問題。挖掘陸地棉蛋白質含量相關基因是培育高蛋白陸地棉品種的重要途徑。
技術實現思路
1、本專利技術的目的是提供一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的生物標志物及其應用，以解決上述現有技術存在的問題。本專利技術研究發現ghir_a12g026360基因和ghir_d03g013600基因在低蛋白質含量陸地棉品種和高蛋白質含量陸地棉品種中存在著差異表達，表明這兩個基因可能參與陸地棉蛋白質含量的積累過程，可應用于鑒別高蛋白含量陸地棉品種。
2、為實現上述目的，本專利技術提供了如下方案：
3、本專利技術提供一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的生物標志物，所述生物標志物為ghir_d03g013600基因或ghir_a12g026360基因；>
4、所述ghir_d03g013600基因的核苷酸序列如seq?id?no.1所示；
5、所述ghir_a12g026360基因的核苷酸序列如seq?id?no.3所示。
6、本專利技術還提供一種檢測上述生物標志物的引物對，當所述生物標志物為所述ghir_d03g013600基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.5所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.6所示的下游引物；
7、當所述生物標志物為所述ghir_a12g026360基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.7所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.8所示的下游引物。
8、本專利技術還提供檢測上述生物標志物表達量的試劑在制備鑒別高蛋白含量陸地棉品種的檢測產品中的應用。
9、進一步地，所述檢測產品為試劑盒。
10、進一步地，所述試劑為上述的引物對。
11、本專利技術還提供一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的檢測產品，包括檢測上述的生物標志物表達量的試劑。
12、進一步地，所述檢測產品為試劑盒。
13、進一步地，所述試劑為上述的引物對。
14、本專利技術還提供上述的生物標志物、引物對或檢測產品在鑒別高蛋白含量陸地棉品種中的應用。
15、本專利技術還提供一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的方法，包括對上述的生物標志物在待檢陸地棉樣品中的表達量進行檢測，根據表達量檢測結果鑒別高蛋白含量陸地棉品種的步驟；
16、當所述生物標志物為所述ghir_d03g013600基因時，所述ghir_d03g013600基因的表達量越低，提示所述待檢陸地棉樣品的蛋白含量越高；
17、當所述生物標志物為所述ghir_a12g026360基因時，所述ghir_a12g026360基因在胚珠發育前期的表達量越高，提示所述待檢陸地棉樣品的蛋白含量越高；所述ghir_a12g026360基因在胚珠發育中后期的表達量越低，提示所述待檢陸地棉樣品的蛋白含量越高。
18、本專利技術公開了以下技術效果：
19、本專利技術在基于近紅外光譜分析法測定491份陸地棉蛋白質含量的基礎上，再隨機選取146份進行凱氏定氮法測定，分析其表型以及基因型與環境間的互作；進一步通過gwas分析獲得與陸地棉蛋白質含量相關的qtls/snps，并結合“tm-1”的轉錄組數據篩選置信區間內的候選基因。本專利技術在多環境和兩種方法共同檢測到的qtl中選擇了2個qtls作為候選區間，找到了兩個顯著的snp位點，在這兩個位點上下游200kb的區間內共鑒定到12個候選基因，利用已公布的rna-seq表達譜數據和注釋信息最終篩選出2個候選基因，使用qrt-pcr進行驗證，發現ghir_a12g026360和ghir_d03g013600在低蛋白質含量品種和高蛋白質含量品種中存在著差異表達，表明這兩個基因可能參與陸地棉蛋白質含量的積累過程。
20、本專利技術研究發現了與陸地棉蛋白質含量相關的穩定遺傳位點，為進一步探究陸地棉蛋白質遺傳機理奠定了基礎，這對于有效篩選優異材料，來緩解飼料、養殖等行業蛋白原料緊缺現狀以及提高棉籽綜合利用率具有十分重要的意義。
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1.一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的生物標志物，其特征在于，所述生物標志物為Ghir_D03G013600基因或Ghir_A12G026360基因；
2.一種檢測權利要求1所述的生物標志物的引物對，其特征在于，當所述生物標志物為所述Ghir_D03G013600基因時，所述引物對包括核苷酸序列如SEQ?ID?NO.5所示的上游引物和核苷酸序列如SEQ?ID?NO.6所示的下游引物；
3.檢測權利要求1所述的生物標志物表達量的試劑在制備鑒別高蛋白含量陸地棉品種的檢測產品中的應用。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述檢測產品為試劑盒。
5.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述試劑為權利要求2所述的引物對。
6.一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的檢測產品，其特征在于，包括檢測權利要求1所述的生物標志物表達量的試劑。
7.根據權利要求6所述的檢測產品，其特征在于，所述檢測產品為試劑盒。
8.根據權利要求6所述的檢測產品，其特征在于，所述試劑為權利要求2所述的引物對。
9.一種如權利
10.一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的方法，其特征在于，包括對權利要求1所述的生物標志物在待檢陸地棉樣品中的表達量進行檢測，根據表達量檢測結果鑒別高蛋白含量陸地棉品種的步驟；
...【技術特征摘要】
1.一種鑒別高蛋白含量陸地棉品種的生物標志物，其特征在于，所述生物標志物為ghir_d03g013600基因或ghir_a12g026360基因；
2.一種檢測權利要求1所述的生物標志物的引物對，其特征在于，當所述生物標志物為所述ghir_d03g013600基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.5所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.6所示的下游引物；
3.檢測權利要求1所述的生物標志物表達量的試劑在制備鑒別高蛋白含量陸地棉品種的檢測產品中的應用。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述檢測產品為試劑盒。
5.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述試劑為權...
【專利技術屬性】
技術研發人員：李黎貝，馮震，段佳豪，陳瑤，喻樹迅，
申請(專利權)人：浙江農林大學，
類型：發明
國別省市：
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