【技術實現步驟摘要】
【國外來華專利技術】
【】本專利技術總的涉及腫瘤學領域。本文提供一種用于檢測和分類鼻咽癌的檢測方法。
技術介紹
0、
技術介紹
1、鼻咽癌（npc）是一種發生在鼻咽的癌癥。雖然npc在美國很少見，但它在世界其他地區經常發生，例如中國南部和東南亞。它是新加坡中年男性第二常見的癌癥。npc的其他風險因素包括接觸eb病毒或過量飲酒。這種癌癥很難早期發現，并且疾病復發率很高，約為30%至40%。此外，治療選擇有限，并且通常與顯著的發病率相關。目前無分子方法可以準確識別復發風險高的患者。
2、期望克服或改善上述問題中的至少一個，或者至少提供一個有用的替代方案。
3、【專利技術概要】
4、本文公開的是一種預測癌癥在受試者中復發可能性的方法，該方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由成纖維細胞生長因子2（fgf2）、補體成分3（c3）和gtp酶、imap家族成員7（gimap7）組成的組中的一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值預測受試者中癌癥復發的可能性。
5、本文公開的是一種確定受試者中癌癥預后的方法，該方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由fgf2、c3和gimap7組成的組中一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值表明受試者可能患有高風險癌癥或低風險癌癥。
6、本文公開的是一種在受試者中治療癌癥的方法，該方法包括：（a）將從受試者獲得的樣本中
7、在一個實施方案中，被發現可能患有高風險癌癥的受試者將被更密切地隨訪。受試者可以接受進一步治療以降低癌癥復發的風險。例如，受試者可能被施用二線抗癌劑。受試者還可以接受針對fgf2和fgfr的靶向治療。受試者也可以接受免疫療法或抗血管內皮生長因子療法。
8、本文還公開了將受試者分級為患有高風險或低風險癌癥的人的方法，該方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由fgf2、c3和gimap7組成的組中一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值將受試者分為患有高風險或低風險癌癥的受試者。
9、本文公開的是一種組合物或固相支持物，其包含多個dna/mrna復合物，其中，多個dna/mrna復合物中的每個dna/mrna復合物包含生物標志物以及與生物標志物雜交的第一和第二dna探針，其中：第一探針為捕獲探針；第二探針為報告探針；生物標志物是mrna轉錄本；并且多個dna/mrna復合物包含選自由fgf2、c3和gimap7組成的組中的一個或多個生物標志物。
10、【附圖簡述】
11、下面僅通過非限制性示例來描述本專利技術的實施例，并參照附圖，其中：
12、圖1（a）在發現隊列中微解剖的腫瘤上皮區室中差異表達基因的熱圖，其比較最終復發的原發性npc腫瘤和未復發的腫瘤（n=34個基因表達文庫）。（b）無監督分級聚類表明，三個基因特征在發現隊列中準確分類了復發的腫瘤和未復發的腫瘤。
13、圖2（a）無監督分級聚類表明，這三個基因特征根據它們在第一個驗證隊列中對發展為復發性疾病的風險特征定義了腫瘤簇。（b）來自三個基因特征的風險評分顯示，與未復發的腫瘤相比，復發的腫瘤具有更高的風險評分。（c）基于kaplan-meier曲線圖的生存分析顯示，與風險評分較低的腫瘤患者相比，風險評分較高的腫瘤患者具有更差的無病生存率。
14、圖3（a）無監督分級聚類表明，這三個基因特征根據它們在第二驗證隊列中對發展為復發性疾病的風險特征定義了腫瘤簇。（b）來自三個基因特征的風險評分顯示，與未復發的腫瘤相比，復發的腫瘤具有更高的風險評分。（c）基于kaplan-meier曲線圖的生存分析顯示，與風險評分較低的腫瘤患者相比，風險評分較高的腫瘤患者具有更差的無病生存率。
15、圖4（a）細胞遷移測定（劃痕測定）的代表性圖像顯示與對照相比，在含有5ng/mlfgf2的培養基中，c666-1細胞遷移增加。（b）定量同一細胞遷移試驗的遷移到受傷區域的細胞。（c）細胞侵襲試驗顯示，與對照相比，與含有fgf2的培養基一起孵育時，c666-1細胞的侵襲增加。
16、【專利技術詳述】
17、本說明書介紹了一種預測受試者中癌癥復發可能性的方法。
18、本文公開的是一種預測癌癥在受試者中復發可能性的方法，該方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由fgf2、c3和gimap7組成的組中的一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值預測受試者中癌癥復發的可能性。
19、不受理論的束縛，本專利技術人開發了一種顯微解剖的基因表達分類器，該分類器在不同的量化基因表達（大量或顯微解剖）的方法中表現穩健。這里確定的基因具有生物學相關性。fgf2是一種潛在可操作的蛋白質，因為已經在靶向該通路的其他實體器官癌癥中進行了臨床試驗。fgfr抑制劑也已獲準用于其他癌癥的臨床應用。c3是參與先天免疫的補體途徑的關鍵成員，而gimap?gtp酶也是潛在靶向的關鍵免疫介質。
20、術語“生物標志物”是指反映生理和/或病理生理狀態的存在或性質（例如，嚴重程度）的可測量特征，包括發展為特定生理或病理生理狀態（例如癌癥）的風險的指標。生物標志物可能存在于在生理或病理生理狀態（包括其癥狀）開始之前從受試者獲得的樣本中。因此，從受試者獲得的樣本中存在生物標志物可能表明受試者出現生理或病理生理狀態或其癥狀的風險增加?；蛘?，或者另外，生物標志物可以在個體中正常表達，但其表達可能會發生變化（即，在生理或病理生理狀態（包括其癥狀）開始之前增加（上調；過度表達）或減少（下調；表達不足）。因此，生物標志物表達水平的變化可能表明受試者發展生理或病理生理狀態或其癥狀的風險增加。
21、生物標志物包括例如基因表達產物，包括mrna轉錄本和肽或來自基因表達的蛋白質、代謝物等?？梢岳斫?，將基因稱為生物標志物（在本文中有時也稱為生物標志物基因）意味著該基因的產物是生物標志物，即mrna轉錄本和/或來自生物標志物基因表達的蛋白質是生物標志物。因此，例如，將fgf2作為生物標志物是指來自fgf2基因的mrna轉錄本和/或來自fgf2基因表達的蛋白質。如本文所述，引用生物標志物的表達包括生物標志物的濃度、水平或活性，例如mrna轉錄本的濃度或水平或蛋白質的濃度、水平或活性。例如，當生物標志物是一種酶時，其表達可以通過酶在已知底物上的活性水平來確定或測量。
22、與基因有關的術語“表達”是指基因的轉錄以產生rna本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.預測癌癥在受試者中復發可能性的方法，所述方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由成纖維細胞生長因子2（FGF2）、補體成分3（C3）和GTP酶、IMAP家族成員7（GIMAP7）組成的組中的一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值預測癌癥在受試者中復發的可能性。
2.根據權利要求1所述的方法，其中，所述癌癥是鼻咽癌（NPC）。
3.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述方法包括比較所述一個或多個生物標志物的mRNA或蛋白質的表達水平。
4.根據權利要求1～3之任一項所述的方法，其中，所述方法包括檢測所述一個或多個生物標志物的水平。
5.根據權利要求1～4之任一項所述的方法，其中，所述方法包括比較FGF2、C3和GIMAP7的水平，或由其組成。
6.根據權利要求1～5之任一項所述的方法，其中，與參照相比，FGF2、C3和GIMAP7的表達水平增加、不變和/或降低預測所述癌癥在所述受試者中復發的可能性。
7.根據權利要求1～5之任一項所述
8.根據權利要求7所述的方法，其中，所述風險評分模型是通過在包含癌癥患者隊列的基因表達數據和臨床結果的數據集上進行回歸而生成的。
9.根據權利要求1～8之任一項所述的方法，其中，所述樣本是組織樣本。
10.確定癌癥在受試者中預后的方法，所述方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由FGF2、C3和GIMAP7組成的組中的一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值表明受試者可能患有高風險癌癥或低風險癌癥。
11.治療受試者中癌癥的方法，所述方法包括：
12.將受試者分級為患有高風險或低風險癌癥個體的方法，所述方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由FGF2、C3和GIMAP7組成的組中一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值將受試者分級為患有高風險或低風險癌癥個體。
13.組合物或固相支持物，其包括多個DNA/mRNA復合物，其中，所述多個DNA/mRNA復合物中的每個DNA/mRNA復合物包含生物標志物和與生物標志物雜交的第一和第二DNA探針，其中：
...【技術特征摘要】
【國外來華專利技術】
1.預測癌癥在受試者中復發可能性的方法，所述方法包括將從受試者獲得的樣本中選自由成纖維細胞生長因子2（fgf2）、補體成分3（c3）和gtp酶、imap家族成員7（gimap7）組成的組中的一個或多個生物標志物的表達水平與參照進行比較，其中，與參照相比，一個或多個生物標志物中表達水平的變化或由其得出的值預測癌癥在受試者中復發的可能性。
2.根據權利要求1所述的方法，其中，所述癌癥是鼻咽癌（npc）。
3.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述方法包括比較所述一個或多個生物標志物的mrna或蛋白質的表達水平。
4.根據權利要求1～3之任一項所述的方法，其中，所述方法包括檢測所述一個或多個生物標志物的水平。
5.根據權利要求1～4之任一項所述的方法，其中，所述方法包括比較fgf2、c3和gimap7的水平，或由其組成。
6.根據權利要求1～5之任一項所述的方法，其中，與參照相比，fgf2、c3和gimap7的表達水平增加、不變和/或降低預測所述癌癥在所述受試者中復發的可能性。
7.根據權利要求1～5之任一項所述的方法，其中，由其得出的值是通過使用風險評分模型對選自fgf2、c3和gimap7組成的組中的一個或多個生物標志物的表...
【專利技術屬性】
技術研發人員：鄭凱勛，羅國聲，張維杰，羅偉翔，L·蘇亞尼，鄔炳成，
申請(專利權)人：新加坡國立大學，
類型：發明
國別省市：
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